MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens IT-45 plasmid pBA45-1

Total Repeats: 192

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020273	CCA	2	6	24	29	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_020273	C	6	6	60	65	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3	NC_020273	C	6	6	68	73	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4	NC_020273	CAAA	2	8	107	114	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_020273	GTTT	2	8	118	125	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020273	TGAG	2	8	152	159	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020273	TCC	2	6	172	177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_020273	TTC	3	9	262	270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348612
9	NC_020273	CTT	2	6	312	317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348612
10	NC_020273	AATC	2	8	378	385	50 %	25 %	0 %	25 %	451348612
11	NC_020273	TAC	2	6	394	399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_020273	CTC	2	6	403	408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_020273	ATTT	2	8	452	459	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020273	AAAC	2	8	502	509	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_020273	CAGT	2	8	527	534	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_020273	AAC	2	6	605	610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_020273	ATA	2	6	617	622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020273	GAA	2	6	778	783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451348613
19	NC_020273	CACT	2	8	886	893	25 %	25 %	0 %	50 %	451348613
20	NC_020273	CGA	2	6	894	899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451348613
21	NC_020273	GAA	2	6	1003	1008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451348613
22	NC_020273	A	6	6	1046	1051	100 %	0 %	0 %	0 %	451348613
23	NC_020273	CACT	2	8	1073	1080	25 %	25 %	0 %	50 %	451348613
24	NC_020273	A	7	7	1133	1139	100 %	0 %	0 %	0 %	451348613
25	NC_020273	GTG	2	6	1140	1145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451348613
26	NC_020273	GAA	2	6	1155	1160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451348613
27	NC_020273	TGC	2	6	1168	1173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_020273	TATT	2	8	1205	1212	25 %	75 %	0 %	0 %	451348614
29	NC_020273	CT	3	6	1333	1338	0 %	50 %	0 %	50 %	451348614
30	NC_020273	CAG	2	6	1399	1404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451348614
31	NC_020273	T	7	7	1437	1443	0 %	100 %	0 %	0 %	451348614
32	NC_020273	CTT	2	6	1563	1568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348614
33	NC_020273	TTC	2	6	1585	1590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348614
34	NC_020273	GCT	2	6	1593	1598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451348614
35	NC_020273	CCG	2	6	1624	1629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451348614
36	NC_020273	CCT	2	6	1653	1658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451348614
37	NC_020273	GTC	2	6	1667	1672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451348614
38	NC_020273	TTC	2	6	1717	1722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348614
39	NC_020273	GCC	2	6	1787	1792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451348614
40	NC_020273	TGC	2	6	1838	1843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451348614
41	NC_020273	T	6	6	1861	1866	0 %	100 %	0 %	0 %	451348614
42	NC_020273	CTT	2	6	1932	1937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348614
43	NC_020273	T	6	6	1936	1941	0 %	100 %	0 %	0 %	451348614
44	NC_020273	CTG	2	6	1972	1977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451348614
45	NC_020273	TGAT	2	8	2048	2055	25 %	50 %	25 %	0 %	451348614
46	NC_020273	CTT	2	6	2080	2085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348614
47	NC_020273	ATC	2	6	2143	2148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451348614
48	NC_020273	GCCG	2	8	2199	2206	0 %	0 %	50 %	50 %	451348614
49	NC_020273	ACA	2	6	2274	2279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451348614
50	NC_020273	GAT	2	6	2307	2312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451348614
51	NC_020273	CGC	2	6	2317	2322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451348614
52	NC_020273	GCT	2	6	2337	2342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451348614
53	NC_020273	ACTC	2	8	2391	2398	25 %	25 %	0 %	50 %	451348614
54	NC_020273	T	6	6	2445	2450	0 %	100 %	0 %	0 %	451348614
55	NC_020273	T	6	6	2541	2546	0 %	100 %	0 %	0 %	451348614
56	NC_020273	TCTT	2	8	2588	2595	0 %	75 %	0 %	25 %	451348614
57	NC_020273	AT	3	6	2644	2649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020273	TAC	2	6	2700	2705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_020273	CT	3	6	2759	2764	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_020273	AT	4	8	2882	2889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020273	A	6	6	2929	2934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020273	ATT	2	6	2965	2970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451348615
63	NC_020273	A	7	7	2996	3002	100 %	0 %	0 %	0 %	451348615
