MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5036 complete genome

Total Repeats: 83872

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
59001	NC_020410	TGTC	2	8	2762956	2762963	0 %	50 %	25 %	25 %	452856575
59002	NC_020410	T	6	6	2763028	2763033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59003	NC_020410	T	6	6	2763040	2763045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59004	NC_020410	GGA	2	6	2763083	2763088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59005	NC_020410	ACG	2	6	2763113	2763118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856576
59006	NC_020410	AC	3	6	2763178	2763183	50 %	0 %	0 %	50 %	452856576
59007	NC_020410	A	7	7	2763197	2763203	100 %	0 %	0 %	0 %	452856576
59008	NC_020410	CTGA	2	8	2763240	2763247	25 %	25 %	25 %	25 %	452856576
59009	NC_020410	GCT	2	6	2763253	2763258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856576
59010	NC_020410	AAGA	2	8	2763286	2763293	75 %	0 %	25 %	0 %	452856576
59011	NC_020410	GATG	2	8	2763371	2763378	25 %	25 %	50 %	0 %	452856577
59012	NC_020410	GCCG	2	8	2763380	2763387	0 %	0 %	50 %	50 %	452856577
59013	NC_020410	CCG	2	6	2763399	2763404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856577
59014	NC_020410	TGA	2	6	2763430	2763435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856577
59015	NC_020410	TCT	3	9	2763474	2763482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856577
59016	NC_020410	GGT	2	6	2763554	2763559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452856577
59017	NC_020410	T	6	6	2763581	2763586	0 %	100 %	0 %	0 %	452856577
59018	NC_020410	ATAA	2	8	2763632	2763639	75 %	25 %	0 %	0 %	452856577
59019	NC_020410	CAC	2	6	2763653	2763658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452856577
59020	NC_020410	ATTG	2	8	2763679	2763686	25 %	50 %	25 %	0 %	452856577
59021	NC_020410	T	6	6	2763744	2763749	0 %	100 %	0 %	0 %	452856577
59022	NC_020410	GTG	2	6	2763750	2763755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452856577
59023	NC_020410	CGA	2	6	2763784	2763789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856577
59024	NC_020410	TCAGC	2	10	2763802	2763811	20 %	20 %	20 %	40 %	452856577
59025	NC_020410	TTCC	2	8	2763844	2763851	0 %	50 %	0 %	50 %	452856577
59026	NC_020410	TGG	2	6	2763936	2763941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452856577
59027	NC_020410	TCG	2	6	2763981	2763986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856577
59028	NC_020410	A	6	6	2764068	2764073	100 %	0 %	0 %	0 %	452856577
59029	NC_020410	T	7	7	2764110	2764116	0 %	100 %	0 %	0 %	452856577
59030	NC_020410	GGAAAA	2	12	2764295	2764306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59031	NC_020410	GGA	2	6	2764349	2764354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59032	NC_020410	GTTTTT	2	12	2764369	2764380	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	452856578
59033	NC_020410	CTGC	2	8	2764394	2764401	0 %	25 %	25 %	50 %	452856578
59034	NC_020410	GC	3	6	2764490	2764495	0 %	0 %	50 %	50 %	452856578
59035	NC_020410	CGG	2	6	2764557	2764562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452856578
59036	NC_020410	GCAG	2	8	2764582	2764589	25 %	0 %	50 %	25 %	452856578
59037	NC_020410	CCAT	2	8	2764628	2764635	25 %	25 %	0 %	50 %	452856578
59038	NC_020410	AATG	2	8	2764664	2764671	50 %	25 %	25 %	0 %	452856578
59039	NC_020410	TC	3	6	2764700	2764705	0 %	50 %	0 %	50 %	452856579
59040	NC_020410	ACTTCC	2	12	2764758	2764769	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	452856579
59041	NC_020410	GAA	2	6	2764847	2764852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452856579
59042	NC_020410	CGC	2	6	2764879	2764884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856579
59043	NC_020410	GGC	2	6	2764910	2764915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452856579
59044	NC_020410	TCG	2	6	2764927	2764932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856579
59045	NC_020410	GCG	2	6	2764975	2764980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452856579
59046	NC_020410	CGGC	2	8	2764999	2765006	0 %	0 %	50 %	50 %	452856579
59047	NC_020410	TCT	2	6	2765022	2765027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856579
59048	NC_020410	ATC	2	6	2765048	2765053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856579
59049	NC_020410	GCT	2	6	2765074	2765079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856579
59050	NC_020410	GGC	2	6	2765113	2765118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452856579
59051	NC_020410	TTCC	2	8	2765170	2765177	0 %	50 %	0 %	50 %	452856579
59052	NC_020410	CAT	2	6	2765183	2765188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856579
59053	NC_020410	CTG	2	6	2765318	2765323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856579
59054	NC_020410	T	7	7	2765361	2765367	0 %	100 %	0 %	0 %	452856579
59055	NC_020410	T	7	7	2765453	2765459	0 %	100 %	0 %	0 %	452856579
59056	NC_020410	ATC	2	6	2765487	2765492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856579
59057	NC_020410	GA	3	6	2765523	2765528	50 %	0 %	50 %	0 %	452856579
59058	NC_020410	GTC	2	6	2765567	2765572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856579
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59061	NC_020410	CGC	2	6	2765666	2765671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856579
59062	NC_020410	CAT	2	6	2765681	2765686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856579
