MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5036 complete genome

Total Repeats: 83872

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
49501	NC_020410	GC	3	6	2324394	2324399	0 %	0 %	50 %	50 %	452856144
49502	NC_020410	TTC	2	6	2324520	2324525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856144
49503	NC_020410	CGGA	2	8	2324574	2324581	25 %	0 %	50 %	25 %	452856144
49504	NC_020410	CCG	2	6	2324617	2324622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856144
49505	NC_020410	CAG	2	6	2324633	2324638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856144
49506	NC_020410	CGG	2	6	2324648	2324653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452856144
49507	NC_020410	AGC	2	6	2324670	2324675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856144
49508	NC_020410	A	6	6	2324718	2324723	100 %	0 %	0 %	0 %	452856144
49509	NC_020410	A	6	6	2324738	2324743	100 %	0 %	0 %	0 %	452856144
49510	NC_020410	AGC	2	6	2324788	2324793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856144
49511	NC_020410	GCT	2	6	2324806	2324811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856144
49512	NC_020410	AGC	2	6	2324971	2324976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856144
49513	NC_020410	T	6	6	2324991	2324996	0 %	100 %	0 %	0 %	452856144
49514	NC_020410	TCA	2	6	2325028	2325033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856144
49515	NC_020410	GCC	2	6	2325046	2325051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856144
49516	NC_020410	AATG	2	8	2325052	2325059	50 %	25 %	25 %	0 %	452856144
49517	NC_020410	TTC	2	6	2325141	2325146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856144
49518	NC_020410	T	7	7	2325240	2325246	0 %	100 %	0 %	0 %	452856144
49519	NC_020410	CAT	2	6	2325254	2325259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856144
49520	NC_020410	GGCG	2	8	2325269	2325276	0 %	0 %	75 %	25 %	452856144
49521	NC_020410	TGC	2	6	2325289	2325294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856144
49522	NC_020410	ATA	2	6	2325313	2325318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452856144
49523	NC_020410	ATG	2	6	2325391	2325396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856144
49524	NC_020410	CCT	2	6	2325412	2325417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452856144
49525	NC_020410	CCG	2	6	2325557	2325562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856144
49526	NC_020410	TCT	2	6	2325691	2325696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856144
49527	NC_020410	GATCA	2	10	2325825	2325834	40 %	20 %	20 %	20 %	452856144
49528	NC_020410	CCTG	2	8	2325873	2325880	0 %	25 %	25 %	50 %	452856144
49529	NC_020410	TAA	2	6	2325902	2325907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452856144
49530	NC_020410	CAA	2	6	2325983	2325988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452856144
49531	NC_020410	CCG	2	6	2326093	2326098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856144
49532	NC_020410	TCCGC	2	10	2326119	2326128	0 %	20 %	20 %	60 %	452856144
49533	NC_020410	GCG	2	6	2326138	2326143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452856144
49534	NC_020410	AGA	3	9	2326161	2326169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452856144
49535	NC_020410	TCA	2	6	2326271	2326276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856144
49536	NC_020410	AAC	2	6	2326366	2326371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452856144
49537	NC_020410	ATCC	2	8	2326383	2326390	25 %	25 %	0 %	50 %	452856144
49538	NC_020410	TGCC	2	8	2326552	2326559	0 %	25 %	25 %	50 %	452856144
49539	NC_020410	TCA	2	6	2326582	2326587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856144
49540	NC_020410	TTGTT	2	10	2326690	2326699	0 %	80 %	20 %	0 %	452856144
49541	NC_020410	TG	3	6	2326716	2326721	0 %	50 %	50 %	0 %	452856144
49542	NC_020410	AAG	2	6	2326779	2326784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452856144
49543	NC_020410	TCT	2	6	2326801	2326806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856144
49544	NC_020410	A	6	6	2326821	2326826	100 %	0 %	0 %	0 %	452856144
49545	NC_020410	GAC	2	6	2326878	2326883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856144
