MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5036 complete genome

Total Repeats: 83872

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_020410	AATG	2	8	472119	472126	50 %	25 %	25 %	0 %	452854482
10003	NC_020410	CGAT	2	8	472139	472146	25 %	25 %	25 %	25 %	452854482
10004	NC_020410	CATCA	2	10	472153	472162	40 %	20 %	0 %	40 %	452854482
10005	NC_020410	AGAC	2	8	472208	472215	50 %	0 %	25 %	25 %	452854482
10006	NC_020410	TCG	2	6	472262	472267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854482
10007	NC_020410	TA	3	6	472283	472288	50 %	50 %	0 %	0 %	452854482
10008	NC_020410	GAA	2	6	472291	472296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854482
10009	NC_020410	AGC	2	6	472324	472329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854482
10010	NC_020410	TGA	2	6	472343	472348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854482
10011	NC_020410	AAG	2	6	472351	472356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854482
10012	NC_020410	CAGGA	2	10	472381	472390	40 %	0 %	40 %	20 %	452854482
10013	NC_020410	GCG	2	6	472396	472401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854482
10014	NC_020410	GAA	2	6	472411	472416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854482
10015	NC_020410	GCTT	2	8	472533	472540	0 %	50 %	25 %	25 %	452854482
10016	NC_020410	ATC	2	6	472548	472553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854482
10017	NC_020410	TCA	2	6	472581	472586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854482
10018	NC_020410	GCG	2	6	472606	472611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854482
10019	NC_020410	CTG	2	6	472615	472620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854482
10020	NC_020410	TGA	2	6	472668	472673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854482
10021	NC_020410	CAG	2	6	472677	472682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854482
10022	NC_020410	TCG	2	6	472721	472726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854482
10023	NC_020410	GGA	2	6	472782	472787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854482
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10026	NC_020410	AGA	2	6	472842	472847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854482
10027	NC_020410	GGA	2	6	472918	472923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854482
10028	NC_020410	CAAA	2	8	472947	472954	75 %	0 %	0 %	25 %	452854482
10029	NC_020410	TCG	2	6	472955	472960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854482
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10032	NC_020410	CAGGGA	2	12	472996	473007	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	452854482
10033	NC_020410	TATTT	2	10	473019	473028	20 %	80 %	0 %	0 %	452854482
10034	NC_020410	GGA	2	6	473040	473045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854482
10035	NC_020410	TGC	2	6	473067	473072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854482
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10044	NC_020410	CAG	2	6	473558	473563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854483
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10047	NC_020410	CGGCG	2	10	473619	473628	0 %	0 %	60 %	40 %	452854483
10048	NC_020410	A	7	7	473646	473652	100 %	0 %	0 %	0 %	452854483
10049	NC_020410	GCCG	2	8	473691	473698	0 %	0 %	50 %	50 %	452854483
10050	NC_020410	TTTG	2	8	473775	473782	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_020410	TCA	2	6	473865	473870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854484
10052	NC_020410	CGG	2	6	473871	473876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854484
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10055	NC_020410	ATTT	3	12	474058	474069	25 %	75 %	0 %	0 %	452854484
10056	NC_020410	ACC	2	6	474080	474085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452854484
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10069	NC_020410	CTGT	2	8	474494	474501	0 %	50 %	25 %	25 %	452854484
10070	NC_020410	TTA	2	6	474588	474593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854484
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10072	NC_020410	GAT	2	6	474649	474654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854484
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10080	NC_020410	CGG	2	6	475080	475085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854484
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10082	NC_020410	GCAT	2	8	475104	475111	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10083	NC_020410	T	7	7	475126	475132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10087	NC_020410	TA	3	6	475208	475213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10088	NC_020410	AG	3	6	475224	475229	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10089	NC_020410	GGC	2	6	475278	475283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854485
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10091	NC_020410	T	6	6	475452	475457	0 %	100 %	0 %	0 %	452854485
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10094	NC_020410	GCTG	2	8	475500	475507	0 %	25 %	50 %	25 %	452854485
10095	NC_020410	TTG	2	6	475544	475549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854485
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10100	NC_020410	CAGCA	2	10	475804	475813	40 %	0 %	20 %	40 %	452854485
10101	NC_020410	CTGT	2	8	475816	475823	0 %	50 %	25 %	25 %	452854485
