MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5036 complete genome

Total Repeats: 83872

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18003	NC_020410	A	7	7	842562	842568	100 %	0 %	0 %	0 %	452854840
18004	NC_020410	TAT	2	6	842606	842611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18005	NC_020410	ATT	2	6	842676	842681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18006	NC_020410	AT	4	8	842719	842726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18007	NC_020410	T	8	8	842840	842847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18008	NC_020410	TCC	2	6	842859	842864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18009	NC_020410	T	6	6	842910	842915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18010	NC_020410	GCTT	2	8	843080	843087	0 %	50 %	25 %	25 %	452854841
18011	NC_020410	TCA	2	6	843116	843121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854841
18012	NC_020410	GTC	2	6	843130	843135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854841
18013	NC_020410	AAT	2	6	843139	843144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854841
18014	NC_020410	CGG	2	6	843204	843209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854841
18015	NC_020410	A	6	6	843238	843243	100 %	0 %	0 %	0 %	452854841
18016	NC_020410	A	6	6	843253	843258	100 %	0 %	0 %	0 %	452854841
18017	NC_020410	TGC	2	6	843266	843271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854841
18018	NC_020410	AAGC	2	8	843351	843358	50 %	0 %	25 %	25 %	452854841
18019	NC_020410	T	6	6	843543	843548	0 %	100 %	0 %	0 %	452854841
18020	NC_020410	TAG	2	6	843563	843568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854841
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18023	NC_020410	A	6	6	843620	843625	100 %	0 %	0 %	0 %	452854841
18024	NC_020410	GT	3	6	843695	843700	0 %	50 %	50 %	0 %	452854841
18025	NC_020410	TTCA	2	8	843720	843727	25 %	50 %	0 %	25 %	452854841
18026	NC_020410	TGA	2	6	843786	843791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854841
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18034	NC_020410	CAG	2	6	844136	844141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854841
18035	NC_020410	TAT	2	6	844331	844336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854841
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18037	NC_020410	TGT	2	6	844434	844439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854841
18038	NC_020410	CGC	2	6	844476	844481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854841
18039	NC_020410	G	6	6	844558	844563	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18040	NC_020410	A	6	6	844596	844601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18041	NC_020410	TGA	2	6	844606	844611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854842
18042	NC_020410	ATT	2	6	844623	844628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854842
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18048	NC_020410	TA	3	6	844871	844876	50 %	50 %	0 %	0 %	452854842
18049	NC_020410	CGG	3	9	844880	844888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854842
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18052	NC_020410	GAA	2	6	845007	845012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854842
18053	NC_020410	GA	3	6	845039	845044	50 %	0 %	50 %	0 %	452854842
18054	NC_020410	GCCG	2	8	845107	845114	0 %	0 %	50 %	50 %	452854842
18055	NC_020410	AGAAA	2	10	845135	845144	80 %	0 %	20 %	0 %	452854842
18056	NC_020410	AGGG	2	8	845148	845155	25 %	0 %	75 %	0 %	452854842
18057	NC_020410	TGA	2	6	845165	845170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854842
18058	NC_020410	GCGCT	2	10	845173	845182	0 %	20 %	40 %	40 %	452854842
18059	NC_020410	TCC	2	6	845217	845222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452854842
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18061	NC_020410	ATA	2	6	845312	845317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854842
