MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Brachyspira pilosicoli P43/6/78 chromosome

Total Repeats: 81891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
77501	NC_019908	T	6	6	2416819	2416824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77502	NC_019908	A	8	8	2416836	2416843	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77503	NC_019908	TA	3	6	2416890	2416895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77504	NC_019908	TAATA	2	10	2416925	2416934	60 %	40 %	0 %	0 %	431808811
77505	NC_019908	CAA	2	6	2416982	2416987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431808811
77506	NC_019908	GTA	2	6	2417097	2417102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431808811
77507	NC_019908	A	6	6	2417123	2417128	100 %	0 %	0 %	0 %	431808811
77508	NC_019908	TATCT	2	10	2417152	2417161	20 %	60 %	0 %	20 %	431808811
77509	NC_019908	GGAA	2	8	2417219	2417226	50 %	0 %	50 %	0 %	431808811
77510	NC_019908	AT	3	6	2417234	2417239	50 %	50 %	0 %	0 %	431808811
77511	NC_019908	GATTTA	2	12	2417286	2417297	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	431808811
77512	NC_019908	AGA	2	6	2417309	2417314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431808811
77513	NC_019908	A	6	6	2417425	2417430	100 %	0 %	0 %	0 %	431808811
77514	NC_019908	TAA	2	6	2417470	2417475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431808811
77515	NC_019908	TA	3	6	2417527	2417532	50 %	50 %	0 %	0 %	431808811
77516	NC_019908	TA	3	6	2417535	2417540	50 %	50 %	0 %	0 %	431808811
77517	NC_019908	A	6	6	2417546	2417551	100 %	0 %	0 %	0 %	431808811
77518	NC_019908	GGA	2	6	2417552	2417557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	431808811
77519	NC_019908	TGAG	2	8	2417564	2417571	25 %	25 %	50 %	0 %	431808811
77520	NC_019908	AAAAT	2	10	2417585	2417594	80 %	20 %	0 %	0 %	431808812
77521	NC_019908	AAT	2	6	2417622	2417627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431808812
77522	NC_019908	AAG	2	6	2417644	2417649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431808812
77523	NC_019908	TCA	2	6	2417661	2417666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431808812
77524	NC_019908	TTTAGG	2	12	2417724	2417735	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	431808812
77525	NC_019908	TAAAAG	2	12	2417741	2417752	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	431808812
77526	NC_019908	AT	3	6	2417817	2417822	50 %	50 %	0 %	0 %	431808812
77527	NC_019908	A	6	6	2417828	2417833	100 %	0 %	0 %	0 %	431808812
77528	NC_019908	ATG	2	6	2417861	2417866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431808812
77529	NC_019908	A	7	7	2417877	2417883	100 %	0 %	0 %	0 %	431808812
77530	NC_019908	TCT	2	6	2417912	2417917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431808812
77531	NC_019908	GCT	2	6	2417956	2417961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431808812
77532	NC_019908	A	6	6	2418021	2418026	100 %	0 %	0 %	0 %	431808812
77533	NC_019908	AGA	2	6	2418057	2418062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431808812
77534	NC_019908	ATG	2	6	2418071	2418076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431808812
77535	NC_019908	GCT	2	6	2418091	2418096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431808812
77536	NC_019908	AGT	2	6	2418123	2418128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431808812
77537	NC_019908	TGA	2	6	2418210	2418215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431808812
77538	NC_019908	TCC	2	6	2418315	2418320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	431808812
77539	NC_019908	GTA	2	6	2418331	2418336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431808812
77540	NC_019908	GAAGCT	2	12	2418337	2418348	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	431808812
77541	NC_019908	GCT	3	9	2418346	2418354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431808812
77542	NC_019908	TA	3	6	2418359	2418364	50 %	50 %	0 %	0 %	431808812
77543	NC_019908	TAT	2	6	2418420	2418425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431808812
77544	NC_019908	CTTG	2	8	2418433	2418440	0 %	50 %	25 %	25 %	431808812
77545	NC_019908	CTT	2	6	2418458	2418463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431808812
77546	NC_019908	GCT	2	6	2418499	2418504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431808812
77547	NC_019908	TGC	2	6	2418516	2418521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431808812
77548	NC_019908	TGC	2	6	2418588	2418593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431808812
77549	NC_019908	CTA	2	6	2418611	2418616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431808812
77550	NC_019908	ATG	2	6	2418626	2418631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431808812
77551	NC_019908	A	7	7	2418648	2418654	100 %	0 %	0 %	0 %	431808812
77552	NC_019908	ATTCTA	2	12	2418665	2418676	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	431808812
77553	NC_019908	TAT	3	9	2418680	2418688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431808812
77554	NC_019908	ATT	2	6	2418730	2418735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431808812
77555	NC_019908	AG	3	6	2418747	2418752	50 %	0 %	50 %	0 %	431808812
77556	NC_019908	ATA	2	6	2418753	2418758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431808812
77557	NC_019908	T	6	6	2418760	2418765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77558	NC_019908	AT	5	10	2418766	2418775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77559	NC_019908	AAAAGC	2	12	2418831	2418842	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	431808813
77560	NC_019908	GAA	2	6	2418910	2418915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431808813
77561	NC_019908	GAA	2	6	2418940	2418945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431808813
77562	NC_019908	A	6	6	2418949	2418954	100 %	0 %	0 %	0 %	431808813
77563	NC_019908	AAT	2	6	2419182	2419187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431808813
77564	NC_019908	GTT	4	12	2419222	2419233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431808813
77565	NC_019908	AAG	3	9	2419244	2419252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431808813
77566	NC_019908	AAAG	2	8	2419285	2419292	75 %	0 %	25 %	0 %	431808813
77567	NC_019908	CGG	2	6	2419335	2419340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431808813
77568	NC_019908	AG	4	8	2419416	2419423	50 %	0 %	50 %	0 %	431808813
