MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5036 complete genome

Total Repeats: 83872

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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52004	NC_020410	CTT	2	6	2442389	2442394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856265
52005	NC_020410	GCT	2	6	2442427	2442432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856265
52006	NC_020410	GAT	2	6	2442515	2442520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856265
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52008	NC_020410	CAT	2	6	2442587	2442592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856265
52009	NC_020410	TTA	2	6	2442637	2442642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452856265
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52011	NC_020410	ACG	2	6	2442766	2442771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856265
52012	NC_020410	T	7	7	2442783	2442789	0 %	100 %	0 %	0 %	452856265
52013	NC_020410	CTT	2	6	2442803	2442808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856265
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52017	NC_020410	TAA	2	6	2443009	2443014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452856265
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52019	NC_020410	T	6	6	2443167	2443172	0 %	100 %	0 %	0 %	452856265
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52051	NC_020410	T	6	6	2444418	2444423	0 %	100 %	0 %	0 %	452856265
52052	NC_020410	TTTA	2	8	2444430	2444437	25 %	75 %	0 %	0 %	452856265
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52054	NC_020410	T	6	6	2444536	2444541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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52118	NC_020410	AGA	2	6	2447120	2447125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452856268
52119	NC_020410	ATC	2	6	2447204	2447209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856268
52120	NC_020410	CCT	2	6	2447241	2447246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52121	NC_020410	TTA	2	6	2447282	2447287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52122	NC_020410	CTGT	2	8	2447493	2447500	0 %	50 %	25 %	25 %	452856269
52123	NC_020410	TTA	2	6	2447522	2447527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452856269
52124	NC_020410	AAAG	2	8	2447576	2447583	75 %	0 %	25 %	0 %	452856269
52125	NC_020410	GCG	2	6	2447709	2447714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452856269
52126	NC_020410	TGCT	2	8	2447752	2447759	0 %	50 %	25 %	25 %	452856269
52127	NC_020410	ATT	2	6	2447785	2447790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452856269
52128	NC_020410	CTG	2	6	2447800	2447805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856269
52129	NC_020410	A	7	7	2447813	2447819	100 %	0 %	0 %	0 %	452856269
52130	NC_020410	CTG	2	6	2447877	2447882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856269
52131	NC_020410	TCA	2	6	2447884	2447889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856269
52132	NC_020410	AAAG	2	8	2447959	2447966	75 %	0 %	25 %	0 %	452856269
52133	NC_020410	CAG	2	6	2447979	2447984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856269
52134	NC_020410	GC	4	8	2448041	2448048	0 %	0 %	50 %	50 %	452856269
52135	NC_020410	TTA	2	6	2448052	2448057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452856269
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52137	NC_020410	CGG	2	6	2448166	2448171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52138	NC_020410	TCT	2	6	2448172	2448177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52139	NC_020410	T	6	6	2448177	2448182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52140	NC_020410	GCG	2	6	2448349	2448354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452856270
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52142	NC_020410	A	6	6	2448400	2448405	100 %	0 %	0 %	0 %	452856270
52143	NC_020410	GAT	2	6	2448448	2448453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856270
52144	NC_020410	CAGG	2	8	2448505	2448512	25 %	0 %	50 %	25 %	452856270
52145	NC_020410	AGTG	2	8	2448669	2448676	25 %	25 %	50 %	0 %	452856271
52146	NC_020410	CA	3	6	2448681	2448686	50 %	0 %	0 %	50 %	452856271
52147	NC_020410	GTC	2	6	2448745	2448750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856271
52148	NC_020410	GAC	3	9	2448762	2448770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856271
52149	NC_020410	AC	3	6	2448775	2448780	50 %	0 %	0 %	50 %	452856271
52150	NC_020410	CGC	2	6	2448864	2448869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856271
52151	NC_020410	A	6	6	2448889	2448894	100 %	0 %	0 %	0 %	452856271
52152	NC_020410	GCC	2	6	2449001	2449006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856271
52153	NC_020410	CGT	2	6	2449023	2449028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856271
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52155	NC_020410	GAAA	2	8	2449038	2449045	75 %	0 %	25 %	0 %	452856271
52156	NC_020410	CTG	2	6	2449121	2449126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856271
52157	NC_020410	TCA	2	6	2449149	2449154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856271
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52165	NC_020410	CTT	2	6	2449645	2449650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856271
52166	NC_020410	GAA	2	6	2449684	2449689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452856271
52167	NC_020410	A	6	6	2449708	2449713	100 %	0 %	0 %	0 %	452856271
