MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5036 complete genome

Total Repeats: 83872

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55501	NC_020410	TCG	2	6	2602143	2602148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856423
55502	NC_020410	GAT	2	6	2602198	2602203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856423
55503	NC_020410	TCG	2	6	2602227	2602232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856423
55504	NC_020410	CGGA	2	8	2602268	2602275	25 %	0 %	50 %	25 %	452856423
55505	NC_020410	TTC	2	6	2602291	2602296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856423
55506	NC_020410	TGA	2	6	2602314	2602319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856423
55507	NC_020410	AT	3	6	2602415	2602420	50 %	50 %	0 %	0 %	452856423
55508	NC_020410	TAA	2	6	2602466	2602471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452856423
55509	NC_020410	AGC	2	6	2602472	2602477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856423
55510	NC_020410	ATAA	2	8	2602478	2602485	75 %	25 %	0 %	0 %	452856423
55511	NC_020410	GAT	2	6	2602504	2602509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856423
55512	NC_020410	CTG	2	6	2602537	2602542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856423
55513	NC_020410	GC	3	6	2602596	2602601	0 %	0 %	50 %	50 %	452856423
55514	NC_020410	T	6	6	2602720	2602725	0 %	100 %	0 %	0 %	452856423
55515	NC_020410	CTT	2	6	2602731	2602736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856423
55516	NC_020410	T	6	6	2602735	2602740	0 %	100 %	0 %	0 %	452856423
55517	NC_020410	ATT	2	6	2602783	2602788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452856423
55518	NC_020410	T	6	6	2602807	2602812	0 %	100 %	0 %	0 %	452856423
55519	NC_020410	GTTC	2	8	2602863	2602870	0 %	50 %	25 %	25 %	452856423
55520	NC_020410	GTC	2	6	2602871	2602876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856423
55521	NC_020410	AAC	2	6	2602925	2602930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452856423
55522	NC_020410	CG	3	6	2602983	2602988	0 %	0 %	50 %	50 %	452856423
55523	NC_020410	CGCC	2	8	2603007	2603014	0 %	0 %	25 %	75 %	452856423
55524	NC_020410	CGG	2	6	2603084	2603089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452856423
55525	NC_020410	T	6	6	2603140	2603145	0 %	100 %	0 %	0 %	452856423
55526	NC_020410	CGC	2	6	2603178	2603183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856423
55527	NC_020410	AATCC	2	10	2603187	2603196	40 %	20 %	0 %	40 %	452856423
55528	NC_020410	ATT	2	6	2603206	2603211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452856423
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55531	NC_020410	TCC	2	6	2603304	2603309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55532	NC_020410	CAG	2	6	2603338	2603343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856424
55533	NC_020410	GAC	2	6	2603387	2603392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856424
55534	NC_020410	CAT	2	6	2603535	2603540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856424
55535	NC_020410	CGG	2	6	2603610	2603615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452856424
55536	NC_020410	GCTC	2	8	2603634	2603641	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55537	NC_020410	GAC	2	6	2603677	2603682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55538	NC_020410	T	6	6	2603758	2603763	0 %	100 %	0 %	0 %	452856425
55539	NC_020410	GAT	2	6	2603794	2603799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856425
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55541	NC_020410	GAA	2	6	2603852	2603857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452856425
55542	NC_020410	ATG	2	6	2603873	2603878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856425
55543	NC_020410	CCA	2	6	2603901	2603906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452856425
55544	NC_020410	AAGC	2	8	2603955	2603962	50 %	0 %	25 %	25 %	452856425
55545	NC_020410	GC	3	6	2603961	2603966	0 %	0 %	50 %	50 %	452856425
55546	NC_020410	G	6	6	2603967	2603972	0 %	0 %	100 %	0 %	452856425
55547	NC_020410	CGC	2	6	2604042	2604047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856425
55548	NC_020410	CGT	2	6	2604130	2604135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856425
55549	NC_020410	TGC	2	6	2604159	2604164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856425
55550	NC_020410	GCAG	2	8	2604180	2604187	25 %	0 %	50 %	25 %	452856425
55551	NC_020410	ACG	2	6	2604257	2604262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856425
55552	NC_020410	CT	3	6	2604334	2604339	0 %	50 %	0 %	50 %	452856425
55553	NC_020410	TATT	3	12	2604340	2604351	25 %	75 %	0 %	0 %	452856425
55554	NC_020410	AATCAG	2	12	2604376	2604387	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	452856425
55555	NC_020410	TGA	2	6	2604438	2604443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856425
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55557	NC_020410	GTC	2	6	2604509	2604514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856425
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55560	NC_020410	A	7	7	2604672	2604678	100 %	0 %	0 %	0 %	452856425
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55566	NC_020410	GCC	2	6	2604902	2604907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856425
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55568	NC_020410	TTTTG	2	10	2604952	2604961	0 %	80 %	20 %	0 %	452856425
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55573	NC_020410	CAT	2	6	2605135	2605140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856425
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55577	NC_020410	T	7	7	2605411	2605417	0 %	100 %	0 %	0 %	452856426
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55589	NC_020410	AT	3	6	2606097	2606102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55590	NC_020410	GGAGA	2	10	2606116	2606125	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
55591	NC_020410	GAA	2	6	2606134	2606139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452856427
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55595	NC_020410	GCGG	2	8	2606299	2606306	0 %	0 %	75 %	25 %	452856427
