MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-328

Total Repeats: 8077

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020385	GT	3	6	26	31	0 %	50 %	50 %	0 %	452202392
2	NC_020385	ATT	2	6	51	56	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202392
3	NC_020385	T	6	6	85	90	0 %	100 %	0 %	0 %	452202392
4	NC_020385	ATG	2	6	151	156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202392
5	NC_020385	TTC	2	6	177	182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202392
6	NC_020385	TTG	2	6	243	248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202392
7	NC_020385	AT	3	6	258	263	50 %	50 %	0 %	0 %	452202392
8	NC_020385	TTGG	2	8	292	299	0 %	50 %	50 %	0 %	452202392
9	NC_020385	ACC	2	6	327	332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452202392
10	NC_020385	TGT	2	6	388	393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202392
11	NC_020385	AT	3	6	505	510	50 %	50 %	0 %	0 %	452202392
12	NC_020385	TCT	2	6	559	564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202392
13	NC_020385	TCA	2	6	788	793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202392
14	NC_020385	GATG	2	8	893	900	25 %	25 %	50 %	0 %	452202392
15	NC_020385	A	6	6	918	923	100 %	0 %	0 %	0 %	452202392
16	NC_020385	TGA	2	6	940	945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202392
17	NC_020385	ATT	2	6	1015	1020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202392
18	NC_020385	TGG	2	6	1098	1103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452202392
19	NC_020385	AACT	2	8	1193	1200	50 %	25 %	0 %	25 %	452202392
20	NC_020385	GAT	2	6	1233	1238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202392
21	NC_020385	TCC	2	6	1275	1280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_020385	TTA	2	6	1302	1307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020385	A	6	6	1344	1349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020385	TA	3	6	1358	1363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020385	GTA	2	6	1376	1381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020385	AG	3	6	1386	1391	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020385	ATG	2	6	1466	1471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020385	ATT	2	6	1514	1519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020385	AAT	2	6	1551	1556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020385	TGG	2	6	1591	1596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020385	ATT	2	6	1639	1644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020385	TCA	2	6	1684	1689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_020385	ACA	2	6	1708	1713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_020385	AGC	2	6	1726	1731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_020385	TGC	2	6	1743	1748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_020385	G	6	6	1757	1762	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020385	A	6	6	1766	1771	100 %	0 %	0 %	0 %	452202393
38	NC_020385	TGTTA	2	10	1806	1815	20 %	60 %	20 %	0 %	452202393
39	NC_020385	TAC	2	6	1827	1832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202393
40	NC_020385	GAT	2	6	1896	1901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202393
41	NC_020385	AGA	2	6	1902	1907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202393
42	NC_020385	TGA	2	6	1929	1934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202393
43	NC_020385	AGA	2	6	1986	1991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202393
44	NC_020385	GAA	2	6	1992	1997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202393
45	NC_020385	AAG	2	6	2011	2016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202393
46	NC_020385	TAG	2	6	2040	2045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202393
47	NC_020385	AG	3	6	2044	2049	50 %	0 %	50 %	0 %	452202393
48	NC_020385	AAAC	2	8	2060	2067	75 %	0 %	0 %	25 %	452202393
49	NC_020385	GTTT	2	8	2168	2175	0 %	75 %	25 %	0 %	452202393
50	NC_020385	TAG	2	6	2183	2188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202393
51	NC_020385	AGA	2	6	2241	2246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202393
52	NC_020385	TAT	2	6	2355	2360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202393
53	NC_020385	TAGA	2	8	2393	2400	50 %	25 %	25 %	0 %	452202393
54	NC_020385	AGA	2	6	2403	2408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202393
55	NC_020385	GAA	2	6	2425	2430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202393
56	NC_020385	AGA	2	6	2457	2462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202393
57	NC_020385	ATGA	2	8	2476	2483	50 %	25 %	25 %	0 %	452202393
58	NC_020385	AG	3	6	2521	2526	50 %	0 %	50 %	0 %	452202393
59	NC_020385	AAGA	2	8	2550	2557	75 %	0 %	25 %	0 %	452202393
60	NC_020385	GAT	2	6	2617	2622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202393
61	NC_020385	AGG	2	6	2634	2639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452202393
62	NC_020385	TTG	2	6	2642	2647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202393
63	NC_020385	GATTT	2	10	2717	2726	20 %	60 %	20 %	0 %	452202393
64	NC_020385	CT	3	6	2836	2841	0 %	50 %	0 %	50 %	452202393
65	NC_020385	TAG	2	6	2852	2857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202393
66	NC_020385	GTTTG	2	10	2934	2943	0 %	60 %	40 %	0 %	452202393
67	NC_020385	GAA	2	6	2973	2978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202393
