MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5036 complete genome

Total Repeats: 83872

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_020410	GTC	2	6	98186	98191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2002	NC_020410	TCGTG	2	10	98195	98204	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2003	NC_020410	GGA	2	6	98298	98303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2004	NC_020410	ATC	2	6	98322	98327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2005	NC_020410	AC	3	6	98349	98354	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2006	NC_020410	AC	3	6	98518	98523	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2007	NC_020410	CAC	2	6	98533	98538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2008	NC_020410	AGCC	2	8	98581	98588	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2009	NC_020410	GAT	2	6	98604	98609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2010	NC_020410	CCT	2	6	98660	98665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2011	NC_020410	GTT	2	6	98820	98825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2012	NC_020410	GGACG	2	10	98954	98963	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2013	NC_020410	AAGC	2	8	98990	98997	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2014	NC_020410	CAC	2	6	99029	99034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2015	NC_020410	GGA	2	6	99114	99119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2016	NC_020410	GCG	2	6	99148	99153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2017	NC_020410	AGG	2	6	99266	99271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2018	NC_020410	TC	3	6	99298	99303	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2019	NC_020410	CGG	2	6	99322	99327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2020	NC_020410	GGA	2	6	99354	99359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2021	NC_020410	AGT	2	6	99475	99480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2022	NC_020410	AGA	2	6	99556	99561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2023	NC_020410	CACG	2	8	99686	99693	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2024	NC_020410	TC	3	6	99759	99764	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2025	NC_020410	AGC	2	6	100017	100022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2026	NC_020410	TTC	2	6	100115	100120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2027	NC_020410	ACA	2	6	100322	100327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2028	NC_020410	ACC	2	6	100343	100348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2029	NC_020410	G	6	6	100368	100373	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2030	NC_020410	AGG	2	6	100378	100383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2031	NC_020410	GCGA	2	8	100474	100481	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2032	NC_020410	TAG	2	6	100486	100491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2033	NC_020410	GAG	2	6	100573	100578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2034	NC_020410	GA	3	6	100596	100601	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2035	NC_020410	GA	3	6	100675	100680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2036	NC_020410	CGG	2	6	100833	100838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2037	NC_020410	GA	3	6	100931	100936	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2038	NC_020410	TAGG	2	8	101049	101056	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2039	NC_020410	TAC	2	6	101103	101108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2040	NC_020410	CGC	2	6	101133	101138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2041	NC_020410	CGGG	2	8	101145	101152	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2042	NC_020410	CCT	2	6	101191	101196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2043	NC_020410	GGT	2	6	101327	101332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2044	NC_020410	CGT	2	6	101522	101527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2045	NC_020410	GAG	2	6	101571	101576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2046	NC_020410	GTT	2	6	101625	101630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2047	NC_020410	C	6	6	101698	101703	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2048	NC_020410	GAT	2	6	101749	101754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2049	NC_020410	ATCG	2	8	101810	101817	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2050	NC_020410	GA	3	6	101862	101867	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2051	NC_020410	TGG	2	6	101883	101888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2052	NC_020410	CGC	2	6	101986	101991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2053	NC_020410	TCA	2	6	102018	102023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2054	NC_020410	T	6	6	102033	102038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2055	NC_020410	TA	3	6	102057	102062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2056	NC_020410	ATA	2	6	102126	102131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2057	NC_020410	AGTCAA	2	12	102196	102207	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2058	NC_020410	AGG	2	6	102211	102216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2059	NC_020410	ATA	2	6	102231	102236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854146