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55602	NC_020410	A	7	7	2606519	2606525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55603	NC_020410	T	7	7	2606543	2606549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55604	NC_020410	GTAT	2	8	2606550	2606557	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55605	NC_020410	GCG	2	6	2606596	2606601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452856428
55606	NC_020410	GAC	2	6	2606638	2606643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856428
55607	NC_020410	TCA	2	6	2606651	2606656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856428
55608	NC_020410	TCC	2	6	2606680	2606685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452856428
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55610	NC_020410	T	6	6	2606707	2606712	0 %	100 %	0 %	0 %	452856428
55611	NC_020410	CTG	2	6	2606743	2606748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856428
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55615	NC_020410	TTTA	2	8	2606855	2606862	25 %	75 %	0 %	0 %	452856429
55616	NC_020410	TTA	2	6	2606882	2606887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452856429
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55618	NC_020410	GTT	2	6	2606996	2607001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452856429
55619	NC_020410	CGGA	2	8	2607097	2607104	25 %	0 %	50 %	25 %	452856429
55620	NC_020410	CGC	2	6	2607210	2607215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856429
55621	NC_020410	CGG	2	6	2607544	2607549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452856429
55622	NC_020410	TCA	2	6	2607554	2607559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856429
55623	NC_020410	CAT	2	6	2607565	2607570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856429
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55625	NC_020410	CCG	2	6	2607710	2607715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856429
55626	NC_020410	CG	3	6	2607730	2607735	0 %	0 %	50 %	50 %	452856429
55627	NC_020410	GCCC	2	8	2607759	2607766	0 %	0 %	25 %	75 %	452856429
55628	NC_020410	CTT	2	6	2607768	2607773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856429
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55630	NC_020410	GC	3	6	2607946	2607951	0 %	0 %	50 %	50 %	452856429
55631	NC_020410	GTTT	2	8	2607956	2607963	0 %	75 %	25 %	0 %	452856429
55632	NC_020410	GTT	2	6	2607993	2607998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452856429
55633	NC_020410	CCT	2	6	2608017	2608022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55634	NC_020410	GAA	2	6	2608063	2608068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452856430
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55642	NC_020410	GCT	2	6	2608590	2608595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856430
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55649	NC_020410	TAA	2	6	2608810	2608815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452856430
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55652	NC_020410	GCAG	2	8	2608865	2608872	25 %	0 %	50 %	25 %	452856430
55653	NC_020410	A	6	6	2608912	2608917	100 %	0 %	0 %	0 %	452856430
55654	NC_020410	GCCC	2	8	2608950	2608957	0 %	0 %	25 %	75 %	452856430
55655	NC_020410	AAAT	2	8	2609044	2609051	75 %	25 %	0 %	0 %	452856430
55656	NC_020410	TCA	2	6	2609058	2609063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856430
55657	NC_020410	A	6	6	2609103	2609108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55658	NC_020410	GAAA	2	8	2609158	2609165	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55659	NC_020410	CTT	2	6	2609180	2609185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55660	NC_020410	AGTC	2	8	2609278	2609285	25 %	25 %	25 %	25 %	452856431
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55667	NC_020410	TTC	2	6	2609556	2609561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856431
55668	NC_020410	TC	3	6	2609596	2609601	0 %	50 %	0 %	50 %	452856431
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55672	NC_020410	GTC	2	6	2609806	2609811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856431
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55675	NC_020410	TCC	2	6	2609896	2609901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452856431
55676	NC_020410	CGT	2	6	2610033	2610038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856431
55677	NC_020410	GTT	2	6	2610082	2610087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452856431
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55683	NC_020410	T	6	6	2610376	2610381	0 %	100 %	0 %	0 %	452856432
55684	NC_020410	GC	3	6	2610463	2610468	0 %	0 %	50 %	50 %	452856432
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55688	NC_020410	CAG	2	6	2610682	2610687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856432
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55695	NC_020410	A	8	8	2610999	2611006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55696	NC_020410	GATC	2	8	2611058	2611065	25 %	25 %	25 %	25 %	452856433
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55702	NC_020410	TCC	2	6	2611345	2611350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452856433
55703	NC_020410	TCC	2	6	2611473	2611478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452856433
55704	NC_020410	TCAA	2	8	2611562	2611569	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55705	NC_020410	TTTC	2	8	2611613	2611620	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55706	NC_020410	A	7	7	2611639	2611645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55707	NC_020410	CT	3	6	2611650	2611655	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55708	NC_020410	GCT	2	6	2611664	2611669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55709	NC_020410	GAT	2	6	2611672	2611677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856434
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55711	NC_020410	T	7	7	2611787	2611793	0 %	100 %	0 %	0 %	452856434
55712	NC_020410	TTA	2	6	2611817	2611822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55713	NC_020410	ATG	2	6	2611874	2611879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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55715	NC_020410	T	6	6	2612014	2612019	0 %	100 %	0 %	0 %	452856435
