MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056

Total Repeats: 132043

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020376	T	8	8	8	15	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020376	TTATC	2	10	60	69	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_020376	T	7	7	135	141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020376	ACG	2	6	167	172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_020376	TATT	2	8	215	222	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020376	TTG	2	6	234	239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020376	AGG	2	6	270	275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020376	A	7	7	329	335	100 %	0 %	0 %	0 %	452196382
9	NC_020376	AAGC	2	8	339	346	50 %	0 %	25 %	25 %	452196382
10	NC_020376	CAA	2	6	371	376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452196382
11	NC_020376	GAA	2	6	390	395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452196382
12	NC_020376	TAT	2	6	516	521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452196382
13	NC_020376	TCC	2	6	555	560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452196382
14	NC_020376	GAT	2	6	583	588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452196382
15	NC_020376	TTTA	2	8	724	731	25 %	75 %	0 %	0 %	452196382
16	NC_020376	ATC	2	6	822	827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452196382
17	NC_020376	GAAT	2	8	840	847	50 %	25 %	25 %	0 %	452196382
18	NC_020376	TTA	2	6	848	853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452196382
19	NC_020376	ATA	2	6	866	871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452196382
20	NC_020376	TAA	2	6	888	893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452196382
21	NC_020376	GAT	2	6	922	927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452196382
22	NC_020376	AAG	2	6	959	964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452196382
23	NC_020376	GAA	2	6	994	999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452196382
24	NC_020376	ACC	2	6	1029	1034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452196382
25	NC_020376	AGA	2	6	1053	1058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452196382
26	NC_020376	TTA	2	6	1088	1093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452196382
27	NC_020376	CGC	2	6	1103	1108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452196382
28	NC_020376	CAAAT	2	10	1196	1205	60 %	20 %	0 %	20 %	452196382
29	NC_020376	TAAT	2	8	1265	1272	50 %	50 %	0 %	0 %	452196382
30	NC_020376	AGC	2	6	1293	1298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452196382
31	NC_020376	ATT	2	6	1315	1320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452196382
32	NC_020376	AGA	2	6	1395	1400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452196382
33	NC_020376	A	6	6	1411	1416	100 %	0 %	0 %	0 %	452196382
34	NC_020376	GAA	2	6	1501	1506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452196382
35	NC_020376	TGG	2	6	1509	1514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452196382
36	NC_020376	ACA	2	6	1525	1530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452196382
37	NC_020376	A	6	6	1547	1552	100 %	0 %	0 %	0 %	452196382
38	NC_020376	ACT	2	6	1560	1565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452196382
39	NC_020376	GAA	2	6	1597	1602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452196382
40	NC_020376	AGT	2	6	1619	1624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452196382
41	NC_020376	TAGA	2	8	1677	1684	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020376	CTATTA	2	12	1730	1741	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_020376	CTA	2	6	1742	1747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_020376	T	6	6	1748	1753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020376	ATTA	2	8	1760	1767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020376	TACAA	2	10	1810	1819	60 %	20 %	0 %	20 %	452196383
47	NC_020376	TCT	2	6	1865	1870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452196383
48	NC_020376	ACA	2	6	1874	1879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452196383
49	NC_020376	GAA	2	6	1916	1921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452196383
50	NC_020376	GAA	2	6	1979	1984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452196383
51	NC_020376	A	7	7	2059	2065	100 %	0 %	0 %	0 %	452196383
52	NC_020376	AAAAT	2	10	2114	2123	80 %	20 %	0 %	0 %	452196383
53	NC_020376	TTA	2	6	2174	2179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452196383
54	NC_020376	GAA	2	6	2189	2194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452196383
55	NC_020376	CAT	2	6	2195	2200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452196383
56	NC_020376	TA	3	6	2307	2312	50 %	50 %	0 %	0 %	452196383
57	NC_020376	ATA	2	6	2382	2387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452196383
58	NC_020376	TGT	2	6	2410	2415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452196383
59	NC_020376	TAAG	2	8	2442	2449	50 %	25 %	25 %	0 %	452196383
60	NC_020376	GAA	2	6	2465	2470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452196383
61	NC_020376	TGG	2	6	2472	2477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452196383
62	NC_020376	TTA	2	6	2484	2489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452196383
63	NC_020376	TAT	2	6	2502	2507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452196383
64	NC_020376	TAT	2	6	2523	2528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452196383
65	NC_020376	TCT	2	6	2529	2534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452196383
66	NC_020376	ACA	2	6	2564	2569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452196383
