MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5036 complete genome

Total Repeats: 83872

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_020410	GAT	2	6	656665	656670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854664
14003	NC_020410	AATC	2	8	656769	656776	50 %	25 %	0 %	25 %	452854664
14004	NC_020410	GCC	2	6	656787	656792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854664
14005	NC_020410	CGA	2	6	656803	656808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854664
14006	NC_020410	TTTC	2	8	656810	656817	0 %	75 %	0 %	25 %	452854664
14007	NC_020410	A	6	6	656838	656843	100 %	0 %	0 %	0 %	452854664
14008	NC_020410	TC	3	6	656855	656860	0 %	50 %	0 %	50 %	452854664
14009	NC_020410	CTGA	2	8	656870	656877	25 %	25 %	25 %	25 %	452854664
14010	NC_020410	GAAG	2	8	656914	656921	50 %	0 %	50 %	0 %	452854664
14011	NC_020410	CGC	2	6	656965	656970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854664
14012	NC_020410	GAA	2	6	657011	657016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854664
14013	NC_020410	GAA	2	6	657047	657052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854664
14014	NC_020410	GAA	3	9	657062	657070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854664
14015	NC_020410	GAA	3	9	657104	657112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854664
14016	NC_020410	GAA	2	6	657223	657228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854664
14017	NC_020410	GAA	2	6	657249	657254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854664
14018	NC_020410	TCCCG	2	10	657281	657290	0 %	20 %	20 %	60 %	452854664
14019	NC_020410	GGC	2	6	657311	657316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854664
14020	NC_020410	A	6	6	657356	657361	100 %	0 %	0 %	0 %	452854664
14021	NC_020410	AGGAA	2	10	657495	657504	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
14022	NC_020410	ATG	2	6	657509	657514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854665
14023	NC_020410	AGA	2	6	657541	657546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854665
14024	NC_020410	CA	3	6	657691	657696	50 %	0 %	0 %	50 %	452854665
14025	NC_020410	GCA	2	6	657736	657741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854665
14026	NC_020410	GAT	3	9	657779	657787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854665
14027	NC_020410	CCG	2	6	657802	657807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854665
14028	NC_020410	TC	3	6	657875	657880	0 %	50 %	0 %	50 %	452854665
14029	NC_020410	GAA	2	6	658058	658063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854665
14030	NC_020410	CTCA	2	8	658117	658124	25 %	25 %	0 %	50 %	452854665
14031	NC_020410	CGAAA	2	10	658149	658158	60 %	0 %	20 %	20 %	452854665
14032	NC_020410	AAAC	2	8	658254	658261	75 %	0 %	0 %	25 %	452854665
14033	NC_020410	A	6	6	658271	658276	100 %	0 %	0 %	0 %	452854665
14034	NC_020410	TCA	2	6	658362	658367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854665
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14036	NC_020410	CGG	2	6	658446	658451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854665
14037	NC_020410	GAA	2	6	658494	658499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854665
14038	NC_020410	CCG	2	6	658518	658523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854665
14039	NC_020410	ACG	2	6	658550	658555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854665
14040	NC_020410	TTAA	2	8	658586	658593	50 %	50 %	0 %	0 %	452854665
14041	NC_020410	GTC	2	6	658625	658630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854665
14042	NC_020410	A	6	6	658631	658636	100 %	0 %	0 %	0 %	452854665
14043	NC_020410	CAT	2	6	658645	658650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854665
14044	NC_020410	GTC	2	6	658658	658663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854665
14045	NC_020410	GAA	2	6	658691	658696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854665
14046	NC_020410	CGCTG	2	10	658767	658776	0 %	20 %	40 %	40 %	452854665
14047	NC_020410	TCA	2	6	658869	658874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854665
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14049	NC_020410	TCCA	2	8	658991	658998	25 %	25 %	0 %	50 %	452854665
14050	NC_020410	CTG	2	6	659027	659032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854665
14051	NC_020410	GAA	2	6	659123	659128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854665
14052	NC_020410	GCT	2	6	659131	659136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854665
14053	NC_020410	AGA	2	6	659194	659199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854665
14054	NC_020410	TGAA	2	8	659214	659221	50 %	25 %	25 %	0 %	452854665
14055	NC_020410	AC	3	6	659241	659246	50 %	0 %	0 %	50 %	452854665
14056	NC_020410	A	6	6	659261	659266	100 %	0 %	0 %	0 %	452854665
