MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5036 complete genome

Total Repeats: 83872

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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71002	NC_020410	CT	3	6	3317346	3317351	0 %	50 %	0 %	50 %	452857125
71003	NC_020410	AAT	2	6	3317417	3317422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452857125
71004	NC_020410	TCTT	2	8	3317423	3317430	0 %	75 %	0 %	25 %	452857125
71005	NC_020410	TCC	2	6	3317459	3317464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71006	NC_020410	A	6	6	3317510	3317515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71007	NC_020410	CATG	2	8	3317537	3317544	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71008	NC_020410	A	7	7	3317551	3317557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71009	NC_020410	CTG	2	6	3317559	3317564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71010	NC_020410	TCT	2	6	3317577	3317582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71011	NC_020410	CAG	2	6	3317589	3317594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71012	NC_020410	ACG	2	6	3317724	3317729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452857126
71013	NC_020410	TAA	2	6	3317739	3317744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452857126
71014	NC_020410	T	6	6	3317804	3317809	0 %	100 %	0 %	0 %	452857126
71015	NC_020410	GTTC	2	8	3317821	3317828	0 %	50 %	25 %	25 %	452857126
71016	NC_020410	AAT	2	6	3317848	3317853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452857126
71017	NC_020410	CTG	2	6	3317893	3317898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452857126
71018	NC_020410	GGC	2	6	3317987	3317992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452857126
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71021	NC_020410	TGG	2	6	3318063	3318068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452857126
71022	NC_020410	T	8	8	3318114	3318121	0 %	100 %	0 %	0 %	452857126
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71032	NC_020410	CGT	2	6	3318481	3318486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452857126
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71052	NC_020410	ATG	2	6	3319335	3319340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452857126
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71054	NC_020410	GCGCC	2	10	3319486	3319495	0 %	0 %	40 %	60 %	452857126
71055	NC_020410	GCT	2	6	3319555	3319560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452857126
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71060	NC_020410	GCT	2	6	3319708	3319713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452857126
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71063	NC_020410	GGAT	2	8	3319837	3319844	25 %	25 %	50 %	0 %	452857126
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71100	NC_020410	T	6	6	3321568	3321573	0 %	100 %	0 %	0 %	452857127
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71106	NC_020410	CTG	2	6	3321846	3321851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452857127
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71111	NC_020410	TA	3	6	3321976	3321981	50 %	50 %	0 %	0 %	452857128
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71113	NC_020410	ACG	2	6	3322077	3322082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452857128
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71117	NC_020410	ATCA	2	8	3322269	3322276	50 %	25 %	0 %	25 %	452857129
71118	NC_020410	GA	3	6	3322287	3322292	50 %	0 %	50 %	0 %	452857129
71119	NC_020410	CCG	2	6	3322322	3322327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452857129
71120	NC_020410	ATC	2	6	3322329	3322334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452857129
71121	NC_020410	GTC	2	6	3322360	3322365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452857129
71122	NC_020410	GCG	2	6	3322391	3322396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452857129
71123	NC_020410	ATCA	2	8	3322464	3322471	50 %	25 %	0 %	25 %	452857129
71124	NC_020410	CGC	2	6	3322499	3322504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452857129
71125	NC_020410	CCG	2	6	3322544	3322549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452857129
71126	NC_020410	GA	3	6	3322571	3322576	50 %	0 %	50 %	0 %	452857129
71127	NC_020410	CTTAT	2	10	3322663	3322672	20 %	60 %	0 %	20 %	452857129
71128	NC_020410	TTTTC	2	10	3322718	3322727	0 %	80 %	0 %	20 %	452857129
71129	NC_020410	A	6	6	3322737	3322742	100 %	0 %	0 %	0 %	452857129
71130	NC_020410	CTTCA	2	10	3322752	3322761	20 %	40 %	0 %	40 %	452857129
71131	NC_020410	GAA	2	6	3322775	3322780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452857129
71132	NC_020410	GC	3	6	3322788	3322793	0 %	0 %	50 %	50 %	452857129
71133	NC_020410	CCT	2	6	3322796	3322801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452857129
71134	NC_020410	TGC	2	6	3322936	3322941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452857129
71135	NC_020410	CTTC	2	8	3322979	3322986	0 %	50 %	0 %	50 %	452857129
71136	NC_020410	T	6	6	3322989	3322994	0 %	100 %	0 %	0 %	452857129
71137	NC_020410	AATC	2	8	3323003	3323010	50 %	25 %	0 %	25 %	452857129
