MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD73 plasmid pHT73

Total Repeats: 1687

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020249	AAG	2	6	69924	69929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449086535
1502	NC_020249	GATA	2	8	69952	69959	50 %	25 %	25 %	0 %	449086535
1503	NC_020249	CAC	2	6	69963	69968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449086535
1504	NC_020249	TGA	2	6	70021	70026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449086535
1505	NC_020249	TTAT	2	8	70124	70131	25 %	75 %	0 %	0 %	449086535
1506	NC_020249	TGT	2	6	70165	70170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449086535
1507	NC_020249	ATT	2	6	70256	70261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449086535
1508	NC_020249	TA	3	6	70285	70290	50 %	50 %	0 %	0 %	449086535
1509	NC_020249	TTTA	2	8	70292	70299	25 %	75 %	0 %	0 %	449086535
1510	NC_020249	T	6	6	70304	70309	0 %	100 %	0 %	0 %	449086535
1511	NC_020249	ATT	2	6	70342	70347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449086535
1512	NC_020249	GT	4	8	70355	70362	0 %	50 %	50 %	0 %	449086535
1513	NC_020249	GAAT	2	8	70413	70420	50 %	25 %	25 %	0 %	449086535
1514	NC_020249	TAAG	2	8	70452	70459	50 %	25 %	25 %	0 %	449086535
1515	NC_020249	CAAA	2	8	70490	70497	75 %	0 %	0 %	25 %	449086535
1516	NC_020249	TGG	2	6	70542	70547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449086535
1517	NC_020249	TAAA	2	8	70611	70618	75 %	25 %	0 %	0 %	449086535
1518	NC_020249	ACC	2	6	70630	70635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449086535
1519	NC_020249	AGA	2	6	70663	70668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449086535
1520	NC_020249	ATG	2	6	70691	70696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449086535
1521	NC_020249	TAC	2	6	70739	70744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449086535
1522	NC_020249	CAG	2	6	70773	70778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449086535
1523	NC_020249	TGCT	2	8	70784	70791	0 %	50 %	25 %	25 %	449086535
1524	NC_020249	TAG	2	6	70794	70799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449086535
1525	NC_020249	TTAT	2	8	70811	70818	25 %	75 %	0 %	0 %	449086535
1526	NC_020249	TAT	2	6	70828	70833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449086535
1527	NC_020249	TAC	2	6	70860	70865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449086535
1528	NC_020249	ATT	2	6	70949	70954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449086535
1529	NC_020249	GAT	2	6	71020	71025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449086535
1530	NC_020249	GGCA	2	8	71134	71141	25 %	0 %	50 %	25 %	449086535
1531	NC_020249	GGAT	2	8	71149	71156	25 %	25 %	50 %	0 %	449086535
1532	NC_020249	ATGG	2	8	71168	71175	25 %	25 %	50 %	0 %	449086535
1533	NC_020249	GAT	2	6	71240	71245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449086535
1534	NC_020249	TGA	2	6	71263	71268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449086535
1535	NC_020249	AACAA	2	10	71275	71284	80 %	0 %	0 %	20 %	449086535
1536	NC_020249	GAA	3	9	71321	71329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449086535
1537	NC_020249	A	6	6	71328	71333	100 %	0 %	0 %	0 %	449086535
1538	NC_020249	GAA	2	6	71354	71359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449086535
1539	NC_020249	AACA	2	8	71364	71371	75 %	0 %	0 %	25 %	449086535
1540	NC_020249	AAC	2	6	71373	71378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449086535
1541	NC_020249	GAA	2	6	71387	71392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449086535
1542	NC_020249	GAA	2	6	71405	71410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449086535
1543	NC_020249	AAGA	2	8	71412	71419	75 %	0 %	25 %	0 %	449086535
1544	NC_020249	TGA	2	6	71428	71433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449086535
1545	NC_020249	AAG	2	6	71466	71471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449086535
1546	NC_020249	AGA	2	6	71476	71481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449086535
1547	NC_020249	AAG	2	6	71487	71492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449086535
1548	NC_020249	AAG	3	9	71496	71504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449086535
1549	NC_020249	GAA	3	9	71540	71548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449086535
1550	NC_020249	AGA	2	6	71569	71574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449086535
1551	NC_020249	AGC	2	6	71580	71585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449086535
1552	NC_020249	GAT	2	6	71594	71599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449086535
1553	NC_020249	TCT	2	6	71600	71605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449086535
1554	NC_020249	AAG	2	6	71619	71624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449086535
1555	NC_020249	AAC	2	6	71633	71638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449086535
1556	NC_020249	GAA	2	6	71639	71644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449086535
1557	NC_020249	A	6	6	71679	71684	100 %	0 %	0 %	0 %	449086535
1558	NC_020249	GAT	2	6	71732	71737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449086535
1559	NC_020249	AAG	2	6	71763	71768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449086535
1560	NC_020249	GAA	2	6	71777	71782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449086535
1561	NC_020249	ATG	2	6	71802	71807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449086535
1562	NC_020249	AAG	2	6	71808	71813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449086535
1563	NC_020249	AGA	2	6	71836	71841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449086535