14057	NC_020410	GGA	2	6	659275	659280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854665
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14059	NC_020410	A	7	7	659402	659408	100 %	0 %	0 %	0 %	452854665
14060	NC_020410	AAGC	2	8	659440	659447	50 %	0 %	25 %	25 %	452854665
14061	NC_020410	GGC	2	6	659554	659559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854666
14062	NC_020410	CGG	2	6	659568	659573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854666
14063	NC_020410	G	6	6	659609	659614	0 %	0 %	100 %	0 %	452854666
14064	NC_020410	TCT	2	6	659651	659656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854666
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14068	NC_020410	GCTC	2	8	659803	659810	0 %	25 %	25 %	50 %	452854666
14069	NC_020410	A	6	6	659894	659899	100 %	0 %	0 %	0 %	452854666
14070	NC_020410	TGC	2	6	659967	659972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854666
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14072	NC_020410	GCA	2	6	660145	660150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854666
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14082	NC_020410	T	7	7	660767	660773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14086	NC_020410	TGA	2	6	660905	660910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14087	NC_020410	AC	4	8	660927	660934	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14088	NC_020410	GCAT	2	8	660966	660973	25 %	25 %	25 %	25 %	452854667
14089	NC_020410	GCTG	2	8	661009	661016	0 %	25 %	50 %	25 %	452854667
14090	NC_020410	AGA	2	6	661133	661138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854667
14091	NC_020410	AT	3	6	661147	661152	50 %	50 %	0 %	0 %	452854667
14092	NC_020410	TCA	2	6	661174	661179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854667
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14097	NC_020410	TA	3	6	661410	661415	50 %	50 %	0 %	0 %	452854667
14098	NC_020410	AGC	2	6	661440	661445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854667
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14103	NC_020410	CTG	2	6	661664	661669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854667
14104	NC_020410	ACA	2	6	661671	661676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854667
14105	NC_020410	TGT	2	6	661677	661682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854667
14106	NC_020410	GAA	2	6	661760	661765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854667
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14108	NC_020410	ATT	2	6	661837	661842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854667
14109	NC_020410	T	7	7	661996	662002	0 %	100 %	0 %	0 %	452854668
14110	NC_020410	CGA	2	6	662024	662029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854668
14111	NC_020410	ATA	2	6	662052	662057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854668
14112	NC_020410	GTG	2	6	662065	662070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452854668
14113	NC_020410	ATC	2	6	662130	662135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854668
14114	NC_020410	CGGA	2	8	662140	662147	25 %	0 %	50 %	25 %	452854668
14115	NC_020410	GAA	2	6	662279	662284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854668
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14117	NC_020410	GTC	2	6	662389	662394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854668
14118	NC_020410	GCGGA	2	10	662478	662487	20 %	0 %	60 %	20 %	452854668
14119	NC_020410	CAT	2	6	662490	662495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854668
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14121	NC_020410	GAT	2	6	662625	662630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854668
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14123	NC_020410	TAA	2	6	662723	662728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14124	NC_020410	GAA	2	6	662772	662777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14125	NC_020410	A	6	6	662776	662781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14162	NC_020410	TCA	2	6	664612	664617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14238	NC_020410	A	7	7	667919	667925	100 %	0 %	0 %	0 %	452854672
14239	NC_020410	GCC	2	6	667929	667934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14240	NC_020410	GCT	2	6	667944	667949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14241	NC_020410	T	7	7	667978	667984	0 %	100 %	0 %	0 %	452854673
14242	NC_020410	CTGC	2	8	668041	668048	0 %	25 %	25 %	50 %	452854673
14243	NC_020410	TAA	2	6	668069	668074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854673
14244	NC_020410	CTG	2	6	668151	668156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854673
14245	NC_020410	CCG	2	6	668198	668203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854673
14246	NC_020410	GCA	2	6	668228	668233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854673
