MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5036 complete genome

Total Repeats: 83872

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_020410	AGAATG	2	12	312776	312787	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	452854347
6502	NC_020410	CGG	2	6	312805	312810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854347
6503	NC_020410	GCT	2	6	312820	312825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854347
6504	NC_020410	TTC	2	6	312866	312871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854347
6505	NC_020410	CGG	2	6	312886	312891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854347
6506	NC_020410	CTG	2	6	312899	312904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854347
6507	NC_020410	AGA	2	6	312946	312951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854347
6508	NC_020410	GC	3	6	312957	312962	0 %	0 %	50 %	50 %	452854347
6509	NC_020410	GCA	2	6	313015	313020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854347
6510	NC_020410	TGA	2	6	313024	313029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854347
6511	NC_020410	TGA	2	6	313060	313065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854347
6512	NC_020410	TTC	2	6	313087	313092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854347
6513	NC_020410	TGA	2	6	313165	313170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854347
6514	NC_020410	TGG	2	6	313172	313177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452854347
6515	NC_020410	A	8	8	313187	313194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6516	NC_020410	T	6	6	313215	313220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6517	NC_020410	TTTA	2	8	313233	313240	25 %	75 %	0 %	0 %	452854348
6518	NC_020410	TGC	2	6	313275	313280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854348
6519	NC_020410	AGC	2	6	313333	313338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854348
6520	NC_020410	CGGATG	2	12	313419	313430	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	452854348
6521	NC_020410	T	6	6	313504	313509	0 %	100 %	0 %	0 %	452854348
6522	NC_020410	AAATG	2	10	313537	313546	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_020410	TAA	2	6	313558	313563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6524	NC_020410	GAT	2	6	313567	313572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_020410	TCC	2	6	313585	313590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6526	NC_020410	T	7	7	313604	313610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6527	NC_020410	A	6	6	313620	313625	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6528	NC_020410	TATT	2	8	313647	313654	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6529	NC_020410	T	7	7	313693	313699	0 %	100 %	0 %	0 %	452854349
6530	NC_020410	CTG	2	6	313815	313820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854349
6531	NC_020410	T	6	6	313912	313917	0 %	100 %	0 %	0 %	452854349
6532	NC_020410	CAG	2	6	313965	313970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854349
6533	NC_020410	GTG	2	6	313977	313982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452854349
6534	NC_020410	CTG	2	6	314008	314013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854349
6535	NC_020410	ATG	3	9	314059	314067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854349
6536	NC_020410	CGG	2	6	314157	314162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854349
6537	NC_020410	ATC	2	6	314164	314169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854349
6538	NC_020410	AT	3	6	314202	314207	50 %	50 %	0 %	0 %	452854349
6539	NC_020410	TCT	2	6	314223	314228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854349
6540	NC_020410	ATC	2	6	314287	314292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854349
6541	NC_020410	T	7	7	314305	314311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6542	NC_020410	A	7	7	314321	314327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6543	NC_020410	TCGA	2	8	314334	314341	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6544	NC_020410	A	6	6	314354	314359	100 %	0 %	0 %	0 %	452854350
6545	NC_020410	TCA	2	6	314450	314455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854350
6546	NC_020410	TCC	2	6	314665	314670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452854350
6547	NC_020410	GCC	2	6	314683	314688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854350
6548	NC_020410	CGTA	2	8	314702	314709	25 %	25 %	25 %	25 %	452854350
6549	NC_020410	GCC	2	6	314761	314766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854350
6550	NC_020410	GAAG	2	8	314818	314825	50 %	0 %	50 %	0 %	452854350
6551	NC_020410	GCCT	2	8	314902	314909	0 %	25 %	25 %	50 %	452854350
6552	NC_020410	GGCA	2	8	314946	314953	25 %	0 %	50 %	25 %	452854350
6553	NC_020410	TCC	2	6	314965	314970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452854350
6554	NC_020410	GCT	2	6	314975	314980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854350
6555	NC_020410	TA	3	6	315012	315017	50 %	50 %	0 %	0 %	452854350
6556	NC_020410	GAAA	2	8	315072	315079	75 %	0 %	25 %	0 %	452854350
6557	NC_020410	TCC	2	6	315141	315146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6558	NC_020410	T	6	6	315218	315223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6559	NC_020410	GT	3	6	315233	315238	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6560	NC_020410	CA	3	6	315258	315263	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6561	NC_020410	T	6	6	315277	315282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6562	NC_020410	AAT	2	6	315297	315302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6563	NC_020410	AATT	2	8	315320	315327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6564	NC_020410	G	6	6	315340	315345	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6565	NC_020410	A	6	6	315357	315362	100 %	0 %	0 %	0 %	452854351
6566	NC_020410	T	6	6	315438	315443	0 %	100 %	0 %	0 %	452854351