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59072	NC_020410	TAT	2	6	2766043	2766048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59073	NC_020410	ATTC	2	8	2766062	2766069	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59074	NC_020410	A	6	6	2766085	2766090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59075	NC_020410	GGC	2	6	2766091	2766096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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59085	NC_020410	A	6	6	2766889	2766894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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59091	NC_020410	AGCC	2	8	2767215	2767222	25 %	0 %	25 %	50 %	452856581
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59098	NC_020410	T	6	6	2767753	2767758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59099	NC_020410	A	8	8	2767775	2767782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59100	NC_020410	ACAG	2	8	2767792	2767799	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
59101	NC_020410	TCC	2	6	2767826	2767831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59102	NC_020410	CTTT	2	8	2767886	2767893	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
59103	NC_020410	TCA	2	6	2767895	2767900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59104	NC_020410	GCTTTT	2	12	2768019	2768030	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	452856582
59105	NC_020410	CTG	2	6	2768048	2768053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856582
59106	NC_020410	CCG	2	6	2768064	2768069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856582
59107	NC_020410	T	6	6	2768080	2768085	0 %	100 %	0 %	0 %	452856582
59108	NC_020410	ATG	2	6	2768093	2768098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856582
59109	NC_020410	TCT	2	6	2768121	2768126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856582
59110	NC_020410	CTG	2	6	2768136	2768141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856582
59111	NC_020410	TTC	2	6	2768153	2768158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856582
59112	NC_020410	T	6	6	2768249	2768254	0 %	100 %	0 %	0 %	452856582
59113	NC_020410	AAT	2	6	2768260	2768265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452856582
59114	NC_020410	ATG	2	6	2768313	2768318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856582
59115	NC_020410	CTTC	2	8	2768367	2768374	0 %	50 %	0 %	50 %	452856582
59116	NC_020410	CTT	2	6	2768401	2768406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856582
59117	NC_020410	TGT	2	6	2768425	2768430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452856582
59118	NC_020410	AGCG	2	8	2768432	2768439	25 %	0 %	50 %	25 %	452856582
59119	NC_020410	CAT	2	6	2768468	2768473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856582
59120	NC_020410	TCT	2	6	2768530	2768535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856582
59121	NC_020410	CAT	2	6	2768540	2768545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856582
59122	NC_020410	GCT	2	6	2768546	2768551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856582
59123	NC_020410	ATC	2	6	2768567	2768572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856582
59124	NC_020410	TCT	2	6	2768616	2768621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856582
59125	NC_020410	CAT	2	6	2768639	2768644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856582
59126	NC_020410	TGC	3	9	2768650	2768658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856582
59127	NC_020410	AGC	2	6	2768733	2768738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856582
59128	NC_020410	CCG	2	6	2768740	2768745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856582
59129	NC_020410	GCG	2	6	2768797	2768802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452856582
59130	NC_020410	AAGC	2	8	2768866	2768873	50 %	0 %	25 %	25 %	452856582
59131	NC_020410	TGG	2	6	2768877	2768882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452856582
59132	NC_020410	GAAA	2	8	2768885	2768892	75 %	0 %	25 %	0 %	452856582
59133	NC_020410	GAT	2	6	2768993	2768998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856582
59134	NC_020410	GTCG	2	8	2769032	2769039	0 %	25 %	50 %	25 %	452856582
59135	NC_020410	GCC	2	6	2769077	2769082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856582
59136	NC_020410	TTC	2	6	2769095	2769100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856582
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59138	NC_020410	AGG	2	6	2769180	2769185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452856582
59139	NC_020410	CTT	4	12	2769211	2769222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856582
59140	NC_020410	T	6	6	2769239	2769244	0 %	100 %	0 %	0 %	452856582
59141	NC_020410	GA	3	6	2769263	2769268	50 %	0 %	50 %	0 %	452856582
59142	NC_020410	GATG	2	8	2769308	2769315	25 %	25 %	50 %	0 %	452856582
59143	NC_020410	T	6	6	2769346	2769351	0 %	100 %	0 %	0 %	452856582
59144	NC_020410	CTT	2	6	2769371	2769376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856582
59145	NC_020410	CTT	2	6	2769394	2769399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856583
59146	NC_020410	TCG	2	6	2769503	2769508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856583
59147	NC_020410	ATGGC	2	10	2769542	2769551	20 %	20 %	40 %	20 %	452856583
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59149	NC_020410	TTTC	2	8	2769597	2769604	0 %	75 %	0 %	25 %	452856583