14247	NC_020410	ATC	2	6	668271	668276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854673
14248	NC_020410	GCC	2	6	668296	668301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854673
14249	NC_020410	TCCG	2	8	668308	668315	0 %	25 %	25 %	50 %	452854673
14250	NC_020410	GAT	2	6	668529	668534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854673
14251	NC_020410	TTC	2	6	668637	668642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854673
14252	NC_020410	TCT	2	6	668686	668691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854673
14253	NC_020410	TTTGA	2	10	668692	668701	20 %	60 %	20 %	0 %	452854673
14254	NC_020410	GTT	2	6	668758	668763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854673
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14256	NC_020410	T	6	6	668775	668780	0 %	100 %	0 %	0 %	452854673
14257	NC_020410	AAAT	2	8	668784	668791	75 %	25 %	0 %	0 %	452854673
14258	NC_020410	T	8	8	668817	668824	0 %	100 %	0 %	0 %	452854673
14259	NC_020410	TTA	2	6	668878	668883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14260	NC_020410	TAT	2	6	668912	668917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14261	NC_020410	CAGT	2	8	668928	668935	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14262	NC_020410	GGA	2	6	668950	668955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14263	NC_020410	ATG	2	6	668957	668962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854674
14264	NC_020410	ATT	2	6	668969	668974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854674
14265	NC_020410	GAA	2	6	668986	668991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854674
14266	NC_020410	TGA	2	6	669009	669014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854674
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14268	NC_020410	GCT	2	6	669122	669127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854674
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14271	NC_020410	GAC	2	6	669317	669322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854674
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14273	NC_020410	CAG	2	6	669491	669496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854674
14274	NC_020410	A	7	7	669527	669533	100 %	0 %	0 %	0 %	452854674
14275	NC_020410	TGA	2	6	669550	669555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854674
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14280	NC_020410	GCG	2	6	669749	669754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854674
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14282	NC_020410	CAG	2	6	669792	669797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854674
14283	NC_020410	A	6	6	669845	669850	100 %	0 %	0 %	0 %	452854674
14284	NC_020410	A	6	6	669968	669973	100 %	0 %	0 %	0 %	452854674
14285	NC_020410	GAT	2	6	670120	670125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854674
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14287	NC_020410	CTT	2	6	670163	670168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854674
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14295	NC_020410	A	6	6	670592	670597	100 %	0 %	0 %	0 %	452854674
14296	NC_020410	TGC	2	6	670599	670604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854674
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14299	NC_020410	CGAAA	2	10	670753	670762	60 %	0 %	20 %	20 %	452854674
14300	NC_020410	TGC	2	6	670800	670805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854674
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14303	NC_020410	CAA	3	9	671008	671016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854674
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14307	NC_020410	AGCA	2	8	671180	671187	50 %	0 %	25 %	25 %	452854674
14308	NC_020410	AAG	2	6	671361	671366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854674
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14310	NC_020410	AAAG	2	8	671503	671510	75 %	0 %	25 %	0 %	452854674
14311	NC_020410	CGG	2	6	671551	671556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854674
14312	NC_020410	CGG	2	6	671650	671655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854674
14313	NC_020410	TGTA	2	8	671721	671728	25 %	50 %	25 %	0 %	452854674
14314	NC_020410	GA	3	6	671733	671738	50 %	0 %	50 %	0 %	452854674
14315	NC_020410	ATGCTG	2	12	671765	671776	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	452854674
14316	NC_020410	TCG	2	6	671784	671789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854674
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14318	NC_020410	CGA	2	6	671847	671852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854674
14319	NC_020410	GA	3	6	671851	671856	50 %	0 %	50 %	0 %	452854674
14320	NC_020410	TGA	2	6	671898	671903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854674