71138	NC_020410	CTT	2	6	3323117	3323122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452857129
71139	NC_020410	TTCT	2	8	3323211	3323218	0 %	75 %	0 %	25 %	452857129
71140	NC_020410	GCT	2	6	3323329	3323334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452857130
71141	NC_020410	AATC	2	8	3323382	3323389	50 %	25 %	0 %	25 %	452857130
71142	NC_020410	ACA	2	6	3323395	3323400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452857130
71143	NC_020410	GC	3	6	3323452	3323457	0 %	0 %	50 %	50 %	452857130
71144	NC_020410	CGA	2	6	3323486	3323491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452857130
71145	NC_020410	GAA	2	6	3323510	3323515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452857130
71146	NC_020410	GCG	2	6	3323519	3323524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452857130
71147	NC_020410	CCTT	2	8	3323612	3323619	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71148	NC_020410	ATAC	2	8	3323620	3323627	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71149	NC_020410	TTTCAT	2	12	3323646	3323657	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71150	NC_020410	AGG	2	6	3323763	3323768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71151	NC_020410	AG	3	6	3323812	3323817	50 %	0 %	50 %	0 %	452857131
71152	NC_020410	GCTG	2	8	3323863	3323870	0 %	25 %	50 %	25 %	452857131
71153	NC_020410	AGC	2	6	3323887	3323892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452857131
71154	NC_020410	AT	3	6	3323920	3323925	50 %	50 %	0 %	0 %	452857131
71155	NC_020410	TGC	2	6	3323931	3323936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452857131
71156	NC_020410	CAG	3	9	3323941	3323949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452857131
71157	NC_020410	A	6	6	3324002	3324007	100 %	0 %	0 %	0 %	452857131
71158	NC_020410	ACA	2	6	3324017	3324022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452857131
71159	NC_020410	TAT	2	6	3324061	3324066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452857132
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71161	NC_020410	T	6	6	3324108	3324113	0 %	100 %	0 %	0 %	452857132
71162	NC_020410	CTT	2	6	3324173	3324178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452857132
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71166	NC_020410	CGA	2	6	3324305	3324310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452857132
71167	NC_020410	ATC	2	6	3324342	3324347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452857132
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71170	NC_020410	CGT	2	6	3324456	3324461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452857132
71171	NC_020410	AAAG	2	8	3324543	3324550	75 %	0 %	25 %	0 %	452857132
71172	NC_020410	AGGA	2	8	3324672	3324679	50 %	0 %	50 %	0 %	452857132
71173	NC_020410	TGA	2	6	3324695	3324700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452857132
71174	NC_020410	CGC	2	6	3324707	3324712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452857132
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71176	NC_020410	ATC	2	6	3324813	3324818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452857132
71177	NC_020410	GTCGAT	2	12	3324876	3324887	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	452857132
71178	NC_020410	GGT	2	6	3324899	3324904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452857132
71179	NC_020410	TTCA	2	8	3324984	3324991	25 %	50 %	0 %	25 %	452857132
71180	NC_020410	AC	3	6	3325016	3325021	50 %	0 %	0 %	50 %	452857132
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71183	NC_020410	GTT	2	6	3325074	3325079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452857132
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71186	NC_020410	CAT	2	6	3325187	3325192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452857132
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71188	NC_020410	CTT	2	6	3325199	3325204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452857132
71189	NC_020410	CCG	2	6	3325214	3325219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452857132
71190	NC_020410	GCC	2	6	3325230	3325235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452857132
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71192	NC_020410	CAT	2	6	3325281	3325286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452857132
71193	NC_020410	TCA	2	6	3325294	3325299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452857132
71194	NC_020410	GT	3	6	3325316	3325321	0 %	50 %	50 %	0 %	452857132
71195	NC_020410	GC	3	6	3325346	3325351	0 %	0 %	50 %	50 %	452857132
71196	NC_020410	TCA	2	6	3325396	3325401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452857132
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71200	NC_020410	TC	3	6	3325550	3325555	0 %	50 %	0 %	50 %	452857132
71201	NC_020410	TCTT	2	8	3325582	3325589	0 %	75 %	0 %	25 %	452857132
71202	NC_020410	CTT	2	6	3325685	3325690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452857132
71203	NC_020410	TC	3	6	3325788	3325793	0 %	50 %	0 %	50 %	452857132
71204	NC_020410	GCA	2	6	3325802	3325807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452857132
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71208	NC_020410	CTC	2	6	3326208	3326213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452857132
