MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5036 complete genome

Total Repeats: 83872

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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75003	NC_020410	T	8	8	3502280	3502287	0 %	100 %	0 %	0 %	452857302
75004	NC_020410	CG	3	6	3502328	3502333	0 %	0 %	50 %	50 %	452857302
75005	NC_020410	TCA	2	6	3502382	3502387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452857302
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75010	NC_020410	A	6	6	3502546	3502551	100 %	0 %	0 %	0 %	452857302
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75013	NC_020410	TC	3	6	3502590	3502595	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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75015	NC_020410	AAG	2	6	3502772	3502777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452857303
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75024	NC_020410	AG	3	6	3503016	3503021	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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75119	NC_020410	TTC	2	6	3507757	3507762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452857308
75120	NC_020410	CAA	2	6	3507801	3507806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452857308
75121	NC_020410	TGC	2	6	3507917	3507922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452857308
75122	NC_020410	TCC	2	6	3507986	3507991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452857309
75123	NC_020410	GCC	2	6	3508070	3508075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452857309
75124	NC_020410	AGCGA	2	10	3508110	3508119	40 %	0 %	40 %	20 %	452857309
75125	NC_020410	T	7	7	3508127	3508133	0 %	100 %	0 %	0 %	452857309
75126	NC_020410	AAC	2	6	3508190	3508195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452857309
75127	NC_020410	CGG	3	9	3508269	3508277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452857309
75128	NC_020410	AGA	2	6	3508284	3508289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452857309
75129	NC_020410	GCA	2	6	3508300	3508305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452857309
75130	NC_020410	T	6	6	3508346	3508351	0 %	100 %	0 %	0 %	452857309
75131	NC_020410	CTT	2	6	3508414	3508419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452857309
75132	NC_020410	CTT	2	6	3508435	3508440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452857309
75133	NC_020410	CAG	2	6	3508507	3508512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452857309
75134	NC_020410	GTT	2	6	3508560	3508565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452857310
75135	NC_020410	TCA	2	6	3508577	3508582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452857310
75136	NC_020410	TTCTTT	2	12	3508660	3508671	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	452857310
75137	NC_020410	CGC	2	6	3508687	3508692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452857310
75138	NC_020410	CTTC	2	8	3508737	3508744	0 %	50 %	0 %	50 %	452857310
75139	NC_020410	T	6	6	3508759	3508764	0 %	100 %	0 %	0 %	452857310
75140	NC_020410	GTGATT	2	12	3508779	3508790	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	452857310
75141	NC_020410	CTT	2	6	3508800	3508805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452857310
75142	NC_020410	GCT	2	6	3508818	3508823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452857310
75143	NC_020410	CTT	2	6	3508842	3508847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452857310
75144	NC_020410	TTTC	2	8	3508850	3508857	0 %	75 %	0 %	25 %	452857310
75145	NC_020410	TAA	2	6	3508948	3508953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452857310
75146	NC_020410	CCG	2	6	3508988	3508993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452857310
75147	NC_020410	CTA	2	6	3509032	3509037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75148	NC_020410	CTG	2	6	3509064	3509069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75149	NC_020410	T	6	6	3509166	3509171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75150	NC_020410	ATTGCA	2	12	3509358	3509369	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	452857311
75151	NC_020410	GCT	2	6	3509370	3509375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452857311
75152	NC_020410	TCC	2	6	3509395	3509400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75153	NC_020410	AT	3	6	3509422	3509427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75154	NC_020410	TG	3	6	3509452	3509457	0 %	50 %	50 %	0 %	452857312
75155	NC_020410	GAA	2	6	3509542	3509547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452857312
75156	NC_020410	AAG	2	6	3509577	3509582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452857312
75157	NC_020410	TCG	2	6	3509599	3509604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452857312
75158	NC_020410	AAG	2	6	3509624	3509629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452857312
75159	NC_020410	CTC	2	6	3509690	3509695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452857312
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75162	NC_020410	CAA	2	6	3509998	3510003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452857312
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75164	NC_020410	CGGA	2	8	3510032	3510039	25 %	0 %	50 %	25 %	452857312
75165	NC_020410	GTG	2	6	3510054	3510059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452857312
75166	NC_020410	CAG	2	6	3510071	3510076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452857312
