MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5036 complete genome

Total Repeats: 83872

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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54505	NC_020410	CTGT	2	8	2555966	2555973	0 %	50 %	25 %	25 %	452856379
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54510	NC_020410	TG	3	6	2556268	2556273	0 %	50 %	50 %	0 %	452856379
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54616	NC_020410	AT	3	6	2561228	2561233	50 %	50 %	0 %	0 %	452856383
54617	NC_020410	TCC	3	9	2561235	2561243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54618	NC_020410	GGA	2	6	2561253	2561258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54619	NC_020410	TGA	2	6	2561290	2561295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856384
54620	NC_020410	TGAA	2	8	2561315	2561322	50 %	25 %	25 %	0 %	452856384
54621	NC_020410	TGA	2	6	2561392	2561397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856384
54622	NC_020410	CAA	2	6	2561398	2561403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452856384
54623	NC_020410	TGG	2	6	2561418	2561423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452856384
54624	NC_020410	TCAT	2	8	2561508	2561515	25 %	50 %	0 %	25 %	452856384
54625	NC_020410	GTTCA	2	10	2561561	2561570	20 %	40 %	20 %	20 %	452856384
54626	NC_020410	TCA	2	6	2561604	2561609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856384
54627	NC_020410	TGC	2	6	2561618	2561623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856384
54628	NC_020410	ATG	2	6	2561678	2561683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856384
54629	NC_020410	GAC	2	6	2561702	2561707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856384
54630	NC_020410	ATG	2	6	2561726	2561731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856384
54631	NC_020410	CCGC	2	8	2561736	2561743	0 %	0 %	25 %	75 %	452856384
54632	NC_020410	CGT	2	6	2561792	2561797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856384
54633	NC_020410	CGC	2	6	2561804	2561809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856384
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54635	NC_020410	CTT	2	6	2561919	2561924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856384
54636	NC_020410	TGC	2	6	2562032	2562037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856385
54637	NC_020410	CG	3	6	2562044	2562049	0 %	0 %	50 %	50 %	452856385
54638	NC_020410	ATC	2	6	2562115	2562120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856385
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54641	NC_020410	TCA	2	6	2562164	2562169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856385
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54643	NC_020410	ATG	2	6	2562277	2562282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856385
54644	NC_020410	GCC	2	6	2562383	2562388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856385
54645	NC_020410	TGT	2	6	2562525	2562530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452856385
54646	NC_020410	TTGT	2	8	2562556	2562563	0 %	75 %	25 %	0 %	452856385
54647	NC_020410	CAT	2	6	2562582	2562587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856385
54648	NC_020410	TCCTA	2	10	2562696	2562705	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
54649	NC_020410	A	6	6	2562710	2562715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54650	NC_020410	ATT	2	6	2562744	2562749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54651	NC_020410	AGA	2	6	2562789	2562794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54652	NC_020410	AGG	2	6	2562801	2562806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54653	NC_020410	TGA	2	6	2562815	2562820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856386
54654	NC_020410	GAAAA	2	10	2562886	2562895	80 %	0 %	20 %	0 %	452856386
54655	NC_020410	AAC	2	6	2562913	2562918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452856386
54656	NC_020410	TCCGT	2	10	2562938	2562947	0 %	40 %	20 %	40 %	452856386
54657	NC_020410	A	8	8	2563022	2563029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54658	NC_020410	GCT	2	6	2563045	2563050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54659	NC_020410	T	6	6	2563050	2563055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54660	NC_020410	T	6	6	2563096	2563101	0 %	100 %	0 %	0 %	452856387
54661	NC_020410	CGTT	2	8	2563137	2563144	0 %	50 %	25 %	25 %	452856387
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54666	NC_020410	GCT	2	6	2563426	2563431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856387
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54670	NC_020410	T	6	6	2563513	2563518	0 %	100 %	0 %	0 %	452856387
54671	NC_020410	T	6	6	2563540	2563545	0 %	100 %	0 %	0 %	452856387
54672	NC_020410	TGA	2	6	2563653	2563658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856387
54673	NC_020410	ACG	2	6	2563673	2563678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856387
