MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-6

Total Repeats: 154

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020390	T	6	6	3	8	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020390	TTGT	2	8	87	94	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020390	TTGT	2	8	171	178	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020390	T	6	6	197	202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020390	TAA	2	6	227	232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020390	TC	3	6	259	264	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_020390	T	7	7	296	302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020390	TGT	2	6	333	338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020390	TCT	2	6	355	360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_020390	TTTCT	2	10	423	432	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_020390	T	7	7	437	443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020390	TTG	2	6	459	464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020390	T	6	6	470	475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020390	TGT	2	6	514	519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020390	ACT	2	6	538	543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_020390	T	6	6	633	638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020390	TGT	2	6	700	705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020390	TCT	2	6	757	762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_020390	GTG	2	6	791	796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020390	AATG	2	8	904	911	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020390	TAC	2	6	933	938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_020390	T	6	6	1025	1030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020390	CAA	2	6	1038	1043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_020390	AAT	2	6	1067	1072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020390	ACT	2	6	1214	1219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_020390	GA	3	6	1242	1247	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020390	TTG	2	6	1313	1318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020390	CCA	2	6	1400	1405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_020390	CTT	2	6	1599	1604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202017
30	NC_020390	GTT	2	6	1626	1631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202017
31	NC_020390	TA	3	6	1663	1668	50 %	50 %	0 %	0 %	452202017
32	NC_020390	TCT	2	6	1681	1686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202017
33	NC_020390	TCT	3	9	1715	1723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202017
34	NC_020390	AT	3	6	1811	1816	50 %	50 %	0 %	0 %	452202017
35	NC_020390	TGT	2	6	1877	1882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202017
36	NC_020390	TCT	2	6	1976	1981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_020390	A	6	6	2174	2179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020390	GAA	2	6	2190	2195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020390	TA	4	8	2275	2282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020390	AG	5	10	2291	2300	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020390	A	8	8	2311	2318	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020390	AT	3	6	2324	2329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020390	GT	3	6	2350	2355	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020390	AC	3	6	2390	2395	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_020390	A	8	8	2404	2411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020390	AAT	2	6	2438	2443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202018
47	NC_020390	ATTTTC	2	12	2465	2476	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	452202018
48	NC_020390	TTCA	2	8	2506	2513	25 %	50 %	0 %	25 %	452202018
49	NC_020390	TG	3	6	2541	2546	0 %	50 %	50 %	0 %	452202018
50	NC_020390	ATT	2	6	2575	2580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202018
51	NC_020390	AATT	2	8	2668	2675	50 %	50 %	0 %	0 %	452202018
52	NC_020390	ACAAT	2	10	2729	2738	60 %	20 %	0 %	20 %	452202018
53	NC_020390	TA	3	6	2752	2757	50 %	50 %	0 %	0 %	452202018
54	NC_020390	TTA	2	6	2789	2794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202018
55	NC_020390	TTTA	2	8	2809	2816	25 %	75 %	0 %	0 %	452202018
56	NC_020390	T	7	7	2871	2877	0 %	100 %	0 %	0 %	452202018
57	NC_020390	ATG	2	6	2956	2961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202018
58	NC_020390	TTTCTA	2	12	2982	2993	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	452202018
59	NC_020390	TTA	2	6	3101	3106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020390	AATT	2	8	3119	3126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020390	TAAT	2	8	3142	3149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020390	A	7	7	3161	3167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020390	CTT	2	6	3171	3176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_020390	GTT	2	6	3182	3187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020390	AAC	2	6	3192	3197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_020390	T	7	7	3218	3224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020390	AT	3	6	3263	3268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020390	T	7	7	3272	3278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020390	TTA	2	6	3319	3324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020390	A	6	6	3336	3341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020390	T	6	6	3359	3364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020390	AT	3	6	3410	3415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020390	TAA	2	6	3426	3431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020390	AT	3	6	3437	3442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020390	ATA	2	6	3469	3474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020390	A	6	6	3484	3489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020390	CAAA	2	8	3511	3518	75 %	0 %	0 %	25 %	452202019
78	NC_020390	A	7	7	3616	3622	100 %	0 %	0 %	0 %	452202019
