MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5036 complete genome

Total Repeats: 83872

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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74002	NC_020410	CGT	2	6	3455904	3455909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452857251
74003	NC_020410	TCA	2	6	3455930	3455935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452857251
74004	NC_020410	GAA	2	6	3455955	3455960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452857251
74005	NC_020410	T	6	6	3456118	3456123	0 %	100 %	0 %	0 %	452857251
74006	NC_020410	CAG	2	6	3456160	3456165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452857251
74007	NC_020410	GAT	2	6	3456173	3456178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452857251
74008	NC_020410	CCG	2	6	3456266	3456271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74009	NC_020410	ACG	2	6	3456302	3456307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452857252
74010	NC_020410	CTT	2	6	3456311	3456316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452857252
74011	NC_020410	AT	3	6	3456326	3456331	50 %	50 %	0 %	0 %	452857252
74012	NC_020410	CGCC	2	8	3456336	3456343	0 %	0 %	25 %	75 %	452857252
74013	NC_020410	CTT	2	6	3456486	3456491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452857252
74014	NC_020410	GATCG	2	10	3456550	3456559	20 %	20 %	40 %	20 %	452857252
74015	NC_020410	GCC	2	6	3456584	3456589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452857252
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74019	NC_020410	CTG	2	6	3456724	3456729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452857252
74020	NC_020410	TTG	2	6	3456734	3456739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452857252
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74023	NC_020410	AT	3	6	3456930	3456935	50 %	50 %	0 %	0 %	452857252
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74037	NC_020410	GCCG	2	8	3457715	3457722	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74038	NC_020410	ATA	2	6	3457726	3457731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74039	NC_020410	GCATAA	2	12	3457732	3457743	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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74043	NC_020410	CGG	2	6	3457824	3457829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452857253
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74055	NC_020410	GTTT	2	8	3458374	3458381	0 %	75 %	25 %	0 %	452857253
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74059	NC_020410	ATC	2	6	3458510	3458515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452857253
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74062	NC_020410	GGAA	2	8	3458534	3458541	50 %	0 %	50 %	0 %	452857253
74063	NC_020410	CCT	2	6	3458576	3458581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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74101	NC_020410	CAT	2	6	3460474	3460479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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74103	NC_020410	ATA	2	6	3460544	3460549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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74106	NC_020410	TGA	2	6	3460688	3460693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452857257
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74112	NC_020410	GCCG	2	8	3461067	3461074	0 %	0 %	50 %	50 %	452857257
74113	NC_020410	TTA	2	6	3461097	3461102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452857257
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74115	NC_020410	A	6	6	3461137	3461142	100 %	0 %	0 %	0 %	452857257
74116	NC_020410	ATTC	2	8	3461167	3461174	25 %	50 %	0 %	25 %	452857257
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74118	NC_020410	ATT	2	6	3461240	3461245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452857257
74119	NC_020410	TCC	2	6	3461290	3461295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452857257
74120	NC_020410	T	6	6	3461340	3461345	0 %	100 %	0 %	0 %	452857257
74121	NC_020410	AGA	2	6	3461385	3461390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452857257
74122	NC_020410	GC	3	6	3461435	3461440	0 %	0 %	50 %	50 %	452857257
74123	NC_020410	GAT	2	6	3461557	3461562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452857257
74124	NC_020410	CCT	2	6	3461593	3461598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452857257
74125	NC_020410	A	6	6	3461644	3461649	100 %	0 %	0 %	0 %	452857257
74126	NC_020410	GAT	2	6	3461794	3461799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452857257
74127	NC_020410	GTGG	2	8	3461889	3461896	0 %	25 %	75 %	0 %	452857257
74128	NC_020410	TCG	2	6	3461909	3461914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452857257
