MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD73 plasmid pHT8_2

Total Repeats: 252

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020242	TCA	2	6	140	145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020242	T	7	7	147	153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020242	CTT	2	6	182	187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020242	A	7	7	189	195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020242	A	7	7	235	241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020242	AAT	2	6	304	309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020242	TAAT	2	8	437	444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020242	T	6	6	488	493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020242	A	7	7	543	549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020242	GCA	2	6	563	568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_020242	AAG	2	6	623	628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020242	TA	3	6	636	641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020242	A	6	6	658	663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020242	GC	3	6	722	727	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_020242	GC	3	6	746	751	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_020242	AT	3	6	817	822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020242	AGA	2	6	846	851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020242	AAG	2	6	893	898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020242	TA	3	6	907	912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020242	TCA	2	6	914	919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_020242	ATGGAA	2	12	966	977	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020242	AAG	2	6	985	990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020242	TTTA	2	8	1011	1018	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020242	T	6	6	1025	1030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020242	T	6	6	1044	1049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020242	A	6	6	1174	1179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020242	T	7	7	1192	1198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020242	AAT	2	6	1223	1228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020242	TAT	2	6	1245	1250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020242	TA	3	6	1264	1269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020242	TTA	2	6	1333	1338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092677
32	NC_020242	TA	3	6	1337	1342	50 %	50 %	0 %	0 %	449092677
33	NC_020242	ACA	2	6	1347	1352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449092677
34	NC_020242	AGC	2	6	1358	1363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449092677
35	NC_020242	A	6	6	1395	1400	100 %	0 %	0 %	0 %	449092677
36	NC_020242	TAT	2	6	1401	1406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092677
37	NC_020242	GA	3	6	1416	1421	50 %	0 %	50 %	0 %	449092677
38	NC_020242	CTT	2	6	1436	1441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449092677
39	NC_020242	TTA	3	9	1500	1508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092677
40	NC_020242	AGGA	2	8	1523	1530	50 %	0 %	50 %	0 %	449092677
41	NC_020242	AGA	2	6	1535	1540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092677
42	NC_020242	TTG	2	6	1552	1557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092677
43	NC_020242	AT	3	6	1600	1605	50 %	50 %	0 %	0 %	449092677
44	NC_020242	ATA	2	6	1624	1629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092677
45	NC_020242	AAT	2	6	1668	1673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092677
46	NC_020242	TGA	2	6	1679	1684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092677
47	NC_020242	ATTAA	2	10	1692	1701	60 %	40 %	0 %	0 %	449092677
48	NC_020242	TCAAA	2	10	1710	1719	60 %	20 %	0 %	20 %	449092677
49	NC_020242	GAT	2	6	1724	1729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092677
50	NC_020242	GAAA	2	8	1775	1782	75 %	0 %	25 %	0 %	449092677
51	NC_020242	TGG	2	6	1801	1806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449092677
52	NC_020242	TAA	2	6	1814	1819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092677
53	NC_020242	A	7	7	1818	1824	100 %	0 %	0 %	0 %	449092677
54	NC_020242	TGG	2	6	1827	1832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449092677
55	NC_020242	T	6	6	1835	1840	0 %	100 %	0 %	0 %	449092677
56	NC_020242	AAAT	2	8	1845	1852	75 %	25 %	0 %	0 %	449092677
57	NC_020242	T	7	7	1867	1873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020242	TAA	2	6	1910	1915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020242	AGG	2	6	1923	1928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020242	GAA	2	6	1938	1943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092678
61	NC_020242	TAAA	2	8	1945	1952	75 %	25 %	0 %	0 %	449092678
62	NC_020242	A	6	6	1950	1955	100 %	0 %	0 %	0 %	449092678
63	NC_020242	AAG	2	6	1996	2001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092678
64	NC_020242	TGGT	2	8	2006	2013	0 %	50 %	50 %	0 %	449092678
65	NC_020242	A	6	6	2020	2025	100 %	0 %	0 %	0 %	449092678
66	NC_020242	ATTT	2	8	2058	2065	25 %	75 %	0 %	0 %	449092678
67	NC_020242	AT	3	6	2078	2083	50 %	50 %	0 %	0 %	449092678
68	NC_020242	ACA	3	9	2084	2092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449092678
69	NC_020242	GAG	2	6	2103	2108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449092678
70	NC_020242	CAA	2	6	2121	2126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449092678
71	NC_020242	ACA	4	12	2141	2152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449092678
72	NC_020242	TAA	2	6	2183	2188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092678
73	NC_020242	AGTTT	2	10	2206	2215	20 %	60 %	20 %	0 %	449092678
74	NC_020242	TAATT	2	10	2217	2226	40 %	60 %	0 %	0 %	449092678
75	NC_020242	AGG	2	6	2229	2234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020242	GAT	2	6	2248	2253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092679
77	NC_020242	AGAAA	2	10	2332	2341	80 %	0 %	20 %	0 %	449092679
