MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-328

Total Repeats: 8077

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_020385	AAT	2	6	324989	324994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_020385	AAC	2	6	325037	325042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202689
8003	NC_020385	GTAC	2	8	325092	325099	25 %	25 %	25 %	25 %	452202689
8004	NC_020385	AT	3	6	325100	325105	50 %	50 %	0 %	0 %	452202689
8005	NC_020385	AACT	2	8	325183	325190	50 %	25 %	0 %	25 %	452202689
8006	NC_020385	TTA	2	6	325206	325211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202689
8007	NC_020385	AT	3	6	325225	325230	50 %	50 %	0 %	0 %	452202689
8008	NC_020385	CTC	2	6	325256	325261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452202689
8009	NC_020385	TAC	2	6	325381	325386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202689
8010	NC_020385	TTGT	2	8	325390	325397	0 %	75 %	25 %	0 %	452202689
8011	NC_020385	CTA	2	6	325420	325425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202689
8012	NC_020385	CTT	2	6	325483	325488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202689
8013	NC_020385	TA	4	8	325492	325499	50 %	50 %	0 %	0 %	452202689
8014	NC_020385	AGT	2	6	325551	325556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202689
8015	NC_020385	TTGC	2	8	325564	325571	0 %	50 %	25 %	25 %	452202689
8016	NC_020385	CAA	2	6	325633	325638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202689
8017	NC_020385	AT	3	6	325655	325660	50 %	50 %	0 %	0 %	452202689
8018	NC_020385	TAT	2	6	325705	325710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_020385	CTTTCA	2	12	325717	325728	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8020	NC_020385	TTAT	2	8	325734	325741	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_020385	TA	4	8	325742	325749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_020385	ATA	2	6	325761	325766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_020385	GCT	2	6	325801	325806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202690
8024	NC_020385	TCC	2	6	325842	325847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452202690
8025	NC_020385	TAAA	2	8	325859	325866	75 %	25 %	0 %	0 %	452202690
8026	NC_020385	CAT	2	6	325874	325879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202690
8027	NC_020385	CTT	2	6	325881	325886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202690
8028	NC_020385	T	7	7	325956	325962	0 %	100 %	0 %	0 %	452202690
8029	NC_020385	CTTT	2	8	325979	325986	0 %	75 %	0 %	25 %	452202690
8030	NC_020385	ACC	2	6	325989	325994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452202690
8031	NC_020385	T	7	7	326033	326039	0 %	100 %	0 %	0 %	452202690
8032	NC_020385	ACC	2	6	326070	326075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452202690
8033	NC_020385	T	8	8	326121	326128	0 %	100 %	0 %	0 %	452202691
8034	NC_020385	TAA	2	6	326147	326152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202691
8035	NC_020385	CACT	2	8	326188	326195	25 %	25 %	0 %	50 %	452202691
8036	NC_020385	CAAG	2	8	326248	326255	50 %	0 %	25 %	25 %	452202691
8037	NC_020385	CTAC	2	8	326370	326377	25 %	25 %	0 %	50 %	452202691
8038	NC_020385	TAA	2	6	326378	326383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202691
8039	NC_020385	AAT	2	6	326394	326399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202691
8040	NC_020385	AGA	2	6	326426	326431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202691
8041	NC_020385	TGC	2	6	326450	326455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202691
8042	NC_020385	ATA	2	6	326464	326469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202691
8043	NC_020385	ATCAAT	3	18	326492	326509	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8044	NC_020385	AT	4	8	326516	326523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_020385	TTA	2	6	326545	326550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_020385	TAAA	2	8	326571	326578	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_020385	T	6	6	326600	326605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_020385	CTT	3	9	326661	326669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202692
8049	NC_020385	AAG	2	6	326747	326752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202692
8050	NC_020385	T	6	6	326794	326799	0 %	100 %	0 %	0 %	452202692
8051	NC_020385	CAT	2	6	326949	326954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202692
8052	NC_020385	ACT	2	6	326956	326961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202692
8053	NC_020385	GTA	2	6	326976	326981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202692
8054	NC_020385	AT	3	6	327008	327013	50 %	50 %	0 %	0 %	452202692
8055	NC_020385	TTGA	2	8	327070	327077	25 %	50 %	25 %	0 %	452202692
8056	NC_020385	TCA	2	6	327105	327110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202692
8057	NC_020385	TAT	2	6	327126	327131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202692
8058	NC_020385	CTA	3	9	327144	327152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202692
8059	NC_020385	TTC	2	6	327215	327220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202692
8060	NC_020385	TTC	2	6	327223	327228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8061	NC_020385	TGT	2	6	327270	327275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202693
8062	NC_020385	TTA	2	6	327315	327320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202693
8063	NC_020385	TAAA	2	8	327350	327357	75 %	25 %	0 %	0 %	452202693
8064	NC_020385	T	6	6	327581	327586	0 %	100 %	0 %	0 %	452202693
8065	NC_020385	CTT	2	6	327589	327594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202693
8066	NC_020385	CAC	2	6	327634	327639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452202693
8067	NC_020385	TGA	2	6	327641	327646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202693
8068	NC_020385	ATC	2	6	327656	327661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202693
8069	NC_020385	GTTG	2	8	327690	327697	0 %	50 %	50 %	0 %	452202693
8070	NC_020385	ACC	2	6	327755	327760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452202693
8071	NC_020385	ACC	2	6	327773	327778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452202693
8072	NC_020385	GTAA	2	8	327844	327851	50 %	25 %	25 %	0 %	452202693
8073	NC_020385	ACC	2	6	327893	327898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452202693
8074	NC_020385	GTT	2	6	327899	327904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202693
8075	NC_020385	CGG	2	6	327970	327975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452202693
8076	NC_020385	TCA	2	6	328023	328028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202693
8077	NC_020385	CA	3	6	328106	328111	50 %	0 %	0 %	50 %	452202693

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.