MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5036 complete genome

Total Repeats: 83872

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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36002	NC_020410	AGA	2	6	1677246	1677251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452855642
36003	NC_020410	TGA	2	6	1677255	1677260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452855642
36004	NC_020410	CTG	2	6	1677284	1677289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452855642
36005	NC_020410	TAT	2	6	1677304	1677309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452855642
36006	NC_020410	CGC	2	6	1677364	1677369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452855642
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36008	NC_020410	AATC	2	8	1677438	1677445	50 %	25 %	0 %	25 %	452855642
36009	NC_020410	CGGCA	2	10	1677493	1677502	20 %	0 %	40 %	40 %	452855642
36010	NC_020410	A	6	6	1677533	1677538	100 %	0 %	0 %	0 %	452855642
36011	NC_020410	A	6	6	1677564	1677569	100 %	0 %	0 %	0 %	452855642
36012	NC_020410	CAT	2	6	1677588	1677593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452855642
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36018	NC_020410	AT	3	6	1677922	1677927	50 %	50 %	0 %	0 %	452855642
36019	NC_020410	CCGG	2	8	1677947	1677954	0 %	0 %	50 %	50 %	452855642
36020	NC_020410	CGC	2	6	1678044	1678049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452855642
36021	NC_020410	GGGC	2	8	1678077	1678084	0 %	0 %	75 %	25 %	452855642
36022	NC_020410	AAAG	2	8	1678154	1678161	75 %	0 %	25 %	0 %	452855642
36023	NC_020410	CAG	2	6	1678179	1678184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452855642
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36026	NC_020410	GGTAT	2	10	1678418	1678427	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
36027	NC_020410	AT	3	6	1678429	1678434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36028	NC_020410	T	7	7	1678527	1678533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36029	NC_020410	GA	3	6	1678572	1678577	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36030	NC_020410	AGG	2	6	1678667	1678672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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36033	NC_020410	TGC	2	6	1678790	1678795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452855643
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36051	NC_020410	GC	3	6	1679520	1679525	0 %	0 %	50 %	50 %	452855643
36052	NC_020410	GAA	2	6	1679529	1679534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452855643
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36101	NC_020410	GTT	2	6	1681720	1681725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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36103	NC_020410	TTA	2	6	1681780	1681785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36104	NC_020410	T	6	6	1681791	1681796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36105	NC_020410	GAG	3	9	1681798	1681806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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36111	NC_020410	GCGG	2	8	1682316	1682323	0 %	0 %	75 %	25 %	452855646
36112	NC_020410	GCG	2	6	1682403	1682408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452855646
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36119	NC_020410	TGA	2	6	1682815	1682820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452855646
36120	NC_020410	GAATTT	2	12	1682880	1682891	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	452855647
36121	NC_020410	GAAA	2	8	1682915	1682922	75 %	0 %	25 %	0 %	452855647
36122	NC_020410	GCA	2	6	1682933	1682938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452855647
36123	NC_020410	CGC	2	6	1683065	1683070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452855647
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36126	NC_020410	A	6	6	1683144	1683149	100 %	0 %	0 %	0 %	452855647
36127	NC_020410	A	7	7	1683162	1683168	100 %	0 %	0 %	0 %	452855647
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36131	NC_020410	ATG	2	6	1683466	1683471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452855647
36132	NC_020410	CGA	2	6	1683485	1683490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452855647
36133	NC_020410	A	6	6	1683515	1683520	100 %	0 %	0 %	0 %	452855647
36134	NC_020410	CGC	2	6	1683614	1683619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452855647
36135	NC_020410	GCAT	2	8	1683705	1683712	25 %	25 %	25 %	25 %	452855647
36136	NC_020410	CTG	2	6	1683729	1683734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452855647
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36139	NC_020410	CGG	2	6	1683970	1683975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452855647
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36141	NC_020410	AAT	2	6	1684109	1684114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36142	NC_020410	ATGA	2	8	1684192	1684199	50 %	25 %	25 %	0 %	452855648
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36144	NC_020410	CGG	2	6	1684232	1684237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452855648
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36148	NC_020410	AGA	2	6	1684359	1684364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452855648
36149	NC_020410	TGA	2	6	1684491	1684496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452855648
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36173	NC_020410	A	7	7	1685500	1685506	100 %	0 %	0 %	0 %	452855648
36174	NC_020410	A	6	6	1685591	1685596	100 %	0 %	0 %	0 %	452855648
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36186	NC_020410	AAAGT	2	10	1686276	1686285	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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36205	NC_020410	AT	3	6	1686996	1687001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36206	NC_020410	AGA	2	6	1687047	1687052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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36218	NC_020410	ATGTC	2	10	1687549	1687558	20 %	40 %	20 %	20 %	452855651
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36221	NC_020410	TA	3	6	1687741	1687746	50 %	50 %	0 %	0 %	452855651
36222	NC_020410	GAA	2	6	1687812	1687817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452855651
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36224	NC_020410	AGACG	2	10	1687910	1687919	40 %	0 %	40 %	20 %	452855651
36225	NC_020410	CGGC	2	8	1687934	1687941	0 %	0 %	50 %	50 %	452855651
36226	NC_020410	CCGC	2	8	1687961	1687968	0 %	0 %	25 %	75 %	452855651
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36229	NC_020410	GAAG	2	8	1688060	1688067	50 %	0 %	50 %	0 %	452855651
36230	NC_020410	A	6	6	1688196	1688201	100 %	0 %	0 %	0 %	452855651
36231	NC_020410	TTGA	2	8	1688220	1688227	25 %	50 %	25 %	0 %	452855651
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36235	NC_020410	TTAA	2	8	1688304	1688311	50 %	50 %	0 %	0 %	452855651