75167	NC_020410	ATC	2	6	3510099	3510104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452857312
75168	NC_020410	CAAA	2	8	3510133	3510140	75 %	0 %	0 %	25 %	452857312
75169	NC_020410	CT	3	6	3510178	3510183	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75170	NC_020410	TGA	2	6	3510189	3510194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75171	NC_020410	AAT	2	6	3510207	3510212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75172	NC_020410	AAT	2	6	3510252	3510257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75173	NC_020410	CTTTC	2	10	3510357	3510366	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
75174	NC_020410	CATT	2	8	3510386	3510393	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75175	NC_020410	AAAC	2	8	3510417	3510424	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
75176	NC_020410	A	7	7	3510451	3510457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75177	NC_020410	CTG	2	6	3510529	3510534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75178	NC_020410	TGA	2	6	3510573	3510578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75179	NC_020410	T	7	7	3510637	3510643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75180	NC_020410	A	6	6	3510666	3510671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75181	NC_020410	TCC	2	6	3510679	3510684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75182	NC_020410	T	6	6	3510737	3510742	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75183	NC_020410	GGA	2	6	3510743	3510748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75184	NC_020410	GGAT	2	8	3510759	3510766	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
75185	NC_020410	ATA	2	6	3510797	3510802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75186	NC_020410	A	6	6	3510854	3510859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75187	NC_020410	A	7	7	3510944	3510950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75188	NC_020410	ATTT	2	8	3510977	3510984	25 %	75 %	0 %	0 %	452857313
75189	NC_020410	TTCA	2	8	3511039	3511046	25 %	50 %	0 %	25 %	452857313
75190	NC_020410	TCA	2	6	3511052	3511057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452857313
75191	NC_020410	GCG	2	6	3511061	3511066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452857313
75192	NC_020410	ATG	2	6	3511087	3511092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452857313
75193	NC_020410	CAG	2	6	3511096	3511101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452857313
75194	NC_020410	CGCGC	2	10	3511153	3511162	0 %	0 %	40 %	60 %	452857313
75195	NC_020410	AGCA	2	8	3511204	3511211	50 %	0 %	25 %	25 %	452857313
75196	NC_020410	TTC	2	6	3511237	3511242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452857313
75197	NC_020410	GAAG	2	8	3511250	3511257	50 %	0 %	50 %	0 %	452857313
75198	NC_020410	TTC	2	6	3511397	3511402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452857313
75199	NC_020410	CACTTC	2	12	3511444	3511455	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	452857313
75200	NC_020410	AT	3	6	3511553	3511558	50 %	50 %	0 %	0 %	452857313
75201	NC_020410	GAT	2	6	3511581	3511586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452857313
75202	NC_020410	T	6	6	3511624	3511629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75203	NC_020410	A	7	7	3511700	3511706	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75204	NC_020410	CCG	2	6	3511708	3511713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75205	NC_020410	CGG	2	6	3511725	3511730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75206	NC_020410	TTA	2	6	3511740	3511745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452857314
75207	NC_020410	TA	3	6	3511760	3511765	50 %	50 %	0 %	0 %	452857314
75208	NC_020410	TCAG	2	8	3511777	3511784	25 %	25 %	25 %	25 %	452857314
75209	NC_020410	CTT	2	6	3511805	3511810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452857314
75210	NC_020410	ATG	2	6	3511830	3511835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452857314
75211	NC_020410	GAT	2	6	3511851	3511856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452857314
75212	NC_020410	CTT	2	6	3511865	3511870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452857314
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75214	NC_020410	TCA	2	6	3511993	3511998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452857314
75215	NC_020410	GA	3	6	3512031	3512036	50 %	0 %	50 %	0 %	452857314
75216	NC_020410	GGT	2	6	3512057	3512062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452857314
75217	NC_020410	ATC	2	6	3512160	3512165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452857314
75218	NC_020410	GAAA	2	8	3512181	3512188	75 %	0 %	25 %	0 %	452857314
75219	NC_020410	TCC	2	6	3512289	3512294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452857314
75220	NC_020410	GTCGTT	2	12	3512320	3512331	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	452857314
75221	NC_020410	TCA	2	6	3512425	3512430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452857314
75222	NC_020410	T	6	6	3512445	3512450	0 %	100 %	0 %	0 %	452857314
75223	NC_020410	CGCT	2	8	3512474	3512481	0 %	25 %	25 %	50 %	452857314
75224	NC_020410	TA	3	6	3512541	3512546	50 %	50 %	0 %	0 %	452857314
75225	NC_020410	CGC	2	6	3512591	3512596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452857314
75226	NC_020410	GT	3	6	3512616	3512621	0 %	50 %	50 %	0 %	452857314