10102	NC_020410	T	6	6	475823	475828	0 %	100 %	0 %	0 %	452854485
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10106	NC_020410	CAT	2	6	476040	476045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854485
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10112	NC_020410	AAT	2	6	476278	476283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452854485
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10114	NC_020410	CGGCTC	2	12	476329	476340	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10115	NC_020410	AT	3	6	476348	476353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10116	NC_020410	T	6	6	476400	476405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_020410	AGG	2	6	476413	476418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10118	NC_020410	A	6	6	476489	476494	100 %	0 %	0 %	0 %	452854486
10119	NC_020410	CAGG	2	8	476510	476517	25 %	0 %	50 %	25 %	452854486
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10121	NC_020410	ATC	2	6	476574	476579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854486
10122	NC_020410	TTC	2	6	476869	476874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854486
10123	NC_020410	CGG	2	6	476924	476929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854486
10124	NC_020410	GGA	2	6	477017	477022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854486
10125	NC_020410	TCA	3	9	477037	477045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854486
10126	NC_020410	GTT	2	6	477072	477077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854486
10127	NC_020410	GCG	2	6	477082	477087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854486
10128	NC_020410	AGA	2	6	477098	477103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854486
10129	NC_020410	ACG	2	6	477181	477186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854486
10130	NC_020410	GAA	2	6	477209	477214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854486
10131	NC_020410	TCG	2	6	477241	477246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854486
10132	NC_020410	CAT	2	6	477269	477274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854486
10133	NC_020410	GGA	2	6	477293	477298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854486
10134	NC_020410	GAC	2	6	477314	477319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854486
10135	NC_020410	AGG	2	6	477331	477336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854486
10136	NC_020410	TAT	2	6	477435	477440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854487
10137	NC_020410	TCA	2	6	477464	477469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854487
10138	NC_020410	GCG	2	6	477685	477690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854487
10139	NC_020410	CTG	2	6	477706	477711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854487
10140	NC_020410	GT	3	6	477731	477736	0 %	50 %	50 %	0 %	452854487
10141	NC_020410	CTT	2	6	477760	477765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854487
10142	NC_020410	TTC	2	6	477837	477842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854487
10143	NC_020410	CTG	2	6	477952	477957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854487
10144	NC_020410	CTGAC	2	10	477968	477977	20 %	20 %	20 %	40 %	452854487
10145	NC_020410	AT	3	6	477981	477986	50 %	50 %	0 %	0 %	452854487
10146	NC_020410	CATTAT	2	12	478038	478049	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	452854487
10147	NC_020410	TTC	2	6	478060	478065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854487
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10150	NC_020410	AAT	2	6	478156	478161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10151	NC_020410	TAA	2	6	478180	478185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10152	NC_020410	TTA	2	6	478218	478223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854488
10153	NC_020410	TCAT	2	8	478265	478272	25 %	50 %	0 %	25 %	452854488
10154	NC_020410	GTTT	2	8	478314	478321	0 %	75 %	25 %	0 %	452854488
10155	NC_020410	TA	3	6	478344	478349	50 %	50 %	0 %	0 %	452854488
10156	NC_020410	TCA	2	6	478374	478379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854488
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10159	NC_020410	AT	3	6	478489	478494	50 %	50 %	0 %	0 %	452854488
10160	NC_020410	T	7	7	478569	478575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10161	NC_020410	TTA	2	6	478621	478626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10162	NC_020410	G	6	6	478646	478651	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10163	NC_020410	ATGG	2	8	478693	478700	25 %	25 %	50 %	0 %	452854489
10164	NC_020410	A	6	6	478701	478706	100 %	0 %	0 %	0 %	452854489
10165	NC_020410	A	6	6	478731	478736	100 %	0 %	0 %	0 %	452854489
10166	NC_020410	TGA	2	6	478747	478752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854489
10167	NC_020410	CGG	2	6	478834	478839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854489
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10171	NC_020410	A	6	6	479090	479095	100 %	0 %	0 %	0 %	452854489
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10175	NC_020410	TCAG	2	8	479221	479228	25 %	25 %	25 %	25 %	452854489
10176	NC_020410	GAA	2	6	479240	479245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854489
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10179	NC_020410	GCT	2	6	479387	479392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854489
