MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5036 complete genome

Total Repeats: 83872

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13502	NC_020410	CGC	2	6	633625	633630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854642
13503	NC_020410	ATG	2	6	633690	633695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854642
13504	NC_020410	AAAGGA	2	12	633765	633776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854642
13505	NC_020410	TCT	2	6	633832	633837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854642
13506	NC_020410	T	6	6	633872	633877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13507	NC_020410	ATAC	2	8	633903	633910	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13508	NC_020410	GAA	2	6	633938	633943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13509	NC_020410	TA	3	6	633978	633983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13510	NC_020410	CCG	2	6	634012	634017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13511	NC_020410	T	7	7	634020	634026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13512	NC_020410	GAA	2	6	634049	634054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854643
13513	NC_020410	AGAAA	2	10	634055	634064	80 %	0 %	20 %	0 %	452854643
13514	NC_020410	GAA	3	9	634070	634078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854643
13515	NC_020410	TGA	2	6	634096	634101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854643
13516	NC_020410	CAAAAG	2	12	634142	634153	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	452854643
13517	NC_020410	A	6	6	634154	634159	100 %	0 %	0 %	0 %	452854643
13518	NC_020410	CCGGCT	2	12	634175	634186	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	452854643
13519	NC_020410	CAT	2	6	634406	634411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854643
13520	NC_020410	T	6	6	634415	634420	0 %	100 %	0 %	0 %	452854643
13521	NC_020410	CGT	2	6	634432	634437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854643
13522	NC_020410	T	6	6	634457	634462	0 %	100 %	0 %	0 %	452854643
13523	NC_020410	CGGC	2	8	634470	634477	0 %	0 %	50 %	50 %	452854643
13524	NC_020410	ATG	2	6	634502	634507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854643
13525	NC_020410	GAT	2	6	634588	634593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854643
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13527	NC_020410	GTG	2	6	634625	634630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452854643
13528	NC_020410	GCC	2	6	634655	634660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854643
13529	NC_020410	CGG	2	6	634740	634745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854643
13530	NC_020410	TCA	3	9	634746	634754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854643
13531	NC_020410	TAA	2	6	634863	634868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13532	NC_020410	GTT	2	6	634874	634879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13533	NC_020410	AT	3	6	634895	634900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13534	NC_020410	ACT	2	6	634930	634935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13535	NC_020410	GAT	2	6	634954	634959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854644
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13537	NC_020410	A	6	6	634997	635002	100 %	0 %	0 %	0 %	452854644
13538	NC_020410	A	6	6	635117	635122	100 %	0 %	0 %	0 %	452854644
13539	NC_020410	GCGGG	2	10	635160	635169	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
13540	NC_020410	T	8	8	635171	635178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13541	NC_020410	ATG	2	6	635188	635193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13542	NC_020410	AGG	2	6	635245	635250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13543	NC_020410	ATG	2	6	635259	635264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854645
13544	NC_020410	ATT	2	6	635301	635306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854645
13545	NC_020410	TCA	2	6	635308	635313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854645
13546	NC_020410	TA	3	6	635321	635326	50 %	50 %	0 %	0 %	452854645
13547	NC_020410	TCTT	2	8	635331	635338	0 %	75 %	0 %	25 %	452854645
13548	NC_020410	GAT	2	6	635348	635353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854645
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13550	NC_020410	TGTA	2	8	635413	635420	25 %	50 %	25 %	0 %	452854645
13551	NC_020410	GAA	2	6	635520	635525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854645
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13553	NC_020410	GACCG	2	10	635649	635658	20 %	0 %	40 %	40 %	452854645
13554	NC_020410	CGC	2	6	635674	635679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854645
13555	NC_020410	ATC	2	6	635736	635741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854645
13556	NC_020410	CGG	2	6	635765	635770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854645
13557	NC_020410	GAA	2	6	635789	635794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854645
13558	NC_020410	GAG	2	6	635795	635800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854645
