MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-8

Total Repeats: 216

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020377	GAT	2	6	25	30	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020377	CAA	2	6	44	49	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020377	AACA	2	8	137	144	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_020377	TCA	2	6	254	259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_020377	ATT	2	6	294	299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202002
6	NC_020377	ATC	2	6	310	315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202002
7	NC_020377	AT	3	6	320	325	50 %	50 %	0 %	0 %	452202002
8	NC_020377	GAC	2	6	392	397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452202002
9	NC_020377	TAC	2	6	511	516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202002
10	NC_020377	T	6	6	522	527	0 %	100 %	0 %	0 %	452202002
11	NC_020377	ATAC	2	8	550	557	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_020377	ATA	2	6	588	593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020377	GTT	2	6	594	599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020377	T	6	6	598	603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020377	A	6	6	660	665	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020377	ATT	2	6	677	682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020377	TTCA	2	8	689	696	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_020377	TTAT	2	8	726	733	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020377	TAAA	2	8	765	772	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020377	ATT	2	6	789	794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020377	TTG	2	6	806	811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020377	TAA	2	6	823	828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020377	AT	3	6	849	854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020377	TAA	2	6	860	865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020377	ATT	2	6	875	880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202003
26	NC_020377	A	7	7	898	904	100 %	0 %	0 %	0 %	452202003
27	NC_020377	A	6	6	1005	1010	100 %	0 %	0 %	0 %	452202003
28	NC_020377	AGAA	2	8	1018	1025	75 %	0 %	25 %	0 %	452202003
29	NC_020377	AAC	2	6	1046	1051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202003
30	NC_020377	ACT	2	6	1066	1071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202003
31	NC_020377	A	6	6	1122	1127	100 %	0 %	0 %	0 %	452202003
32	NC_020377	ACT	2	6	1137	1142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202003
33	NC_020377	TAAC	2	8	1146	1153	50 %	25 %	0 %	25 %	452202003
34	NC_020377	A	6	6	1248	1253	100 %	0 %	0 %	0 %	452202004
35	NC_020377	CAAA	2	8	1265	1272	75 %	0 %	0 %	25 %	452202004
36	NC_020377	TATT	2	8	1280	1287	25 %	75 %	0 %	0 %	452202004
37	NC_020377	TAA	2	6	1363	1368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202004
38	NC_020377	GA	3	6	1403	1408	50 %	0 %	50 %	0 %	452202004
39	NC_020377	CT	3	6	1436	1441	0 %	50 %	0 %	50 %	452202004
40	NC_020377	A	7	7	1457	1463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020377	T	6	6	1484	1489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020377	T	6	6	1505	1510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020377	TAA	2	6	1534	1539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020377	TA	3	6	1546	1551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020377	TAA	2	6	1554	1559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020377	A	6	6	1655	1660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020377	T	7	7	1699	1705	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020377	TAA	2	6	1720	1725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020377	T	6	6	1791	1796	0 %	100 %	0 %	0 %	452202005
50	NC_020377	TA	3	6	1822	1827	50 %	50 %	0 %	0 %	452202005
51	NC_020377	TAA	2	6	1910	1915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202005
52	NC_020377	A	7	7	1959	1965	100 %	0 %	0 %	0 %	452202005
53	NC_020377	A	7	7	1992	1998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020377	A	6	6	2003	2008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020377	GATATA	2	12	2025	2036	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020377	A	7	7	2040	2046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020377	AGT	2	6	2080	2085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020377	ATC	2	6	2094	2099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_020377	AT	3	6	2108	2113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020377	AAATTT	2	12	2152	2163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020377	A	6	6	2167	2172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020377	TCTT	2	8	2173	2180	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_020377	A	7	7	2202	2208	100 %	0 %	0 %	0 %	452202006
64	NC_020377	TACT	2	8	2220	2227	25 %	50 %	0 %	25 %	452202006
65	NC_020377	TTTC	2	8	2241	2248	0 %	75 %	0 %	25 %	452202006
66	NC_020377	A	7	7	2254	2260	100 %	0 %	0 %	0 %	452202006
67	NC_020377	TC	3	6	2291	2296	0 %	50 %	0 %	50 %	452202006
68	NC_020377	ATC	2	6	2311	2316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202007
69	NC_020377	CAC	2	6	2322	2327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452202007
70	NC_020377	TTC	2	6	2416	2421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202007
71	NC_020377	T	6	6	2461	2466	0 %	100 %	0 %	0 %	452202007
72	NC_020377	TCA	2	6	2491	2496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202008
73	NC_020377	TAA	2	6	2596	2601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202008
74	NC_020377	T	6	6	2652	2657	0 %	100 %	0 %	0 %	452202008
75	NC_020377	CCA	2	6	2677	2682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452202008
76	NC_020377	AATT	2	8	2688	2695	50 %	50 %	0 %	0 %	452202008
77	NC_020377	TAAA	2	8	2712	2719	75 %	25 %	0 %	0 %	452202008
