MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-9

Total Repeats: 216

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020378	GAT	2	6	24	29	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020378	CAT	3	9	82	90	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020378	GATT	2	8	228	235	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020378	GAA	2	6	328	333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020378	CTT	2	6	352	357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_020378	T	6	6	432	437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020378	TA	3	6	482	487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020378	TCA	2	6	546	551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_020378	ATC	2	6	566	571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_020378	ATG	2	6	581	586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020378	ATA	2	6	656	661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020378	TCA	3	9	681	689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_020378	ATTCA	2	10	764	773	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_020378	TCG	2	6	814	819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_020378	TAA	2	6	839	844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020378	GTT	2	6	922	927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020378	CTT	2	6	931	936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_020378	TAA	2	6	1036	1041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020378	TCT	2	6	1051	1056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_020378	T	6	6	1064	1069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020378	TGCT	2	8	1076	1083	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_020378	T	6	6	1100	1105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020378	TTTG	2	8	1110	1117	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020378	TCA	2	6	1123	1128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_020378	T	6	6	1321	1326	0 %	100 %	0 %	0 %	452202111
26	NC_020378	GTA	2	6	1478	1483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202111
27	NC_020378	TTG	2	6	1506	1511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202111
28	NC_020378	CATA	2	8	1541	1548	50 %	25 %	0 %	25 %	452202111
29	NC_020378	GAA	2	6	1553	1558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202111
30	NC_020378	TAT	2	6	1610	1615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202111
31	NC_020378	TTG	2	6	1629	1634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202111
32	NC_020378	TAA	2	6	1647	1652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202111
33	NC_020378	AGA	2	6	1668	1673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202111
34	NC_020378	TTC	2	6	1755	1760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202111
35	NC_020378	CCAG	2	8	1833	1840	25 %	0 %	25 %	50 %	452202111
36	NC_020378	ATTTT	2	10	2056	2065	20 %	80 %	0 %	0 %	452202112
37	NC_020378	T	6	6	2062	2067	0 %	100 %	0 %	0 %	452202112
38	NC_020378	AGT	2	6	2095	2100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202112
39	NC_020378	AGA	2	6	2177	2182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202112
40	NC_020378	TAA	2	6	2204	2209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202112
41	NC_020378	GAC	2	6	2238	2243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452202112
42	NC_020378	TAA	2	6	2273	2278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202112
43	NC_020378	CTGTA	2	10	2300	2309	20 %	40 %	20 %	20 %	452202112
44	NC_020378	TCGA	2	8	2316	2323	25 %	25 %	25 %	25 %	452202112
45	NC_020378	GTT	2	6	2375	2380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202112
46	NC_020378	CCT	2	6	2383	2388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452202112
47	NC_020378	AAT	2	6	2400	2405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202112
48	NC_020378	TCAT	2	8	2431	2438	25 %	50 %	0 %	25 %	452202112
49	NC_020378	GATA	2	8	2442	2449	50 %	25 %	25 %	0 %	452202112
50	NC_020378	TTA	2	6	2512	2517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202112
51	NC_020378	AC	3	6	2525	2530	50 %	0 %	0 %	50 %	452202112
52	NC_020378	T	6	6	2542	2547	0 %	100 %	0 %	0 %	452202112
53	NC_020378	CAA	2	6	2558	2563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202112
54	NC_020378	TTG	2	6	2628	2633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202112
55	NC_020378	CTA	2	6	2674	2679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202112
56	NC_020378	TAAGA	2	10	2864	2873	60 %	20 %	20 %	0 %	452202112
57	NC_020378	TCC	2	6	2904	2909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_020378	TATT	2	8	2939	2946	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020378	ATTTAT	2	12	2979	2990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020378	ACA	2	6	3004	3009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_020378	TGT	2	6	3022	3027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020378	ATT	2	6	3028	3033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020378	T	6	6	3032	3037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020378	A	7	7	3042	3048	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020378	AAT	2	6	3068	3073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020378	AT	3	6	3075	3080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020378	T	7	7	3088	3094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020378	T	7	7	3117	3123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020378	T	6	6	3203	3208	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020378	TAT	2	6	3217	3222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020378	T	6	6	3243	3248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020378	T	7	7	3285	3291	0 %	100 %	0 %	0 %	452202113