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13560	NC_020410	GAAG	2	8	635881	635888	50 %	0 %	50 %	0 %	452854646
13561	NC_020410	CGG	2	6	635906	635911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854646
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13563	NC_020410	A	7	7	635975	635981	100 %	0 %	0 %	0 %	452854646
13564	NC_020410	AGAA	2	8	636022	636029	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13565	NC_020410	GTT	2	6	636072	636077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13566	NC_020410	CG	3	6	636225	636230	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13567	NC_020410	T	9	9	636279	636287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13568	NC_020410	ATC	2	6	636339	636344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854647
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13582	NC_020410	A	7	7	636811	636817	100 %	0 %	0 %	0 %	452854648
13583	NC_020410	ATG	2	6	636871	636876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854648
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13592	NC_020410	CGG	2	6	637257	637262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854648
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13594	NC_020410	GACA	2	8	637301	637308	50 %	0 %	25 %	25 %	452854648
13595	NC_020410	GCTGT	2	10	637318	637327	0 %	40 %	40 %	20 %	452854648
13596	NC_020410	GCT	2	6	637429	637434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854648
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13602	NC_020410	GGA	2	6	637776	637781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854648
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13605	NC_020410	TGA	2	6	637881	637886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854648
13606	NC_020410	GGA	2	6	637930	637935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854648
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13614	NC_020410	TTG	2	6	638302	638307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854649
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13622	NC_020410	GGC	2	6	638612	638617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854649
13623	NC_020410	CGA	2	6	638632	638637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854649
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13625	NC_020410	GC	3	6	638784	638789	0 %	0 %	50 %	50 %	452854649
13626	NC_020410	TCAT	2	8	638855	638862	25 %	50 %	0 %	25 %	452854649
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13865	NC_020410	CATC	2	8	650399	650406	25 %	25 %	0 %	50 %	452854659
13866	NC_020410	TCT	2	6	650471	650476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854659
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13870	NC_020410	GAAT	2	8	650523	650530	50 %	25 %	25 %	0 %	452854659
13871	NC_020410	GGA	2	6	650547	650552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854659
13872	NC_020410	CGAT	2	8	650564	650571	25 %	25 %	25 %	25 %	452854659
13873	NC_020410	CCT	2	6	650585	650590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452854659
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13877	NC_020410	GCTT	2	8	650649	650656	0 %	50 %	25 %	25 %	452854659
13878	NC_020410	CTG	2	6	650719	650724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854659
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13895	NC_020410	TGC	2	6	651449	651454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854660
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13983	NC_020410	A	6	6	655811	655816	100 %	0 %	0 %	0 %	452854664
13984	NC_020410	CTG	2	6	655817	655822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854664
13985	NC_020410	TGA	2	6	655843	655848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854664
13986	NC_020410	GAC	2	6	655858	655863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854664
13987	NC_020410	AGC	2	6	655977	655982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854664
13988	NC_020410	CGT	2	6	656008	656013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854664
13989	NC_020410	TCCTT	2	10	656067	656076	0 %	60 %	0 %	40 %	452854664
13990	NC_020410	CAA	2	6	656130	656135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854664
13991	NC_020410	GGC	2	6	656149	656154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854664
13992	NC_020410	TTA	2	6	656233	656238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854664
13993	NC_020410	GCG	2	6	656241	656246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854664
13994	NC_020410	TCG	2	6	656271	656276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854664
13995	NC_020410	CGG	2	6	656309	656314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854664
13996	NC_020410	CG	3	6	656358	656363	0 %	0 %	50 %	50 %	452854664
13997	NC_020410	TCG	2	6	656406	656411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854664
13998	NC_020410	GAAA	2	8	656434	656441	75 %	0 %	25 %	0 %	452854664
13999	NC_020410	GAC	3	9	656483	656491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854664
14000	NC_020410	A	6	6	656550	656555	100 %	0 %	0 %	0 %	452854664

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