71209	NC_020410	GGC	2	6	3326286	3326291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452857132
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71211	NC_020410	ACT	2	6	3326323	3326328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452857132
71212	NC_020410	T	7	7	3326347	3326353	0 %	100 %	0 %	0 %	452857132
71213	NC_020410	CAG	2	6	3326598	3326603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452857132
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71215	NC_020410	GC	3	6	3326745	3326750	0 %	0 %	50 %	50 %	452857132
71216	NC_020410	GAT	2	6	3326815	3326820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452857132
71217	NC_020410	ACG	3	9	3326845	3326853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452857132
71218	NC_020410	T	6	6	3326884	3326889	0 %	100 %	0 %	0 %	452857132
71219	NC_020410	TCA	2	6	3326941	3326946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452857133
71220	NC_020410	GCC	2	6	3326987	3326992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452857133
71221	NC_020410	CTT	2	6	3327018	3327023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452857133
71222	NC_020410	TTCT	2	8	3327061	3327068	0 %	75 %	0 %	25 %	452857133
71223	NC_020410	TTC	2	6	3327109	3327114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452857133
71224	NC_020410	CG	3	6	3327136	3327141	0 %	0 %	50 %	50 %	452857133
71225	NC_020410	GCG	2	6	3327174	3327179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452857133
71226	NC_020410	CTG	2	6	3327208	3327213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452857133
71227	NC_020410	CGG	2	6	3327218	3327223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452857133
71228	NC_020410	ATG	2	6	3327278	3327283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452857133
71229	NC_020410	GCC	2	6	3327305	3327310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452857133
71230	NC_020410	GGA	2	6	3327345	3327350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452857133
71231	NC_020410	CTT	2	6	3327354	3327359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452857133
71232	NC_020410	CAG	2	6	3327415	3327420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452857133
71233	NC_020410	CAT	2	6	3327438	3327443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452857133
71234	NC_020410	GAT	2	6	3327466	3327471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452857133
71235	NC_020410	T	7	7	3327561	3327567	0 %	100 %	0 %	0 %	452857133
71236	NC_020410	GTC	2	6	3327575	3327580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452857133
71237	NC_020410	GATCA	2	10	3327625	3327634	40 %	20 %	20 %	20 %	452857133
71238	NC_020410	CGGA	2	8	3327652	3327659	25 %	0 %	50 %	25 %	452857133
71239	NC_020410	GAG	2	6	3327676	3327681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452857133
71240	NC_020410	TGA	2	6	3327693	3327698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452857133
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71243	NC_020410	CGG	2	6	3327976	3327981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452857133
71244	NC_020410	CAT	2	6	3328039	3328044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452857133
71245	NC_020410	GCT	2	6	3328065	3328070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452857133
71246	NC_020410	CTC	2	6	3328123	3328128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452857133
71247	NC_020410	CT	3	6	3328252	3328257	0 %	50 %	0 %	50 %	452857133
71248	NC_020410	CAG	2	6	3328411	3328416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452857133
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71252	NC_020410	TC	3	6	3328526	3328531	0 %	50 %	0 %	50 %	452857133
71253	NC_020410	AG	3	6	3328541	3328546	50 %	0 %	50 %	0 %	452857133
71254	NC_020410	TCA	2	6	3328577	3328582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452857133
71255	NC_020410	CTT	2	6	3328764	3328769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452857133
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71257	NC_020410	A	6	6	3329051	3329056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71258	NC_020410	TCTT	2	8	3329115	3329122	0 %	75 %	0 %	25 %	452857134
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71266	NC_020410	TTC	2	6	3329360	3329365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71267	NC_020410	A	6	6	3329384	3329389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71268	NC_020410	GAA	2	6	3329391	3329396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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71272	NC_020410	TTC	2	6	3329513	3329518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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71274	NC_020410	GAA	2	6	3329618	3329623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71275	NC_020410	A	7	7	3329622	3329628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71276	NC_020410	GAA	2	6	3329670	3329675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452857135
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71302	NC_020410	GACA	2	8	3331095	3331102	50 %	0 %	25 %	25 %	452857135
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