74129	NC_020410	GCC	2	6	3461959	3461964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452857257
74130	NC_020410	CCT	2	6	3461987	3461992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452857257
74131	NC_020410	GCG	2	6	3462001	3462006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452857257
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74133	NC_020410	A	7	7	3462023	3462029	100 %	0 %	0 %	0 %	452857257
74134	NC_020410	GC	3	6	3462052	3462057	0 %	0 %	50 %	50 %	452857257
74135	NC_020410	A	6	6	3462064	3462069	100 %	0 %	0 %	0 %	452857257
74136	NC_020410	A	7	7	3462093	3462099	100 %	0 %	0 %	0 %	452857257
74137	NC_020410	CAG	2	6	3462100	3462105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452857257
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74139	NC_020410	AAG	2	6	3462164	3462169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452857257
74140	NC_020410	GAAAG	2	10	3462177	3462186	60 %	0 %	40 %	0 %	452857257
74141	NC_020410	TTGA	2	8	3462187	3462194	25 %	50 %	25 %	0 %	452857257
74142	NC_020410	TCAT	2	8	3462216	3462223	25 %	50 %	0 %	25 %	452857258
74143	NC_020410	ATG	2	6	3462264	3462269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452857258
74144	NC_020410	AGC	2	6	3462276	3462281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452857258
74145	NC_020410	TCAG	2	8	3462291	3462298	25 %	25 %	25 %	25 %	452857258
74146	NC_020410	GCT	2	6	3462412	3462417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452857258
74147	NC_020410	A	6	6	3462421	3462426	100 %	0 %	0 %	0 %	452857258
74148	NC_020410	ATTC	2	8	3462435	3462442	25 %	50 %	0 %	25 %	452857258
74149	NC_020410	CGA	2	6	3462492	3462497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452857258
74150	NC_020410	TTC	2	6	3462525	3462530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452857258
74151	NC_020410	ATG	2	6	3462645	3462650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452857258
74152	NC_020410	CTG	2	6	3462653	3462658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452857258
74153	NC_020410	GGC	2	6	3462666	3462671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452857258
74154	NC_020410	GCCG	2	8	3462688	3462695	0 %	0 %	50 %	50 %	452857258
74155	NC_020410	GAT	2	6	3462728	3462733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452857258
74156	NC_020410	GAC	2	6	3462815	3462820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452857258
74157	NC_020410	A	7	7	3462848	3462854	100 %	0 %	0 %	0 %	452857258
74158	NC_020410	T	6	6	3462869	3462874	0 %	100 %	0 %	0 %	452857258
74159	NC_020410	A	6	6	3462893	3462898	100 %	0 %	0 %	0 %	452857258
74160	NC_020410	CG	4	8	3462925	3462932	0 %	0 %	50 %	50 %	452857258
74161	NC_020410	ACG	2	6	3462983	3462988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452857258
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74163	NC_020410	TCT	2	6	3463014	3463019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452857258
74164	NC_020410	TTC	2	6	3463062	3463067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452857258
74165	NC_020410	CAT	2	6	3463071	3463076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452857258
74166	NC_020410	ATG	2	6	3463103	3463108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452857258
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74172	NC_020410	GC	3	6	3463364	3463369	0 %	0 %	50 %	50 %	452857258
74173	NC_020410	CAT	2	6	3463411	3463416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452857258
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74177	NC_020410	GCCT	2	8	3463693	3463700	0 %	25 %	25 %	50 %	452857258
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74179	NC_020410	GCCG	2	8	3463794	3463801	0 %	0 %	50 %	50 %	452857258
74180	NC_020410	CGT	2	6	3463840	3463845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452857258
74181	NC_020410	CTT	2	6	3463851	3463856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452857258
74182	NC_020410	TTC	2	6	3463888	3463893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452857258
74183	NC_020410	TGA	2	6	3463918	3463923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452857258
74184	NC_020410	CG	3	6	3463961	3463966	0 %	0 %	50 %	50 %	452857258
74185	NC_020410	CAT	2	6	3463988	3463993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452857258
74186	NC_020410	TGC	2	6	3464106	3464111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452857258
74187	NC_020410	A	6	6	3464133	3464138	100 %	0 %	0 %	0 %	452857258
74188	NC_020410	CAG	2	6	3464153	3464158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452857258
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74191	NC_020410	ACAG	2	8	3464410	3464417	50 %	0 %	25 %	25 %	452857258