18062	NC_020410	T	8	8	845321	845328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18063	NC_020410	GA	4	8	845395	845402	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18064	NC_020410	GCG	2	6	845404	845409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18065	NC_020410	CTT	2	6	845411	845416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18066	NC_020410	TAT	2	6	845467	845472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18067	NC_020410	TGA	2	6	845476	845481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18068	NC_020410	AAT	2	6	845486	845491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18069	NC_020410	TTTC	2	8	845494	845501	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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18071	NC_020410	T	7	7	845535	845541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18072	NC_020410	GTGCTG	2	12	845542	845553	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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18091	NC_020410	ACG	2	6	846509	846514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854843
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18098	NC_020410	CGGCG	2	10	846907	846916	0 %	0 %	60 %	40 %	452854843
18099	NC_020410	TGA	2	6	846988	846993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854843
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18101	NC_020410	ATG	2	6	847164	847169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854843
18102	NC_020410	GAAA	2	8	847315	847322	75 %	0 %	25 %	0 %	452854843
18103	NC_020410	AAAAG	2	10	847365	847374	80 %	0 %	20 %	0 %	452854843
18104	NC_020410	CATCTT	2	12	847393	847404	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18106	NC_020410	GCG	2	6	847430	847435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854844
18107	NC_020410	AT	3	6	847457	847462	50 %	50 %	0 %	0 %	452854844
18108	NC_020410	TTGAC	2	10	847483	847492	20 %	40 %	20 %	20 %	452854844
18109	NC_020410	TCTT	2	8	847626	847633	0 %	75 %	0 %	25 %	452854844
18110	NC_020410	CAG	2	6	847637	847642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854844
18111	NC_020410	AT	3	6	847657	847662	50 %	50 %	0 %	0 %	452854844
18112	NC_020410	TTGCG	2	10	847676	847685	0 %	40 %	40 %	20 %	452854844
18113	NC_020410	TAG	2	6	847687	847692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854844
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18118	NC_020410	TTCG	2	8	847761	847768	0 %	50 %	25 %	25 %	452854844
18119	NC_020410	CG	3	6	847803	847808	0 %	0 %	50 %	50 %	452854844
18120	NC_020410	A	6	6	847881	847886	100 %	0 %	0 %	0 %	452854844
18121	NC_020410	TAA	2	6	847898	847903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854844
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18123	NC_020410	TGA	2	6	848043	848048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854844
18124	NC_020410	ATC	2	6	848109	848114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854844
18125	NC_020410	A	6	6	848132	848137	100 %	0 %	0 %	0 %	452854844
18126	NC_020410	CAT	2	6	848169	848174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854844
18127	NC_020410	GGA	2	6	848303	848308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854844
18128	NC_020410	AAGT	2	8	848318	848325	50 %	25 %	25 %	0 %	452854844
18129	NC_020410	TCC	2	6	848352	848357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452854844
18130	NC_020410	TTC	2	6	848503	848508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854844
18131	NC_020410	TGTT	2	8	848635	848642	0 %	75 %	25 %	0 %	452854844
18132	NC_020410	ATG	2	6	848656	848661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854844
18133	NC_020410	GCA	2	6	848701	848706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854844
18134	NC_020410	T	6	6	848724	848729	0 %	100 %	0 %	0 %	452854844
18135	NC_020410	TGT	2	6	848748	848753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854844
18136	NC_020410	TCAC	2	8	848767	848774	25 %	25 %	0 %	50 %	452854844
18137	NC_020410	GA	3	6	848819	848824	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18138	NC_020410	GGAA	2	8	848844	848851	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18139	NC_020410	TG	3	6	848886	848891	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18140	NC_020410	T	6	6	848973	848978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18141	NC_020410	ATGA	2	8	848990	848997	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18142	NC_020410	A	6	6	849028	849033	100 %	0 %	0 %	0 %	452854845
18143	NC_020410	A	6	6	849059	849064	100 %	0 %	0 %	0 %	452854845
18144	NC_020410	A	6	6	849067	849072	100 %	0 %	0 %	0 %	452854845
18145	NC_020410	AAAC	2	8	849115	849122	75 %	0 %	0 %	25 %	452854845
18146	NC_020410	TA	3	6	849161	849166	50 %	50 %	0 %	0 %	452854845
18147	NC_020410	AGAT	2	8	849168	849175	50 %	25 %	25 %	0 %	452854845
18148	NC_020410	GA	3	6	849208	849213	50 %	0 %	50 %	0 %	452854846
18149	NC_020410	GGA	2	6	849218	849223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854846