67	NC_020376	CAG	2	6	2580	2585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452196383
68	NC_020376	AG	3	6	2584	2589	50 %	0 %	50 %	0 %	452196383
69	NC_020376	GA	3	6	2656	2661	50 %	0 %	50 %	0 %	452196383
70	NC_020376	TTC	2	6	2716	2721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452196383
71	NC_020376	GAA	2	6	2750	2755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452196383
72	NC_020376	AT	3	6	2809	2814	50 %	50 %	0 %	0 %	452196383
73	NC_020376	GATG	2	8	2815	2822	25 %	25 %	50 %	0 %	452196383
74	NC_020376	AGTT	2	8	2854	2861	25 %	50 %	25 %	0 %	452196383
75	NC_020376	ATG	2	6	2901	2906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452196383
76	NC_020376	ATT	2	6	2912	2917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452196383
77	NC_020376	AATT	2	8	2919	2926	50 %	50 %	0 %	0 %	452196383
78	NC_020376	TACT	2	8	2938	2945	25 %	50 %	0 %	25 %	452196383
79	NC_020376	TTTA	2	8	3025	3032	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020376	AAC	2	6	3195	3200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452196384
81	NC_020376	AGA	2	6	3213	3218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452196384
82	NC_020376	ATG	2	6	3238	3243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452196384
83	NC_020376	A	6	6	3323	3328	100 %	0 %	0 %	0 %	452196385
84	NC_020376	AAAC	2	8	3406	3413	75 %	0 %	0 %	25 %	452196385
85	NC_020376	A	6	6	3523	3528	100 %	0 %	0 %	0 %	452196385
86	NC_020376	TCTTTG	2	12	3537	3548	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	452196385
87	NC_020376	A	6	6	3564	3569	100 %	0 %	0 %	0 %	452196385
88	NC_020376	AAC	2	6	3598	3603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452196385
89	NC_020376	AT	3	6	3617	3622	50 %	50 %	0 %	0 %	452196385
90	NC_020376	TGA	2	6	3628	3633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452196385
91	NC_020376	AGA	2	6	3653	3658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452196385
92	NC_020376	AAG	2	6	3689	3694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452196385
93	NC_020376	TTG	2	6	3786	3791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452196385
94	NC_020376	A	7	7	3792	3798	100 %	0 %	0 %	0 %	452196385
95	NC_020376	AGA	2	6	3953	3958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452196385
96	NC_020376	AAG	2	6	4021	4026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452196385
97	NC_020376	AAC	2	6	4054	4059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452196385
98	NC_020376	TGA	2	6	4100	4105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452196385
99	NC_020376	TTC	2	6	4113	4118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452196385
100	NC_020376	ACA	2	6	4157	4162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452196385
101	NC_020376	ACGA	2	8	4163	4170	50 %	0 %	25 %	25 %	452196385
102	NC_020376	AATT	2	8	4201	4208	50 %	50 %	0 %	0 %	452196385
103	NC_020376	GAT	2	6	4245	4250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452196385
104	NC_020376	ACG	2	6	4329	4334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452196385
105	NC_020376	AACG	2	8	4388	4395	50 %	0 %	25 %	25 %	452196385
106	NC_020376	ATAG	2	8	4413	4420	50 %	25 %	25 %	0 %	452196385
107	NC_020376	AACAAA	2	12	4471	4482	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	452196386
108	NC_020376	ATG	2	6	4498	4503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452196386
109	NC_020376	GTAT	2	8	4555	4562	25 %	50 %	25 %	0 %	452196386
110	NC_020376	CAC	2	6	4590	4595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452196386
111	NC_020376	ATA	2	6	4615	4620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452196386
112	NC_020376	GAA	2	6	4671	4676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452196386
113	NC_020376	ATA	2	6	4678	4683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452196386
114	NC_020376	A	6	6	4732	4737	100 %	0 %	0 %	0 %	452196386
115	NC_020376	TTA	2	6	4759	4764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452196386
116	NC_020376	TCC	2	6	4771	4776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452196386
117	NC_020376	TGG	2	6	4781	4786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452196386
118	NC_020376	TGGCGG	2	12	4793	4804	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	452196386
119	NC_020376	TGG	2	6	4817	4822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452196386
120	NC_020376	TGT	2	6	4844	4849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452196386
121	NC_020376	GAC	2	6	5015	5020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452196386
122	NC_020376	ATTAA	2	10	5082	5091	60 %	40 %	0 %	0 %	452196386
123	NC_020376	AAAG	2	8	5120	5127	75 %	0 %	25 %	0 %	452196386
124	NC_020376	AAC	2	6	5182	5187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452196386
125	NC_020376	AAGTTG	2	12	5236	5247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452196386
126	NC_020376	ATA	2	6	5296	5301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452196386
127	NC_020376	GGT	2	6	5316	5321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452196386
128	NC_020376	TTA	2	6	5359	5364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452196386
129	NC_020376	GCA	2	6	5616	5621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452196386
130	NC_020376	AGC	2	6	5633	5638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452196386
131	NC_020376	TTC	2	6	5714	5719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452196386
132	NC_020376	ATT	2	6	5832	5837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452196386
133	NC_020376	ATG	2	6	5875	5880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452196386
134	NC_020376	ATT	2	6	5892	5897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452196386