52168	NC_020410	GAA	2	6	2449732	2449737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452856271
52169	NC_020410	AAG	2	6	2449778	2449783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452856271
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52171	NC_020410	A	7	7	2449832	2449838	100 %	0 %	0 %	0 %	452856272
52172	NC_020410	CTC	2	6	2449910	2449915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452856272
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52177	NC_020410	ATC	2	6	2450046	2450051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856272
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52179	NC_020410	TCT	2	6	2450107	2450112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856272
52180	NC_020410	TTCC	2	8	2450138	2450145	0 %	50 %	0 %	50 %	452856272
52181	NC_020410	TAG	2	6	2450161	2450166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856272
52182	NC_020410	T	6	6	2450236	2450241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52183	NC_020410	T	6	6	2450252	2450257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52184	NC_020410	GAT	2	6	2450437	2450442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856273
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52186	NC_020410	AT	3	6	2450524	2450529	50 %	50 %	0 %	0 %	452856273
52187	NC_020410	GAAGC	2	10	2450533	2450542	40 %	0 %	40 %	20 %	452856273
52188	NC_020410	GGAC	2	8	2450568	2450575	25 %	0 %	50 %	25 %	452856273
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52190	NC_020410	AGA	2	6	2450625	2450630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452856273
52191	NC_020410	CATT	2	8	2450661	2450668	25 %	50 %	0 %	25 %	452856273
52192	NC_020410	A	6	6	2450716	2450721	100 %	0 %	0 %	0 %	452856273
52193	NC_020410	ATTT	2	8	2450732	2450739	25 %	75 %	0 %	0 %	452856273
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52197	NC_020410	AAAC	2	8	2450889	2450896	75 %	0 %	0 %	25 %	452856273
52198	NC_020410	A	6	6	2450922	2450927	100 %	0 %	0 %	0 %	452856273
52199	NC_020410	CCT	2	6	2450928	2450933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52200	NC_020410	AGG	2	6	2450942	2450947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52201	NC_020410	T	6	6	2450948	2450953	0 %	100 %	0 %	0 %	452856274
52202	NC_020410	ATC	2	6	2451018	2451023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856274
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52212	NC_020410	CAG	2	6	2451421	2451426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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52214	NC_020410	ATG	2	6	2451464	2451469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52215	NC_020410	TAA	2	6	2451542	2451547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452856275
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52217	NC_020410	TGG	2	6	2451665	2451670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452856275
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52219	NC_020410	TCA	2	6	2451748	2451753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856275
52220	NC_020410	ATA	2	6	2451792	2451797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452856275
52221	NC_020410	C	6	6	2451993	2451998	0 %	0 %	0 %	100 %	452856275
52222	NC_020410	CGA	2	6	2452073	2452078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856275
52223	NC_020410	AT	3	6	2452114	2452119	50 %	50 %	0 %	0 %	452856275
52224	NC_020410	GAG	2	6	2452176	2452181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452856275
52225	NC_020410	GGT	2	6	2452199	2452204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452856275
52226	NC_020410	ATT	2	6	2452245	2452250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452856275
52227	NC_020410	CGG	2	6	2452277	2452282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452856275
52228	NC_020410	TAA	2	6	2452384	2452389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52229	NC_020410	GAT	2	6	2452485	2452490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856276
52230	NC_020410	ATT	2	6	2452504	2452509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452856276
52231	NC_020410	TCAA	2	8	2452520	2452527	50 %	25 %	0 %	25 %	452856276
52232	NC_020410	CTG	2	6	2452543	2452548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856276
52233	NC_020410	AAG	2	6	2452581	2452586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452856276
52234	NC_020410	A	6	6	2452620	2452625	100 %	0 %	0 %	0 %	452856276
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52355	NC_020410	TAA	2	6	2458218	2458223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452856282
52356	NC_020410	TCT	2	6	2458321	2458326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856282
52357	NC_020410	TCA	2	6	2458339	2458344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856282
52358	NC_020410	CT	3	6	2458374	2458379	0 %	50 %	0 %	50 %	452856282
52359	NC_020410	CTG	2	6	2458581	2458586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856282
52360	NC_020410	AT	3	6	2458717	2458722	50 %	50 %	0 %	0 %	452856282
52361	NC_020410	TTCAT	2	10	2458753	2458762	20 %	60 %	0 %	20 %	452856282
52362	NC_020410	A	7	7	2458811	2458817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52363	NC_020410	GCG	2	6	2458833	2458838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52364	NC_020410	TA	3	6	2458862	2458867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52365	NC_020410	TTTA	2	8	2458882	2458889	25 %	75 %	0 %	0 %	452856283
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52371	NC_020410	A	6	6	2459217	2459222	100 %	0 %	0 %	0 %	452856283