55716	NC_020410	ATC	2	6	2612041	2612046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856435
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55720	NC_020410	GTCA	2	8	2612095	2612102	25 %	25 %	25 %	25 %	452856435
55721	NC_020410	T	6	6	2612134	2612139	0 %	100 %	0 %	0 %	452856435
55722	NC_020410	GCC	2	6	2612159	2612164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856435
55723	NC_020410	TGC	2	6	2612206	2612211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856435
55724	NC_020410	CGG	2	6	2612212	2612217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452856435
55725	NC_020410	CCGT	2	8	2612246	2612253	0 %	25 %	25 %	50 %	452856435
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55727	NC_020410	CAT	2	6	2612329	2612334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856435
55728	NC_020410	AAT	2	6	2612397	2612402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452856435
55729	NC_020410	CGTC	2	8	2612432	2612439	0 %	25 %	25 %	50 %	452856435
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55732	NC_020410	T	6	6	2612512	2612517	0 %	100 %	0 %	0 %	452856435
55733	NC_020410	C	6	6	2612532	2612537	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
55734	NC_020410	GCG	2	6	2612585	2612590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55735	NC_020410	GGC	2	6	2612591	2612596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55736	NC_020410	A	7	7	2612639	2612645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55737	NC_020410	ACAT	2	8	2612652	2612659	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55738	NC_020410	TCT	3	9	2612676	2612684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856436
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55770	NC_020410	CCT	2	6	2613868	2613873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55771	NC_020410	TTC	2	6	2613915	2613920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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55774	NC_020410	AGG	2	6	2613966	2613971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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55836	NC_020410	ATAAA	2	10	2617541	2617550	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55837	NC_020410	T	7	7	2617558	2617564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55838	NC_020410	CGG	2	6	2617611	2617616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452856440
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55854	NC_020410	TGC	2	6	2618100	2618105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856440
55855	NC_020410	GCT	2	6	2618327	2618332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856440
55856	NC_020410	GGA	2	6	2618356	2618361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452856440
55857	NC_020410	ATT	2	6	2618391	2618396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452856440
55858	NC_020410	CATTT	2	10	2618428	2618437	20 %	60 %	0 %	20 %	452856440
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55862	NC_020410	T	7	7	2618485	2618491	0 %	100 %	0 %	0 %	452856440
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55868	NC_020410	AAAG	2	8	2618719	2618726	75 %	0 %	25 %	0 %	452856440
55869	NC_020410	TGC	2	6	2618783	2618788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856441
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55873	NC_020410	A	6	6	2618895	2618900	100 %	0 %	0 %	0 %	452856441
55874	NC_020410	CGA	2	6	2618915	2618920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856441
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55897	NC_020410	TCTCT	2	10	2620166	2620175	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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55910	NC_020410	T	7	7	2620670	2620676	0 %	100 %	0 %	0 %	452856444
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55949	NC_020410	A	7	7	2622653	2622659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55950	NC_020410	TCA	2	6	2622677	2622682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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55952	NC_020410	A	8	8	2622850	2622857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55953	NC_020410	T	6	6	2622877	2622882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55954	NC_020410	ATT	2	6	2622888	2622893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452856446
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55956	NC_020410	TCC	2	6	2622985	2622990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452856446
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55958	NC_020410	ATCTA	2	10	2623159	2623168	40 %	40 %	0 %	20 %	452856446
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55965	NC_020410	T	6	6	2623584	2623589	0 %	100 %	0 %	0 %	452856448
55966	NC_020410	T	7	7	2623628	2623634	0 %	100 %	0 %	0 %	452856448
55967	NC_020410	CAA	2	6	2623715	2623720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452856448
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55969	NC_020410	CTT	2	6	2623790	2623795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856448
55970	NC_020410	CCT	2	6	2623847	2623852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55971	NC_020410	A	6	6	2623944	2623949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55972	NC_020410	GCA	3	9	2623992	2624000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856449
55973	NC_020410	GCTG	2	8	2624067	2624074	0 %	25 %	50 %	25 %	452856449
55974	NC_020410	GCA	2	6	2624178	2624183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856449
55975	NC_020410	GTA	2	6	2624206	2624211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856449
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55978	NC_020410	CAG	3	9	2624333	2624341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856449
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55981	NC_020410	TGA	2	6	2624466	2624471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856449
55982	NC_020410	GA	3	6	2624480	2624485	50 %	0 %	50 %	0 %	452856449
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56000	NC_020410	CTGA	2	8	2625197	2625204	25 %	25 %	25 %	25 %	452856450

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