MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5036 complete genome

Total Repeats: 83872

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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78002	NC_020410	C	6	6	3640975	3640980	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
78003	NC_020410	TAT	2	6	3641040	3641045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452857445
78004	NC_020410	ACA	2	6	3641054	3641059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452857445
78005	NC_020410	ACT	2	6	3641062	3641067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452857445
78006	NC_020410	TTAT	2	8	3641084	3641091	25 %	75 %	0 %	0 %	452857445
78007	NC_020410	AGC	2	6	3641156	3641161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452857445
78008	NC_020410	A	6	6	3641216	3641221	100 %	0 %	0 %	0 %	452857445
78009	NC_020410	GCG	2	6	3641251	3641256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452857445
78010	NC_020410	TTC	2	6	3641272	3641277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452857445
78011	NC_020410	A	7	7	3641375	3641381	100 %	0 %	0 %	0 %	452857445
78012	NC_020410	GTG	2	6	3641427	3641432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452857445
78013	NC_020410	T	7	7	3641498	3641504	0 %	100 %	0 %	0 %	452857445
78014	NC_020410	ATT	2	6	3641525	3641530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452857445
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78017	NC_020410	GAG	2	6	3641693	3641698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452857445
78018	NC_020410	CATT	2	8	3641714	3641721	25 %	50 %	0 %	25 %	452857446
78019	NC_020410	GTC	2	6	3641729	3641734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452857446
78020	NC_020410	TG	3	6	3641735	3641740	0 %	50 %	50 %	0 %	452857446
78021	NC_020410	C	6	6	3641794	3641799	0 %	0 %	0 %	100 %	452857446
78022	NC_020410	AGCA	2	8	3641836	3641843	50 %	0 %	25 %	25 %	452857446
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78032	NC_020410	GACA	2	8	3642332	3642339	50 %	0 %	25 %	25 %	452857446
78033	NC_020410	T	6	6	3642390	3642395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78034	NC_020410	TTTCC	2	10	3642441	3642450	0 %	60 %	0 %	40 %	452857447
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78036	NC_020410	TC	3	6	3642466	3642471	0 %	50 %	0 %	50 %	452857447
78037	NC_020410	GAT	2	6	3642478	3642483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452857447
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78043	NC_020410	GTCCTT	2	12	3642910	3642921	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	452857447
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78047	NC_020410	TCCTT	2	10	3643011	3643020	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
78048	NC_020410	AT	3	6	3643039	3643044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78049	NC_020410	T	7	7	3643056	3643062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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78052	NC_020410	T	6	6	3643124	3643129	0 %	100 %	0 %	0 %	452857448
78053	NC_020410	GCC	2	6	3643133	3643138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452857448
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78055	NC_020410	ATTC	2	8	3643177	3643184	25 %	50 %	0 %	25 %	452857448
78056	NC_020410	GCC	2	6	3643197	3643202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452857448
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78059	NC_020410	TCTG	2	8	3643330	3643337	0 %	50 %	25 %	25 %	452857448
78060	NC_020410	CGG	2	6	3643369	3643374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452857448
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78085	NC_020410	TC	3	6	3644550	3644555	0 %	50 %	0 %	50 %	452857449
78086	NC_020410	GC	3	6	3644559	3644564	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78087	NC_020410	AGCGA	2	10	3644633	3644642	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
78088	NC_020410	CA	3	6	3644738	3644743	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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78119	NC_020410	ATT	2	6	3646170	3646175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452857451
78120	NC_020410	ATC	2	6	3646253	3646258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452857452
78121	NC_020410	T	6	6	3646260	3646265	0 %	100 %	0 %	0 %	452857452
78122	NC_020410	CCAG	2	8	3646303	3646310	25 %	0 %	25 %	50 %	452857452
78123	NC_020410	GGC	2	6	3646316	3646321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452857452
78124	NC_020410	ATG	2	6	3646350	3646355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452857452
78125	NC_020410	TCC	2	6	3646569	3646574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452857452
78126	NC_020410	CTT	2	6	3646594	3646599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452857452
78127	NC_020410	TTCT	2	8	3646619	3646626	0 %	75 %	0 %	25 %	452857452
78128	NC_020410	GAC	2	6	3646652	3646657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452857452
78129	NC_020410	TTC	2	6	3646700	3646705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452857452
78130	NC_020410	ACG	2	6	3646719	3646724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452857452
78131	NC_020410	TCC	2	6	3646746	3646751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452857452
78132	NC_020410	TGC	2	6	3646758	3646763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452857452
78133	NC_020410	CAA	2	6	3646783	3646788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452857452
78134	NC_020410	ATC	2	6	3646857	3646862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452857452
78135	NC_020410	TTC	2	6	3646890	3646895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452857452
78136	NC_020410	ATA	2	6	3646902	3646907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452857452
78137	NC_020410	GTCA	2	8	3646982	3646989	25 %	25 %	25 %	25 %	452857452
78138	NC_020410	A	6	6	3647130	3647135	100 %	0 %	0 %	0 %	452857452
78139	NC_020410	ATT	2	6	3647195	3647200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78140	NC_020410	AATATA	2	12	3647239	3647250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78141	NC_020410	CAT	2	6	3647258	3647263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78142	NC_020410	A	6	6	3647268	3647273	100 %	0 %	0 %	0 %	452857453
78143	NC_020410	TGC	2	6	3647275	3647280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452857453
