MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5036 complete genome

Total Repeats: 83872

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53001	NC_020410	AAT	2	6	2488051	2488056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452856312
53002	NC_020410	TTC	2	6	2488145	2488150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856312
53003	NC_020410	TTTC	2	8	2488159	2488166	0 %	75 %	0 %	25 %	452856312
53004	NC_020410	TTGA	2	8	2488173	2488180	25 %	50 %	25 %	0 %	452856312
53005	NC_020410	TGA	2	6	2488193	2488198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856312
53006	NC_020410	AGCG	2	8	2488245	2488252	25 %	0 %	50 %	25 %	452856312
53007	NC_020410	CCG	2	6	2488302	2488307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856312
53008	NC_020410	GCC	2	6	2488329	2488334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856312
53009	NC_020410	GGAGC	2	10	2488346	2488355	20 %	0 %	60 %	20 %	452856312
53010	NC_020410	TGC	2	6	2488386	2488391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856312
53011	NC_020410	T	6	6	2488693	2488698	0 %	100 %	0 %	0 %	452856312
53012	NC_020410	T	6	6	2488711	2488716	0 %	100 %	0 %	0 %	452856312
53013	NC_020410	ATA	2	6	2488787	2488792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452856312
53014	NC_020410	T	6	6	2488837	2488842	0 %	100 %	0 %	0 %	452856312
53015	NC_020410	TCC	2	6	2488857	2488862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452856312
53016	NC_020410	T	7	7	2488913	2488919	0 %	100 %	0 %	0 %	452856312
53017	NC_020410	TAA	2	6	2488966	2488971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452856312
53018	NC_020410	CAT	3	9	2489006	2489014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856312
53019	NC_020410	A	6	6	2489102	2489107	100 %	0 %	0 %	0 %	452856313
53020	NC_020410	TAA	2	6	2489128	2489133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452856313
53021	NC_020410	TTC	2	6	2489161	2489166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856313
53022	NC_020410	TCG	2	6	2489222	2489227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856313
53023	NC_020410	GCTT	2	8	2489255	2489262	0 %	50 %	25 %	25 %	452856313
53024	NC_020410	TCT	2	6	2489300	2489305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856313
53025	NC_020410	CTC	2	6	2489314	2489319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452856313
53026	NC_020410	CGTG	2	8	2489331	2489338	0 %	25 %	50 %	25 %	452856313
53027	NC_020410	TTC	2	6	2489359	2489364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856313
53028	NC_020410	AT	3	6	2489420	2489425	50 %	50 %	0 %	0 %	452856313
53029	NC_020410	GGC	2	6	2489607	2489612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452856313
53030	NC_020410	TGT	2	6	2489766	2489771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452856313
53031	NC_020410	T	6	6	2489838	2489843	0 %	100 %	0 %	0 %	452856313
53032	NC_020410	ATC	2	6	2489932	2489937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856313
53033	NC_020410	CGTCC	2	10	2490080	2490089	0 %	20 %	20 %	60 %	452856313
53034	NC_020410	GAGT	2	8	2490118	2490125	25 %	25 %	50 %	0 %	452856313
53035	NC_020410	GGCT	2	8	2490143	2490150	0 %	25 %	50 %	25 %	452856313
53036	NC_020410	GAATAT	2	12	2490204	2490215	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	452856313
53037	NC_020410	CTT	3	9	2490239	2490247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53038	NC_020410	AGAA	2	8	2490251	2490258	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53039	NC_020410	GCG	2	6	2490275	2490280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53040	NC_020410	T	6	6	2490291	2490296	0 %	100 %	0 %	0 %	452856314
53041	NC_020410	CTT	2	6	2490380	2490385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856314
53042	NC_020410	AAG	2	6	2490396	2490401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452856314
53043	NC_020410	TTCCGT	2	12	2490403	2490414	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	452856314
53044	NC_020410	TCC	2	6	2490423	2490428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452856314
53045	NC_020410	CGC	2	6	2490498	2490503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856314
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53047	NC_020410	A	6	6	2490726	2490731	100 %	0 %	0 %	0 %	452856314
53048	NC_020410	CACCG	2	10	2490840	2490849	20 %	0 %	20 %	60 %	452856314