79	NC_020390	AGA	3	9	3633	3641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202019
80	NC_020390	CCA	2	6	3681	3686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452202019
81	NC_020390	AC	3	6	3746	3751	50 %	0 %	0 %	50 %	452202019
82	NC_020390	TCT	2	6	3762	3767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202019
83	NC_020390	TAT	2	6	3775	3780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202019
84	NC_020390	T	6	6	3784	3789	0 %	100 %	0 %	0 %	452202019
85	NC_020390	TAT	2	6	3901	3906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202019
86	NC_020390	CAA	2	6	3934	3939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202019
87	NC_020390	TAA	2	6	4023	4028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202019
88	NC_020390	CA	3	6	4047	4052	50 %	0 %	0 %	50 %	452202019
89	NC_020390	GAA	2	6	4075	4080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202019
90	NC_020390	AT	3	6	4100	4105	50 %	50 %	0 %	0 %	452202019
91	NC_020390	AAAAAG	2	12	4109	4120	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	452202019
92	NC_020390	TATG	2	8	4161	4168	25 %	50 %	25 %	0 %	452202019
93	NC_020390	CAAAA	2	10	4169	4178	80 %	0 %	0 %	20 %	452202019
94	NC_020390	AACAAA	2	12	4282	4293	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	452202019
95	NC_020390	TAA	2	6	4329	4334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202019
96	NC_020390	GAA	2	6	4345	4350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202019
97	NC_020390	ATA	2	6	4417	4422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202019
98	NC_020390	A	7	7	4563	4569	100 %	0 %	0 %	0 %	452202019
99	NC_020390	ATA	2	6	4574	4579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202019
100	NC_020390	A	7	7	4596	4602	100 %	0 %	0 %	0 %	452202019
101	NC_020390	ATT	2	6	4623	4628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202020
102	NC_020390	CTTTA	2	10	4634	4643	20 %	60 %	0 %	20 %	452202020
103	NC_020390	A	6	6	4693	4698	100 %	0 %	0 %	0 %	452202020
104	NC_020390	TTTA	2	8	4779	4786	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020390	T	8	8	4803	4810	0 %	100 %	0 %	0 %	452202021
106	NC_020390	TAT	2	6	4825	4830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202021
107	NC_020390	ATA	2	6	4923	4928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202021
108	NC_020390	A	6	6	4933	4938	100 %	0 %	0 %	0 %	452202021
109	NC_020390	A	6	6	4952	4957	100 %	0 %	0 %	0 %	452202021
110	NC_020390	T	6	6	4981	4986	0 %	100 %	0 %	0 %	452202021
111	NC_020390	AATC	2	8	5002	5009	50 %	25 %	0 %	25 %	452202021
112	NC_020390	A	6	6	5082	5087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020390	TTA	2	6	5098	5103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202022
114	NC_020390	CCAA	2	8	5120	5127	50 %	0 %	0 %	50 %	452202022
115	NC_020390	TG	3	6	5157	5162	0 %	50 %	50 %	0 %	452202022
116	NC_020390	CTG	2	6	5216	5221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202022
117	NC_020390	GCT	2	6	5230	5235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202022
118	NC_020390	TAA	2	6	5253	5258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202022
119	NC_020390	ATT	2	6	5307	5312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202022
120	NC_020390	TTG	2	6	5319	5324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202022
121	NC_020390	CCA	2	6	5358	5363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452202022
122	NC_020390	ATT	2	6	5418	5423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202022
123	NC_020390	TAT	2	6	5459	5464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202022
124	NC_020390	TCTAAT	2	12	5575	5586	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	452202022
125	NC_020390	AT	3	6	5608	5613	50 %	50 %	0 %	0 %	452202022
126	NC_020390	AAT	2	6	5637	5642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202022
127	NC_020390	T	7	7	5700	5706	0 %	100 %	0 %	0 %	452202022
128	NC_020390	TCT	2	6	5749	5754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202022
129	NC_020390	AAC	2	6	5763	5768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202022
130	NC_020390	ATA	2	6	5786	5791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202022
131	NC_020390	T	6	6	5820	5825	0 %	100 %	0 %	0 %	452202022
132	NC_020390	ATA	2	6	5833	5838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202022
133	NC_020390	AAT	2	6	5864	5869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202022
134	NC_020390	CAT	2	6	5915	5920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_020390	AAT	2	6	5961	5966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020390	AT	3	6	5975	5980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020390	AATC	2	8	6032	6039	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_020390	CAA	2	6	6065	6070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_020390	A	6	6	6069	6074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020390	A	6	6	6076	6081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020390	ATCT	2	8	6089	6096	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_020390	ACT	2	6	6151	6156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_020390	TTTC	2	8	6232	6239	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_020390	A	7	7	6314	6320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020390	T	7	7	6345	6351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020390	A	6	6	6437	6442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020390	TA	4	8	6449	6456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020390	T	6	6	6471	6476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020390	ACC	2	6	6563	6568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
150	NC_020390	GAC	2	6	6612	6617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_020390	CAC	2	6	6682	6687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
152	NC_020390	T	6	6	6724	6729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_020390	ACA	2	6	6730	6735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_020390	TAA	2	6	6843	6848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.