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18152	NC_020410	GCG	2	6	849307	849312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854846
18153	NC_020410	GAA	2	6	849322	849327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854846
18154	NC_020410	CGG	2	6	849374	849379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854846
18155	NC_020410	TTG	2	6	849416	849421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854846
18156	NC_020410	GT	3	6	849443	849448	0 %	50 %	50 %	0 %	452854846
18157	NC_020410	A	6	6	849606	849611	100 %	0 %	0 %	0 %	452854846
18158	NC_020410	CTG	2	6	849670	849675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854846
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18162	NC_020410	TGA	2	6	849783	849788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854846
18163	NC_020410	GCT	2	6	849831	849836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854846
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18175	NC_020410	ACAA	2	8	850592	850599	75 %	0 %	0 %	25 %	452854846
18176	NC_020410	GCC	2	6	850609	850614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854846
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18178	NC_020410	AAAAG	2	10	850753	850762	80 %	0 %	20 %	0 %	452854846
18179	NC_020410	ATT	2	6	850877	850882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854846
18180	NC_020410	TC	3	6	850899	850904	0 %	50 %	0 %	50 %	452854846
18181	NC_020410	TCAAT	2	10	850912	850921	40 %	40 %	0 %	20 %	452854846
18182	NC_020410	AGG	2	6	850978	850983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18183	NC_020410	ATTC	2	8	851015	851022	25 %	50 %	0 %	25 %	452854847
18184	NC_020410	TAT	2	6	851054	851059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854847
18185	NC_020410	T	7	7	851059	851065	0 %	100 %	0 %	0 %	452854847
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18188	NC_020410	T	7	7	851417	851423	0 %	100 %	0 %	0 %	452854847
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18229	NC_020410	GCG	2	6	853332	853337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854849
18230	NC_020410	TGC	2	6	853341	853346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854849
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18239	NC_020410	AG	3	6	853826	853831	50 %	0 %	50 %	0 %	452854849
18240	NC_020410	A	6	6	853875	853880	100 %	0 %	0 %	0 %	452854850
18241	NC_020410	GAG	2	6	853887	853892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854850
18242	NC_020410	G	6	6	853896	853901	0 %	0 %	100 %	0 %	452854850
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18244	NC_020410	A	6	6	854041	854046	100 %	0 %	0 %	0 %	452854850
18245	NC_020410	T	6	6	854061	854066	0 %	100 %	0 %	0 %	452854850
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18263	NC_020410	T	6	6	854869	854874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18371	NC_020410	GCT	2	6	859819	859824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854855
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18384	NC_020410	GGGA	2	8	860428	860435	25 %	0 %	75 %	0 %	452854856
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18434	NC_020410	T	6	6	862744	862749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18435	NC_020410	A	9	9	862765	862773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18436	NC_020410	A	7	7	862812	862818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18442	NC_020410	A	6	6	862967	862972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18487	NC_020410	CGG	2	6	865281	865286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854862
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18491	NC_020410	GAA	2	6	865625	865630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854862
18492	NC_020410	CAG	2	6	865750	865755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854862
18493	NC_020410	T	6	6	865814	865819	0 %	100 %	0 %	0 %	452854862
18494	NC_020410	GAT	2	6	865829	865834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854862
18495	NC_020410	TAAT	2	8	865847	865854	50 %	50 %	0 %	0 %	452854862
18496	NC_020410	TGG	2	6	865862	865867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18497	NC_020410	A	6	6	865875	865880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18498	NC_020410	CCGC	2	8	865993	866000	0 %	0 %	25 %	75 %	452854863
18499	NC_020410	GAT	2	6	866015	866020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854863
18500	NC_020410	GC	3	6	866032	866037	0 %	0 %	50 %	50 %	452854863

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