MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5036 complete genome

Total Repeats: 83872

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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40003	NC_020410	T	7	7	1869206	1869212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40004	NC_020410	AAT	2	6	1869293	1869298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40005	NC_020410	T	6	6	1869329	1869334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40006	NC_020410	TAA	2	6	1869336	1869341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40007	NC_020410	TCC	2	6	1869349	1869354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40008	NC_020410	ATG	2	6	1869371	1869376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40009	NC_020410	T	7	7	1869378	1869384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40010	NC_020410	TGA	2	6	1869391	1869396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40011	NC_020410	TAA	2	6	1869463	1869468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40012	NC_020410	CGC	2	6	1869472	1869477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40013	NC_020410	GCCAG	2	10	1869483	1869492	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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40041	NC_020410	CGAG	2	8	1870970	1870977	25 %	0 %	50 %	25 %	452855771
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40117	NC_020410	GCCG	2	8	1875577	1875584	0 %	0 %	50 %	50 %	452855771
40118	NC_020410	TGT	2	6	1875624	1875629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452855771
40119	NC_020410	CGG	2	6	1875633	1875638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452855771
40120	NC_020410	CGA	2	6	1875699	1875704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452855771
40121	NC_020410	CCG	2	6	1875746	1875751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452855771
40122	NC_020410	CCG	2	6	1875797	1875802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452855771
40123	NC_020410	CAG	2	6	1875828	1875833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452855771
40124	NC_020410	ATA	2	6	1875881	1875886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452855771
40125	NC_020410	AAT	2	6	1875904	1875909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452855771
40126	NC_020410	CAAG	2	8	1875915	1875922	50 %	0 %	25 %	25 %	452855771
40127	NC_020410	GCA	2	6	1875923	1875928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452855771
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40130	NC_020410	T	6	6	1876035	1876040	0 %	100 %	0 %	0 %	452855771
40131	NC_020410	CGG	2	6	1876058	1876063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452855771
40132	NC_020410	CCA	2	6	1876066	1876071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452855771
40133	NC_020410	CTG	2	6	1876166	1876171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452855771
40134	NC_020410	TCT	2	6	1876295	1876300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452855771
40135	NC_020410	TA	3	6	1876303	1876308	50 %	50 %	0 %	0 %	452855771
40136	NC_020410	ATTG	2	8	1876467	1876474	25 %	50 %	25 %	0 %	452855771
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40138	NC_020410	TTC	2	6	1876555	1876560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452855771
40139	NC_020410	ATA	2	6	1876686	1876691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452855771
40140	NC_020410	CAT	2	6	1876729	1876734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452855771
40141	NC_020410	TCAA	2	8	1876778	1876785	50 %	25 %	0 %	25 %	452855771
40142	NC_020410	GCA	2	6	1876820	1876825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452855771
40143	NC_020410	GAT	2	6	1876879	1876884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452855771
40144	NC_020410	TCA	2	6	1877063	1877068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452855771
40145	NC_020410	CTT	2	6	1877106	1877111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452855771
40146	NC_020410	AAC	2	6	1877339	1877344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452855771
40147	NC_020410	TGT	2	6	1877348	1877353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452855771
40148	NC_020410	GGC	2	6	1877410	1877415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40149	NC_020410	ATGG	2	8	1877535	1877542	25 %	25 %	50 %	0 %	452855772
40150	NC_020410	AAG	2	6	1877661	1877666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452855772
40151	NC_020410	TGTT	2	8	1877699	1877706	0 %	75 %	25 %	0 %	452855772
40152	NC_020410	GA	3	6	1877723	1877728	50 %	0 %	50 %	0 %	452855772
40153	NC_020410	TGTT	2	8	1877744	1877751	0 %	75 %	25 %	0 %	452855772
40154	NC_020410	TTC	2	6	1877831	1877836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452855772
40155	NC_020410	TTTC	2	8	1877875	1877882	0 %	75 %	0 %	25 %	452855772
40156	NC_020410	TA	3	6	1877891	1877896	50 %	50 %	0 %	0 %	452855772
40157	NC_020410	ATC	2	6	1878017	1878022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452855772
40158	NC_020410	CAG	2	6	1878041	1878046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452855772
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40160	NC_020410	GCT	2	6	1878103	1878108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452855772
40161	NC_020410	CGGAG	2	10	1878315	1878324	20 %	0 %	60 %	20 %	452855772
40162	NC_020410	TTC	2	6	1878356	1878361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452855772
40163	NC_020410	CCGT	2	8	1878384	1878391	0 %	25 %	25 %	50 %	452855772
40164	NC_020410	TCG	2	6	1878519	1878524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452855772
40165	NC_020410	TCT	2	6	1878751	1878756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452855772
40166	NC_020410	GTCCG	2	10	1878806	1878815	0 %	20 %	40 %	40 %	452855772
40167	NC_020410	TTC	2	6	1878848	1878853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452855772
40168	NC_020410	GCC	2	6	1878947	1878952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452855772
40169	NC_020410	GCT	2	6	1879021	1879026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452855772
40170	NC_020410	AGTC	2	8	1879054	1879061	25 %	25 %	25 %	25 %	452855772