74192	NC_020410	GCT	2	6	3464452	3464457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452857258
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74195	NC_020410	TC	3	6	3464612	3464617	0 %	50 %	0 %	50 %	452857258
74196	NC_020410	AGAA	2	8	3464634	3464641	75 %	0 %	25 %	0 %	452857258
74197	NC_020410	GCGG	2	8	3464669	3464676	0 %	0 %	75 %	25 %	452857258
74198	NC_020410	TGG	2	6	3464726	3464731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452857258
74199	NC_020410	CGG	2	6	3464736	3464741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452857258
74200	NC_020410	CGAC	2	8	3464754	3464761	25 %	0 %	25 %	50 %	452857258
74201	NC_020410	ACG	2	6	3464813	3464818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452857258
74202	NC_020410	GAA	2	6	3464828	3464833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452857258
74203	NC_020410	A	6	6	3464832	3464837	100 %	0 %	0 %	0 %	452857258
74204	NC_020410	GAAAC	2	10	3464852	3464861	60 %	0 %	20 %	20 %	452857258
74205	NC_020410	GAA	2	6	3464927	3464932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452857258
74206	NC_020410	CT	3	6	3464984	3464989	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74207	NC_020410	AGA	2	6	3464991	3464996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74208	NC_020410	GTC	2	6	3465010	3465015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74209	NC_020410	CGC	2	6	3465026	3465031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74210	NC_020410	TCT	2	6	3465160	3465165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452857259
74211	NC_020410	GCC	2	6	3465196	3465201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452857259
74212	NC_020410	ACCG	2	8	3465231	3465238	25 %	0 %	25 %	50 %	452857259
74213	NC_020410	CGG	2	6	3465239	3465244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452857259
74214	NC_020410	TCA	2	6	3465403	3465408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452857259
74215	NC_020410	CTT	2	6	3465446	3465451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452857259
74216	NC_020410	ATGA	2	8	3465470	3465477	50 %	25 %	25 %	0 %	452857259
74217	NC_020410	GCC	2	6	3465514	3465519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452857259
74218	NC_020410	AGC	2	6	3465583	3465588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452857259
74219	NC_020410	TGCC	2	8	3465589	3465596	0 %	25 %	25 %	50 %	452857259
74220	NC_020410	TTTG	2	8	3465618	3465625	0 %	75 %	25 %	0 %	452857259
74221	NC_020410	TTC	2	6	3465687	3465692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452857259
74222	NC_020410	GGC	2	6	3465735	3465740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452857259
74223	NC_020410	GC	3	6	3465806	3465811	0 %	0 %	50 %	50 %	452857259
74224	NC_020410	TGA	2	6	3465886	3465891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452857259
74225	NC_020410	CTG	2	6	3465892	3465897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452857259
74226	NC_020410	CAG	2	6	3465900	3465905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452857259
74227	NC_020410	CTT	2	6	3465952	3465957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452857260
74228	NC_020410	CAG	2	6	3466037	3466042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452857260
74229	NC_020410	TCT	2	6	3466158	3466163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452857260
74230	NC_020410	ACG	2	6	3466248	3466253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452857260
74231	NC_020410	CCG	2	6	3466293	3466298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452857260
74232	NC_020410	TGAT	2	8	3466344	3466351	25 %	50 %	25 %	0 %	452857260
74233	NC_020410	TAA	2	6	3466360	3466365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452857260
74234	NC_020410	GAT	2	6	3466427	3466432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452857260
74235	NC_020410	CGC	2	6	3466552	3466557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452857260
74236	NC_020410	CTT	2	6	3466605	3466610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452857260
74237	NC_020410	AGC	2	6	3466632	3466637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452857260
74238	NC_020410	CCG	2	6	3466661	3466666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452857260
74239	NC_020410	TCTT	2	8	3466700	3466707	0 %	75 %	0 %	25 %	452857260
74240	NC_020410	GTAA	2	8	3466747	3466754	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74241	NC_020410	AT	3	6	3466773	3466778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74242	NC_020410	CTT	2	6	3466811	3466816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74243	NC_020410	T	6	6	3466825	3466830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74244	NC_020410	A	7	7	3466842	3466848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74245	NC_020410	AGG	2	6	3466874	3466879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74246	NC_020410	A	6	6	3466917	3466922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74247	NC_020410	CAGC	2	8	3466932	3466939	25 %	0 %	25 %	50 %	452857261