2060	NC_020410	CAT	2	6	102244	102249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854146
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2062	NC_020410	AAAT	2	8	102348	102355	75 %	25 %	0 %	0 %	452854146
2063	NC_020410	TCA	2	6	102360	102365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854146
2064	NC_020410	AT	3	6	102391	102396	50 %	50 %	0 %	0 %	452854146
2065	NC_020410	GGC	2	6	102416	102421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854146
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2069	NC_020410	ATA	2	6	102474	102479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854146
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2072	NC_020410	ATG	2	6	102578	102583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854146
2073	NC_020410	TA	3	6	102609	102614	50 %	50 %	0 %	0 %	452854146
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2077	NC_020410	GTT	2	6	102753	102758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2079	NC_020410	TAT	2	6	102859	102864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2080	NC_020410	GCT	2	6	102869	102874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2094	NC_020410	AG	3	6	103737	103742	50 %	0 %	50 %	0 %	452854148
2095	NC_020410	GGGAC	2	10	103772	103781	20 %	0 %	60 %	20 %	452854148
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2099	NC_020410	GAT	2	6	103970	103975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854148
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2102	NC_020410	TGA	2	6	104202	104207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854148
2103	NC_020410	CGAA	2	8	104259	104266	50 %	0 %	25 %	25 %	452854148
2104	NC_020410	AGA	2	6	104276	104281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854148
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2112	NC_020410	A	7	7	104598	104604	100 %	0 %	0 %	0 %	452854149
2113	NC_020410	GAACA	2	10	104657	104666	60 %	0 %	20 %	20 %	452854149
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2127	NC_020410	AT	3	6	105312	105317	50 %	50 %	0 %	0 %	452854149
2128	NC_020410	GCG	2	6	105463	105468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854149
2129	NC_020410	CTTC	2	8	105501	105508	0 %	50 %	0 %	50 %	452854149
2130	NC_020410	CGAT	2	8	105518	105525	25 %	25 %	25 %	25 %	452854149
2131	NC_020410	TGA	2	6	105531	105536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854149
2132	NC_020410	GCT	2	6	105631	105636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854149
2133	NC_020410	AGC	2	6	105683	105688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854149
2134	NC_020410	GA	3	6	105693	105698	50 %	0 %	50 %	0 %	452854149
2135	NC_020410	A	7	7	105715	105721	100 %	0 %	0 %	0 %	452854149
2136	NC_020410	GAAA	2	8	105726	105733	75 %	0 %	25 %	0 %	452854149
2137	NC_020410	TTCA	2	8	105963	105970	25 %	50 %	0 %	25 %	452854149
2138	NC_020410	TGA	2	6	106038	106043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854149
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2141	NC_020410	ATG	2	6	106133	106138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854149
2142	NC_020410	GGC	2	6	106141	106146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854149
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2144	NC_020410	TGA	2	6	106194	106199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854149
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2146	NC_020410	GAGC	3	12	106328	106339	25 %	0 %	50 %	25 %	452854149
2147	NC_020410	CAA	2	6	106347	106352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854149
2148	NC_020410	A	6	6	106492	106497	100 %	0 %	0 %	0 %	452854149
2149	NC_020410	TC	3	6	106560	106565	0 %	50 %	0 %	50 %	452854149
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2154	NC_020410	AGA	2	6	106680	106685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854149
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2157	NC_020410	TA	3	6	106830	106835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2158	NC_020410	ACA	2	6	106864	106869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2159	NC_020410	ATGG	2	8	106929	106936	25 %	25 %	50 %	0 %	452854150
2160	NC_020410	TGG	2	6	106970	106975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452854150
2161	NC_020410	A	7	7	106986	106992	100 %	0 %	0 %	0 %	452854150
2162	NC_020410	CGG	2	6	107005	107010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854150
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2165	NC_020410	GAA	2	6	107104	107109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854150
