MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD73 plasmid pHT8_1

Total Repeats: 215

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020241	TG	3	6	63	68	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020241	TTG	2	6	98	103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092660
3	NC_020241	T	6	6	114	119	0 %	100 %	0 %	0 %	449092660
4	NC_020241	A	6	6	188	193	100 %	0 %	0 %	0 %	449092660
5	NC_020241	AT	3	6	222	227	50 %	50 %	0 %	0 %	449092660
6	NC_020241	AT	3	6	230	235	50 %	50 %	0 %	0 %	449092660
7	NC_020241	ATG	2	6	258	263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092660
8	NC_020241	A	6	6	264	269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020241	A	6	6	285	290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020241	A	6	6	298	303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020241	T	6	6	312	317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020241	TTTA	2	8	325	332	25 %	75 %	0 %	0 %	449092661
13	NC_020241	TC	3	6	367	372	0 %	50 %	0 %	50 %	449092661
14	NC_020241	TTA	2	6	407	412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092661
15	NC_020241	AATA	2	8	488	495	75 %	25 %	0 %	0 %	449092661
16	NC_020241	TTTG	2	8	503	510	0 %	75 %	25 %	0 %	449092661
17	NC_020241	T	6	6	522	527	0 %	100 %	0 %	0 %	449092661
18	NC_020241	T	7	7	613	619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020241	TA	3	6	658	663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020241	ATA	2	6	716	721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020241	AT	3	6	727	732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020241	AT	3	6	762	767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020241	A	6	6	768	773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020241	ATT	2	6	784	789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020241	GTAA	2	8	823	830	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020241	TGAA	2	8	845	852	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020241	GTA	2	6	873	878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020241	ATA	2	6	916	921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092662
29	NC_020241	TAA	2	6	965	970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092662
30	NC_020241	TCT	2	6	993	998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449092662
31	NC_020241	AT	3	6	1064	1069	50 %	50 %	0 %	0 %	449092662
32	NC_020241	GAT	2	6	1074	1079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092662
33	NC_020241	AAT	2	6	1090	1095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092662
34	NC_020241	ATG	2	6	1129	1134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020241	T	8	8	1179	1186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020241	TAG	2	6	1334	1339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092663
37	NC_020241	TGA	2	6	1359	1364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020241	T	7	7	1396	1402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020241	TA	3	6	1472	1477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020241	AAAAT	2	10	1526	1535	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020241	ATT	2	6	1601	1606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092664
42	NC_020241	ATT	2	6	1641	1646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092664
43	NC_020241	AAC	2	6	1686	1691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449092664
44	NC_020241	AGA	3	9	1694	1702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092664
45	NC_020241	TAT	2	6	1719	1724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092664
46	NC_020241	A	6	6	1789	1794	100 %	0 %	0 %	0 %	449092664
47	NC_020241	AC	3	6	1811	1816	50 %	0 %	0 %	50 %	449092664
48	NC_020241	T	6	6	1823	1828	0 %	100 %	0 %	0 %	449092664
49	NC_020241	TAT	2	6	1836	1841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092664
50	NC_020241	GCAT	2	8	1855	1862	25 %	25 %	25 %	25 %	449092664
51	NC_020241	AGA	2	6	1925	1930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092664
52	NC_020241	TGA	2	6	1937	1942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092664
53	NC_020241	TAT	2	6	1983	1988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092664
54	NC_020241	TCA	2	6	1994	1999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449092664
55	NC_020241	TTA	2	6	2004	2009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092664
56	NC_020241	T	7	7	2039	2045	0 %	100 %	0 %	0 %	449092664
57	NC_020241	AC	3	6	2089	2094	50 %	0 %	0 %	50 %	449092664
58	NC_020241	AGA	2	6	2135	2140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092664
59	NC_020241	TAA	2	6	2159	2164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092664
60	NC_020241	TCT	2	6	2264	2269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449092664
61	NC_020241	AAG	2	6	2287	2292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092664
62	NC_020241	TTA	2	6	2313	2318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092664
63	NC_020241	ACAA	2	8	2342	2349	75 %	0 %	0 %	25 %	449092664
64	NC_020241	AT	3	6	2363	2368	50 %	50 %	0 %	0 %	449092664
65	NC_020241	ATAC	2	8	2513	2520	50 %	25 %	0 %	25 %	449092664
66	NC_020241	GAA	2	6	2532	2537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092664
67	NC_020241	GAA	2	6	2556	2561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092664
68	NC_020241	TTA	2	6	2619	2624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092664
69	NC_020241	ATG	2	6	2642	2647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092664
70	NC_020241	A	6	6	2648	2653	100 %	0 %	0 %	0 %	449092665
71	NC_020241	ACA	2	6	2684	2689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449092665