78	NC_020377	TTC	2	6	2880	2885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202008
79	NC_020377	AAT	2	6	2915	2920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202008
80	NC_020377	ATA	2	6	3009	3014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202008
81	NC_020377	TAT	2	6	3029	3034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202008
82	NC_020377	TTC	2	6	3045	3050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202008
83	NC_020377	AAT	2	6	3133	3138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202008
84	NC_020377	TTA	2	6	3139	3144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202008
85	NC_020377	GTC	2	6	3202	3207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202008
86	NC_020377	A	7	7	3214	3220	100 %	0 %	0 %	0 %	452202008
87	NC_020377	CTTT	2	8	3227	3234	0 %	75 %	0 %	25 %	452202008
88	NC_020377	CAT	2	6	3255	3260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202008
89	NC_020377	TAC	2	6	3392	3397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202008
90	NC_020377	CTCA	2	8	3423	3430	25 %	25 %	0 %	50 %	452202008
91	NC_020377	T	6	6	3431	3436	0 %	100 %	0 %	0 %	452202008
92	NC_020377	AT	3	6	3527	3532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020377	A	6	6	3553	3558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020377	T	6	6	3610	3615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020377	T	9	9	3662	3670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020377	AAAG	2	8	3746	3753	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020377	A	7	7	3788	3794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020377	T	6	6	3826	3831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020377	ATT	2	6	3847	3852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020377	TC	3	6	3857	3862	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_020377	AAC	2	6	3895	3900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202009
102	NC_020377	TC	3	6	3991	3996	0 %	50 %	0 %	50 %	452202009
103	NC_020377	TCA	2	6	4016	4021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202009
104	NC_020377	CAAA	2	8	4080	4087	75 %	0 %	0 %	25 %	452202009
105	NC_020377	TCT	2	6	4137	4142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202009
106	NC_020377	TCTAA	2	10	4160	4169	40 %	40 %	0 %	20 %	452202009
107	NC_020377	AATT	2	8	4180	4187	50 %	50 %	0 %	0 %	452202009
108	NC_020377	T	6	6	4207	4212	0 %	100 %	0 %	0 %	452202009
109	NC_020377	CTT	2	6	4266	4271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202009
110	NC_020377	CTT	2	6	4347	4352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202009
111	NC_020377	T	6	6	4351	4356	0 %	100 %	0 %	0 %	452202009
112	NC_020377	CTT	2	6	4362	4367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202009
113	NC_020377	CAA	2	6	4377	4382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202009
114	NC_020377	TCAT	2	8	4430	4437	25 %	50 %	0 %	25 %	452202009
115	NC_020377	T	6	6	4467	4472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020377	GAA	2	6	4496	4501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020377	TTA	2	6	4530	4535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020377	CTTT	2	8	4560	4567	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_020377	TAAA	2	8	4571	4578	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020377	CAAG	2	8	4586	4593	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_020377	CTAA	2	8	4703	4710	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_020377	ATA	3	9	4716	4724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020377	AG	3	6	4726	4731	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020377	ACA	2	6	4739	4744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_020377	A	6	6	4753	4758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020377	AAG	2	6	4761	4766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020377	A	6	6	4771	4776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020377	CAAA	3	12	4784	4795	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_020377	TA	3	6	4814	4819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020377	A	6	6	4866	4871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020377	AGG	2	6	4889	4894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452202010
132	NC_020377	A	6	6	4934	4939	100 %	0 %	0 %	0 %	452202010
133	NC_020377	ACT	2	6	5002	5007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202010
134	NC_020377	GAA	2	6	5050	5055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202010
135	NC_020377	A	7	7	5073	5079	100 %	0 %	0 %	0 %	452202010
136	NC_020377	A	7	7	5083	5089	100 %	0 %	0 %	0 %	452202010
137	NC_020377	GGA	2	6	5203	5208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452202011
138	NC_020377	TA	3	6	5234	5239	50 %	50 %	0 %	0 %	452202011
139	NC_020377	TTA	2	6	5324	5329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202011
140	NC_020377	CAA	2	6	5351	5356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202011
141	NC_020377	ATT	2	6	5407	5412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202011
142	NC_020377	CAAA	2	8	5448	5455	75 %	0 %	0 %	25 %	452202011
143	NC_020377	AAG	2	6	5523	5528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202011
144	NC_020377	GTA	2	6	5549	5554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202011
145	NC_020377	GAA	2	6	5573	5578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202011
146	NC_020377	TCA	2	6	5603	5608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202011
147	NC_020377	A	7	7	5625	5631	100 %	0 %	0 %	0 %	452202011
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150	NC_020377	TAT	2	6	5711	5716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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198	NC_020377	TCC	2	6	7655	7660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.