77569	NC_019908	ATG	2	6	2419484	2419489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431808813
77570	NC_019908	AGA	2	6	2419530	2419535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431808813
77571	NC_019908	AAG	2	6	2419556	2419561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431808813
77572	NC_019908	CTT	2	6	2419566	2419571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431808813
77573	NC_019908	AGA	2	6	2419660	2419665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431808813
77574	NC_019908	GCT	2	6	2419691	2419696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431808813
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77576	NC_019908	A	7	7	2419725	2419731	100 %	0 %	0 %	0 %	431808813
77577	NC_019908	GTTTA	2	10	2419781	2419790	20 %	60 %	20 %	0 %	431808813
77578	NC_019908	AGA	2	6	2419854	2419859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431808813
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77582	NC_019908	AAGCTC	2	12	2420024	2420035	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	431808813
77583	NC_019908	TGC	2	6	2420079	2420084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431808813
77584	NC_019908	TATG	2	8	2420085	2420092	25 %	50 %	25 %	0 %	431808813
77585	NC_019908	CTG	2	6	2420093	2420098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431808813
77586	NC_019908	CTA	2	6	2420102	2420107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431808813
77587	NC_019908	TA	3	6	2420106	2420111	50 %	50 %	0 %	0 %	431808813
77588	NC_019908	TAA	2	6	2420118	2420123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431808813
77589	NC_019908	ATA	2	6	2420124	2420129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431808813
77590	NC_019908	ATTA	2	8	2420135	2420142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77591	NC_019908	AATAAA	3	18	2420143	2420160	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77592	NC_019908	AT	3	6	2420188	2420193	50 %	50 %	0 %	0 %	431808814
77593	NC_019908	TGA	2	6	2420266	2420271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431808814
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77597	NC_019908	AT	3	6	2420566	2420571	50 %	50 %	0 %	0 %	431808814
77598	NC_019908	AAG	2	6	2420574	2420579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431808814
77599	NC_019908	ATG	2	6	2420607	2420612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431808814
77600	NC_019908	ACC	2	6	2420661	2420666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431808814
77601	NC_019908	ATG	2	6	2420675	2420680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431808814
77602	NC_019908	A	6	6	2420735	2420740	100 %	0 %	0 %	0 %	431808814
77603	NC_019908	CTT	2	6	2420766	2420771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431808814
77604	NC_019908	TGC	2	6	2420800	2420805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431808814
77605	NC_019908	GCT	2	6	2420906	2420911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431808814
77606	NC_019908	TGT	2	6	2420965	2420970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431808814
77607	NC_019908	TGC	2	6	2420995	2421000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431808814
77608	NC_019908	AG	3	6	2421007	2421012	50 %	0 %	50 %	0 %	431808814
77609	NC_019908	ATT	2	6	2421067	2421072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431808814
77610	NC_019908	GAA	2	6	2421110	2421115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431808814
77611	NC_019908	A	6	6	2421114	2421119	100 %	0 %	0 %	0 %	431808814
77612	NC_019908	GAA	2	6	2421121	2421126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431808814
77613	NC_019908	CTG	2	6	2421165	2421170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431808814
77614	NC_019908	ATG	2	6	2421177	2421182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431808814
77615	NC_019908	TGC	2	6	2421205	2421210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431808814
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77972	NC_019908	TGA	2	6	2432433	2432438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431808824
77973	NC_019908	T	6	6	2432442	2432447	0 %	100 %	0 %	0 %	431808824
77974	NC_019908	CAG	2	6	2432481	2432486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431808824
77975	NC_019908	T	6	6	2432547	2432552	0 %	100 %	0 %	0 %	431808824
77976	NC_019908	T	6	6	2432578	2432583	0 %	100 %	0 %	0 %	431808824
77977	NC_019908	TTC	2	6	2432590	2432595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431808824
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77980	NC_019908	ACACCA	2	12	2432651	2432662	50 %	0 %	0 %	50 %	431808824
77981	NC_019908	TAA	2	6	2432703	2432708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431808824
77982	NC_019908	CCG	2	6	2432723	2432728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	431808824
77983	NC_019908	ATA	2	6	2432753	2432758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431808824
77984	NC_019908	TAT	2	6	2432805	2432810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431808824
77985	NC_019908	TAC	2	6	2432839	2432844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431808824
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77987	NC_019908	GTT	2	6	2432886	2432891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431808824
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77989	NC_019908	T	6	6	2432918	2432923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77990	NC_019908	AATT	2	8	2432924	2432931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77991	NC_019908	TAT	2	6	2432937	2432942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77992	NC_019908	TTAT	2	8	2432960	2432967	25 %	75 %	0 %	0 %	431808825
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77994	NC_019908	TCT	2	6	2433012	2433017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431808825
77995	NC_019908	TTTAC	2	10	2433084	2433093	20 %	60 %	0 %	20 %	431808825
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77998	NC_019908	TGA	2	6	2433206	2433211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431808825
77999	NC_019908	ACTT	2	8	2433314	2433321	25 %	50 %	0 %	25 %	431808825
78000	NC_019908	AGA	2	6	2433374	2433379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431808825

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