68	NC_020385	GTAA	2	8	2981	2988	50 %	25 %	25 %	0 %	452202393
69	NC_020385	ATAGA	2	10	3034	3043	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020385	TAT	2	6	3170	3175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020385	AT	3	6	3174	3179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020385	A	7	7	3204	3210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020385	GTTT	2	8	3220	3227	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020385	AAT	2	6	3228	3233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020385	ATTT	2	8	3234	3241	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020385	AAT	2	6	3248	3253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020385	T	7	7	3331	3337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020385	T	6	6	3339	3344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020385	GTT	2	6	3412	3417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020385	ATT	2	6	3419	3424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202394
81	NC_020385	T	6	6	3448	3453	0 %	100 %	0 %	0 %	452202394
82	NC_020385	TGCTT	2	10	3461	3470	0 %	60 %	20 %	20 %	452202394
83	NC_020385	ATT	2	6	3492	3497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202394
84	NC_020385	ATA	2	6	3523	3528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202394
85	NC_020385	TGT	2	6	3543	3548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202394
86	NC_020385	TTAG	2	8	3553	3560	25 %	50 %	25 %	0 %	452202394
87	NC_020385	AAT	2	6	3594	3599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202394
88	NC_020385	TCT	2	6	3625	3630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202394
89	NC_020385	TCT	2	6	3830	3835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_020385	ATTT	2	8	3866	3873	25 %	75 %	0 %	0 %	452202395
91	NC_020385	CTT	2	6	3915	3920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202395
92	NC_020385	TAA	2	6	3952	3957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202395
93	NC_020385	TTG	2	6	3989	3994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202395
94	NC_020385	TAC	2	6	3998	4003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202396
95	NC_020385	TACCA	2	10	4027	4036	40 %	20 %	0 %	40 %	452202396
96	NC_020385	ATGT	2	8	4153	4160	25 %	50 %	25 %	0 %	452202396
97	NC_020385	AAG	2	6	4166	4171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202396
98	NC_020385	GGT	2	6	4187	4192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452202396
99	NC_020385	TTG	2	6	4224	4229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202396
100	NC_020385	CTT	2	6	4251	4256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202396
101	NC_020385	AGG	2	6	4369	4374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452202396
102	NC_020385	TAT	2	6	4387	4392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202396
103	NC_020385	TTC	2	6	4414	4419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202396
104	NC_020385	TGC	2	6	4432	4437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202396
105	NC_020385	CTTG	2	8	4465	4472	0 %	50 %	25 %	25 %	452202396
106	NC_020385	T	6	6	4523	4528	0 %	100 %	0 %	0 %	452202396
107	NC_020385	CTT	2	6	4539	4544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202396
108	NC_020385	TATCT	2	10	4549	4558	20 %	60 %	0 %	20 %	452202396
109	NC_020385	CTT	2	6	4560	4565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202396
110	NC_020385	ATG	2	6	4580	4585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202396
111	NC_020385	TCTT	2	8	4607	4614	0 %	75 %	0 %	25 %	452202396
112	NC_020385	TCT	2	6	4644	4649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202396
113	NC_020385	TCT	2	6	4652	4657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202396
114	NC_020385	AAC	2	6	4674	4679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202396
115	NC_020385	TAA	2	6	4687	4692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202396
116	NC_020385	TATG	2	8	4735	4742	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020385	ATT	2	6	4755	4760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020385	GTAA	2	8	4761	4768	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020385	ATAA	2	8	4798	4805	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020385	AT	3	6	4807	4812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020385	AAATTT	2	12	4813	4824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020385	AAG	2	6	4954	4959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020385	G	7	7	4989	4995	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020385	AT	3	6	5087	5092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020385	ATC	2	6	5136	5141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_020385	A	6	6	5142	5147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020385	A	6	6	5188	5193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020385	G	6	6	5256	5261	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020385	TCT	2	6	5277	5282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_020385	CT	3	6	5298	5303	0 %	50 %	0 %	50 %	452202397
131	NC_020385	TGT	2	6	5341	5346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202397
132	NC_020385	ATT	2	6	5542	5547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202397
133	NC_020385	ATA	2	6	5563	5568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202397