49546	NC_020410	AGAAT	2	10	2326885	2326894	60 %	20 %	20 %	0 %	452856144
49547	NC_020410	CGGCG	2	10	2327010	2327019	0 %	0 %	60 %	40 %	452856144
49548	NC_020410	CTT	2	6	2327093	2327098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856144
49549	NC_020410	AAT	2	6	2327114	2327119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452856144
49550	NC_020410	TCA	2	6	2327128	2327133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856144
49551	NC_020410	A	6	6	2327148	2327153	100 %	0 %	0 %	0 %	452856144
49552	NC_020410	TGC	2	6	2327159	2327164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856144
49553	NC_020410	GAC	2	6	2327205	2327210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856144
49554	NC_020410	AATCC	2	10	2327219	2327228	40 %	20 %	0 %	40 %	452856144
49555	NC_020410	CTT	2	6	2327295	2327300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856144
49556	NC_020410	T	6	6	2327315	2327320	0 %	100 %	0 %	0 %	452856144
49557	NC_020410	ATC	2	6	2327343	2327348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856144
49558	NC_020410	ACGG	2	8	2327369	2327376	25 %	0 %	50 %	25 %	452856144
49559	NC_020410	CTTCT	2	10	2327385	2327394	0 %	60 %	0 %	40 %	452856144
49560	NC_020410	TG	3	6	2327401	2327406	0 %	50 %	50 %	0 %	452856144
49561	NC_020410	CTG	2	6	2327448	2327453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856144
49562	NC_020410	GCCG	2	8	2327526	2327533	0 %	0 %	50 %	50 %	452856144
49563	NC_020410	CCA	2	6	2327583	2327588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452856144
49564	NC_020410	AAG	2	6	2327595	2327600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452856144
49565	NC_020410	T	7	7	2327662	2327668	0 %	100 %	0 %	0 %	452856144
49566	NC_020410	GCA	2	6	2327669	2327674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856144
49567	NC_020410	T	6	6	2327707	2327712	0 %	100 %	0 %	0 %	452856144
49568	NC_020410	CTG	2	6	2327771	2327776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856144
49569	NC_020410	GCT	2	6	2327783	2327788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856144
49570	NC_020410	TCT	2	6	2327839	2327844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856144
49571	NC_020410	CCCG	2	8	2327940	2327947	0 %	0 %	25 %	75 %	452856144
49572	NC_020410	CAAT	2	8	2328017	2328024	50 %	25 %	0 %	25 %	452856144
49573	NC_020410	A	6	6	2328046	2328051	100 %	0 %	0 %	0 %	452856144
49574	NC_020410	ATT	2	6	2328063	2328068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452856144
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49577	NC_020410	T	6	6	2328222	2328227	0 %	100 %	0 %	0 %	452856144
49578	NC_020410	TCC	2	6	2328238	2328243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452856144
49579	NC_020410	T	6	6	2328263	2328268	0 %	100 %	0 %	0 %	452856144
49580	NC_020410	AGG	2	6	2328292	2328297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452856144
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49582	NC_020410	CTG	2	6	2328319	2328324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856144
49583	NC_020410	T	6	6	2328413	2328418	0 %	100 %	0 %	0 %	452856144
49584	NC_020410	TC	4	8	2328434	2328441	0 %	50 %	0 %	50 %	452856144
49585	NC_020410	GGAA	2	8	2328522	2328529	50 %	0 %	50 %	0 %	452856144
49586	NC_020410	CGG	2	6	2328818	2328823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452856144
49587	NC_020410	CAT	2	6	2328858	2328863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856144
49588	NC_020410	CG	3	6	2328951	2328956	0 %	0 %	50 %	50 %	452856144
49589	NC_020410	GAT	2	6	2329014	2329019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856144
49590	NC_020410	GA	3	6	2329068	2329073	50 %	0 %	50 %	0 %	452856144
49591	NC_020410	GCA	2	6	2329084	2329089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856144
49592	NC_020410	TGCGG	2	10	2329105	2329114	0 %	20 %	60 %	20 %	452856144
49593	NC_020410	CTTT	2	8	2329140	2329147	0 %	75 %	0 %	25 %	452856144
49594	NC_020410	T	6	6	2329161	2329166	0 %	100 %	0 %	0 %	452856144
49595	NC_020410	AT	3	6	2329210	2329215	50 %	50 %	0 %	0 %	452856144
49596	NC_020410	CCG	2	6	2329246	2329251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856144