1564	NC_020249	AAG	2	6	71886	71891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449086535
1565	NC_020249	ATA	2	6	71898	71903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449086535
1566	NC_020249	GAA	2	6	71906	71911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449086535
1567	NC_020249	AG	3	6	71924	71929	50 %	0 %	50 %	0 %	449086535
1568	NC_020249	AAG	2	6	72030	72035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449086535
1569	NC_020249	GAA	2	6	72044	72049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449086535
1570	NC_020249	CAA	2	6	72054	72059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449086535
1571	NC_020249	ATG	2	6	72069	72074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449086535
1572	NC_020249	GAA	3	9	72077	72085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449086535
1573	NC_020249	AGA	2	6	72106	72111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449086535
1574	NC_020249	AGC	2	6	72117	72122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449086535
1575	NC_020249	GAT	2	6	72131	72136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449086535
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1577	NC_020249	AAT	2	6	72221	72226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449086535
1578	NC_020249	GAT	2	6	72269	72274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449086535
1579	NC_020249	GAA	2	6	72299	72304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449086535
1580	NC_020249	ACA	2	6	72326	72331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449086535
1581	NC_020249	GAA	2	6	72332	72337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449086535
1582	NC_020249	TAC	2	6	72340	72345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449086535
1583	NC_020249	GAT	2	6	72407	72412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449086535
1584	NC_020249	CGA	2	6	72462	72467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449086535
1585	NC_020249	AGA	2	6	72469	72474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449086535
1586	NC_020249	TAC	2	6	72478	72483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449086535
1587	NC_020249	CAT	2	6	72669	72674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449086535
1588	NC_020249	CAA	2	6	72777	72782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449086535
1589	NC_020249	CGA	2	6	72804	72809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449086535
1590	NC_020249	TGG	2	6	72898	72903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449086535
1591	NC_020249	AAT	2	6	72914	72919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449086535
1592	NC_020249	AGT	2	6	73040	73045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449086535
1593	NC_020249	GAAGC	2	10	73181	73190	40 %	0 %	40 %	20 %	449086535
1594	NC_020249	ATAAA	2	10	73221	73230	80 %	20 %	0 %	0 %	449086535
1595	NC_020249	ACA	2	6	73244	73249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449086535
1596	NC_020249	AGC	2	6	73276	73281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449086535
1597	NC_020249	ACA	2	6	73309	73314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449086535
1598	NC_020249	GAA	2	6	73340	73345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449086535
1599	NC_020249	AGAAAC	2	12	73360	73371	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	449086535
1600	NC_020249	T	6	6	73424	73429	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_020249	AAG	2	6	73481	73486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449086536
1602	NC_020249	AAAG	2	8	73491	73498	75 %	0 %	25 %	0 %	449086536
1603	NC_020249	ATGG	2	8	73524	73531	25 %	25 %	50 %	0 %	449086536
1604	NC_020249	GTT	2	6	73538	73543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449086536
1605	NC_020249	TAG	2	6	73548	73553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449086536
1606	NC_020249	TTAT	2	8	73597	73604	25 %	75 %	0 %	0 %	449086536
1607	NC_020249	TGA	2	6	73614	73619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449086536
1608	NC_020249	A	8	8	73619	73626	100 %	0 %	0 %	0 %	449086536
1609	NC_020249	GTG	2	6	73637	73642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449086536
1610	NC_020249	GCC	2	6	73670	73675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	449086536
1611	NC_020249	ACAA	2	8	73682	73689	75 %	0 %	0 %	25 %	449086536
1612	NC_020249	GT	3	6	73724	73729	0 %	50 %	50 %	0 %	449086536
1613	NC_020249	ATA	2	6	73772	73777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449086536
1614	NC_020249	TTA	2	6	73789	73794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449086536
1615	NC_020249	A	6	6	73843	73848	100 %	0 %	0 %	0 %	449086536
1616	NC_020249	AGA	2	6	73920	73925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449086536
1617	NC_020249	TA	3	6	73963	73968	50 %	50 %	0 %	0 %	449086536
1618	NC_020249	ACA	2	6	73981	73986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449086536
1619	NC_020249	CCG	2	6	74014	74019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	449086536
1620	NC_020249	CAG	2	6	74083	74088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449086536
1621	NC_020249	CAG	2	6	74117	74122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449086536
1622	NC_020249	GACA	2	8	74264	74271	50 %	0 %	25 %	25 %	449086536
1623	NC_020249	TGG	2	6	74337	74342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449086536
1624	NC_020249	CAT	2	6	74513	74518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449086536
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.