53049	NC_020410	CAT	2	6	2490867	2490872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856314
53050	NC_020410	CTC	2	6	2490891	2490896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452856314
53051	NC_020410	CAA	3	9	2490941	2490949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452856314
53052	NC_020410	CAT	2	6	2490974	2490979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856314
53053	NC_020410	ATCG	2	8	2491185	2491192	25 %	25 %	25 %	25 %	452856314
53054	NC_020410	GT	3	6	2491289	2491294	0 %	50 %	50 %	0 %	452856314
53055	NC_020410	GCA	2	6	2491312	2491317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856314
53056	NC_020410	CAGT	2	8	2491340	2491347	25 %	25 %	25 %	25 %	452856314
53057	NC_020410	AC	3	6	2491376	2491381	50 %	0 %	0 %	50 %	452856314
53058	NC_020410	CAT	2	6	2491416	2491421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856314
53059	NC_020410	CGA	2	6	2491472	2491477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856314
53060	NC_020410	CGATGC	2	12	2491586	2491597	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	452856314
53061	NC_020410	TTA	2	6	2491699	2491704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452856314
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53063	NC_020410	CAA	2	6	2491787	2491792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452856314
53064	NC_020410	GATGA	2	10	2491866	2491875	40 %	20 %	40 %	0 %	452856314
53065	NC_020410	AT	4	8	2491877	2491884	50 %	50 %	0 %	0 %	452856314
53066	NC_020410	TCT	2	6	2491885	2491890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856314
53067	NC_020410	AATTT	2	10	2491922	2491931	40 %	60 %	0 %	0 %	452856314
53068	NC_020410	T	6	6	2492012	2492017	0 %	100 %	0 %	0 %	452856314
53069	NC_020410	ATCCG	2	10	2492023	2492032	20 %	20 %	20 %	40 %	452856314
53070	NC_020410	GAT	2	6	2492064	2492069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856314
53071	NC_020410	CT	3	6	2492095	2492100	0 %	50 %	0 %	50 %	452856314
53072	NC_020410	CTA	2	6	2492136	2492141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53073	NC_020410	AAGA	2	8	2492203	2492210	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53074	NC_020410	ATC	2	6	2492230	2492235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53075	NC_020410	TCA	2	6	2492247	2492252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53076	NC_020410	TGTTTT	2	12	2492371	2492382	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	452856315
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53079	NC_020410	AAGG	2	8	2492473	2492480	50 %	0 %	50 %	0 %	452856315
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53083	NC_020410	TC	3	6	2492625	2492630	0 %	50 %	0 %	50 %	452856316
53084	NC_020410	GC	3	6	2492699	2492704	0 %	0 %	50 %	50 %	452856316
53085	NC_020410	TTC	2	6	2492710	2492715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856316
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53087	NC_020410	T	6	6	2492836	2492841	0 %	100 %	0 %	0 %	452856316
53088	NC_020410	TTC	2	6	2492881	2492886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856316
53089	NC_020410	T	7	7	2492898	2492904	0 %	100 %	0 %	0 %	452856316
53090	NC_020410	CGA	3	9	2492907	2492915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856316
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53092	NC_020410	GC	3	6	2493024	2493029	0 %	0 %	50 %	50 %	452856316
53093	NC_020410	TCG	2	6	2493050	2493055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856316
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53101	NC_020410	GTTTT	2	10	2493323	2493332	0 %	80 %	20 %	0 %	452856316
53102	NC_020410	CTT	2	6	2493351	2493356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856316
53103	NC_020410	CGG	3	9	2493379	2493387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452856316
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53107	NC_020410	ATA	2	6	2493696	2493701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452856316
53108	NC_020410	T	7	7	2493793	2493799	0 %	100 %	0 %	0 %	452856316
53109	NC_020410	AGG	2	6	2493856	2493861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53110	NC_020410	ATC	2	6	2493956	2493961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856317
53111	NC_020410	TTTTCG	2	12	2494041	2494052	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	452856317