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49601	NC_020410	GCGA	2	8	2329465	2329472	25 %	0 %	50 %	25 %	452856144
49602	NC_020410	TCA	2	6	2329513	2329518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856144
49603	NC_020410	GTT	2	6	2329565	2329570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452856144
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49605	NC_020410	CAT	2	6	2329655	2329660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856144
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49609	NC_020410	CTG	2	6	2329806	2329811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856144
49610	NC_020410	CCGGC	2	10	2329817	2329826	0 %	0 %	40 %	60 %	452856144
49611	NC_020410	ATT	2	6	2329837	2329842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452856144
49612	NC_020410	T	6	6	2329841	2329846	0 %	100 %	0 %	0 %	452856144
49613	NC_020410	GCC	2	6	2330005	2330010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856144
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49616	NC_020410	TGCA	2	8	2330076	2330083	25 %	25 %	25 %	25 %	452856144
49617	NC_020410	AGC	2	6	2330110	2330115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856144
49618	NC_020410	GCA	2	6	2330168	2330173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856144
49619	NC_020410	CCAT	2	8	2330200	2330207	25 %	25 %	0 %	50 %	452856144
49620	NC_020410	CTTTC	2	10	2330279	2330288	0 %	60 %	0 %	40 %	452856144
49621	NC_020410	CA	3	6	2330581	2330586	50 %	0 %	0 %	50 %	452856144
49622	NC_020410	AG	3	6	2330593	2330598	50 %	0 %	50 %	0 %	452856144
49623	NC_020410	GCC	2	6	2330635	2330640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856144
49624	NC_020410	TCA	2	6	2330761	2330766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856144
49625	NC_020410	GCA	2	6	2330777	2330782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856144
49626	NC_020410	T	6	6	2330809	2330814	0 %	100 %	0 %	0 %	452856144
49627	NC_020410	T	7	7	2330824	2330830	0 %	100 %	0 %	0 %	452856144
49628	NC_020410	GAT	2	6	2331076	2331081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856144
49629	NC_020410	CT	3	6	2331111	2331116	0 %	50 %	0 %	50 %	452856144
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49631	NC_020410	GCT	2	6	2331224	2331229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856144
49632	NC_020410	ACG	2	6	2331250	2331255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856144
49633	NC_020410	CCT	2	6	2331334	2331339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452856144
49634	NC_020410	GCG	2	6	2331358	2331363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452856144
49635	NC_020410	GTT	2	6	2331399	2331404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452856144
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49637	NC_020410	GTGCC	2	10	2331647	2331656	0 %	20 %	40 %	40 %	452856144
49638	NC_020410	CCG	2	6	2331686	2331691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856144
49639	NC_020410	GCC	2	6	2331774	2331779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856144
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49644	NC_020410	ATTC	2	8	2332205	2332212	25 %	50 %	0 %	25 %	452856144
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49647	NC_020410	CAG	2	6	2332294	2332299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856144
49648	NC_020410	A	7	7	2332358	2332364	100 %	0 %	0 %	0 %	452856144
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49650	NC_020410	TAA	2	6	2332447	2332452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452856144
49651	NC_020410	CCGT	2	8	2332585	2332592	0 %	25 %	25 %	50 %	452856144
49652	NC_020410	GCC	2	6	2332615	2332620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856144
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49658	NC_020410	A	7	7	2332839	2332845	100 %	0 %	0 %	0 %	452856144
49659	NC_020410	CCG	2	6	2332981	2332986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856145
49660	NC_020410	TGTC	2	8	2332998	2333005	0 %	50 %	25 %	25 %	452856145
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49662	NC_020410	TGA	2	6	2333354	2333359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856145