73	NC_020378	T	6	6	3334	3339	0 %	100 %	0 %	0 %	452202113
74	NC_020378	ATA	2	6	3358	3363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202113
75	NC_020378	AT	3	6	3437	3442	50 %	50 %	0 %	0 %	452202113
76	NC_020378	TA	4	8	3483	3490	50 %	50 %	0 %	0 %	452202113
77	NC_020378	T	6	6	3493	3498	0 %	100 %	0 %	0 %	452202113
78	NC_020378	TAAA	2	8	3513	3520	75 %	25 %	0 %	0 %	452202113
79	NC_020378	CAT	2	6	3559	3564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202113
80	NC_020378	T	9	9	3575	3583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020378	TCC	2	6	3593	3598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_020378	ATT	2	6	3602	3607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020378	GAACCA	2	12	3710	3721	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	452202114
84	NC_020378	T	7	7	3764	3770	0 %	100 %	0 %	0 %	452202114
85	NC_020378	TAAA	2	8	3799	3806	75 %	25 %	0 %	0 %	452202114
86	NC_020378	AGT	2	6	3826	3831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202114
87	NC_020378	TTG	2	6	3955	3960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202114
88	NC_020378	CTA	2	6	4026	4031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202114
89	NC_020378	CTG	2	6	4035	4040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202114
90	NC_020378	AT	3	6	4062	4067	50 %	50 %	0 %	0 %	452202114
91	NC_020378	TCA	2	6	4115	4120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202114
92	NC_020378	ATT	2	6	4156	4161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202114
93	NC_020378	CATT	2	8	4172	4179	25 %	50 %	0 %	25 %	452202114
94	NC_020378	AT	3	6	4225	4230	50 %	50 %	0 %	0 %	452202114
95	NC_020378	TTC	2	6	4240	4245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202114
96	NC_020378	CATT	2	8	4262	4269	25 %	50 %	0 %	25 %	452202114
97	NC_020378	CTT	2	6	4299	4304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202114
98	NC_020378	AAT	2	6	4336	4341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202114
99	NC_020378	CAG	2	6	4347	4352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452202114
100	NC_020378	A	6	6	4381	4386	100 %	0 %	0 %	0 %	452202114
101	NC_020378	TAAT	2	8	4404	4411	50 %	50 %	0 %	0 %	452202114
102	NC_020378	T	6	6	4414	4419	0 %	100 %	0 %	0 %	452202114
103	NC_020378	ATT	2	6	4441	4446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020378	TTCAAA	2	12	4482	4493	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_020378	A	6	6	4511	4516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020378	TTA	2	6	4528	4533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020378	AAT	2	6	4538	4543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020378	GAA	2	6	4645	4650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020378	A	6	6	4744	4749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020378	TA	3	6	4844	4849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020378	GAGAGT	2	12	4850	4861	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020378	CTA	2	6	4869	4874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_020378	TTA	2	6	4890	4895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020378	ATTAAA	2	12	4964	4975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020378	A	6	6	4973	4978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020378	A	6	6	4987	4992	100 %	0 %	0 %	0 %	452202115
117	NC_020378	T	6	6	5006	5011	0 %	100 %	0 %	0 %	452202115
118	NC_020378	ATAA	2	8	5031	5038	75 %	25 %	0 %	0 %	452202115
119	NC_020378	GTT	2	6	5049	5054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202115
120	NC_020378	ATA	2	6	5082	5087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202115
121	NC_020378	TAA	2	6	5095	5100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202115
122	NC_020378	GAAT	2	8	5262	5269	50 %	25 %	25 %	0 %	452202115
123	NC_020378	TACAA	2	10	5276	5285	60 %	20 %	0 %	20 %	452202115
124	NC_020378	TTC	2	6	5333	5338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202115
125	NC_020378	A	6	6	5345	5350	100 %	0 %	0 %	0 %	452202115
126	NC_020378	ACTTT	2	10	5398	5407	20 %	60 %	0 %	20 %	452202115
127	NC_020378	CTT	3	9	5488	5496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202115
128	NC_020378	CTTTT	2	10	5525	5534	0 %	80 %	0 %	20 %	452202115
129	NC_020378	TTA	2	6	5652	5657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020378	AATT	2	8	5670	5677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020378	TAAT	2	8	5693	5700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020378	A	7	7	5712	5718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020378	T	7	7	5770	5776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020378	TCAT	2	8	5837	5844	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_020378	A	7	7	5854	5860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020378	T	7	7	5918	5924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020378	T	6	6	6033	6038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020378	TGA	2	6	6074	6079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020378	CAT	2	6	6118	6123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_020378	CTTT	2	8	6153	6160	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_020378	ATT	2	6	6209	6214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020378	ACA	2	6	6290	6295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_020378	A	7	7	6313	6319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020378	AAC	2	6	6349	6354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_020378	TATT	2	8	6398	6405	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020378	AATT	2	8	6432	6439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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216	NC_020378	AGA	2	6	9664	9669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.