MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5036 complete genome

Total Repeats: 83872

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_020410	GC	3	6	517125	517130	0 %	0 %	50 %	50 %	452854533
11002	NC_020410	GCT	2	6	517148	517153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854533
11003	NC_020410	TCAC	2	8	517167	517174	25 %	25 %	0 %	50 %	452854533
11004	NC_020410	ATA	2	6	517213	517218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854533
11005	NC_020410	TGAA	2	8	517255	517262	50 %	25 %	25 %	0 %	452854533
11006	NC_020410	ACA	2	6	517266	517271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854533
11007	NC_020410	TAA	2	6	517330	517335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854533
11008	NC_020410	TTG	2	6	517352	517357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854533
11009	NC_020410	TCC	2	6	517370	517375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452854533
11010	NC_020410	TTA	2	6	517510	517515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854533
11011	NC_020410	TTC	2	6	517526	517531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854533
11012	NC_020410	TGA	2	6	517630	517635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11013	NC_020410	ATGA	2	8	517679	517686	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11014	NC_020410	TCT	2	6	517690	517695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11015	NC_020410	T	6	6	517736	517741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11016	NC_020410	T	6	6	517753	517758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11017	NC_020410	GAA	2	6	517763	517768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11018	NC_020410	ATT	2	6	517774	517779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11019	NC_020410	TTA	2	6	517819	517824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854534
11020	NC_020410	GAA	2	6	517836	517841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854534
11021	NC_020410	A	6	6	517885	517890	100 %	0 %	0 %	0 %	452854534
11022	NC_020410	ATC	2	6	517966	517971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854534
11023	NC_020410	ATGA	2	8	517989	517996	50 %	25 %	25 %	0 %	452854534
11024	NC_020410	GAA	2	6	518052	518057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854534
11025	NC_020410	TCA	2	6	518098	518103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854534
11026	NC_020410	AT	3	6	518159	518164	50 %	50 %	0 %	0 %	452854534
11027	NC_020410	TTA	2	6	518184	518189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854534
11028	NC_020410	CTG	2	6	518245	518250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854534
11029	NC_020410	ATGA	2	8	518393	518400	50 %	25 %	25 %	0 %	452854535
11030	NC_020410	TTTG	2	8	518435	518442	0 %	75 %	25 %	0 %	452854535
11031	NC_020410	ATG	2	6	518664	518669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854535
11032	NC_020410	A	6	6	518689	518694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11033	NC_020410	TTG	2	6	518869	518874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11034	NC_020410	AGC	2	6	518878	518883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11035	NC_020410	AAG	2	6	518922	518927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11036	NC_020410	GCT	2	6	518951	518956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11037	NC_020410	AGCA	2	8	519015	519022	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11038	NC_020410	TGC	2	6	519062	519067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11039	NC_020410	GC	3	6	519069	519074	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11040	NC_020410	GCT	2	6	519089	519094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11041	NC_020410	TAT	2	6	519095	519100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11042	NC_020410	TCA	2	6	519124	519129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11043	NC_020410	TGT	2	6	519143	519148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11044	NC_020410	TCA	2	6	519184	519189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11045	NC_020410	GA	3	6	519246	519251	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11046	NC_020410	TAT	2	6	519267	519272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854536
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11050	NC_020410	GAA	2	6	519432	519437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854536
11051	NC_020410	AGC	2	6	519449	519454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854536
11052	NC_020410	AGC	2	6	519458	519463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854536
11053	NC_020410	AGC	2	6	519503	519508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854536
11054	NC_020410	A	6	6	519522	519527	100 %	0 %	0 %	0 %	452854536
11055	NC_020410	AAGA	2	8	519534	519541	75 %	0 %	25 %	0 %	452854536
11056	NC_020410	A	6	6	519543	519548	100 %	0 %	0 %	0 %	452854536
11057	NC_020410	AAG	2	6	519570	519575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854536
11058	NC_020410	A	6	6	519576	519581	100 %	0 %	0 %	0 %	452854536
11059	NC_020410	AAGAT	2	10	519603	519612	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11060	NC_020410	CAG	2	6	519707	519712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11061	NC_020410	CATG	2	8	519716	519723	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11062	NC_020410	A	6	6	519804	519809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11063	NC_020410	GA	3	6	519815	519820	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11064	NC_020410	T	8	8	519851	519858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11065	NC_020410	ATC	2	6	519867	519872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11066	NC_020410	TGTC	2	8	520070	520077	0 %	50 %	25 %	25 %	452854537
11067	NC_020410	GTAA	2	8	520113	520120	50 %	25 %	25 %	0 %	452854537
11068	NC_020410	GAA	2	6	520142	520147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854537
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11071	NC_020410	GGA	2	6	520371	520376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854537
11072	NC_020410	CGAT	2	8	520410	520417	25 %	25 %	25 %	25 %	452854537
11073	NC_020410	GGC	2	6	520524	520529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854537
