MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5036 complete genome

Total Repeats: 83872

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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65002	NC_020410	T	6	6	3041012	3041017	0 %	100 %	0 %	0 %	452856842
65003	NC_020410	T	6	6	3041039	3041044	0 %	100 %	0 %	0 %	452856842
65004	NC_020410	TGA	2	6	3041085	3041090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856842
65005	NC_020410	GAC	2	6	3041105	3041110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856842
65006	NC_020410	TTC	2	6	3041177	3041182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65007	NC_020410	TA	3	6	3041243	3041248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65008	NC_020410	GCCAC	2	10	3041386	3041395	20 %	0 %	20 %	60 %	452856843
65009	NC_020410	TCA	2	6	3041428	3041433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856843
65010	NC_020410	TGT	2	6	3041434	3041439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452856843
65011	NC_020410	GCT	2	6	3041494	3041499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856843
65012	NC_020410	GAA	2	6	3041555	3041560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452856843
65013	NC_020410	CAG	2	6	3041573	3041578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856843
65014	NC_020410	AGG	2	6	3041605	3041610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452856843
65015	NC_020410	GTC	2	6	3041666	3041671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856843
65016	NC_020410	GAT	2	6	3041674	3041679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856843
65017	NC_020410	TGC	2	6	3041689	3041694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856843
65018	NC_020410	AT	3	6	3041697	3041702	50 %	50 %	0 %	0 %	452856843
65019	NC_020410	GGC	2	6	3041717	3041722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452856843
65020	NC_020410	TCC	2	6	3041763	3041768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452856843
65021	NC_020410	TCT	2	6	3041814	3041819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856843
65022	NC_020410	AAT	2	6	3041884	3041889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452856843
65023	NC_020410	TTTTC	2	10	3041908	3041917	0 %	80 %	0 %	20 %	452856843
65024	NC_020410	CTT	2	6	3042019	3042024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856843
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65026	NC_020410	TCCT	2	8	3042161	3042168	0 %	50 %	0 %	50 %	452856843
65027	NC_020410	GTA	2	6	3042227	3042232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856843
65028	NC_020410	AAGA	2	8	3042278	3042285	75 %	0 %	25 %	0 %	452856843
65029	NC_020410	ATG	2	6	3042363	3042368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856843
65030	NC_020410	TCA	2	6	3042373	3042378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856843
65031	NC_020410	CCTG	2	8	3042385	3042392	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65032	NC_020410	CGG	2	6	3042427	3042432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65033	NC_020410	AAT	2	6	3042440	3042445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65034	NC_020410	TGT	2	6	3042499	3042504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452856844
65035	NC_020410	A	7	7	3042515	3042521	100 %	0 %	0 %	0 %	452856844
65036	NC_020410	AAC	2	6	3042550	3042555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452856844
65037	NC_020410	G	6	6	3042598	3042603	0 %	0 %	100 %	0 %	452856844
65038	NC_020410	GACG	2	8	3042608	3042615	25 %	0 %	50 %	25 %	452856844
65039	NC_020410	A	8	8	3042643	3042650	100 %	0 %	0 %	0 %	452856844
65040	NC_020410	ATC	2	6	3042652	3042657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856844
65041	NC_020410	A	7	7	3042766	3042772	100 %	0 %	0 %	0 %	452856844
65042	NC_020410	TGA	2	6	3042806	3042811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856844
65043	NC_020410	AT	3	6	3042856	3042861	50 %	50 %	0 %	0 %	452856844
65044	NC_020410	TGA	2	6	3042965	3042970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856844
65045	NC_020410	TCG	2	6	3042973	3042978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856844
65046	NC_020410	GCA	2	6	3042987	3042992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856844
65047	NC_020410	T	7	7	3043060	3043066	0 %	100 %	0 %	0 %	452856845
65048	NC_020410	AATC	2	8	3043094	3043101	50 %	25 %	0 %	25 %	452856845
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65051	NC_020410	ATA	2	6	3043276	3043281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452856845
65052	NC_020410	TTG	2	6	3043400	3043405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452856845
65053	NC_020410	TCT	2	6	3043504	3043509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856845
65054	NC_020410	TTC	2	6	3043527	3043532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856845
65055	NC_020410	CTT	2	6	3043550	3043555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856845
65056	NC_020410	T	6	6	3043581	3043586	0 %	100 %	0 %	0 %	452856845
65057	NC_020410	TGC	2	6	3043600	3043605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856845
65058	NC_020410	TCG	2	6	3043619	3043624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856845
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65062	NC_020410	CG	3	6	3043730	3043735	0 %	0 %	50 %	50 %	452856845
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65086	NC_020410	CTTAT	2	10	3044816	3044825	20 %	60 %	0 %	20 %	452856848