53112	NC_020410	CTT	2	6	2494124	2494129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856317
53113	NC_020410	CGG	2	6	2494147	2494152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452856317
53114	NC_020410	TC	3	6	2494186	2494191	0 %	50 %	0 %	50 %	452856317
53115	NC_020410	AT	3	6	2494207	2494212	50 %	50 %	0 %	0 %	452856317
53116	NC_020410	AAT	2	6	2494451	2494456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452856317
53117	NC_020410	GC	3	6	2494501	2494506	0 %	0 %	50 %	50 %	452856317
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53119	NC_020410	CGA	2	6	2494630	2494635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856317
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53238	NC_020410	TTG	2	6	2499833	2499838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53239	NC_020410	TCA	2	6	2499940	2499945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856322
53240	NC_020410	CAG	2	6	2499952	2499957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856322
53241	NC_020410	CCGT	2	8	2499965	2499972	0 %	25 %	25 %	50 %	452856322
53242	NC_020410	TCT	2	6	2499975	2499980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856322
53243	NC_020410	T	6	6	2500004	2500009	0 %	100 %	0 %	0 %	452856322
53244	NC_020410	TATTGA	2	12	2500054	2500065	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	452856322
53245	NC_020410	GCT	2	6	2500089	2500094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856322
53246	NC_020410	CGTCC	2	10	2500142	2500151	0 %	20 %	20 %	60 %	452856322
53247	NC_020410	GCT	2	6	2500156	2500161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856322
53248	NC_020410	ATTCA	2	10	2500175	2500184	40 %	40 %	0 %	20 %	452856322
53249	NC_020410	GCC	2	6	2500202	2500207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856322
53250	NC_020410	TTTCA	2	10	2500244	2500253	20 %	60 %	0 %	20 %	452856322
53251	NC_020410	ATCA	2	8	2500286	2500293	50 %	25 %	0 %	25 %	452856322
53252	NC_020410	T	6	6	2500316	2500321	0 %	100 %	0 %	0 %	452856322
53253	NC_020410	CTG	2	6	2500361	2500366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856322
53254	NC_020410	CCG	2	6	2500457	2500462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856322
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53256	NC_020410	ATTGC	2	10	2500493	2500502	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
53257	NC_020410	AGG	2	6	2500537	2500542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53258	NC_020410	ATA	2	6	2500743	2500748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452856323
53259	NC_020410	AT	4	8	2500771	2500778	50 %	50 %	0 %	0 %	452856323
53260	NC_020410	A	6	6	2500788	2500793	100 %	0 %	0 %	0 %	452856323
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53266	NC_020410	GGC	2	6	2501241	2501246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452856323
53267	NC_020410	AT	3	6	2501338	2501343	50 %	50 %	0 %	0 %	452856323
53268	NC_020410	GAA	2	6	2501351	2501356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452856323
53269	NC_020410	A	6	6	2501410	2501415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53270	NC_020410	TGCC	2	8	2501461	2501468	0 %	25 %	25 %	50 %	452856324
53271	NC_020410	AAAGA	2	10	2501471	2501480	80 %	0 %	20 %	0 %	452856324
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53276	NC_020410	A	6	6	2501639	2501644	100 %	0 %	0 %	0 %	452856324
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53282	NC_020410	T	7	7	2501956	2501962	0 %	100 %	0 %	0 %	452856324
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53297	NC_020410	TCC	2	6	2502541	2502546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53298	NC_020410	CTGG	2	8	2502599	2502606	0 %	25 %	50 %	25 %	452856326
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53310	NC_020410	T	6	6	2503169	2503174	0 %	100 %	0 %	0 %	452856327
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53343	NC_020410	TC	3	6	2504820	2504825	0 %	50 %	0 %	50 %	452856330
53344	NC_020410	CGG	2	6	2504838	2504843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452856330
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53347	NC_020410	A	6	6	2504923	2504928	100 %	0 %	0 %	0 %	452856330
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53353	NC_020410	GTTT	2	8	2505162	2505169	0 %	75 %	25 %	0 %	452856330
53354	NC_020410	TTCA	2	8	2505170	2505177	25 %	50 %	0 %	25 %	452856330