135	NC_020376	TGG	2	6	5918	5923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452196386
136	NC_020376	TTA	3	9	5959	5967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452196386
137	NC_020376	TAT	2	6	6007	6012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452196386
138	NC_020376	TTC	2	6	6018	6023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452196386
139	NC_020376	AAT	2	6	6041	6046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452196386
140	NC_020376	AT	6	12	6056	6067	50 %	50 %	0 %	0 %	452196386
141	NC_020376	CAA	2	6	6093	6098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452196386
142	NC_020376	A	7	7	6102	6108	100 %	0 %	0 %	0 %	452196386
143	NC_020376	A	6	6	6139	6144	100 %	0 %	0 %	0 %	452196386
144	NC_020376	CCAGC	2	10	6159	6168	20 %	0 %	20 %	60 %	452196386
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150	NC_020376	ATGT	2	8	6439	6446	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_020376	AGG	2	6	6463	6468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020376	CAA	3	9	6490	6498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452196387
153	NC_020376	ATGA	2	8	6637	6644	50 %	25 %	25 %	0 %	452196387
154	NC_020376	CAG	2	6	6830	6835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452196387
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159	NC_020376	CCG	2	6	7030	7035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452196387
160	NC_020376	AT	3	6	7113	7118	50 %	50 %	0 %	0 %	452196387
161	NC_020376	TAT	2	6	7200	7205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452196387
162	NC_020376	TAT	2	6	7254	7259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452196387
163	NC_020376	TAA	2	6	7284	7289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452196387
164	NC_020376	A	6	6	7304	7309	100 %	0 %	0 %	0 %	452196387
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208	NC_020376	TTG	2	6	9062	9067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
209	NC_020376	ATA	2	6	9074	9079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
210	NC_020376	AT	3	6	9087	9092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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238	NC_020376	AC	3	6	10594	10599	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
239	NC_020376	CAC	2	6	10609	10614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
240	NC_020376	AGCC	2	8	10657	10664	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
241	NC_020376	GAT	2	6	10680	10685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
242	NC_020376	CCT	2	6	10736	10741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
243	NC_020376	TGA	2	6	10755	10760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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245	NC_020376	GA	3	6	10808	10813	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
246	NC_020376	TC	3	6	10818	10823	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
247	NC_020376	AT	3	6	10824	10829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
248	NC_020376	ATGT	2	8	10832	10839	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
249	NC_020376	T	6	6	10872	10877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
250	NC_020376	GTAA	2	8	10977	10984	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
251	NC_020376	ATGGT	2	10	11029	11038	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
252	NC_020376	AGAC	2	8	11067	11074	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
253	NC_020376	GGA	2	6	11102	11107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
254	NC_020376	GCG	2	6	11136	11141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
255	NC_020376	CGT	2	6	11249	11254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
256	NC_020376	AAC	2	6	11262	11267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
257	NC_020376	TC	3	6	11287	11292	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
258	NC_020376	CGG	2	6	11311	11316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
259	NC_020376	GGA	2	6	11343	11348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
260	NC_020376	CACG	2	8	11673	11680	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
261	NC_020376	GT	3	6	11946	11951	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
262	NC_020376	AGC	2	6	12005	12010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
263	NC_020376	ACC	2	6	12083	12088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
264	NC_020376	TGG	2	6	12164	12169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
265	NC_020376	ACA	2	6	12314	12319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
266	NC_020376	ACC	2	6	12335	12340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
267	NC_020376	AGA	2	6	12378	12383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
268	NC_020376	GAG	2	6	12564	12569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
269	NC_020376	GA	3	6	12587	12592	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
270	NC_020376	CT	3	6	12704	12709	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
271	NC_020376	CTGAA	2	10	12792	12801	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
272	NC_020376	CGG	2	6	12813	12818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
273	NC_020376	TGG	2	6	13075	13080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
274	NC_020376	CCT	2	6	13171	13176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
275	NC_020376	GGT	2	6	13307	13312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
276	NC_020376	CGT	2	6	13502	13507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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