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6568	NC_020410	TA	3	6	315459	315464	50 %	50 %	0 %	0 %	452854351
6569	NC_020410	CCAT	2	8	315492	315499	25 %	25 %	0 %	50 %	452854351
6570	NC_020410	T	6	6	315541	315546	0 %	100 %	0 %	0 %	452854351
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6575	NC_020410	TATT	2	8	315889	315896	25 %	75 %	0 %	0 %	452854351
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6578	NC_020410	GACT	2	8	316012	316019	25 %	25 %	25 %	25 %	452854351
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6583	NC_020410	CGG	2	6	316247	316252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854351
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6589	NC_020410	TGAG	2	8	316444	316451	25 %	25 %	50 %	0 %	452854351
6590	NC_020410	AGAA	2	8	316663	316670	75 %	0 %	25 %	0 %	452854351
6591	NC_020410	TCT	2	6	316680	316685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6592	NC_020410	TTTC	2	8	316700	316707	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6593	NC_020410	ATA	2	6	316745	316750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6594	NC_020410	AGG	2	6	316772	316777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6595	NC_020410	AGAA	2	8	316819	316826	75 %	0 %	25 %	0 %	452854352
6596	NC_020410	ACA	2	6	316862	316867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452854352
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6598	NC_020410	A	6	6	316967	316972	100 %	0 %	0 %	0 %	452854352
6599	NC_020410	TA	3	6	317006	317011	50 %	50 %	0 %	0 %	452854352
6600	NC_020410	TGC	2	6	317090	317095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854352
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6602	NC_020410	CTG	2	6	317159	317164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854352
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6604	NC_020410	AGA	2	6	317284	317289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854352
6605	NC_020410	T	6	6	317380	317385	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6606	NC_020410	AAAC	2	8	317392	317399	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6607	NC_020410	TTA	2	6	317402	317407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6608	NC_020410	AAT	2	6	317480	317485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6609	NC_020410	CTC	2	6	317549	317554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452854353
6610	NC_020410	CAT	3	9	317576	317584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854353
6611	NC_020410	CAGCA	2	10	317848	317857	40 %	0 %	20 %	40 %	452854353
6612	NC_020410	ATT	2	6	317933	317938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854353
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6616	NC_020410	GGC	2	6	318060	318065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854353
6617	NC_020410	TGA	2	6	318144	318149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854353
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6621	NC_020410	ATAC	2	8	318387	318394	50 %	25 %	0 %	25 %	452854353
6622	NC_020410	CTT	2	6	318395	318400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854353
6623	NC_020410	GAC	2	6	318446	318451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854353
6624	NC_020410	T	6	6	318476	318481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6625	NC_020410	ATC	2	6	318525	318530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854354
6626	NC_020410	GAA	2	6	318531	318536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854354
6627	NC_020410	AGCAC	2	10	318551	318560	40 %	0 %	20 %	40 %	452854354
6628	NC_020410	AGCGAC	2	12	318618	318629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854354
6629	NC_020410	A	6	6	318657	318662	100 %	0 %	0 %	0 %	452854354
6630	NC_020410	TCGA	2	8	318675	318682	25 %	25 %	25 %	25 %	452854354
6631	NC_020410	AGA	2	6	318701	318706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854354
6632	NC_020410	A	6	6	318768	318773	100 %	0 %	0 %	0 %	452854354
6633	NC_020410	CT	3	6	318798	318803	0 %	50 %	0 %	50 %	452854354
6634	NC_020410	GAT	2	6	318809	318814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854354
6635	NC_020410	TAT	2	6	318816	318821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854354
6636	NC_020410	A	6	6	318922	318927	100 %	0 %	0 %	0 %	452854354
6637	NC_020410	AGTGA	2	10	318942	318951	40 %	20 %	40 %	0 %	452854354
6638	NC_020410	CCG	2	6	319023	319028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854354
6639	NC_020410	A	7	7	319107	319113	100 %	0 %	0 %	0 %	452854354
6640	NC_020410	TCAT	2	8	319150	319157	25 %	50 %	0 %	25 %	452854354
6641	NC_020410	AGA	3	9	319166	319174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854354
6642	NC_020410	GGA	2	6	319232	319237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854354
6643	NC_020410	G	6	6	319276	319281	0 %	0 %	100 %	0 %	452854354
6644	NC_020410	TCCG	2	8	319313	319320	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6645	NC_020410	T	6	6	319323	319328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6646	NC_020410	AAG	2	6	319351	319356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6647	NC_020410	CTT	2	6	319455	319460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6648	NC_020410	T	6	6	319500	319505	0 %	100 %	0 %	0 %	452854355
6649	NC_020410	AGC	2	6	319522	319527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854355
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6652	NC_020410	GAG	2	6	319708	319713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452854355
6653	NC_020410	TGCA	2	8	319714	319721	25 %	25 %	25 %	25 %	452854355
6654	NC_020410	TGA	2	6	319740	319745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854355
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6659	NC_020410	TGA	2	6	319992	319997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854355
6660	NC_020410	A	6	6	320072	320077	100 %	0 %	0 %	0 %	452854355