2166	NC_020410	GGC	3	9	107125	107133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854150
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2168	NC_020410	CGGC	2	8	107225	107232	0 %	0 %	50 %	50 %	452854150
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2203	NC_020410	TGA	2	6	109059	109064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854151
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2214	NC_020410	TA	3	6	109318	109323	50 %	50 %	0 %	0 %	452854151
2215	NC_020410	TAT	2	6	109369	109374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2216	NC_020410	CTG	2	6	109416	109421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2232	NC_020410	AGA	2	6	109900	109905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854152
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2239	NC_020410	CGC	2	6	110106	110111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854152
2240	NC_020410	AGG	2	6	110191	110196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854152
2241	NC_020410	CGT	2	6	110237	110242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854152
2242	NC_020410	TAAA	2	8	110263	110270	75 %	25 %	0 %	0 %	452854152
2243	NC_020410	GAT	2	6	110423	110428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854152
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2246	NC_020410	TA	3	6	110451	110456	50 %	50 %	0 %	0 %	452854152
2247	NC_020410	GCG	2	6	110499	110504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854152
2248	NC_020410	CCAAGC	2	12	110521	110532	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	452854152
2249	NC_020410	TGT	2	6	110573	110578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854153
2250	NC_020410	TCA	2	6	110635	110640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854153
2251	NC_020410	TTA	2	6	110659	110664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854153
2252	NC_020410	AC	4	8	110666	110673	50 %	0 %	0 %	50 %	452854153
2253	NC_020410	AAT	2	6	110708	110713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854153
2254	NC_020410	GCT	2	6	110753	110758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854153
2255	NC_020410	TGAT	2	8	110842	110849	25 %	50 %	25 %	0 %	452854153
2256	NC_020410	GTC	2	6	110859	110864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854153
2257	NC_020410	GC	3	6	110880	110885	0 %	0 %	50 %	50 %	452854153
2258	NC_020410	CA	3	6	110894	110899	50 %	0 %	0 %	50 %	452854153
2259	NC_020410	CAG	2	6	110926	110931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854153
2260	NC_020410	AGG	2	6	110932	110937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854153
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2262	NC_020410	TCTT	2	8	111059	111066	0 %	75 %	0 %	25 %	452854153
2263	NC_020410	CTT	2	6	111104	111109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854153
2264	NC_020410	TCG	2	6	111130	111135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854153
2265	NC_020410	TCA	2	6	111311	111316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854154
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2267	NC_020410	GCT	2	6	111348	111353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854154
2268	NC_020410	TGC	2	6	111377	111382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854154
2269	NC_020410	GCT	2	6	111483	111488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854154
2270	NC_020410	GTAC	2	8	111522	111529	25 %	25 %	25 %	25 %	452854154
2271	NC_020410	ATT	2	6	111550	111555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854154
2272	NC_020410	TC	3	6	111629	111634	0 %	50 %	0 %	50 %	452854154
2273	NC_020410	CGA	3	9	111650	111658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854154
2274	NC_020410	TGG	2	6	111758	111763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2275	NC_020410	AT	3	6	111776	111781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2276	NC_020410	CGTT	2	8	111841	111848	0 %	50 %	25 %	25 %	452854155
2277	NC_020410	TATT	2	8	111908	111915	25 %	75 %	0 %	0 %	452854155
2278	NC_020410	TAT	2	6	111940	111945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854155
2279	NC_020410	CGG	2	6	112051	112056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854155
2280	NC_020410	CTT	2	6	112118	112123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854155
2281	NC_020410	GCTT	2	8	112132	112139	0 %	50 %	25 %	25 %	452854155
2282	NC_020410	GAA	3	9	112157	112165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854155
2283	NC_020410	ATC	2	6	112313	112318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854155
2284	NC_020410	A	6	6	112388	112393	100 %	0 %	0 %	0 %	452854155
2285	NC_020410	A	6	6	112574	112579	100 %	0 %	0 %	0 %	452854155
2286	NC_020410	TGA	2	6	112591	112596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854155
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2289	NC_020410	GAA	2	6	112694	112699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854155