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65108	NC_020410	TCTT	2	8	3045705	3045712	0 %	75 %	0 %	25 %	452856848
65109	NC_020410	CAT	2	6	3045724	3045729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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65113	NC_020410	T	6	6	3045949	3045954	0 %	100 %	0 %	0 %	452856849
65114	NC_020410	CGAA	2	8	3046007	3046014	50 %	0 %	25 %	25 %	452856849
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65118	NC_020410	AAATCC	2	12	3046178	3046189	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	452856849
65119	NC_020410	GACGGC	2	12	3046239	3046250	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	452856849
65120	NC_020410	ATG	2	6	3046273	3046278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856849
65121	NC_020410	ATT	2	6	3046357	3046362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452856849
65122	NC_020410	CCG	2	6	3046364	3046369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856849
65123	NC_020410	GCC	2	6	3046423	3046428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856849
65124	NC_020410	GCA	2	6	3046483	3046488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856849
65125	NC_020410	CGG	2	6	3046511	3046516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452856849
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65127	NC_020410	CGG	2	6	3046616	3046621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452856849
65128	NC_020410	CCG	2	6	3046761	3046766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856849
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65130	NC_020410	AC	3	6	3046899	3046904	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65131	NC_020410	GCC	2	6	3046906	3046911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65132	NC_020410	TG	3	6	3046927	3046932	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65133	NC_020410	TCTT	2	8	3046943	3046950	0 %	75 %	0 %	25 %	452856850
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65137	NC_020410	TGC	2	6	3047321	3047326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856850
65138	NC_020410	CTTC	2	8	3047343	3047350	0 %	50 %	0 %	50 %	452856850
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65145	NC_020410	A	7	7	3047614	3047620	100 %	0 %	0 %	0 %	452856850
65146	NC_020410	AGA	2	6	3047630	3047635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452856850
65147	NC_020410	CT	3	6	3047661	3047666	0 %	50 %	0 %	50 %	452856850
65148	NC_020410	C	6	6	3047702	3047707	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
65149	NC_020410	G	6	6	3047734	3047739	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
65150	NC_020410	TATTT	2	10	3047746	3047755	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65151	NC_020410	CGGC	2	8	3047801	3047808	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65152	NC_020410	CG	3	6	3047830	3047835	0 %	0 %	50 %	50 %	452856851
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65172	NC_020410	ATT	2	6	3048969	3048974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452856851
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65175	NC_020410	TC	3	6	3049219	3049224	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65176	NC_020410	GAC	2	6	3049280	3049285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856852
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65182	NC_020410	CAT	2	6	3049499	3049504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856852
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65220	NC_020410	TTTTG	2	10	3051155	3051164	0 %	80 %	20 %	0 %	452856854
65221	NC_020410	CCG	2	6	3051174	3051179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856854
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65223	NC_020410	A	7	7	3051359	3051365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65224	NC_020410	TCA	2	6	3051374	3051379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856855
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65231	NC_020410	GAGCG	2	10	3051873	3051882	20 %	0 %	60 %	20 %	452856855
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65233	NC_020410	T	6	6	3051908	3051913	0 %	100 %	0 %	0 %	452856855
65234	NC_020410	AAT	2	6	3051933	3051938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452856855
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65474	NC_020410	CCT	2	6	3063828	3063833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65475	NC_020410	TGTTA	2	10	3063861	3063870	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
65476	NC_020410	TAT	2	6	3063918	3063923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65477	NC_020410	ATA	2	6	3063930	3063935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65478	NC_020410	ATA	2	6	3063939	3063944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65479	NC_020410	TAC	3	9	3063946	3063954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65480	NC_020410	AGG	2	6	3063962	3063967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65481	NC_020410	TA	3	6	3064005	3064010	50 %	50 %	0 %	0 %	452856864
65482	NC_020410	AAG	2	6	3064043	3064048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452856864
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65487	NC_020410	GCA	2	6	3064171	3064176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856864
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65497	NC_020410	T	6	6	3064744	3064749	0 %	100 %	0 %	0 %	452856865
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