64	NC_020273	ATC	2	6	3025	3030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451348615
65	NC_020273	TTA	2	6	3170	3175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451348615
66	NC_020273	TAA	2	6	3210	3215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451348615
67	NC_020273	GGT	2	6	3219	3224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451348615
68	NC_020273	TTC	2	6	3227	3232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348615
69	NC_020273	TTTCC	2	10	3288	3297	0 %	60 %	0 %	40 %	451348615
70	NC_020273	CTC	2	6	3315	3320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451348615
71	NC_020273	TA	3	6	3334	3339	50 %	50 %	0 %	0 %	451348615
72	NC_020273	AAT	2	6	3359	3364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451348615
73	NC_020273	CAAA	2	8	3420	3427	75 %	0 %	0 %	25 %	451348615
74	NC_020273	A	6	6	3425	3430	100 %	0 %	0 %	0 %	451348615
75	NC_020273	AAG	2	6	3439	3444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451348615
76	NC_020273	CTT	2	6	3496	3501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348615
77	NC_020273	TCC	2	6	3533	3538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_020273	CAAAAT	2	12	3573	3584	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_020273	A	6	6	3585	3590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020273	TCA	2	6	3610	3615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451348616
81	NC_020273	CTA	2	6	3617	3622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451348616
82	NC_020273	AATT	2	8	3639	3646	50 %	50 %	0 %	0 %	451348616
83	NC_020273	TCCTTT	2	12	3799	3810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348616
84	NC_020273	CGC	2	6	3879	3884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451348616
85	NC_020273	T	7	7	3895	3901	0 %	100 %	0 %	0 %	451348616
86	NC_020273	AGT	2	6	3907	3912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451348616
87	NC_020273	AGG	2	6	3970	3975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451348616
88	NC_020273	ATT	2	6	3983	3988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451348616
89	NC_020273	TAAT	2	8	4020	4027	50 %	50 %	0 %	0 %	451348616
90	NC_020273	ACTTT	2	10	4028	4037	20 %	60 %	0 %	20 %	451348616
91	NC_020273	T	6	6	4035	4040	0 %	100 %	0 %	0 %	451348616
92	NC_020273	ATA	2	6	4063	4068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020273	CTTAA	2	10	4074	4083	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_020273	CAA	2	6	4143	4148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451348617
95	NC_020273	GAT	2	6	4200	4205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451348617
96	NC_020273	ATGT	2	8	4206	4213	25 %	50 %	25 %	0 %	451348617
97	NC_020273	T	6	6	4330	4335	0 %	100 %	0 %	0 %	451348617
98	NC_020273	T	7	7	4366	4372	0 %	100 %	0 %	0 %	451348617
99	NC_020273	TAA	3	9	4480	4488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451348617
100	NC_020273	AAT	2	6	4495	4500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451348617
101	NC_020273	CTT	2	6	4523	4528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348617
102	NC_020273	TAA	2	6	4539	4544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451348617
103	NC_020273	ATTA	2	8	4564	4571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020273	AT	3	6	4575	4580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020273	TAT	2	6	4608	4613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020273	T	6	6	4629	4634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020273	T	7	7	4668	4674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020273	A	8	8	4711	4718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020273	T	7	7	4736	4742	0 %	100 %	0 %	0 %	451348618
110	NC_020273	TCT	2	6	4817	4822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348618
111	NC_020273	CGC	2	6	4842	4847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451348618
112	NC_020273	ACC	2	6	4894	4899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451348618
113	NC_020273	CAT	2	6	4929	4934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451348618
114	NC_020273	ATT	2	6	4957	4962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451348618
115	NC_020273	CAT	2	6	5041	5046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451348618
116	NC_020273	CT	3	6	5063	5068	0 %	50 %	0 %	50 %	451348618
117	NC_020273	CTCTT	2	10	5091	5100	0 %	60 %	0 %	40 %	451348618
118	NC_020273	CGA	2	6	5115	5120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451348618
119	NC_020273	GCTT	2	8	5171	5178	0 %	50 %	25 %	25 %	451348618
120	NC_020273	AAT	2	6	5196	5201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451348618
121	NC_020273	AAC	2	6	5216	5221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451348618
122	NC_020273	GAT	2	6	5235	5240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451348618
123	NC_020273	TCT	2	6	5246	5251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348618
124	NC_020273	T	6	6	5308	5313	0 %	100 %	0 %	0 %	451348618
125	NC_020273	CAT	2	6	5341	5346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451348618
126	NC_020273	CGTCAA	2	12	5392	5403	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	451348618