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2292	NC_020410	AATT	2	8	112917	112924	50 %	50 %	0 %	0 %	452854155
2293	NC_020410	CTGA	2	8	112970	112977	25 %	25 %	25 %	25 %	452854155
2294	NC_020410	TGC	2	6	113065	113070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854155
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2298	NC_020410	AC	3	6	113198	113203	50 %	0 %	0 %	50 %	452854155
2299	NC_020410	TTG	2	6	113284	113289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2300	NC_020410	AGAA	2	8	113321	113328	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2301	NC_020410	GA	4	8	113341	113348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2302	NC_020410	GAA	2	6	113389	113394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2303	NC_020410	GGC	2	6	113421	113426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2304	NC_020410	CGC	2	6	113427	113432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2305	NC_020410	CG	3	6	113489	113494	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2306	NC_020410	T	7	7	113532	113538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2307	NC_020410	GA	3	6	113566	113571	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2308	NC_020410	G	6	6	113574	113579	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2309	NC_020410	T	6	6	113589	113594	0 %	100 %	0 %	0 %	452854156
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2314	NC_020410	TTC	2	6	113736	113741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854156
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2318	NC_020410	GAAAA	2	10	113917	113926	80 %	0 %	20 %	0 %	452854156
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2320	NC_020410	GTC	2	6	114087	114092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854156
2321	NC_020410	GAA	2	6	114103	114108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854156
2322	NC_020410	AGC	2	6	114175	114180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854156
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2324	NC_020410	AGGA	2	8	114294	114301	50 %	0 %	50 %	0 %	452854157
2325	NC_020410	GAC	2	6	114449	114454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854157
2326	NC_020410	GGC	2	6	114466	114471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854157
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2328	NC_020410	A	6	6	114626	114631	100 %	0 %	0 %	0 %	452854157
2329	NC_020410	CAAT	2	8	114707	114714	50 %	25 %	0 %	25 %	452854157
2330	NC_020410	TGA	2	6	114715	114720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854157
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2343	NC_020410	GAT	3	9	115310	115318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854157
2344	NC_020410	GTTTG	2	10	115343	115352	0 %	60 %	40 %	0 %	452854157
2345	NC_020410	TAC	2	6	115373	115378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854157
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2350	NC_020410	CGC	2	6	115526	115531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854157
2351	NC_020410	GCTT	2	8	115691	115698	0 %	50 %	25 %	25 %	452854158
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2357	NC_020410	CAT	2	6	116076	116081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854159
2358	NC_020410	A	6	6	116085	116090	100 %	0 %	0 %	0 %	452854159
2359	NC_020410	ATGG	2	8	116136	116143	25 %	25 %	50 %	0 %	452854159
2360	NC_020410	GCG	2	6	116198	116203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854159
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2362	NC_020410	A	6	6	116227	116232	100 %	0 %	0 %	0 %	452854159
2363	NC_020410	TGG	2	6	116243	116248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452854159
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2365	NC_020410	TA	3	6	116312	116317	50 %	50 %	0 %	0 %	452854159
2366	NC_020410	CTTT	2	8	116345	116352	0 %	75 %	0 %	25 %	452854159
2367	NC_020410	CAT	2	6	116394	116399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854159
2368	NC_020410	GACT	2	8	116459	116466	25 %	25 %	25 %	25 %	452854159
2369	NC_020410	CGT	2	6	116511	116516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854159
2370	NC_020410	TGA	2	6	116544	116549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854159
2371	NC_020410	GTC	2	6	116572	116577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854159
2372	NC_020410	CGGC	2	8	116750	116757	0 %	0 %	50 %	50 %	452854159
2373	NC_020410	TAG	2	6	116825	116830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854160
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2376	NC_020410	GA	3	6	116898	116903	50 %	0 %	50 %	0 %	452854160
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2496	NC_020410	AGG	2	6	121823	121828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2497	NC_020410	TAA	2	6	121832	121837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854168
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2500	NC_020410	GACCG	2	10	122080	122089	20 %	0 %	40 %	40 %	452854168

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