54674	NC_020410	AT	3	6	2563810	2563815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54675	NC_020410	GTT	2	6	2563834	2563839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54676	NC_020410	ATTT	2	8	2563849	2563856	25 %	75 %	0 %	0 %	452856388
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54680	NC_020410	GCT	2	6	2564130	2564135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856388
54681	NC_020410	TCG	2	6	2564193	2564198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856388
54682	NC_020410	TTTTGT	2	12	2564199	2564210	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	452856388
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54684	NC_020410	CCG	2	6	2564249	2564254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856388
54685	NC_020410	CG	4	8	2564253	2564260	0 %	0 %	50 %	50 %	452856388
54686	NC_020410	CGC	2	6	2564263	2564268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856388
54687	NC_020410	CAT	2	6	2564269	2564274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856388
54688	NC_020410	T	7	7	2564306	2564312	0 %	100 %	0 %	0 %	452856388
54689	NC_020410	T	7	7	2564338	2564344	0 %	100 %	0 %	0 %	452856388
54690	NC_020410	TTTGTC	2	12	2564350	2564361	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	452856388
54691	NC_020410	T	6	6	2564382	2564387	0 %	100 %	0 %	0 %	452856388
54692	NC_020410	GCCC	2	8	2564437	2564444	0 %	0 %	25 %	75 %	452856388
54693	NC_020410	ATC	2	6	2564488	2564493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856388
54694	NC_020410	T	6	6	2564494	2564499	0 %	100 %	0 %	0 %	452856388
54695	NC_020410	TGCGGC	2	12	2564653	2564664	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	452856388
54696	NC_020410	CTG	2	6	2564725	2564730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856388
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54699	NC_020410	T	6	6	2564810	2564815	0 %	100 %	0 %	0 %	452856388
54700	NC_020410	TCA	2	6	2564999	2565004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856388
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54702	NC_020410	TGTT	2	8	2565126	2565133	0 %	75 %	25 %	0 %	452856388
54703	NC_020410	AT	3	6	2565149	2565154	50 %	50 %	0 %	0 %	452856388
54704	NC_020410	CTG	2	6	2565227	2565232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856388
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54710	NC_020410	CGTC	2	8	2565413	2565420	0 %	25 %	25 %	50 %	452856388
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54713	NC_020410	A	6	6	2565499	2565504	100 %	0 %	0 %	0 %	452856388
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54715	NC_020410	AGAA	2	8	2565533	2565540	75 %	0 %	25 %	0 %	452856388
54716	NC_020410	A	6	6	2565595	2565600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54717	NC_020410	CTT	2	6	2565703	2565708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856389
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54722	NC_020410	CGT	2	6	2565920	2565925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856389
54723	NC_020410	TTC	2	6	2565950	2565955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856389
54724	NC_020410	CTT	2	6	2565999	2566004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856389
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54727	NC_020410	TGG	2	6	2566135	2566140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54728	NC_020410	CAA	2	6	2566149	2566154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54729	NC_020410	TATG	2	8	2566166	2566173	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54730	NC_020410	A	6	6	2566186	2566191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54731	NC_020410	TTC	2	6	2566221	2566226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54732	NC_020410	TC	3	6	2566225	2566230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54733	NC_020410	TG	3	6	2566261	2566266	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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54735	NC_020410	ATA	2	6	2566336	2566341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54854	NC_020410	GTTCG	2	10	2571350	2571359	0 %	40 %	40 %	20 %	452856395
54855	NC_020410	TCA	2	6	2571384	2571389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856395
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54973	NC_020410	TGA	2	6	2577042	2577047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856400
54974	NC_020410	AAGG	2	8	2577112	2577119	50 %	0 %	50 %	0 %	452856400
54975	NC_020410	GTC	2	6	2577133	2577138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856400
54976	NC_020410	AAG	2	6	2577161	2577166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452856400
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54980	NC_020410	GGA	2	6	2577300	2577305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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54999	NC_020410	GGCA	2	8	2578279	2578286	25 %	0 %	50 %	25 %	452856402
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