74248	NC_020410	GTCT	2	8	3467011	3467018	0 %	50 %	25 %	25 %	452857261
74249	NC_020410	CTT	2	6	3467027	3467032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452857261
74250	NC_020410	T	6	6	3467099	3467104	0 %	100 %	0 %	0 %	452857261
74251	NC_020410	GCT	2	6	3467204	3467209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452857261
74252	NC_020410	GCCG	2	8	3467238	3467245	0 %	0 %	50 %	50 %	452857261
74253	NC_020410	TCC	2	6	3467275	3467280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74254	NC_020410	GGCT	2	8	3467293	3467300	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
74255	NC_020410	GTA	2	6	3467306	3467311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74256	NC_020410	GCT	2	6	3467359	3467364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74257	NC_020410	TGTTTT	2	12	3467369	3467380	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	452857262
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74260	NC_020410	CCG	2	6	3467496	3467501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452857262
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74264	NC_020410	TC	3	6	3467725	3467730	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74265	NC_020410	A	6	6	3467759	3467764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74266	NC_020410	ATG	2	6	3467797	3467802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74267	NC_020410	A	6	6	3467829	3467834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74268	NC_020410	TAA	2	6	3467847	3467852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74269	NC_020410	ACA	2	6	3467870	3467875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74270	NC_020410	GATT	2	8	3467977	3467984	25 %	50 %	25 %	0 %	452857263
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74272	NC_020410	T	7	7	3468050	3468056	0 %	100 %	0 %	0 %	452857263
74273	NC_020410	TGA	2	6	3468064	3468069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452857263
74274	NC_020410	AGAA	2	8	3468076	3468083	75 %	0 %	25 %	0 %	452857263
74275	NC_020410	A	7	7	3468108	3468114	100 %	0 %	0 %	0 %	452857263
74276	NC_020410	CCGCC	2	10	3468119	3468128	0 %	0 %	20 %	80 %	452857263
74277	NC_020410	TCG	2	6	3468154	3468159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452857263
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74283	NC_020410	GAG	2	6	3468359	3468364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452857264
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74300	NC_020410	TTTG	2	8	3468788	3468795	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
74301	NC_020410	CA	3	6	3468831	3468836	50 %	0 %	0 %	50 %	452857265
74302	NC_020410	CG	5	10	3468885	3468894	0 %	0 %	50 %	50 %	452857265
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74311	NC_020410	TAT	2	6	3469301	3469306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74312	NC_020410	ATAA	2	8	3469381	3469388	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74313	NC_020410	GAT	2	6	3469419	3469424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452857266
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74339	NC_020410	TAC	2	6	3470428	3470433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452857266
74340	NC_020410	A	8	8	3470434	3470441	100 %	0 %	0 %	0 %	452857266
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74342	NC_020410	CTT	2	6	3470496	3470501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74343	NC_020410	CTGA	2	8	3470506	3470513	25 %	25 %	25 %	25 %	452857267
74344	NC_020410	GC	3	6	3470633	3470638	0 %	0 %	50 %	50 %	452857267
74345	NC_020410	TGCC	2	8	3470655	3470662	0 %	25 %	25 %	50 %	452857267
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74347	NC_020410	ATT	2	6	3470751	3470756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452857267
74348	NC_020410	TCA	2	6	3470912	3470917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452857267
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74350	NC_020410	CCG	2	6	3470938	3470943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452857267
74351	NC_020410	CCGT	2	8	3470985	3470992	0 %	25 %	25 %	50 %	452857267
74352	NC_020410	CGGT	2	8	3471046	3471053	0 %	25 %	50 %	25 %	452857267
74353	NC_020410	T	7	7	3471053	3471059	0 %	100 %	0 %	0 %	452857267
74354	NC_020410	CCCTG	2	10	3471067	3471076	0 %	20 %	20 %	60 %	452857267
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74356	NC_020410	GCG	2	6	3471125	3471130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452857267
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