127	NC_020273	A	7	7	5402	5408	100 %	0 %	0 %	0 %	451348618
128	NC_020273	AAT	2	6	5443	5448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451348618
129	NC_020273	CA	3	6	5490	5495	50 %	0 %	0 %	50 %	451348618
130	NC_020273	T	6	6	5681	5686	0 %	100 %	0 %	0 %	451348618
131	NC_020273	TAT	2	6	5801	5806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020273	TTTGG	2	10	5807	5816	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020273	ATA	2	6	5826	5831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020273	AC	3	6	5874	5879	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_020273	TAA	2	6	5887	5892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020273	ATG	2	6	5904	5909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020273	TTG	2	6	5910	5915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020273	TA	3	6	5917	5922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020273	A	6	6	5968	5973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020273	T	7	7	5994	6000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020273	C	6	6	6030	6035	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
142	NC_020273	T	6	6	6047	6052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020273	A	7	7	6054	6060	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020273	ATT	2	6	6079	6084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020273	CA	3	6	6119	6124	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_020273	ATT	2	6	6158	6163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020273	A	6	6	6179	6184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020273	CTA	2	6	6229	6234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451348619
149	NC_020273	A	7	7	6234	6240	100 %	0 %	0 %	0 %	451348619
150	NC_020273	TAAA	2	8	6306	6313	75 %	25 %	0 %	0 %	451348619
151	NC_020273	A	6	6	6311	6316	100 %	0 %	0 %	0 %	451348619
152	NC_020273	A	7	7	6381	6387	100 %	0 %	0 %	0 %	451348619
153	NC_020273	CCG	2	6	6488	6493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
154	NC_020273	CAG	2	6	6516	6521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_020273	CTC	2	6	6555	6560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451348620
156	NC_020273	TA	3	6	6600	6605	50 %	50 %	0 %	0 %	451348620
157	NC_020273	CTT	2	6	6623	6628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348620
158	NC_020273	AGCT	2	8	6653	6660	25 %	25 %	25 %	25 %	451348620
159	NC_020273	T	6	6	6708	6713	0 %	100 %	0 %	0 %	451348620
160	NC_020273	AATA	2	8	6737	6744	75 %	25 %	0 %	0 %	451348620
161	NC_020273	CAA	2	6	6761	6766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451348620
162	NC_020273	A	6	6	6818	6823	100 %	0 %	0 %	0 %	451348620
163	NC_020273	TAA	2	6	6876	6881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451348620
164	NC_020273	T	6	6	6909	6914	0 %	100 %	0 %	0 %	451348620
165	NC_020273	CTT	2	6	7024	7029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348620
166	NC_020273	ATC	2	6	7085	7090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451348620
167	NC_020273	TGTA	2	8	7135	7142	25 %	50 %	25 %	0 %	451348620
168	NC_020273	CTT	2	6	7148	7153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348620
169	NC_020273	ATA	2	6	7178	7183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451348620
170	NC_020273	A	6	6	7213	7218	100 %	0 %	0 %	0 %	451348620
171	NC_020273	TAAAA	2	10	7231	7240	80 %	20 %	0 %	0 %	451348620
172	NC_020273	TCA	2	6	7257	7262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451348620
173	NC_020273	CAG	2	6	7370	7375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451348620
174	NC_020273	T	6	6	7433	7438	0 %	100 %	0 %	0 %	451348620
175	NC_020273	AGA	2	6	7439	7444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451348620
176	NC_020273	CAT	2	6	7466	7471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451348620
177	NC_020273	ATA	2	6	7499	7504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451348620
178	NC_020273	TAA	2	6	7508	7513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451348620
179	NC_020273	T	6	6	7543	7548	0 %	100 %	0 %	0 %	451348620
180	NC_020273	T	6	6	7575	7580	0 %	100 %	0 %	0 %	451348620
181	NC_020273	TA	3	6	7595	7600	50 %	50 %	0 %	0 %	451348620
182	NC_020273	TTG	2	6	7722	7727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
183	NC_020273	ATA	2	6	7754	7759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_020273	TAC	2	6	7781	7786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
185	NC_020273	ACA	2	6	7787	7792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
186	NC_020273	A	6	6	7805	7810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_020273	TAC	2	6	7847	7852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
188	NC_020273	C	6	6	7852	7857	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
189	NC_020273	AGG	2	6	7867	7872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
190	NC_020273	CGGTC	2	10	7889	7898	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
191	NC_020273	TC	3	6	7942	7947	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
192	NC_020273	T	6	6	7968	7973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.