MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5036 complete genome

Total Repeats: 83872

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_020410	GAA	2	6	588529	588534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854600
12502	NC_020410	CGG	2	6	588547	588552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854600
12503	NC_020410	TTGG	2	8	588566	588573	0 %	50 %	50 %	0 %	452854600
12504	NC_020410	GGAA	2	8	588663	588670	50 %	0 %	50 %	0 %	452854600
12505	NC_020410	A	6	6	588719	588724	100 %	0 %	0 %	0 %	452854600
12506	NC_020410	GAA	2	6	588794	588799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854601
12507	NC_020410	CTT	2	6	588825	588830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854601
12508	NC_020410	AAC	2	6	588883	588888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854601
12509	NC_020410	GGA	2	6	589012	589017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854601
12510	NC_020410	GAA	2	6	589040	589045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854601
12511	NC_020410	CTGC	2	8	589103	589110	0 %	25 %	25 %	50 %	452854601
12512	NC_020410	TCA	2	6	589128	589133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854601
12513	NC_020410	TGA	2	6	589144	589149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854601
12514	NC_020410	GAG	2	6	589202	589207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854601
12515	NC_020410	ATAA	2	8	589208	589215	75 %	25 %	0 %	0 %	452854601
12516	NC_020410	TCGT	2	8	589267	589274	0 %	50 %	25 %	25 %	452854602
12517	NC_020410	A	6	6	589310	589315	100 %	0 %	0 %	0 %	452854602
12518	NC_020410	CTG	2	6	589339	589344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854602
12519	NC_020410	GGC	2	6	589514	589519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854602
12520	NC_020410	ACGG	2	8	589522	589529	25 %	0 %	50 %	25 %	452854602
12521	NC_020410	TA	3	6	589579	589584	50 %	50 %	0 %	0 %	452854602
12522	NC_020410	TTC	2	6	589624	589629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854602
12523	NC_020410	GAAA	2	8	589670	589677	75 %	0 %	25 %	0 %	452854602
12524	NC_020410	GAA	2	6	589722	589727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854602
12525	NC_020410	ATT	2	6	589855	589860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854602
12526	NC_020410	TGGA	2	8	589887	589894	25 %	25 %	50 %	0 %	452854602
12527	NC_020410	GAAAAC	2	12	589920	589931	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	452854603
12528	NC_020410	ATT	2	6	590107	590112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854603
12529	NC_020410	GTT	2	6	590181	590186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854603
12530	NC_020410	A	7	7	590213	590219	100 %	0 %	0 %	0 %	452854603
12531	NC_020410	AAG	2	6	590223	590228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854603
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12533	NC_020410	ATC	2	6	590255	590260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854603
12534	NC_020410	TA	3	6	590273	590278	50 %	50 %	0 %	0 %	452854603
12535	NC_020410	A	6	6	590278	590283	100 %	0 %	0 %	0 %	452854603
12536	NC_020410	GGA	2	6	590299	590304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854603
12537	NC_020410	TTA	2	6	590344	590349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854603
12538	NC_020410	TGA	2	6	590413	590418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854604
12539	NC_020410	A	6	6	590437	590442	100 %	0 %	0 %	0 %	452854604
12540	NC_020410	ATT	2	6	590453	590458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854604
12541	NC_020410	CGG	2	6	590500	590505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854604
12542	NC_020410	CAT	2	6	590531	590536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854604
12543	NC_020410	TGA	2	6	590593	590598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854604
12544	NC_020410	TCA	2	6	590710	590715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854604
12545	NC_020410	GCTT	2	8	590770	590777	0 %	50 %	25 %	25 %	452854604
12546	NC_020410	GAT	2	6	590855	590860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854604
12547	NC_020410	GCTG	2	8	590935	590942	0 %	25 %	50 %	25 %	452854604
12548	NC_020410	ATTCC	2	10	590955	590964	20 %	40 %	0 %	40 %	452854604
12549	NC_020410	CGTG	2	8	590972	590979	0 %	25 %	50 %	25 %	452854604
12550	NC_020410	GAA	2	6	590984	590989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854604
12551	NC_020410	TTCAGC	2	12	591002	591013	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	452854604
12552	NC_020410	A	7	7	591057	591063	100 %	0 %	0 %	0 %	452854604
12553	NC_020410	TCC	2	6	591073	591078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452854604
12554	NC_020410	GGA	2	6	591079	591084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854604
12555	NC_020410	CAG	2	6	591101	591106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854604
12556	NC_020410	TGC	2	6	591171	591176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854604
12557	NC_020410	GCA	2	6	591220	591225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854604
12558	NC_020410	ATC	2	6	591257	591262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854604
12559	NC_020410	CCG	2	6	591263	591268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854604
12560	NC_020410	CTTT	2	8	591269	591276	0 %	75 %	0 %	25 %	452854604