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11076	NC_020410	ATT	2	6	520772	520777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854537
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11081	NC_020410	GCG	2	6	521014	521019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854537
11082	NC_020410	CCGT	2	8	521063	521070	0 %	25 %	25 %	50 %	452854537
11083	NC_020410	AAG	2	6	521113	521118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854537
11084	NC_020410	TGA	2	6	521155	521160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854537
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11086	NC_020410	GT	3	6	521374	521379	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11087	NC_020410	CCTG	2	8	521522	521529	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11088	NC_020410	TAACG	2	10	521614	521623	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11089	NC_020410	A	6	6	521686	521691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11090	NC_020410	A	6	6	521871	521876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11091	NC_020410	TA	3	6	521900	521905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11092	NC_020410	AT	3	6	521909	521914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11093	NC_020410	T	6	6	521938	521943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11094	NC_020410	AGA	2	6	521970	521975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11095	NC_020410	AAT	2	6	521976	521981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11096	NC_020410	AGG	2	6	522001	522006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11097	NC_020410	TCACAA	2	12	522020	522031	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	452854538
11098	NC_020410	AAG	2	6	522051	522056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854538
11099	NC_020410	ATA	2	6	522096	522101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854538
11100	NC_020410	A	7	7	522214	522220	100 %	0 %	0 %	0 %	452854538
11101	NC_020410	TCA	2	6	522227	522232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854538
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11104	NC_020410	CCG	2	6	522345	522350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854538
11105	NC_020410	CAA	2	6	522358	522363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854538
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11107	NC_020410	AT	3	6	522403	522408	50 %	50 %	0 %	0 %	452854538
11108	NC_020410	ATG	2	6	522423	522428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854538
11109	NC_020410	AAT	2	6	522447	522452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854538
11110	NC_020410	TAA	2	6	522481	522486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854538
11111	NC_020410	ATC	2	6	522531	522536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854538
11112	NC_020410	AAG	2	6	522596	522601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854538
11113	NC_020410	GGAA	2	8	522641	522648	50 %	0 %	50 %	0 %	452854538
11114	NC_020410	GTT	2	6	522774	522779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854538
11115	NC_020410	CAT	4	12	522942	522953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854538
11116	NC_020410	AGG	2	6	522957	522962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11117	NC_020410	CTG	2	6	522982	522987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11118	NC_020410	G	6	6	523008	523013	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11119	NC_020410	ACG	2	6	523024	523029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854539
11120	NC_020410	CAGG	2	8	523050	523057	25 %	0 %	50 %	25 %	452854539
11121	NC_020410	AAG	2	6	523080	523085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854539
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11123	NC_020410	TTTA	2	8	523163	523170	25 %	75 %	0 %	0 %	452854539
11124	NC_020410	A	6	6	523235	523240	100 %	0 %	0 %	0 %	452854539
11125	NC_020410	TGC	2	6	523247	523252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854539
11126	NC_020410	A	6	6	523260	523265	100 %	0 %	0 %	0 %	452854539
11127	NC_020410	TAA	2	6	523309	523314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854539
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11129	NC_020410	TAA	2	6	523342	523347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854539
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11151	NC_020410	A	6	6	524137	524142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11152	NC_020410	TTAA	2	8	524152	524159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11153	NC_020410	AAG	2	6	524161	524166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11154	NC_020410	ATTG	2	8	524178	524185	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11155	NC_020410	TGT	2	6	524283	524288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11156	NC_020410	GCT	2	6	524355	524360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11158	NC_020410	CGG	2	6	524461	524466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11159	NC_020410	CTG	2	6	524476	524481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11161	NC_020410	CTG	2	6	524616	524621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11162	NC_020410	ATTG	2	8	524652	524659	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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11164	NC_020410	TTG	2	6	524687	524692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11165	NC_020410	GCT	2	6	524743	524748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11167	NC_020410	ATA	5	15	524774	524788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11168	NC_020410	TGT	2	6	524883	524888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11194	NC_020410	TAA	2	6	525956	525961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11202	NC_020410	A	7	7	526317	526323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11207	NC_020410	TA	3	6	526408	526413	50 %	50 %	0 %	0 %	452854542
