MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5036 complete genome

Total Repeats: 83872

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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76002	NC_020410	CCG	2	6	3548190	3548195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452857351
76003	NC_020410	GCTTC	2	10	3548199	3548208	0 %	40 %	20 %	40 %	452857351
76004	NC_020410	ATTCAT	2	12	3548274	3548285	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	452857351
76005	NC_020410	GGA	2	6	3548493	3548498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452857351
76006	NC_020410	GCG	2	6	3548499	3548504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452857351
76007	NC_020410	CTT	2	6	3548538	3548543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452857351
76008	NC_020410	CTG	2	6	3548660	3548665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452857351
76009	NC_020410	CGC	2	6	3548689	3548694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452857351
76010	NC_020410	GCA	2	6	3548697	3548702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452857351
76011	NC_020410	GATT	2	8	3548745	3548752	25 %	50 %	25 %	0 %	452857351
76012	NC_020410	TTC	2	6	3548797	3548802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452857351
76013	NC_020410	GCTGTC	2	12	3548812	3548823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452857351
76014	NC_020410	TCAT	2	8	3548825	3548832	25 %	50 %	0 %	25 %	452857351
76015	NC_020410	TCG	2	6	3548841	3548846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452857351
76016	NC_020410	CAG	2	6	3548851	3548856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452857351
76017	NC_020410	T	6	6	3548974	3548979	0 %	100 %	0 %	0 %	452857351
76018	NC_020410	CGC	2	6	3549025	3549030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452857351
76019	NC_020410	CTT	2	6	3549045	3549050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452857351
76020	NC_020410	TTGA	2	8	3549070	3549077	25 %	50 %	25 %	0 %	452857351
76021	NC_020410	CGC	2	6	3549109	3549114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452857351
76022	NC_020410	A	7	7	3549222	3549228	100 %	0 %	0 %	0 %	452857351
76023	NC_020410	CGGA	2	8	3549301	3549308	25 %	0 %	50 %	25 %	452857351
76024	NC_020410	CCG	2	6	3549341	3549346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452857351
76025	NC_020410	CAGG	2	8	3549539	3549546	25 %	0 %	50 %	25 %	452857351
76026	NC_020410	ACGG	2	8	3549552	3549559	25 %	0 %	50 %	25 %	452857351
76027	NC_020410	ATC	2	6	3549562	3549567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452857351
76028	NC_020410	CCG	2	6	3549587	3549592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452857351
76029	NC_020410	ACGT	2	8	3549644	3549651	25 %	25 %	25 %	25 %	452857351
76030	NC_020410	T	6	6	3549673	3549678	0 %	100 %	0 %	0 %	452857351
76031	NC_020410	GA	3	6	3549770	3549775	50 %	0 %	50 %	0 %	452857351
76032	NC_020410	TTC	2	6	3549799	3549804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452857351
76033	NC_020410	CTG	2	6	3549829	3549834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452857351
76034	NC_020410	T	6	6	3549920	3549925	0 %	100 %	0 %	0 %	452857351
76035	NC_020410	GAA	2	6	3550000	3550005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452857351
76036	NC_020410	CATCGC	2	12	3550090	3550101	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	452857351
76037	NC_020410	TGA	2	6	3550266	3550271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452857351
76038	NC_020410	CGTC	2	8	3550308	3550315	0 %	25 %	25 %	50 %	452857351
76039	NC_020410	CGG	2	6	3550342	3550347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452857351
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76043	NC_020410	AG	3	6	3550499	3550504	50 %	0 %	50 %	0 %	452857351
76044	NC_020410	GCC	2	6	3550549	3550554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452857351
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76047	NC_020410	GTGG	2	8	3550870	3550877	0 %	25 %	75 %	0 %	452857351
76048	NC_020410	ATG	2	6	3550966	3550971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452857351
76049	NC_020410	TTTTCT	2	12	3551016	3551027	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	452857351
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76051	NC_020410	T	6	6	3551121	3551126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76052	NC_020410	CA	3	6	3551138	3551143	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76053	NC_020410	AGC	2	6	3551145	3551150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76054	NC_020410	AGGA	2	8	3551151	3551158	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76055	NC_020410	TCA	2	6	3551187	3551192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76056	NC_020410	A	8	8	3551192	3551199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76057	NC_020410	AAC	2	6	3551262	3551267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452857352
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76060	NC_020410	AG	3	6	3551417	3551422	50 %	0 %	50 %	0 %	452857352
76061	NC_020410	TCA	2	6	3551433	3551438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452857352
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76067	NC_020410	AGG	2	6	3551817	3551822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76068	NC_020410	GAT	2	6	3551837	3551842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452857353
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76078	NC_020410	GTTCT	2	10	3552183	3552192	0 %	60 %	20 %	20 %	452857353
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76083	NC_020410	A	6	6	3552326	3552331	100 %	0 %	0 %	0 %	452857353
76084	NC_020410	T	6	6	3552447	3552452	0 %	100 %	0 %	0 %	452857353
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76092	NC_020410	T	7	7	3553073	3553079	0 %	100 %	0 %	0 %	452857354
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76099	NC_020410	GAA	2	6	3553308	3553313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76100	NC_020410	GTAT	2	8	3553325	3553332	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76101	NC_020410	A	6	6	3553365	3553370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76102	NC_020410	TC	3	6	3553418	3553423	0 %	50 %	0 %	50 %	452857355
76103	NC_020410	A	6	6	3553563	3553568	100 %	0 %	0 %	0 %	452857355
76104	NC_020410	GCTT	2	8	3553614	3553621	0 %	50 %	25 %	25 %	452857355
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76108	NC_020410	GCCG	2	8	3553847	3553854	0 %	0 %	50 %	50 %	452857355
76109	NC_020410	A	6	6	3553899	3553904	100 %	0 %	0 %	0 %	452857355
76110	NC_020410	AGAT	2	8	3553911	3553918	50 %	25 %	25 %	0 %	452857355
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76478	NC_020410	TTCTT	2	10	3570665	3570674	0 %	80 %	0 %	20 %	452857374
76479	NC_020410	GCC	2	6	3570737	3570742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452857374
76480	NC_020410	AT	3	6	3570879	3570884	50 %	50 %	0 %	0 %	452857374
76481	NC_020410	AAT	2	6	3570913	3570918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452857374
76482	NC_020410	TCA	2	6	3570968	3570973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452857374
76483	NC_020410	AT	3	6	3571032	3571037	50 %	50 %	0 %	0 %	452857374
76484	NC_020410	CATC	2	8	3571072	3571079	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
76485	NC_020410	T	6	6	3571092	3571097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76486	NC_020410	TAT	2	6	3571179	3571184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76487	NC_020410	T	6	6	3571192	3571197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76488	NC_020410	AGA	2	6	3571364	3571369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76489	NC_020410	TGGA	2	8	3571415	3571422	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
76490	NC_020410	A	8	8	3571449	3571456	100 %	0 %	0 %	0 %	452857375
76491	NC_020410	GCT	2	6	3571468	3571473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452857375
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76499	NC_020410	CAT	3	9	3571909	3571917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452857375
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