78	NC_020242	GAT	2	6	2365	2370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092679
79	NC_020242	TA	3	6	2384	2389	50 %	50 %	0 %	0 %	449092679
80	NC_020242	ACA	2	6	2452	2457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449092679
81	NC_020242	AAAG	2	8	2526	2533	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020242	ATTA	2	8	2584	2591	50 %	50 %	0 %	0 %	449092680
83	NC_020242	GAA	2	6	2593	2598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092680
84	NC_020242	T	6	6	2666	2671	0 %	100 %	0 %	0 %	449092680
85	NC_020242	CAATC	2	10	2699	2708	40 %	20 %	0 %	40 %	449092680
86	NC_020242	TCT	2	6	2744	2749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449092680
87	NC_020242	T	6	6	2802	2807	0 %	100 %	0 %	0 %	449092680
88	NC_020242	TAA	2	6	2941	2946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020242	AG	3	6	2998	3003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020242	GTT	2	6	3006	3011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020242	TAT	2	6	3027	3032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092681
92	NC_020242	TTA	2	6	3040	3045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092681
93	NC_020242	T	6	6	3095	3100	0 %	100 %	0 %	0 %	449092681
94	NC_020242	TAA	2	6	3122	3127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092681
95	NC_020242	T	6	6	3157	3162	0 %	100 %	0 %	0 %	449092681
96	NC_020242	TAAAG	2	10	3245	3254	60 %	20 %	20 %	0 %	449092681
97	NC_020242	TAA	3	9	3295	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020242	GTT	2	6	3344	3349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020242	T	6	6	3348	3353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020242	CGG	2	6	3381	3386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449092682
101	NC_020242	GAA	2	6	3430	3435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092682
102	NC_020242	GCA	2	6	3480	3485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449092682
103	NC_020242	T	6	6	3534	3539	0 %	100 %	0 %	0 %	449092682
104	NC_020242	TGA	2	6	3566	3571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092682
105	NC_020242	AT	3	6	3632	3637	50 %	50 %	0 %	0 %	449092682
106	NC_020242	A	6	6	3645	3650	100 %	0 %	0 %	0 %	449092682
107	NC_020242	GTTA	2	8	3651	3658	25 %	50 %	25 %	0 %	449092682
108	NC_020242	GAAAA	2	10	3681	3690	80 %	0 %	20 %	0 %	449092682
109	NC_020242	A	7	7	3693	3699	100 %	0 %	0 %	0 %	449092682
110	NC_020242	A	6	6	3743	3748	100 %	0 %	0 %	0 %	449092682
111	NC_020242	A	6	6	3773	3778	100 %	0 %	0 %	0 %	449092682
112	NC_020242	TAT	2	6	3783	3788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092682
113	NC_020242	A	6	6	3808	3813	100 %	0 %	0 %	0 %	449092682
114	NC_020242	TAG	2	6	3841	3846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092682
115	NC_020242	TAA	2	6	3875	3880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092682
116	NC_020242	ACGA	2	8	3910	3917	50 %	0 %	25 %	25 %	449092682
117	NC_020242	GAAT	2	8	3938	3945	50 %	25 %	25 %	0 %	449092682
118	NC_020242	TTA	2	6	3961	3966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092682
119	NC_020242	AGTTG	2	10	3971	3980	20 %	40 %	40 %	0 %	449092682
120	NC_020242	T	6	6	4007	4012	0 %	100 %	0 %	0 %	449092682
121	NC_020242	ATT	2	6	4033	4038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092682
122	NC_020242	GAA	2	6	4043	4048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092682
123	NC_020242	GTGA	2	8	4065	4072	25 %	25 %	50 %	0 %	449092682
124	NC_020242	GA	3	6	4110	4115	50 %	0 %	50 %	0 %	449092682
125	NC_020242	AAGG	2	8	4227	4234	50 %	0 %	50 %	0 %	449092682
126	NC_020242	ATTA	2	8	4250	4257	50 %	50 %	0 %	0 %	449092682
127	NC_020242	GTT	2	6	4277	4282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092682
128	NC_020242	TGA	2	6	4283	4288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092682
129	NC_020242	GAA	3	9	4296	4304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092682
130	NC_020242	CAA	2	6	4348	4353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449092682
131	NC_020242	AGA	2	6	4388	4393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092682
132	NC_020242	TTA	2	6	4396	4401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092682
133	NC_020242	GAT	2	6	4473	4478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092682
134	NC_020242	TGA	2	6	4562	4567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092682
135	NC_020242	TTA	2	6	4596	4601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092682
136	NC_020242	AAAAT	2	10	4615	4624	80 %	20 %	0 %	0 %	449092682
137	NC_020242	ATT	2	6	4628	4633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092682
138	NC_020242	A	6	6	4683	4688	100 %	0 %	0 %	0 %	449092682
139	NC_020242	TTTTA	2	10	4712	4721	20 %	80 %	0 %	0 %	449092682
140	NC_020242	TTG	2	6	4758	4763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092682
141	NC_020242	T	6	6	4835	4840	0 %	100 %	0 %	0 %	449092682
142	NC_020242	TAA	2	6	4853	4858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092682
143	NC_020242	ATT	2	6	4878	4883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092682
144	NC_020242	TGA	2	6	4915	4920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092682
145	NC_020242	TAT	2	6	4924	4929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092682
146	NC_020242	ATT	2	6	4953	4958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092682
147	NC_020242	TGA	2	6	4967	4972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092682
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149	NC_020242	AATT	2	8	5113	5120	50 %	50 %	0 %	0 %	449092682
150	NC_020242	ATG	2	6	5134	5139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092682
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152	NC_020242	TTAAT	2	10	5224	5233	40 %	60 %	0 %	0 %	449092682
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198	NC_020242	TATT	2	8	6854	6861	25 %	75 %	0 %	0 %	449092684
199	NC_020242	TTAG	2	8	6877	6884	25 %	50 %	25 %	0 %	449092684
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252	NC_020242	A	7	7	8230	8236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.