14321	NC_020410	CATTGG	2	12	671934	671945	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	452854674
14322	NC_020410	CGG	2	6	671998	672003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854674
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14325	NC_020410	T	6	6	672141	672146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14326	NC_020410	TTG	2	6	672169	672174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14327	NC_020410	GTT	2	6	672205	672210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14328	NC_020410	TAA	2	6	672216	672221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14329	NC_020410	GAT	2	6	672244	672249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14332	NC_020410	CCA	2	6	672392	672397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452854675
14333	NC_020410	CGC	2	6	672399	672404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854675
14334	NC_020410	AAG	2	6	672407	672412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854675
14335	NC_020410	CGG	2	6	672447	672452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854675
14336	NC_020410	GTC	2	6	672472	672477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854675
14337	NC_020410	CAT	2	6	672516	672521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854675
14338	NC_020410	GA	4	8	672567	672574	50 %	0 %	50 %	0 %	452854675
14339	NC_020410	GCCC	2	8	672613	672620	0 %	0 %	25 %	75 %	452854675
14340	NC_020410	CGG	2	6	672666	672671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854675
14341	NC_020410	ATG	2	6	672695	672700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854675
14342	NC_020410	GCTT	2	8	672732	672739	0 %	50 %	25 %	25 %	452854675
14343	NC_020410	ATT	2	6	672740	672745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854675
14344	NC_020410	TGC	2	6	672761	672766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854675
14345	NC_020410	CGAC	2	8	672775	672782	25 %	0 %	25 %	50 %	452854675
14346	NC_020410	TCGG	2	8	672856	672863	0 %	25 %	50 %	25 %	452854675
14347	NC_020410	ATT	2	6	672919	672924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854675
14348	NC_020410	A	6	6	672928	672933	100 %	0 %	0 %	0 %	452854675
14349	NC_020410	ATT	2	6	673003	673008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854675
14350	NC_020410	CGG	2	6	673077	673082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854675
14351	NC_020410	TGC	2	6	673085	673090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854675
14352	NC_020410	TCA	2	6	673127	673132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854675
14353	NC_020410	GAT	2	6	673159	673164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854675
14354	NC_020410	ATGAAA	2	12	673315	673326	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	452854676
14355	NC_020410	A	7	7	673337	673343	100 %	0 %	0 %	0 %	452854676
14356	NC_020410	ATG	2	6	673352	673357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854676
14357	NC_020410	CCTG	2	8	673434	673441	0 %	25 %	25 %	50 %	452854676
14358	NC_020410	A	6	6	673474	673479	100 %	0 %	0 %	0 %	452854676
14359	NC_020410	GAAG	2	8	673509	673516	50 %	0 %	50 %	0 %	452854676
14360	NC_020410	ACAA	2	8	673553	673560	75 %	0 %	0 %	25 %	452854676
14361	NC_020410	GCG	2	6	673562	673567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854676
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14363	NC_020410	AAG	2	6	673779	673784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854676
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14486	NC_020410	GTG	2	6	678796	678801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452854681
14487	NC_020410	CCTT	2	8	678811	678818	0 %	50 %	0 %	50 %	452854681
14488	NC_020410	CTTT	2	8	678848	678855	0 %	75 %	0 %	25 %	452854681
14489	NC_020410	CGG	2	6	678897	678902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854681
14490	NC_020410	CTT	2	6	678986	678991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854681
14491	NC_020410	CGCC	2	8	679025	679032	0 %	0 %	25 %	75 %	452854681
14492	NC_020410	GAT	2	6	679052	679057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854681
14493	NC_020410	GATTT	2	10	679089	679098	20 %	60 %	20 %	0 %	452854681
14494	NC_020410	T	7	7	679116	679122	0 %	100 %	0 %	0 %	452854681
14495	NC_020410	TTTG	2	8	679148	679155	0 %	75 %	25 %	0 %	452854681
14496	NC_020410	GTTT	2	8	679168	679175	0 %	75 %	25 %	0 %	452854681
14497	NC_020410	TGCT	2	8	679211	679218	0 %	50 %	25 %	25 %	452854681
14498	NC_020410	GGC	2	6	679245	679250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854681
14499	NC_020410	CGA	2	6	679289	679294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854681
14500	NC_020410	TTC	2	6	679380	679385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854681

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