6661	NC_020410	ATG	2	6	320153	320158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854355
6662	NC_020410	TGG	2	6	320267	320272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452854355
6663	NC_020410	AAG	2	6	320273	320278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854355
6664	NC_020410	AAG	2	6	320389	320394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854355
6665	NC_020410	A	6	6	320396	320401	100 %	0 %	0 %	0 %	452854355
6666	NC_020410	GA	3	6	320404	320409	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6667	NC_020410	GAA	2	6	320472	320477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854356
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6670	NC_020410	AGA	2	6	320594	320599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854356
6671	NC_020410	GTC	2	6	320601	320606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854356
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6674	NC_020410	CCG	2	6	320738	320743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854356
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6676	NC_020410	GAA	2	6	320903	320908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452854356
6677	NC_020410	CCG	2	6	320949	320954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854356
6678	NC_020410	CTT	2	6	320960	320965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452854356
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6683	NC_020410	TTG	2	6	321148	321153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452854356
6684	NC_020410	CG	3	6	321219	321224	0 %	0 %	50 %	50 %	452854356
6685	NC_020410	CAG	2	6	321243	321248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854356
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6689	NC_020410	GAT	2	6	321585	321590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452854356
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6696	NC_020410	G	6	6	321990	321995	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6697	NC_020410	GGA	3	9	322024	322032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6698	NC_020410	ATT	2	6	322057	322062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854357
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6700	NC_020410	G	6	6	322147	322152	0 %	0 %	100 %	0 %	452854357
6701	NC_020410	GCG	2	6	322192	322197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854357
6702	NC_020410	GCG	2	6	322256	322261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452854357
6703	NC_020410	ATC	2	6	322458	322463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854357
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6708	NC_020410	TCCGT	2	10	322691	322700	0 %	40 %	20 %	40 %	452854357
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6712	NC_020410	GAAA	2	8	322827	322834	75 %	0 %	25 %	0 %	452854357
6713	NC_020410	GATG	2	8	322862	322869	25 %	25 %	50 %	0 %	452854357
6714	NC_020410	ACC	2	6	322922	322927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452854357
6715	NC_020410	GCTG	2	8	322941	322948	0 %	25 %	50 %	25 %	452854357
6716	NC_020410	ATT	2	6	322996	323001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854357
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6721	NC_020410	GTC	2	6	323428	323433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854357
6722	NC_020410	GAA	2	6	323525	323530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6723	NC_020410	T	7	7	323598	323604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6724	NC_020410	GATAAA	2	12	323633	323644	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6725	NC_020410	AG	4	8	323680	323687	50 %	0 %	50 %	0 %	452854358
6726	NC_020410	T	6	6	323688	323693	0 %	100 %	0 %	0 %	452854358
6727	NC_020410	AATT	2	8	323712	323719	50 %	50 %	0 %	0 %	452854358
6728	NC_020410	TCA	2	6	323724	323729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854358
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6730	NC_020410	TTA	2	6	323794	323799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452854358
6731	NC_020410	CAG	2	6	323825	323830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452854358
6732	NC_020410	A	7	7	323842	323848	100 %	0 %	0 %	0 %	452854358
6733	NC_020410	A	6	6	323931	323936	100 %	0 %	0 %	0 %	452854358
6734	NC_020410	AG	3	6	323958	323963	50 %	0 %	50 %	0 %	452854358
6735	NC_020410	GACG	2	8	324034	324041	25 %	0 %	50 %	25 %	452854358
6736	NC_020410	T	6	6	324052	324057	0 %	100 %	0 %	0 %	452854358
6737	NC_020410	ATC	2	6	324086	324091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452854358
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6739	NC_020410	GA	3	6	324125	324130	50 %	0 %	50 %	0 %	452854358
6740	NC_020410	TGC	2	6	324216	324221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854358
6741	NC_020410	T	6	6	324228	324233	0 %	100 %	0 %	0 %	452854358
6742	NC_020410	GTC	2	6	324239	324244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854358
6743	NC_020410	CGC	2	6	324250	324255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452854358
6744	NC_020410	ATGGGG	2	12	324258	324269	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	452854358
6745	NC_020410	AGTC	2	8	324325	324332	25 %	25 %	25 %	25 %	452854358
6746	NC_020410	TCG	3	9	324363	324371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854358
6747	NC_020410	A	6	6	324384	324389	100 %	0 %	0 %	0 %	452854358
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6749	NC_020410	CTG	2	6	324428	324433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452854358
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6997	NC_020410	T	6	6	336221	336226	0 %	100 %	0 %	0 %	452854365
6998	NC_020410	T	6	6	336422	336427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6999	NC_020410	TGAT	2	8	336429	336436	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7000	NC_020410	AATA	2	8	336473	336480	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

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