MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Brachyspira pilosicoli P43/6/78 chromosome

Total Repeats: 81891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
50001	NC_019908	AATGA	2	10	1563205	1563214	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
50002	NC_019908	ATG	2	6	1563224	1563229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50003	NC_019908	AT	3	6	1563239	1563244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50004	NC_019908	AGC	2	6	1563262	1563267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50005	NC_019908	AAT	2	6	1563274	1563279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50006	NC_019908	ACA	2	6	1563296	1563301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50007	NC_019908	TAA	2	6	1563318	1563323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50008	NC_019908	TAA	2	6	1563333	1563338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50009	NC_019908	CTA	2	6	1563344	1563349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50010	NC_019908	TAA	2	6	1563363	1563368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50011	NC_019908	ATA	2	6	1563410	1563415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50012	NC_019908	CAAA	2	8	1563418	1563425	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50013	NC_019908	CAG	2	6	1563428	1563433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50014	NC_019908	AAAC	2	8	1563440	1563447	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50015	NC_019908	TCC	2	6	1563495	1563500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50016	NC_019908	CCT	2	6	1563514	1563519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50017	NC_019908	ATA	3	9	1563539	1563547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50018	NC_019908	AT	3	6	1563567	1563572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50019	NC_019908	TA	3	6	1563584	1563589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50020	NC_019908	TGC	2	6	1563666	1563671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50021	NC_019908	ATA	2	6	1563677	1563682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50022	NC_019908	A	10	10	1563742	1563751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50023	NC_019908	A	9	9	1563773	1563781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50024	NC_019908	ATG	2	6	1563787	1563792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50025	NC_019908	GATA	2	8	1563810	1563817	50 %	25 %	25 %	0 %	431808058
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50028	NC_019908	A	7	7	1563884	1563890	100 %	0 %	0 %	0 %	431808059
50029	NC_019908	AT	3	6	1563906	1563911	50 %	50 %	0 %	0 %	431808059
50030	NC_019908	AGA	2	6	1563976	1563981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431808059
50031	NC_019908	A	7	7	1563985	1563991	100 %	0 %	0 %	0 %	431808059
50032	NC_019908	ATT	2	6	1563999	1564004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431808059
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50035	NC_019908	TAT	2	6	1564123	1564128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431808059
50036	NC_019908	ATG	2	6	1564131	1564136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431808059
50037	NC_019908	GAAT	2	8	1564171	1564178	50 %	25 %	25 %	0 %	431808059
50038	NC_019908	A	6	6	1564243	1564248	100 %	0 %	0 %	0 %	431808059
50039	NC_019908	AAT	2	6	1564254	1564259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431808059
50040	NC_019908	A	7	7	1564271	1564277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50041	NC_019908	T	7	7	1564289	1564295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50042	NC_019908	TA	3	6	1564305	1564310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50043	NC_019908	AC	3	6	1564319	1564324	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50044	NC_019908	ATT	2	6	1564326	1564331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50045	NC_019908	TAA	2	6	1564348	1564353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50046	NC_019908	GAA	2	6	1564362	1564367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50047	NC_019908	ATA	2	6	1564438	1564443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50048	NC_019908	ATT	2	6	1564448	1564453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50049	NC_019908	ATA	2	6	1564476	1564481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50050	NC_019908	ATT	2	6	1564586	1564591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50051	NC_019908	GCA	2	6	1564605	1564610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50052	NC_019908	AT	3	6	1564613	1564618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50053	NC_019908	TAA	2	6	1564625	1564630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50054	NC_019908	GCT	2	6	1564656	1564661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50055	NC_019908	TAA	2	6	1564736	1564741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50056	NC_019908	TGA	2	6	1564763	1564768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50057	NC_019908	CAG	2	6	1564797	1564802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50058	NC_019908	TAG	2	6	1564804	1564809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50059	NC_019908	ATG	2	6	1564819	1564824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50060	NC_019908	A	7	7	1564863	1564869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50061	NC_019908	TAC	3	9	1564928	1564936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50062	NC_019908	A	6	6	1564970	1564975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50063	NC_019908	CGG	2	6	1565021	1565026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50064	NC_019908	CTCA	2	8	1565035	1565042	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
50065	NC_019908	AGA	2	6	1565100	1565105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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50067	NC_019908	TAT	2	6	1565154	1565159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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50070	NC_019908	TGCTT	2	10	1565282	1565291	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
50071	NC_019908	ATT	2	6	1565320	1565325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50072	NC_019908	GA	3	6	1565352	1565357	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50073	NC_019908	A	7	7	1565360	1565366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50074	NC_019908	ATTT	2	8	1565368	1565375	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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50078	NC_019908	ATA	2	6	1565604	1565609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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50082	NC_019908	AGA	2	6	1565696	1565701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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50094	NC_019908	CT	3	6	1566055	1566060	0 %	50 %	0 %	50 %	431808060
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50109	NC_019908	AAT	2	6	1566625	1566630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50110	NC_019908	TA	4	8	1566634	1566641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50111	NC_019908	ATA	3	9	1566639	1566647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50112	NC_019908	ATT	2	6	1566654	1566659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50113	NC_019908	T	7	7	1566665	1566671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50114	NC_019908	AT	3	6	1566686	1566691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50115	NC_019908	ATA	2	6	1566694	1566699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50116	NC_019908	TAA	2	6	1566706	1566711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50117	NC_019908	ATTTA	2	10	1566713	1566722	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50118	NC_019908	T	6	6	1566738	1566743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50119	NC_019908	ATATT	2	10	1566772	1566781	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50120	NC_019908	TA	3	6	1566798	1566803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50121	NC_019908	TAT	2	6	1566824	1566829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50122	NC_019908	AT	3	6	1566828	1566833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50123	NC_019908	CAA	2	6	1566840	1566845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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50483	NC_019908	CTT	2	6	1580353	1580358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50484	NC_019908	T	6	6	1580366	1580371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50485	NC_019908	TATTTT	2	12	1580375	1580386	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50486	NC_019908	T	7	7	1580383	1580389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50487	NC_019908	TA	4	8	1580406	1580413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50488	NC_019908	CTA	2	6	1580417	1580422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50489	NC_019908	T	6	6	1580453	1580458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50490	NC_019908	TA	3	6	1580505	1580510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50491	NC_019908	ACAT	2	8	1580540	1580547	50 %	25 %	0 %	25 %	431808070
50492	NC_019908	CTA	2	6	1580551	1580556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431808070
50493	NC_019908	T	6	6	1580563	1580568	0 %	100 %	0 %	0 %	431808070
50494	NC_019908	ATA	2	6	1580600	1580605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431808070
50495	NC_019908	CAA	2	6	1580609	1580614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431808070
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50499	NC_019908	TA	3	6	1580700	1580705	50 %	50 %	0 %	0 %	431808070
50500	NC_019908	GCA	2	6	1580710	1580715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431808070

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