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53356	NC_020410	TCA	2	6	2505300	2505305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856330
53357	NC_020410	CGT	2	6	2505329	2505334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856330
53358	NC_020410	GGT	2	6	2505350	2505355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452856330
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53382	NC_020410	AAT	2	6	2506211	2506216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452856331
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53384	NC_020410	TTC	2	6	2506276	2506281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856331
53385	NC_020410	TAA	2	6	2506350	2506355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452856331
53386	NC_020410	AT	3	6	2506401	2506406	50 %	50 %	0 %	0 %	452856331
53387	NC_020410	A	8	8	2506427	2506434	100 %	0 %	0 %	0 %	452856331
53388	NC_020410	T	6	6	2506436	2506441	0 %	100 %	0 %	0 %	452856331
53389	NC_020410	CCTT	2	8	2506456	2506463	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53390	NC_020410	ATC	2	6	2506472	2506477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53391	NC_020410	A	7	7	2506523	2506529	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53392	NC_020410	TTC	2	6	2506548	2506553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53393	NC_020410	AC	3	6	2506573	2506578	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53394	NC_020410	TTA	2	6	2506590	2506595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53395	NC_020410	CAT	2	6	2506732	2506737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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53397	NC_020410	AGG	2	6	2506770	2506775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53398	NC_020410	TGA	2	6	2506818	2506823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856332
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53408	NC_020410	GCT	2	6	2507073	2507078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856333
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53416	NC_020410	GAAGCA	2	12	2507250	2507261	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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53432	NC_020410	CAGG	2	8	2507979	2507986	25 %	0 %	50 %	25 %	452856334
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53438	NC_020410	TTTC	2	8	2508176	2508183	0 %	75 %	0 %	25 %	452856335
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53444	NC_020410	CGG	2	6	2508390	2508395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452856335
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53458	NC_020410	TCA	2	6	2509085	2509090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856336
53459	NC_020410	TGA	2	6	2509100	2509105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856336
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53461	NC_020410	GGC	2	6	2509150	2509155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452856336
53462	NC_020410	T	6	6	2509201	2509206	0 %	100 %	0 %	0 %	452856336
53463	NC_020410	T	6	6	2509315	2509320	0 %	100 %	0 %	0 %	452856336
53464	NC_020410	A	6	6	2509353	2509358	100 %	0 %	0 %	0 %	452856336
53465	NC_020410	GCT	2	6	2509359	2509364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856336
53466	NC_020410	TTCAT	2	10	2509395	2509404	20 %	60 %	0 %	20 %	452856336
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53469	NC_020410	T	7	7	2509507	2509513	0 %	100 %	0 %	0 %	452856336
53470	NC_020410	CAA	2	6	2509581	2509586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452856336
53471	NC_020410	CTG	2	6	2509588	2509593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856336
53472	NC_020410	AAG	2	6	2509645	2509650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452856336
53473	NC_020410	A	6	6	2509675	2509680	100 %	0 %	0 %	0 %	452856336
53474	NC_020410	CGG	2	6	2509705	2509710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452856337
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53476	NC_020410	TTTC	2	8	2509771	2509778	0 %	75 %	0 %	25 %	452856337
53477	NC_020410	CTG	2	6	2509900	2509905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856337
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53481	NC_020410	TTA	2	6	2510066	2510071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452856337
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