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59152	NC_020410	CTT	2	6	2769702	2769707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856583
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59155	NC_020410	GGC	2	6	2769995	2770000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452856583
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59157	NC_020410	TCT	2	6	2770013	2770018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856583
59158	NC_020410	CATT	2	8	2770028	2770035	25 %	50 %	0 %	25 %	452856583
59159	NC_020410	TCT	2	6	2770124	2770129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856583
59160	NC_020410	TTTTCC	2	12	2770259	2770270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856583
59161	NC_020410	T	6	6	2770285	2770290	0 %	100 %	0 %	0 %	452856583
59162	NC_020410	ACGG	2	8	2770299	2770306	25 %	0 %	50 %	25 %	452856583
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59165	NC_020410	TCCTT	2	10	2770460	2770469	0 %	60 %	0 %	40 %	452856583
59166	NC_020410	CAA	2	6	2770491	2770496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452856583
59167	NC_020410	CCT	2	6	2770547	2770552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452856583
59168	NC_020410	T	7	7	2770571	2770577	0 %	100 %	0 %	0 %	452856583
59169	NC_020410	TAAT	2	8	2770621	2770628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59170	NC_020410	TGTA	2	8	2770641	2770648	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59171	NC_020410	T	6	6	2770672	2770677	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59172	NC_020410	A	8	8	2770690	2770697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59173	NC_020410	T	6	6	2770708	2770713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59174	NC_020410	AAT	2	6	2770785	2770790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452856584
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59177	NC_020410	GGC	2	6	2770887	2770892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452856584
59178	NC_020410	TCC	2	6	2770903	2770908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452856584
59179	NC_020410	GCG	2	6	2770964	2770969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452856584
59180	NC_020410	CAT	2	6	2771142	2771147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856584
59181	NC_020410	TTTC	2	8	2771168	2771175	0 %	75 %	0 %	25 %	452856584
59182	NC_020410	A	6	6	2771314	2771319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59183	NC_020410	T	6	6	2771341	2771346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59184	NC_020410	CGC	2	6	2771457	2771462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856585
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59208	NC_020410	GTTC	2	8	2772574	2772581	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59209	NC_020410	T	6	6	2772582	2772587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59210	NC_020410	A	6	6	2772609	2772614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59211	NC_020410	TTTC	2	8	2772756	2772763	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
59212	NC_020410	CATT	2	8	2772791	2772798	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59213	NC_020410	AAAAGC	2	12	2772802	2772813	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59214	NC_020410	CTT	2	6	2772840	2772845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59215	NC_020410	ATT	2	6	2772850	2772855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452856586
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59219	NC_020410	T	6	6	2772971	2772976	0 %	100 %	0 %	0 %	452856586
59220	NC_020410	TAG	2	6	2773021	2773026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856586
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59223	NC_020410	GC	3	6	2773093	2773098	0 %	0 %	50 %	50 %	452856586
59224	NC_020410	A	6	6	2773124	2773129	100 %	0 %	0 %	0 %	452856586
59225	NC_020410	AATA	2	8	2773169	2773176	75 %	25 %	0 %	0 %	452856586
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59227	NC_020410	TAG	2	6	2773245	2773250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856586
59228	NC_020410	ATAA	2	8	2773290	2773297	75 %	25 %	0 %	0 %	452856586
59229	NC_020410	TCG	2	6	2773380	2773385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856586
59230	NC_020410	CAG	2	6	2773439	2773444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856586
59231	NC_020410	GCC	2	6	2773493	2773498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856586
59232	NC_020410	TGA	2	6	2773522	2773527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856586
59233	NC_020410	TCTG	2	8	2773552	2773559	0 %	50 %	25 %	25 %	452856586
59234	NC_020410	GGC	2	6	2773787	2773792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452856586
59235	NC_020410	TCC	2	6	2773844	2773849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59236	NC_020410	GCA	2	6	2773872	2773877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59237	NC_020410	TC	3	6	2773892	2773897	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59238	NC_020410	GGT	2	6	2773946	2773951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452856587
59239	NC_020410	TCGCT	2	10	2773955	2773964	0 %	40 %	20 %	40 %	452856587
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59341	NC_020410	ATACG	2	10	2778278	2778287	40 %	20 %	20 %	20 %	452856593
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59355	NC_020410	TC	4	8	2778875	2778882	0 %	50 %	0 %	50 %	452856593
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