MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5036 complete genome

Total Repeats: 83872

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_020410	AT	3	6	540293	540298	50 %	50 %	0 %	0 %	452854555
11502	NC_020410	ATA	2	6	540331	540336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854555
11503	NC_020410	AGC	2	6	540340	540345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854555
11504	NC_020410	TCA	2	6	540353	540358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854555
11505	NC_020410	GCG	2	6	540382	540387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854555
11506	NC_020410	ATG	2	6	540401	540406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854555
11507	NC_020410	T	6	6	540543	540548	0 %	100 %	0 %	0 %	452854555
11508	NC_020410	GCT	2	6	540633	540638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854555
11509	NC_020410	ATA	2	6	540687	540692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854555
11510	NC_020410	GAA	2	6	540728	540733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854555
11511	NC_020410	TGTT	3	12	540765	540776	0 %	75 %	25 %	0 %	452854555
11512	NC_020410	ATGA	2	8	540789	540796	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11513	NC_020410	ATG	2	6	540818	540823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11514	NC_020410	TCA	2	6	540883	540888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11515	NC_020410	TAT	2	6	540930	540935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11516	NC_020410	ATA	2	6	540942	540947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11517	NC_020410	T	7	7	540986	540992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11518	NC_020410	GGAA	2	8	541032	541039	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11519	NC_020410	CG	3	6	541070	541075	0 %	0 %	50 %	50 %	452854556
11520	NC_020410	TTCT	2	8	541097	541104	0 %	75 %	0 %	25 %	452854556
11521	NC_020410	TTG	2	6	541120	541125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854556
11522	NC_020410	AGTA	2	8	541176	541183	50 %	25 %	25 %	0 %	452854556
11523	NC_020410	TGG	2	6	541201	541206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452854556
11524	NC_020410	CTTT	2	8	541236	541243	0 %	75 %	0 %	25 %	452854556
11525	NC_020410	AT	3	6	541295	541300	50 %	50 %	0 %	0 %	452854556
11526	NC_020410	CCACG	2	10	541305	541314	20 %	0 %	20 %	60 %	452854556
11527	NC_020410	TTA	2	6	541352	541357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854556
11528	NC_020410	GAA	2	6	541399	541404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854556
11529	NC_020410	CGC	2	6	541429	541434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854556
11530	NC_020410	AG	3	6	541483	541488	50 %	0 %	50 %	0 %	452854556
11531	NC_020410	TGA	2	6	541557	541562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854556
11532	NC_020410	TGA	2	6	541592	541597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854556
11533	NC_020410	GCCT	2	8	541617	541624	0 %	25 %	25 %	50 %	452854556
11534	NC_020410	TGAT	2	8	541722	541729	25 %	50 %	25 %	0 %	452854557
11535	NC_020410	CCG	2	6	541737	541742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854557
11536	NC_020410	GGC	2	6	541743	541748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854557
11537	NC_020410	CCG	2	6	541778	541783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854557
11538	NC_020410	GGC	2	6	541818	541823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854557
11539	NC_020410	GAA	2	6	541836	541841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854557
11540	NC_020410	GC	3	6	541964	541969	0 %	0 %	50 %	50 %	452854557
11541	NC_020410	GCC	2	6	542069	542074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854557
11542	NC_020410	GGCG	2	8	542081	542088	0 %	0 %	75 %	25 %	452854557
11543	NC_020410	TCC	2	6	542160	542165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452854557
11544	NC_020410	GCA	2	6	542168	542173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854557
11545	NC_020410	TGC	2	6	542195	542200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854557
11546	NC_020410	CCT	2	6	542242	542247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452854557
11547	NC_020410	AGC	2	6	542341	542346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854557
11548	NC_020410	ACG	2	6	542359	542364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854557
11549	NC_020410	TTA	2	6	542378	542383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854557
11550	NC_020410	ATG	2	6	542389	542394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854557
11551	NC_020410	GAG	2	6	542427	542432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854557
11552	NC_020410	CGCGG	2	10	542460	542469	0 %	0 %	60 %	40 %	452854557
11553	NC_020410	TTC	2	6	542581	542586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854557
11554	NC_020410	AT	4	8	542602	542609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11555	NC_020410	AGA	2	6	542686	542691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11556	NC_020410	GGAG	2	8	542702	542709	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
11557	NC_020410	CAG	2	6	542763	542768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854558
11558	NC_020410	CTTC	2	8	542826	542833	0 %	50 %	0 %	50 %	452854558
11559	NC_020410	GTCA	2	8	542862	542869	25 %	25 %	25 %	25 %	452854558
11560	NC_020410	GAC	2	6	542870	542875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854558
11561	NC_020410	GCC	2	6	542901	542906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854558
11562	NC_020410	CAAA	2	8	543000	543007	75 %	0 %	0 %	25 %	452854558
11563	NC_020410	GAAG	2	8	543011	543018	50 %	0 %	50 %	0 %	452854558
11564	NC_020410	GATT	2	8	543029	543036	25 %	50 %	25 %	0 %	452854558
11565	NC_020410	GAT	2	6	543141	543146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854558
11566	NC_020410	CG	3	6	543196	543201	0 %	0 %	50 %	50 %	452854558