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11227	NC_020410	ATT	2	6	527469	527474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11228	NC_020410	A	7	7	527508	527514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11229	NC_020410	A	7	7	527530	527536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11230	NC_020410	T	6	6	527561	527566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11231	NC_020410	TGA	2	6	527583	527588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11232	NC_020410	GCT	2	6	527612	527617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11233	NC_020410	ATC	2	6	527684	527689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11235	NC_020410	T	6	6	527723	527728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11236	NC_020410	GCC	2	6	527843	527848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11237	NC_020410	A	6	6	527906	527911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11238	NC_020410	AG	3	6	528116	528121	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11239	NC_020410	TATCT	2	10	528128	528137	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11240	NC_020410	TTTA	2	8	528171	528178	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11241	NC_020410	A	6	6	528208	528213	100 %	0 %	0 %	0 %	452854543
11242	NC_020410	TAG	2	6	528242	528247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854543
11243	NC_020410	TGA	2	6	528263	528268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854543
11244	NC_020410	T	6	6	528307	528312	0 %	100 %	0 %	0 %	452854543
11245	NC_020410	TGA	2	6	528405	528410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854543
11246	NC_020410	GCA	2	6	528433	528438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854543
11247	NC_020410	A	8	8	528499	528506	100 %	0 %	0 %	0 %	452854543
11248	NC_020410	GAT	2	6	528604	528609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854543
11249	NC_020410	GCA	2	6	528637	528642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854543
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11251	NC_020410	A	6	6	528748	528753	100 %	0 %	0 %	0 %	452854544
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11374	NC_020410	T	7	7	534857	534863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11375	NC_020410	GGT	2	6	534912	534917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11376	NC_020410	TAT	2	6	534978	534983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854550
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11378	NC_020410	GAT	2	6	535047	535052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854550
11379	NC_020410	TTTA	2	8	535127	535134	25 %	75 %	0 %	0 %	452854550
11380	NC_020410	A	6	6	535166	535171	100 %	0 %	0 %	0 %	452854550
11381	NC_020410	TGA	2	6	535220	535225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854550
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11383	NC_020410	T	7	7	535387	535393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11384	NC_020410	AAACA	2	10	535410	535419	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11385	NC_020410	ATCA	2	8	535434	535441	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11386	NC_020410	T	6	6	535452	535457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11387	NC_020410	T	6	6	535467	535472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11388	NC_020410	GGT	2	6	535538	535543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11389	NC_020410	CTGGT	2	10	535619	535628	0 %	40 %	40 %	20 %	452854551
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11403	NC_020410	CGG	2	6	536298	536303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854551
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11413	NC_020410	GC	3	6	536696	536701	0 %	0 %	50 %	50 %	452854551
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11417	NC_020410	T	6	6	536862	536867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11418	NC_020410	TG	3	6	536908	536913	0 %	50 %	50 %	0 %	452854552
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11431	NC_020410	GCT	2	6	537404	537409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854552
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11434	NC_020410	GCT	2	6	537491	537496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854552
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11439	NC_020410	CTG	2	6	537726	537731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854552
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11448	NC_020410	TTTG	2	8	538202	538209	0 %	75 %	25 %	0 %	452854552
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11451	NC_020410	TTA	2	6	538319	538324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11452	NC_020410	GAGAG	2	10	538355	538364	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
11453	NC_020410	TGTA	2	8	538368	538375	25 %	50 %	25 %	0 %	452854553
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11478	NC_020410	ATC	2	6	539493	539498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11480	NC_020410	GGAT	2	8	539525	539532	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11481	NC_020410	AGA	2	6	539537	539542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11482	NC_020410	A	7	7	539550	539556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11483	NC_020410	TCC	2	6	539691	539696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452854555
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11486	NC_020410	ATAA	2	8	539737	539744	75 %	25 %	0 %	0 %	452854555
11487	NC_020410	A	6	6	539780	539785	100 %	0 %	0 %	0 %	452854555
11488	NC_020410	CTGA	2	8	539793	539800	25 %	25 %	25 %	25 %	452854555
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11494	NC_020410	TGC	2	6	539982	539987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854555
11495	NC_020410	AAT	2	6	540061	540066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854555
11496	NC_020410	GTC	2	6	540076	540081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854555
11497	NC_020410	CGG	2	6	540127	540132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854555
11498	NC_020410	GCA	2	6	540152	540157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854555
11499	NC_020410	ACA	2	6	540247	540252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854555
11500	NC_020410	CGG	2	6	540260	540265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854555

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