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49670	NC_020410	CT	4	8	2333563	2333570	0 %	50 %	0 %	50 %	452856145
49671	NC_020410	TAA	2	6	2333579	2333584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452856145
49672	NC_020410	TCC	2	6	2333670	2333675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452856145
49673	NC_020410	GAC	2	6	2333679	2333684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856145
49674	NC_020410	CCT	2	6	2333711	2333716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49675	NC_020410	T	7	7	2333734	2333740	0 %	100 %	0 %	0 %	452856146
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49677	NC_020410	TTTG	2	8	2333809	2333816	0 %	75 %	25 %	0 %	452856146
49678	NC_020410	CTG	2	6	2333878	2333883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856146
49679	NC_020410	T	6	6	2333907	2333912	0 %	100 %	0 %	0 %	452856146
49680	NC_020410	TC	3	6	2333986	2333991	0 %	50 %	0 %	50 %	452856146
49681	NC_020410	TTC	2	6	2334016	2334021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856146
49682	NC_020410	TA	3	6	2334032	2334037	50 %	50 %	0 %	0 %	452856146
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49685	NC_020410	AG	3	6	2334350	2334355	50 %	0 %	50 %	0 %	452856146
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49688	NC_020410	C	6	6	2334491	2334496	0 %	0 %	0 %	100 %	452856146
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49692	NC_020410	TGCTT	2	10	2334626	2334635	0 %	60 %	20 %	20 %	452856146
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49701	NC_020410	TTCT	2	8	2334944	2334951	0 %	75 %	0 %	25 %	452856146
49702	NC_020410	A	6	6	2334953	2334958	100 %	0 %	0 %	0 %	452856146
49703	NC_020410	ATC	2	6	2334977	2334982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856146
49704	NC_020410	AT	3	6	2335100	2335105	50 %	50 %	0 %	0 %	452856147
49705	NC_020410	TGC	2	6	2335125	2335130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856147
49706	NC_020410	TCCATC	2	12	2335187	2335198	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	452856147
49707	NC_020410	TGA	2	6	2335225	2335230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856147
49708	NC_020410	CAT	2	6	2335257	2335262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452856147
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49711	NC_020410	TTC	2	6	2335369	2335374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49712	NC_020410	TGA	2	6	2335389	2335394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452856148
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49717	NC_020410	CG	3	6	2335661	2335666	0 %	0 %	50 %	50 %	452856148
49718	NC_020410	CCG	2	6	2335716	2335721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452856148
49719	NC_020410	GCA	2	6	2335769	2335774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856148
49720	NC_020410	CTG	2	6	2335809	2335814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452856148
49721	NC_020410	GGC	2	6	2335883	2335888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452856148
49722	NC_020410	TG	3	6	2335961	2335966	0 %	50 %	50 %	0 %	452856148
49723	NC_020410	CGA	2	6	2335971	2335976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856148
49724	NC_020410	AAT	2	6	2336064	2336069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452856148
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49726	NC_020410	TG	3	6	2336265	2336270	0 %	50 %	50 %	0 %	452856148
49727	NC_020410	CAG	3	9	2336284	2336292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452856148
49728	NC_020410	TCC	2	6	2336365	2336370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49729	NC_020410	A	6	6	2336375	2336380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49730	NC_020410	AAG	2	6	2336429	2336434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452856149
49731	NC_020410	TTC	2	6	2336444	2336449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856149
49732	NC_020410	TTCC	2	8	2336581	2336588	0 %	50 %	0 %	50 %	452856149
49733	NC_020410	TTC	2	6	2336738	2336743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452856149
49734	NC_020410	T	6	6	2336758	2336763	0 %	100 %	0 %	0 %	452856149
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