12561	NC_020410	GAT	2	6	591295	591300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854604
12562	NC_020410	ATATG	2	10	591346	591355	40 %	40 %	20 %	0 %	452854604
12563	NC_020410	T	8	8	591417	591424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12564	NC_020410	TTA	2	6	591427	591432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12565	NC_020410	AT	3	6	591466	591471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12566	NC_020410	GTT	2	6	591503	591508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12567	NC_020410	GT	3	6	591544	591549	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12568	NC_020410	AGG	2	6	591577	591582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12569	NC_020410	A	6	6	591595	591600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12570	NC_020410	TTC	2	6	591633	591638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854605
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12573	NC_020410	TAA	2	6	591663	591668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854605
12574	NC_020410	CAG	2	6	591753	591758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854605
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12583	NC_020410	ATAGTC	2	12	591975	591986	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	452854605
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12591	NC_020410	GATC	2	8	592407	592414	25 %	25 %	25 %	25 %	452854605
12592	NC_020410	CGA	2	6	592481	592486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854605
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12594	NC_020410	GCG	2	6	592535	592540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854605
12595	NC_020410	CGT	2	6	592583	592588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854605
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12599	NC_020410	T	6	6	592842	592847	0 %	100 %	0 %	0 %	452854605
12600	NC_020410	GAC	2	6	592881	592886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854605
12601	NC_020410	AAT	2	6	592946	592951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854605
12602	NC_020410	TCG	2	6	592988	592993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854605
12603	NC_020410	CAG	3	9	593025	593033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854605
12604	NC_020410	GCC	2	6	593061	593066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854605
12605	NC_020410	GCC	2	6	593154	593159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854605
12606	NC_020410	TCA	2	6	593198	593203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854605
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12608	NC_020410	TTC	2	6	593241	593246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854605
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12610	NC_020410	TTC	2	6	593301	593306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854605
12611	NC_020410	TG	3	6	593334	593339	0 %	50 %	50 %	0 %	452854605
12612	NC_020410	CTA	2	6	593453	593458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854605
12613	NC_020410	GCGAT	2	10	593461	593470	20 %	20 %	40 %	20 %	452854605
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12616	NC_020410	TAA	2	6	593577	593582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12617	NC_020410	CTG	2	6	593603	593608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12618	NC_020410	GAA	2	6	593722	593727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854606
12619	NC_020410	TGG	2	6	593741	593746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452854606
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12621	NC_020410	GCTG	2	8	593859	593866	0 %	25 %	50 %	25 %	452854606
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12748	NC_020410	CTG	2	6	599085	599090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12776	NC_020410	T	6	6	599947	599952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12986	NC_020410	ATC	2	6	610159	610164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854623
12987	NC_020410	TGA	2	6	610221	610226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854623
12988	NC_020410	TCTA	2	8	610263	610270	25 %	50 %	0 %	25 %	452854623
12989	NC_020410	A	6	6	610362	610367	100 %	0 %	0 %	0 %	452854623
12990	NC_020410	CGG	2	6	610382	610387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854623
12991	NC_020410	GATT	2	8	610457	610464	25 %	50 %	25 %	0 %	452854623
12992	NC_020410	GGA	2	6	610500	610505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854623
12993	NC_020410	TGA	2	6	610544	610549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854623
12994	NC_020410	AAG	2	6	610622	610627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854623
12995	NC_020410	CTT	2	6	610730	610735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854623
12996	NC_020410	TGG	2	6	610742	610747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452854623
12997	NC_020410	CAG	2	6	610765	610770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854623
12998	NC_020410	GACG	2	8	610779	610786	25 %	0 %	50 %	25 %	452854623
12999	NC_020410	GCG	2	6	610814	610819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854623
13000	NC_020410	ATG	3	9	610840	610848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854623

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