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10181	NC_020410	CGG	2	6	479553	479558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854489
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10188	NC_020410	CCG	2	6	479747	479752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854489
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10197	NC_020410	T	7	7	480095	480101	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10198	NC_020410	TGA	2	6	480113	480118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10199	NC_020410	CTGAG	2	10	480120	480129	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10200	NC_020410	CCT	2	6	480149	480154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10201	NC_020410	AAT	2	6	480262	480267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10202	NC_020410	GCT	2	6	480299	480304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10203	NC_020410	TCCA	2	8	480318	480325	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10204	NC_020410	ATGA	2	8	480330	480337	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10205	NC_020410	GGA	2	6	480342	480347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10206	NC_020410	ATGA	2	8	480356	480363	50 %	25 %	25 %	0 %	452854491
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10221	NC_020410	GAAA	2	8	481024	481031	75 %	0 %	25 %	0 %	452854491
10222	NC_020410	CAG	2	6	481042	481047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854491
10223	NC_020410	CTGT	2	8	481121	481128	0 %	50 %	25 %	25 %	452854491
10224	NC_020410	AAG	2	6	481131	481136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854491
10225	NC_020410	ACATGA	2	12	481174	481185	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	452854491
10226	NC_020410	CTT	2	6	481275	481280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854492
10227	NC_020410	CTTT	2	8	481314	481321	0 %	75 %	0 %	25 %	452854492
10228	NC_020410	GTTCA	2	10	481399	481408	20 %	40 %	20 %	20 %	452854492
10229	NC_020410	TTC	2	6	481429	481434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854492
10230	NC_020410	GAT	2	6	481501	481506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854492
10231	NC_020410	TGT	2	6	481543	481548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854492
10232	NC_020410	T	7	7	481554	481560	0 %	100 %	0 %	0 %	452854492
10233	NC_020410	ATAAA	2	10	481596	481605	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10234	NC_020410	TACA	2	8	481613	481620	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10235	NC_020410	AAT	2	6	481648	481653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10236	NC_020410	TTG	2	6	481696	481701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10237	NC_020410	G	6	6	481703	481708	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10238	NC_020410	CGG	2	6	481743	481748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854493
10239	NC_020410	GCT	2	6	481872	481877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854493
10240	NC_020410	CGAT	2	8	481994	482001	25 %	25 %	25 %	25 %	452854493
10241	NC_020410	CTG	2	6	482056	482061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854493
10242	NC_020410	CAT	2	6	482102	482107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854493
10243	NC_020410	TCA	2	6	482126	482131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854493
10244	NC_020410	CGC	2	6	482175	482180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854493
10245	NC_020410	A	6	6	482187	482192	100 %	0 %	0 %	0 %	452854493
10246	NC_020410	GCT	2	6	482216	482221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854493
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10253	NC_020410	GCT	2	6	482694	482699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854493
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10258	NC_020410	AACA	2	8	482946	482953	75 %	0 %	0 %	25 %	452854494
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10265	NC_020410	GAA	2	6	483653	483658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854494
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10289	NC_020410	AAT	2	6	484575	484580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10354	NC_020410	TCAA	2	8	486946	486953	50 %	25 %	0 %	25 %	452854497
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10488	NC_020410	ACG	2	6	493817	493822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854506
10489	NC_020410	A	6	6	493904	493909	100 %	0 %	0 %	0 %	452854506
10490	NC_020410	AGGA	2	8	494061	494068	50 %	0 %	50 %	0 %	452854506
10491	NC_020410	AGG	2	6	494100	494105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854506
10492	NC_020410	AGC	2	6	494135	494140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854507
10493	NC_020410	ATC	2	6	494144	494149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854507
10494	NC_020410	GCT	2	6	494151	494156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854507
10495	NC_020410	AT	3	6	494163	494168	50 %	50 %	0 %	0 %	452854507
10496	NC_020410	TCC	2	6	494238	494243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452854507
10497	NC_020410	GGA	2	6	494244	494249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854507
10498	NC_020410	AGT	2	6	494271	494276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854507
10499	NC_020410	T	6	6	494325	494330	0 %	100 %	0 %	0 %	452854507
10500	NC_020410	GA	3	6	494382	494387	50 %	0 %	50 %	0 %	452854507

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