134	NC_020385	ATA	2	6	5675	5680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202397
135	NC_020385	CGT	2	6	5703	5708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202397
136	NC_020385	TGT	2	6	5729	5734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202397
137	NC_020385	TAA	2	6	5871	5876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202397
138	NC_020385	CATCCC	2	12	5910	5921	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	452202397
139	NC_020385	AAT	2	6	6015	6020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202397
140	NC_020385	TTA	2	6	6050	6055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202397
141	NC_020385	AT	3	6	6133	6138	50 %	50 %	0 %	0 %	452202397
142	NC_020385	TAT	2	6	6180	6185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202397
143	NC_020385	T	6	6	6222	6227	0 %	100 %	0 %	0 %	452202397
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151	NC_020385	TA	3	6	6579	6584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020385	TCAA	2	8	6596	6603	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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176	NC_020385	TAA	2	6	7261	7266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_020385	AT	3	6	7418	7423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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264	NC_020385	A	7	7	11245	11251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
265	NC_020385	AT	3	6	11279	11284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
266	NC_020385	TAT	3	9	11290	11298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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268	NC_020385	CTT	2	6	11386	11391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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270	NC_020385	TGT	2	6	11462	11467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
271	NC_020385	TTAT	2	8	11488	11495	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_020385	CATAA	2	10	11500	11509	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
273	NC_020385	AT	3	6	11577	11582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_020385	GAA	2	6	11618	11623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
275	NC_020385	GAA	2	6	11667	11672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
276	NC_020385	T	6	6	11701	11706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_020385	GAAT	2	8	11725	11732	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
278	NC_020385	TTTA	2	8	11767	11774	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_020385	AGA	2	6	11787	11792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
280	NC_020385	A	7	7	11799	11805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_020385	AGA	2	6	11879	11884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
282	NC_020385	TAA	2	6	11957	11962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_020385	AGG	2	6	11987	11992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
284	NC_020385	AT	3	6	12007	12012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_020385	ATGT	2	8	12015	12022	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
286	NC_020385	TGAA	2	8	12062	12069	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
287	NC_020385	ATA	2	6	12070	12075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_020385	ATTTT	2	10	12179	12188	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_020385	ATT	2	6	12291	12296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_020385	TA	3	6	12345	12350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_020385	ATT	2	6	12366	12371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_020385	TTA	2	6	12372	12377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_020385	TGA	2	6	12392	12397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
294	NC_020385	ATA	2	6	12404	12409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202403
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357	NC_020385	AT	3	6	15224	15229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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400	NC_020385	AC	3	6	16561	16566	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
401	NC_020385	CATA	2	8	16572	16579	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
402	NC_020385	GT	3	6	16588	16593	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
403	NC_020385	AT	3	6	16633	16638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
404	NC_020385	A	7	7	16694	16700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
405	NC_020385	CAATT	2	10	16815	16824	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
406	NC_020385	TTA	2	6	16839	16844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
407	NC_020385	TTA	2	6	16860	16865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
408	NC_020385	AAT	2	6	16870	16875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
409	NC_020385	TGCAT	2	10	16905	16914	20 %	40 %	20 %	20 %	452202411
410	NC_020385	T	7	7	16921	16927	0 %	100 %	0 %	0 %	452202411
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415	NC_020385	A	6	6	17061	17066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
416	NC_020385	AGGTA	2	10	17082	17091	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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