40171	NC_020410	AT	3	6	1879164	1879169	50 %	50 %	0 %	0 %	452855772
40172	NC_020410	CTGA	2	8	1879202	1879209	25 %	25 %	25 %	25 %	452855772
40173	NC_020410	CTG	2	6	1879225	1879230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452855772
40174	NC_020410	CCT	2	6	1879367	1879372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452855772
40175	NC_020410	CGA	2	6	1879537	1879542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452855772
40176	NC_020410	TTCA	2	8	1879568	1879575	25 %	50 %	0 %	25 %	452855772
40177	NC_020410	GCA	2	6	1879726	1879731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452855772
40178	NC_020410	TTG	2	6	1879735	1879740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452855772
40179	NC_020410	GAT	2	6	1879763	1879768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452855772
40180	NC_020410	GAT	2	6	1879916	1879921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452855772
40181	NC_020410	TCC	2	6	1879931	1879936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452855772
40182	NC_020410	GCA	2	6	1879996	1880001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452855772
40183	NC_020410	TGT	2	6	1880093	1880098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452855772
40184	NC_020410	ACAT	2	8	1880115	1880122	50 %	25 %	0 %	25 %	452855772
40185	NC_020410	AAGATT	2	12	1880144	1880155	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	452855772
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40187	NC_020410	GCG	2	6	1880215	1880220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452855772
40188	NC_020410	CCG	2	6	1880282	1880287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452855772
40189	NC_020410	TGC	2	6	1880321	1880326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452855772
40190	NC_020410	GAT	2	6	1880354	1880359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452855772
40191	NC_020410	CAA	2	6	1880389	1880394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452855772
40192	NC_020410	GAA	2	6	1880422	1880427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452855772
40193	NC_020410	CG	3	6	1880428	1880433	0 %	0 %	50 %	50 %	452855772
40194	NC_020410	TTCA	2	8	1880450	1880457	25 %	50 %	0 %	25 %	452855772
40195	NC_020410	CTG	2	6	1880522	1880527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452855772
40196	NC_020410	TGA	2	6	1880538	1880543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452855772
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40198	NC_020410	TAA	2	6	1880659	1880664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452855772
40199	NC_020410	CAT	2	6	1880693	1880698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452855772
40200	NC_020410	CTT	2	6	1880764	1880769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452855772
40201	NC_020410	CAG	2	6	1880773	1880778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452855772
40202	NC_020410	GATC	2	8	1880932	1880939	25 %	25 %	25 %	25 %	452855772
40203	NC_020410	GA	3	6	1881010	1881015	50 %	0 %	50 %	0 %	452855772
40204	NC_020410	AAT	2	6	1881122	1881127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452855772
40205	NC_020410	AAT	2	6	1881156	1881161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452855772
40206	NC_020410	AT	3	6	1881183	1881188	50 %	50 %	0 %	0 %	452855772
40207	NC_020410	GCT	2	6	1881214	1881219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452855772
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40209	NC_020410	CGGC	2	8	1881301	1881308	0 %	0 %	50 %	50 %	452855772
40210	NC_020410	CGC	2	6	1881328	1881333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452855772
40211	NC_020410	CTT	2	6	1881355	1881360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452855772
40212	NC_020410	CTG	2	6	1881371	1881376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452855772
40213	NC_020410	TC	3	6	1881442	1881447	0 %	50 %	0 %	50 %	452855772
40214	NC_020410	AAT	2	6	1881503	1881508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452855772
40215	NC_020410	GTG	2	6	1881509	1881514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452855772
40216	NC_020410	AGC	2	6	1881570	1881575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452855772
40217	NC_020410	GGC	2	6	1881576	1881581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452855772
40218	NC_020410	CAT	2	6	1881628	1881633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452855772
40219	NC_020410	CTT	2	6	1881634	1881639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452855772
40220	NC_020410	CGC	2	6	1881665	1881670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452855772
40221	NC_020410	TGC	2	6	1881762	1881767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452855772
40222	NC_020410	TGT	2	6	1881814	1881819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452855772
40223	NC_020410	ATA	2	6	1881884	1881889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452855772
40224	NC_020410	T	6	6	1881895	1881900	0 %	100 %	0 %	0 %	452855772
40225	NC_020410	GCA	2	6	1881915	1881920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452855772
40226	NC_020410	CCG	2	6	1882059	1882064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452855772
40227	NC_020410	A	6	6	1882070	1882075	100 %	0 %	0 %	0 %	452855772
40228	NC_020410	TCC	2	6	1882113	1882118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452855772
40229	NC_020410	GCG	2	6	1882153	1882158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452855772
40230	NC_020410	AT	3	6	1882275	1882280	50 %	50 %	0 %	0 %	452855772
40231	NC_020410	CTG	2	6	1882336	1882341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452855772
40232	NC_020410	TCA	2	6	1882365	1882370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452855772
40233	NC_020410	GCG	2	6	1882392	1882397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452855772
40234	NC_020410	CTT	2	6	1882399	1882404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452855772
40235	NC_020410	CGATT	2	10	1882430	1882439	20 %	40 %	20 %	20 %	452855772
40236	NC_020410	TGA	2	6	1882476	1882481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452855772
40237	NC_020410	AT	3	6	1882494	1882499	50 %	50 %	0 %	0 %	452855772