75227	NC_020410	GCC	2	6	3512628	3512633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452857314
75228	NC_020410	CG	3	6	3512757	3512762	0 %	0 %	50 %	50 %	452857314
75229	NC_020410	GCC	2	6	3512802	3512807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452857314
75230	NC_020410	GTA	2	6	3512808	3512813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452857314
75231	NC_020410	TTTG	2	8	3512841	3512848	0 %	75 %	25 %	0 %	452857314
75232	NC_020410	AATT	2	8	3512904	3512911	50 %	50 %	0 %	0 %	452857314
75233	NC_020410	TTGT	2	8	3512961	3512968	0 %	75 %	25 %	0 %	452857314
75234	NC_020410	TCA	2	6	3512987	3512992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452857314
75235	NC_020410	ACC	2	6	3513032	3513037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75236	NC_020410	A	7	7	3513080	3513086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75237	NC_020410	TCA	2	6	3513135	3513140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452857315
75238	NC_020410	ATGC	2	8	3513261	3513268	25 %	25 %	25 %	25 %	452857315
75239	NC_020410	C	6	6	3513367	3513372	0 %	0 %	0 %	100 %	452857315
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75358	NC_020410	TGC	2	6	3518324	3518329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452857322
75359	NC_020410	CAG	2	6	3518360	3518365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452857323
75360	NC_020410	GCG	2	6	3518385	3518390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452857323
75361	NC_020410	CGG	2	6	3518401	3518406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452857323
75362	NC_020410	CTT	2	6	3518431	3518436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452857323
75363	NC_020410	GCT	2	6	3518461	3518466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452857323
75364	NC_020410	CCGCT	2	10	3518467	3518476	0 %	20 %	20 %	60 %	452857323
75365	NC_020410	GAT	2	6	3518495	3518500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452857323
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75369	NC_020410	GCG	3	9	3518583	3518591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452857323
75370	NC_020410	T	6	6	3518615	3518620	0 %	100 %	0 %	0 %	452857323
75371	NC_020410	TTTC	2	8	3518642	3518649	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
75372	NC_020410	CCG	2	6	3518665	3518670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75373	NC_020410	CGG	2	6	3518681	3518686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75374	NC_020410	T	6	6	3518689	3518694	0 %	100 %	0 %	0 %	452857324
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75378	NC_020410	GAC	2	6	3518826	3518831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452857324
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75381	NC_020410	TCT	2	6	3518962	3518967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452857324
75382	NC_020410	CGG	2	6	3518979	3518984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452857324
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75384	NC_020410	T	6	6	3519006	3519011	0 %	100 %	0 %	0 %	452857324
75385	NC_020410	TGA	2	6	3519015	3519020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452857324
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75390	NC_020410	TCTG	2	8	3519233	3519240	0 %	50 %	25 %	25 %	452857324
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75394	NC_020410	A	6	6	3519303	3519308	100 %	0 %	0 %	0 %	452857324
75395	NC_020410	ATA	2	6	3519337	3519342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452857324
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75422	NC_020410	A	6	6	3520720	3520725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75423	NC_020410	GGA	2	6	3520726	3520731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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75428	NC_020410	T	6	6	3521123	3521128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75429	NC_020410	GAA	2	6	3521129	3521134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75430	NC_020410	CTTT	2	8	3521141	3521148	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
75431	NC_020410	CTT	2	6	3521158	3521163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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75443	NC_020410	A	6	6	3521797	3521802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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75457	NC_020410	TA	3	6	3522828	3522833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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75466	NC_020410	TTC	2	6	3523477	3523482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452857329
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75468	NC_020410	CGATTC	2	12	3523629	3523640	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	452857329
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75471	NC_020410	GC	3	6	3523798	3523803	0 %	0 %	50 %	50 %	452857329
75472	NC_020410	GAA	2	6	3523830	3523835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452857329
75473	NC_020410	GCA	2	6	3524012	3524017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452857329
75474	NC_020410	GATCA	2	10	3524110	3524119	40 %	20 %	20 %	20 %	452857329
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75476	NC_020410	TCT	2	6	3524203	3524208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452857329
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75485	NC_020410	TTTA	2	8	3524482	3524489	25 %	75 %	0 %	0 %	452857329
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