52372	NC_020410	TTCTAA	2	12	2459286	2459297	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52373	NC_020410	TGTTT	2	10	2459375	2459384	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
52374	NC_020410	ATAA	2	8	2459444	2459451	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52375	NC_020410	T	6	6	2459488	2459493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52376	NC_020410	TAT	2	6	2459540	2459545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52377	NC_020410	AT	3	6	2459548	2459553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52378	NC_020410	A	6	6	2459563	2459568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52379	NC_020410	CT	3	6	2459680	2459685	0 %	50 %	0 %	50 %	452856284
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52383	NC_020410	TTC	2	6	2459767	2459772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856284
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52386	NC_020410	TTC	2	6	2459989	2459994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856284
52387	NC_020410	CT	3	6	2460004	2460009	0 %	50 %	0 %	50 %	452856284
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52392	NC_020410	CTT	2	6	2460213	2460218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856284
52393	NC_020410	T	6	6	2460333	2460338	0 %	100 %	0 %	0 %	452856284
52394	NC_020410	TCT	2	6	2460353	2460358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856284
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52399	NC_020410	ATA	2	6	2460553	2460558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452856284
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52402	NC_020410	GCT	2	6	2460654	2460659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856284
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52407	NC_020410	ATA	2	6	2460818	2460823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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52427	NC_020410	GGCC	2	8	2461743	2461750	0 %	0 %	50 %	50 %	452856285
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52433	NC_020410	GC	3	6	2461957	2461962	0 %	0 %	50 %	50 %	452856285
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52443	NC_020410	TATT	2	8	2462319	2462326	25 %	75 %	0 %	0 %	452856285
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52450	NC_020410	CCCG	2	8	2462518	2462525	0 %	0 %	25 %	75 %	452856285
52451	NC_020410	AGT	2	6	2462613	2462618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856285
52452	NC_020410	CAA	2	6	2462661	2462666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452856285
52453	NC_020410	CTG	2	6	2462670	2462675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856285
52454	NC_020410	CTG	2	6	2462677	2462682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856285
52455	NC_020410	ACT	2	6	2462693	2462698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856285
52456	NC_020410	CGT	2	6	2462734	2462739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52457	NC_020410	ATT	2	6	2462742	2462747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452856286
52458	NC_020410	TTTGA	2	10	2462754	2462763	20 %	60 %	20 %	0 %	452856286
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52460	NC_020410	T	7	7	2462787	2462793	0 %	100 %	0 %	0 %	452856286
52461	NC_020410	TCT	2	6	2462819	2462824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856286
52462	NC_020410	T	6	6	2462833	2462838	0 %	100 %	0 %	0 %	452856286
52463	NC_020410	GAAT	2	8	2462849	2462856	50 %	25 %	25 %	0 %	452856286
52464	NC_020410	CTT	2	6	2462861	2462866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856286
52465	NC_020410	TCA	2	6	2462892	2462897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856286
52466	NC_020410	AG	3	6	2462972	2462977	50 %	0 %	50 %	0 %	452856286
52467	NC_020410	ACG	2	6	2463002	2463007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856286
52468	NC_020410	AT	3	6	2463032	2463037	50 %	50 %	0 %	0 %	452856286
52469	NC_020410	CTT	2	6	2463048	2463053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856286
52470	NC_020410	ATG	2	6	2463114	2463119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856286
52471	NC_020410	CGA	2	6	2463120	2463125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856286
52472	NC_020410	ATT	2	6	2463161	2463166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452856286
52473	NC_020410	TCTTT	2	10	2463207	2463216	0 %	80 %	0 %	20 %	452856286
52474	NC_020410	AGA	2	6	2463224	2463229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452856286
52475	NC_020410	ATA	2	6	2463355	2463360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52476	NC_020410	T	6	6	2463413	2463418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52477	NC_020410	TGA	2	6	2463527	2463532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856287
52478	NC_020410	ATG	2	6	2463533	2463538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856287
52479	NC_020410	CTT	2	6	2463624	2463629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856287
52480	NC_020410	GA	3	6	2463673	2463678	50 %	0 %	50 %	0 %	452856287
52481	NC_020410	T	6	6	2463739	2463744	0 %	100 %	0 %	0 %	452856287
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52496	NC_020410	TAA	2	6	2464438	2464443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452856288
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52499	NC_020410	CTG	2	6	2464571	2464576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856288
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