40238	NC_020410	TCC	2	6	1882554	1882559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452855772
40239	NC_020410	CAA	2	6	1882576	1882581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452855772
40240	NC_020410	CGTC	2	8	1882588	1882595	0 %	25 %	25 %	50 %	452855772
40241	NC_020410	CCCG	2	8	1882618	1882625	0 %	0 %	25 %	75 %	452855772
40242	NC_020410	T	7	7	1882679	1882685	0 %	100 %	0 %	0 %	452855772
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40245	NC_020410	CGT	2	6	1882880	1882885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452855772
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40247	NC_020410	TGC	2	6	1883001	1883006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452855772
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40250	NC_020410	GAGC	2	8	1883125	1883132	25 %	0 %	50 %	25 %	452855772
40251	NC_020410	CAT	2	6	1883152	1883157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452855772
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40254	NC_020410	AG	3	6	1883288	1883293	50 %	0 %	50 %	0 %	452855772
40255	NC_020410	CTG	2	6	1883301	1883306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452855772
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40263	NC_020410	TCT	2	6	1883778	1883783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452855772
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40265	NC_020410	TGC	2	6	1884006	1884011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452855772
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40294	NC_020410	AAG	2	6	1885366	1885371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452855772
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40304	NC_020410	CTGC	2	8	1886002	1886009	0 %	25 %	25 %	50 %	452855772
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40323	NC_020410	CT	3	6	1886939	1886944	0 %	50 %	0 %	50 %	452855772
40324	NC_020410	CTT	3	9	1886971	1886979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452855772
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40328	NC_020410	TC	3	6	1887208	1887213	0 %	50 %	0 %	50 %	452855772
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40331	NC_020410	TTC	2	6	1887454	1887459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452855772
40332	NC_020410	TTTC	2	8	1887487	1887494	0 %	75 %	0 %	25 %	452855772
40333	NC_020410	CAT	2	6	1887583	1887588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452855772
40334	NC_020410	GAT	2	6	1887593	1887598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452855772
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40338	NC_020410	CAT	2	6	1887808	1887813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452855772
40339	NC_020410	TCA	2	6	1887855	1887860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452855772
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40342	NC_020410	GCT	2	6	1888170	1888175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452855772
40343	NC_020410	TGA	2	6	1888212	1888217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452855772
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40346	NC_020410	TTC	2	6	1888469	1888474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452855772
40347	NC_020410	GATG	2	8	1888496	1888503	25 %	25 %	50 %	0 %	452855772
40348	NC_020410	GGC	2	6	1888513	1888518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452855772
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40350	NC_020410	CAG	2	6	1888765	1888770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452855772
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40353	NC_020410	GCA	2	6	1888849	1888854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452855772
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40465	NC_020410	AAT	2	6	1893575	1893580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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40467	NC_020410	AGT	2	6	1893705	1893710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452855773
40468	NC_020410	T	6	6	1893748	1893753	0 %	100 %	0 %	0 %	452855773
40469	NC_020410	GAT	2	6	1893828	1893833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452855773
40470	NC_020410	GCA	2	6	1893894	1893899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452855773
40471	NC_020410	AGATGC	2	12	1893944	1893955	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	452855773
40472	NC_020410	AATT	2	8	1893958	1893965	50 %	50 %	0 %	0 %	452855773
40473	NC_020410	CCG	2	6	1894050	1894055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452855773
40474	NC_020410	ATA	2	6	1894145	1894150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452855773
40475	NC_020410	TCT	2	6	1894151	1894156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452855773
40476	NC_020410	TCT	2	6	1894226	1894231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452855773
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40479	NC_020410	TCA	2	6	1894494	1894499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452855773
40480	NC_020410	ATGAT	2	10	1894526	1894535	40 %	40 %	20 %	0 %	452855773
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40483	NC_020410	GCG	2	6	1894596	1894601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452855773
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40486	NC_020410	GCTT	2	8	1894660	1894667	0 %	50 %	25 %	25 %	452855773
40487	NC_020410	TGA	2	6	1894697	1894702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452855773
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40489	NC_020410	GCG	2	6	1894781	1894786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452855773
40490	NC_020410	GATC	2	8	1894800	1894807	25 %	25 %	25 %	25 %	452855773
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40492	NC_020410	TG	3	6	1894861	1894866	0 %	50 %	50 %	0 %	452855773
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40495	NC_020410	GA	3	6	1895014	1895019	50 %	0 %	50 %	0 %	452855773
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40499	NC_020410	CTG	2	6	1895197	1895202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452855773
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