78144	NC_020410	CTG	2	6	3647301	3647306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452857453
78145	NC_020410	CGG	2	6	3647338	3647343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452857453
78146	NC_020410	ATT	2	6	3647396	3647401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452857453
78147	NC_020410	GCA	2	6	3647442	3647447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452857453
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78150	NC_020410	TAT	2	6	3647513	3647518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452857453
78151	NC_020410	GTC	3	9	3647547	3647555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452857453
78152	NC_020410	A	6	6	3647622	3647627	100 %	0 %	0 %	0 %	452857453
78153	NC_020410	A	6	6	3647687	3647692	100 %	0 %	0 %	0 %	452857454
78154	NC_020410	CGC	2	6	3647724	3647729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452857454
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78156	NC_020410	CTT	2	6	3647765	3647770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452857454
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78158	NC_020410	CTG	2	6	3647810	3647815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452857454
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78164	NC_020410	ATC	2	6	3648107	3648112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452857454
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78167	NC_020410	AGCTC	2	10	3648213	3648222	20 %	20 %	20 %	40 %	452857454
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78169	NC_020410	T	7	7	3648338	3648344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78170	NC_020410	GATT	2	8	3648357	3648364	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78171	NC_020410	TGTC	2	8	3648365	3648372	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
78172	NC_020410	GAA	2	6	3648424	3648429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78173	NC_020410	CAG	2	6	3648451	3648456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452857455
78174	NC_020410	CG	3	6	3648572	3648577	0 %	0 %	50 %	50 %	452857455
78175	NC_020410	GCA	2	6	3648618	3648623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452857455
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78177	NC_020410	T	7	7	3648663	3648669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78178	NC_020410	TTCT	2	8	3648700	3648707	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
78179	NC_020410	TA	3	6	3648709	3648714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78180	NC_020410	A	6	6	3648716	3648721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78181	NC_020410	AGG	2	6	3648775	3648780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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78194	NC_020410	ATC	2	6	3649525	3649530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452857456
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78205	NC_020410	GGA	2	6	3649948	3649953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452857457
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78210	NC_020410	ATC	2	6	3650209	3650214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452857457
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78214	NC_020410	TTATC	2	10	3650453	3650462	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
78215	NC_020410	TTTTC	2	10	3650487	3650496	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
78216	NC_020410	T	6	6	3650528	3650533	0 %	100 %	0 %	0 %	452857458
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78220	NC_020410	TTC	2	6	3650673	3650678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452857458
78221	NC_020410	GCT	2	6	3650690	3650695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452857458
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78224	NC_020410	T	6	6	3650721	3650726	0 %	100 %	0 %	0 %	452857458
78225	NC_020410	CAG	2	6	3650750	3650755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452857458
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78228	NC_020410	AAG	2	6	3650806	3650811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452857458
78229	NC_020410	GAT	2	6	3650822	3650827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452857458
78230	NC_020410	T	6	6	3650846	3650851	0 %	100 %	0 %	0 %	452857458
78231	NC_020410	CTC	2	6	3650989	3650994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452857458
78232	NC_020410	GCC	2	6	3651000	3651005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452857458
78233	NC_020410	CGT	2	6	3651124	3651129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452857458
78234	NC_020410	TCG	2	6	3651204	3651209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452857458
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78236	NC_020410	CGC	2	6	3651373	3651378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452857458
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78330	NC_020410	A	8	8	3655460	3655467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78331	NC_020410	TCA	2	6	3655502	3655507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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78339	NC_020410	T	7	7	3655934	3655940	0 %	100 %	0 %	0 %	452857462
78340	NC_020410	TCT	2	6	3655963	3655968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452857462
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78342	NC_020410	CAAT	2	8	3656041	3656048	50 %	25 %	0 %	25 %	452857462
78343	NC_020410	ATC	2	6	3656053	3656058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452857462
78344	NC_020410	TTAA	2	8	3656077	3656084	50 %	50 %	0 %	0 %	452857462
78345	NC_020410	TAA	2	6	3656104	3656109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452857462
78346	NC_020410	GCT	2	6	3656127	3656132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452857462
78347	NC_020410	GCG	2	6	3656180	3656185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452857462
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78350	NC_020410	AAG	2	6	3656294	3656299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452857462
78351	NC_020410	CCCA	2	8	3656307	3656314	25 %	0 %	0 %	75 %	452857462
78352	NC_020410	ATC	2	6	3656331	3656336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452857462
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