36236	NC_020410	ATC	2	6	1688320	1688325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452855651
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36238	NC_020410	TAT	2	6	1688451	1688456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452855651
36239	NC_020410	GACG	2	8	1688493	1688500	25 %	0 %	50 %	25 %	452855651
36240	NC_020410	AAG	2	6	1688563	1688568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452855651
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36244	NC_020410	CGT	2	6	1688792	1688797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452855651
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36246	NC_020410	AAG	2	6	1688965	1688970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452855651
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36249	NC_020410	TGA	2	6	1689113	1689118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452855651
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36251	NC_020410	ATT	2	6	1689168	1689173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452855651
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36254	NC_020410	ATCAA	2	10	1689316	1689325	60 %	20 %	0 %	20 %	452855651
36255	NC_020410	CG	3	6	1689399	1689404	0 %	0 %	50 %	50 %	452855651
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36264	NC_020410	AAATA	2	10	1689710	1689719	80 %	20 %	0 %	0 %	452855652
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36266	NC_020410	GGT	2	6	1689731	1689736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452855652
36267	NC_020410	GCCT	2	8	1689743	1689750	0 %	25 %	25 %	50 %	452855652
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36269	NC_020410	TCG	2	6	1689831	1689836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452855652
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36271	NC_020410	CCG	2	6	1689893	1689898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452855652
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36275	NC_020410	TGT	2	6	1690190	1690195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452855652
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36301	NC_020410	TCAA	2	8	1691391	1691398	50 %	25 %	0 %	25 %	452855652
36302	NC_020410	ACG	2	6	1691419	1691424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452855652
36303	NC_020410	CGGC	2	8	1691483	1691490	0 %	0 %	50 %	50 %	452855652
36304	NC_020410	TCA	2	6	1691501	1691506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452855652
36305	NC_020410	TC	4	8	1691569	1691576	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36306	NC_020410	TCA	2	6	1691617	1691622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36307	NC_020410	T	6	6	1691636	1691641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36308	NC_020410	TC	3	6	1691706	1691711	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36309	NC_020410	CAC	2	6	1691732	1691737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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36312	NC_020410	TGGT	2	8	1691863	1691870	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36313	NC_020410	A	6	6	1691874	1691879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36314	NC_020410	TTTTA	2	10	1691907	1691916	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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36316	NC_020410	TTAA	2	8	1691953	1691960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36317	NC_020410	TTA	2	6	1692055	1692060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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36321	NC_020410	T	7	7	1692234	1692240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36322	NC_020410	TGA	2	6	1692299	1692304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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36325	NC_020410	A	6	6	1692425	1692430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36326	NC_020410	GATT	2	8	1692456	1692463	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36327	NC_020410	A	6	6	1692490	1692495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36328	NC_020410	CAA	2	6	1692536	1692541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36329	NC_020410	AATT	2	8	1692561	1692568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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36331	NC_020410	ATT	2	6	1692622	1692627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36332	NC_020410	G	7	7	1692643	1692649	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
36333	NC_020410	ATT	2	6	1692674	1692679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452855653
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36337	NC_020410	TA	3	6	1692912	1692917	50 %	50 %	0 %	0 %	452855653
36338	NC_020410	A	6	6	1692917	1692922	100 %	0 %	0 %	0 %	452855653
36339	NC_020410	CAG	2	6	1692964	1692969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36340	NC_020410	TAT	2	6	1692974	1692979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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36342	NC_020410	T	6	6	1693039	1693044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36343	NC_020410	GAT	2	6	1693052	1693057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36344	NC_020410	A	6	6	1693072	1693077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36345	NC_020410	T	7	7	1693094	1693100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36346	NC_020410	T	6	6	1693110	1693115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36347	NC_020410	TTA	2	6	1693138	1693143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36348	NC_020410	TTAAA	2	10	1693195	1693204	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36349	NC_020410	T	6	6	1693229	1693234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36350	NC_020410	GAT	2	6	1693236	1693241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36351	NC_020410	TTAAA	2	10	1693419	1693428	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36352	NC_020410	AATTT	2	10	1693488	1693497	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36353	NC_020410	TCA	3	9	1693518	1693526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36354	NC_020410	TATT	2	8	1693527	1693534	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36355	NC_020410	ATC	2	6	1693535	1693540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36356	NC_020410	A	6	6	1693541	1693546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36357	NC_020410	GCT	2	6	1693551	1693556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36358	NC_020410	CT	3	6	1693555	1693560	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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36360	NC_020410	A	6	6	1693657	1693662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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36485	NC_020410	A	7	7	1699641	1699647	100 %	0 %	0 %	0 %	452855659
36486	NC_020410	TGA	2	6	1699657	1699662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452855659
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