11567	NC_020410	ATT	2	6	543357	543362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854558
11568	NC_020410	TGAA	2	8	543403	543410	50 %	25 %	25 %	0 %	452854558
11569	NC_020410	AGC	2	6	543412	543417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854558
11570	NC_020410	TCA	2	6	543443	543448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854558
11571	NC_020410	GCT	2	6	543491	543496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854558
11572	NC_020410	GGA	2	6	543506	543511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854558
11573	NC_020410	AGA	2	6	543530	543535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854558
11574	NC_020410	CAT	2	6	543577	543582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854558
11575	NC_020410	TTAT	2	8	543610	543617	25 %	75 %	0 %	0 %	452854558
11576	NC_020410	CTTC	2	8	543642	543649	0 %	50 %	0 %	50 %	452854558
11577	NC_020410	TTC	2	6	543670	543675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854558
11578	NC_020410	CTT	2	6	543709	543714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854558
11579	NC_020410	TA	3	6	543715	543720	50 %	50 %	0 %	0 %	452854558
11580	NC_020410	A	7	7	543819	543825	100 %	0 %	0 %	0 %	452854558
11581	NC_020410	TAT	2	6	543832	543837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854558
11582	NC_020410	GCG	2	6	543848	543853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854558
11583	NC_020410	GGA	2	6	543956	543961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854558
11584	NC_020410	A	6	6	544015	544020	100 %	0 %	0 %	0 %	452854558
11585	NC_020410	TC	3	6	544026	544031	0 %	50 %	0 %	50 %	452854558
11586	NC_020410	AAG	2	6	544063	544068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854558
11587	NC_020410	A	7	7	544073	544079	100 %	0 %	0 %	0 %	452854558
11588	NC_020410	GCC	2	6	544086	544091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854558
11589	NC_020410	CAG	2	6	544154	544159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11590	NC_020410	CAT	2	6	544262	544267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854559
11591	NC_020410	CTT	2	6	544300	544305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854559
11592	NC_020410	CGC	2	6	544355	544360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854559
11593	NC_020410	CATT	2	8	544432	544439	25 %	50 %	0 %	25 %	452854559
11594	NC_020410	AAT	2	6	544454	544459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854559
11595	NC_020410	ATTC	2	8	544463	544470	25 %	50 %	0 %	25 %	452854559
11596	NC_020410	TCAT	2	8	544472	544479	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11597	NC_020410	CTC	2	6	544480	544485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452854560
11598	NC_020410	TTG	2	6	544534	544539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854560
11599	NC_020410	CTG	2	6	544553	544558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854560
11600	NC_020410	TTTC	2	8	544564	544571	0 %	75 %	0 %	25 %	452854560
11601	NC_020410	CGGAT	2	10	544577	544586	20 %	20 %	40 %	20 %	452854560
11602	NC_020410	AAG	2	6	544633	544638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854560
11603	NC_020410	ATC	2	6	544727	544732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854561
11604	NC_020410	GCTTC	2	10	544762	544771	0 %	40 %	20 %	40 %	452854561
11605	NC_020410	ACA	2	6	544794	544799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854561
11606	NC_020410	GCC	2	6	544931	544936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854561
11607	NC_020410	GCC	2	6	545096	545101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854561
11608	NC_020410	TTC	2	6	545169	545174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854561
11609	NC_020410	CAG	2	6	545241	545246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854561
11610	NC_020410	CTT	2	6	545302	545307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854561
11611	NC_020410	CATCG	2	10	545345	545354	20 %	20 %	20 %	40 %	452854561
11612	NC_020410	TTC	2	6	545381	545386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854561
11613	NC_020410	GCC	2	6	545462	545467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854561
11614	NC_020410	TGAT	2	8	545516	545523	25 %	50 %	25 %	0 %	452854561
11615	NC_020410	AAT	2	6	545585	545590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854561
11616	NC_020410	T	6	6	545603	545608	0 %	100 %	0 %	0 %	452854561
11617	NC_020410	TTC	2	6	545633	545638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854561
11618	NC_020410	GAT	2	6	545663	545668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854561
11619	NC_020410	ACG	2	6	545799	545804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854561
11620	NC_020410	AGTGTT	2	12	545851	545862	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	452854562
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11622	NC_020410	GCA	2	6	546064	546069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854562
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11869	NC_020410	CCG	2	6	557266	557271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854572
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11993	NC_020410	CAG	2	6	562692	562697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854578
11994	NC_020410	CGC	2	6	562721	562726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854578
11995	NC_020410	CGC	2	6	562751	562756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854578
11996	NC_020410	CTC	2	6	562858	562863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452854578
11997	NC_020410	GAA	2	6	562896	562901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854578
11998	NC_020410	AGC	2	6	562907	562912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854578
11999	NC_020410	TGC	2	6	562994	562999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854578
12000	NC_020410	CAT	2	6	563031	563036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854578

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