72	NC_020241	TTTTC	2	10	2694	2703	0 %	80 %	0 %	20 %	449092665
73	NC_020241	AAT	2	6	2711	2716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092665
74	NC_020241	ATG	2	6	2730	2735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092665
75	NC_020241	A	7	7	2742	2748	100 %	0 %	0 %	0 %	449092665
76	NC_020241	ATT	2	6	2753	2758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092665
77	NC_020241	CAA	2	6	2759	2764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449092665
78	NC_020241	CAA	2	6	2799	2804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_020241	ATT	2	6	2829	2834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020241	TAT	2	6	2867	2872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020241	AAT	2	6	2881	2886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092666
82	NC_020241	A	7	7	2911	2917	100 %	0 %	0 %	0 %	449092666
83	NC_020241	GA	3	6	2926	2931	50 %	0 %	50 %	0 %	449092666
84	NC_020241	A	7	7	2953	2959	100 %	0 %	0 %	0 %	449092666
85	NC_020241	GGA	2	6	2980	2985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449092666
86	NC_020241	AAT	2	6	3016	3021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092666
87	NC_020241	AAC	2	6	3043	3048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449092666
88	NC_020241	ATA	2	6	3052	3057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092666
89	NC_020241	TC	3	6	3070	3075	0 %	50 %	0 %	50 %	449092666
90	NC_020241	GAA	2	6	3136	3141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092666
91	NC_020241	TA	4	8	3147	3154	50 %	50 %	0 %	0 %	449092666
92	NC_020241	TTG	2	6	3170	3175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092666
93	NC_020241	TAA	2	6	3186	3191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449092666
94	NC_020241	ATG	2	6	3212	3217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092666
95	NC_020241	ACA	2	6	3237	3242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449092666
96	NC_020241	A	6	6	3247	3252	100 %	0 %	0 %	0 %	449092666
97	NC_020241	T	6	6	3313	3318	0 %	100 %	0 %	0 %	449092666
98	NC_020241	TGG	2	6	3348	3353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449092666
99	NC_020241	A	6	6	3373	3378	100 %	0 %	0 %	0 %	449092666
100	NC_020241	AAG	2	6	3386	3391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449092666
101	NC_020241	GTAGC	2	10	3425	3434	20 %	20 %	40 %	20 %	449092666
102	NC_020241	TTA	2	6	3456	3461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092666
103	NC_020241	TATTT	3	15	3512	3526	20 %	80 %	0 %	0 %	449092667
104	NC_020241	AT	3	6	3595	3600	50 %	50 %	0 %	0 %	449092667
105	NC_020241	ATT	2	6	3614	3619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092667
106	NC_020241	TAG	2	6	3633	3638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092667
107	NC_020241	A	8	8	3665	3672	100 %	0 %	0 %	0 %	449092667
108	NC_020241	CTTATT	2	12	3717	3728	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_020241	TAT	2	6	3732	3737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020241	A	7	7	3788	3794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020241	T	6	6	3820	3825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020241	GAC	2	6	3884	3889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_020241	A	6	6	3933	3938	100 %	0 %	0 %	0 %	449092668
114	NC_020241	T	7	7	3949	3955	0 %	100 %	0 %	0 %	449092668
115	NC_020241	CAC	2	6	4103	4108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_020241	T	7	7	4109	4115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020241	T	7	7	4145	4151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020241	TGA	2	6	4367	4372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020241	A	8	8	4415	4422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020241	AGT	2	6	4439	4444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020241	TTG	2	6	4543	4548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092670
122	NC_020241	TAG	2	6	4577	4582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092670
123	NC_020241	A	7	7	4586	4592	100 %	0 %	0 %	0 %	449092670
124	NC_020241	GTG	2	6	4646	4651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449092670
125	NC_020241	ATG	2	6	4712	4717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020241	T	8	8	4923	4930	0 %	100 %	0 %	0 %	449092671
127	NC_020241	CGG	2	6	4949	4954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449092671
128	NC_020241	A	7	7	5033	5039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020241	GA	3	6	5093	5098	50 %	0 %	50 %	0 %	449092672
130	NC_020241	AAAG	2	8	5133	5140	75 %	0 %	25 %	0 %	449092672
131	NC_020241	ATT	2	6	5157	5162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449092672
132	NC_020241	AATT	2	8	5224	5231	50 %	50 %	0 %	0 %	449092672
133	NC_020241	TGT	2	6	5285	5290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092672
134	NC_020241	TTG	2	6	5291	5296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449092672
135	NC_020241	T	6	6	5381	5386	0 %	100 %	0 %	0 %	449092672
136	NC_020241	GAGAA	2	10	5401	5410	60 %	0 %	40 %	0 %	449092672
137	NC_020241	TGA	2	6	5435	5440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449092672
138	NC_020241	A	6	6	5440	5445	100 %	0 %	0 %	0 %	449092672
139	NC_020241	AAAAAC	2	12	5482	5493	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	449092672
140	NC_020241	T	6	6	5508	5513	0 %	100 %	0 %	0 %	449092672
141	NC_020241	GAAA	2	8	5564	5571	75 %	0 %	25 %	0 %	449092672
142	NC_020241	GTG	2	6	5590	5595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449092672
143	NC_020241	ACA	2	6	5648	5653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449092672
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.