MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum AS43.3 chromosome

Total Repeats: 84908

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28002	NC_019842	GCGG	2	8	1309300	1309307	0 %	0 %	75 %	25 %	429504842
28003	NC_019842	TTA	2	6	1309312	1309317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429504842
28004	NC_019842	A	6	6	1309339	1309344	100 %	0 %	0 %	0 %	429504842
28005	NC_019842	CTG	2	6	1309345	1309350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504842
28006	NC_019842	AGA	2	6	1309365	1309370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504842
28007	NC_019842	CCG	2	6	1309388	1309393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429504842
28008	NC_019842	CAG	2	6	1309447	1309452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504842
28009	NC_019842	ATGGA	2	10	1309495	1309504	40 %	20 %	40 %	0 %	429504842
28010	NC_019842	AGA	2	6	1309515	1309520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504842
28011	NC_019842	TC	3	6	1309544	1309549	0 %	50 %	0 %	50 %	429504842
28012	NC_019842	ACG	2	6	1309649	1309654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504842
28013	NC_019842	A	6	6	1309690	1309695	100 %	0 %	0 %	0 %	429504842
28014	NC_019842	GCG	2	6	1309790	1309795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504842
28015	NC_019842	CGC	2	6	1309876	1309881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28016	NC_019842	GCG	2	6	1309900	1309905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28017	NC_019842	CGGT	2	8	1309982	1309989	0 %	25 %	50 %	25 %	429504843
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28019	NC_019842	GC	3	6	1310128	1310133	0 %	0 %	50 %	50 %	429504843
28020	NC_019842	GAT	2	6	1310137	1310142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504843
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28032	NC_019842	GCC	2	6	1311030	1311035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429504844
28033	NC_019842	CT	3	6	1311104	1311109	0 %	50 %	0 %	50 %	429504844
28034	NC_019842	GGGGC	2	10	1311111	1311120	0 %	0 %	80 %	20 %	429504844
28035	NC_019842	TTTG	2	8	1311141	1311148	0 %	75 %	25 %	0 %	429504844
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28038	NC_019842	GAG	2	6	1311310	1311315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429504844
28039	NC_019842	GATCA	2	10	1311417	1311426	40 %	20 %	20 %	20 %	429504844
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28042	NC_019842	AAG	2	6	1311482	1311487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504844
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28047	NC_019842	TGA	2	6	1311692	1311697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504844
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28053	NC_019842	TTTGAT	2	12	1311844	1311855	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	429504844
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28055	NC_019842	GGC	2	6	1311889	1311894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504844
28056	NC_019842	CGA	2	6	1311927	1311932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504844
28057	NC_019842	GT	3	6	1311953	1311958	0 %	50 %	50 %	0 %	429504844
28058	NC_019842	AGC	2	6	1311986	1311991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504845
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28091	NC_019842	TTTA	2	8	1313498	1313505	25 %	75 %	0 %	0 %	429504846
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28099	NC_019842	CTTT	2	8	1313870	1313877	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28100	NC_019842	T	6	6	1313875	1313880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28101	NC_019842	CAAA	2	8	1313975	1313982	75 %	0 %	0 %	25 %	429504847
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28111	NC_019842	GTCTT	2	10	1314951	1314960	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
28112	NC_019842	GCA	2	6	1315030	1315035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504848
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28117	NC_019842	ATC	2	6	1315211	1315216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504848
28118	NC_019842	TTC	2	6	1315243	1315248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429504848
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28145	NC_019842	T	7	7	1316599	1316605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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28355	NC_019842	CCG	2	6	1326249	1326254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429504862
28356	NC_019842	CGGTC	2	10	1326379	1326388	0 %	20 %	40 %	40 %	429504862
28357	NC_019842	CCG	2	6	1326419	1326424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429504862
28358	NC_019842	GAA	2	6	1326504	1326509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504862
28359	NC_019842	T	6	6	1326627	1326632	0 %	100 %	0 %	0 %	429504862
28360	NC_019842	TTC	2	6	1326667	1326672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429504862
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28363	NC_019842	TTA	2	6	1326797	1326802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28364	NC_019842	TCA	2	6	1326927	1326932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28365	NC_019842	TA	3	6	1327035	1327040	50 %	50 %	0 %	0 %	429504863
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28371	NC_019842	AT	3	6	1327223	1327228	50 %	50 %	0 %	0 %	429504863
28372	NC_019842	TTAA	2	8	1327266	1327273	50 %	50 %	0 %	0 %	429504863
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28392	NC_019842	A	7	7	1328182	1328188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28393	NC_019842	TCC	2	6	1328224	1328229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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28402	NC_019842	TGTT	2	8	1328607	1328614	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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28457	NC_019842	GA	3	6	1331356	1331361	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28458	NC_019842	CT	3	6	1331389	1331394	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28459	NC_019842	TC	3	6	1331397	1331402	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28460	NC_019842	GTC	2	6	1331444	1331449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28461	NC_019842	CGGT	2	8	1331490	1331497	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28462	NC_019842	T	7	7	1331558	1331564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28463	NC_019842	CAT	2	6	1331574	1331579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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28465	NC_019842	TTATC	2	10	1331587	1331596	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
28466	NC_019842	ATCA	2	8	1331661	1331668	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28467	NC_019842	CAG	2	6	1331694	1331699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504865
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28471	NC_019842	GA	3	6	1331950	1331955	50 %	0 %	50 %	0 %	429504865
28472	NC_019842	CCA	2	6	1331972	1331977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429504865
28473	NC_019842	CTT	2	6	1332161	1332166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429504865
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28475	NC_019842	CCG	2	6	1332283	1332288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429504865
28476	NC_019842	GCTT	2	8	1332309	1332316	0 %	50 %	25 %	25 %	429504865
28477	NC_019842	CCG	2	6	1332337	1332342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429504865
28478	NC_019842	GGC	2	6	1332354	1332359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504865
28479	NC_019842	GT	3	6	1332375	1332380	0 %	50 %	50 %	0 %	429504865
28480	NC_019842	TCT	2	6	1332409	1332414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429504865
28481	NC_019842	TCA	2	6	1332424	1332429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504865
28482	NC_019842	CCG	2	6	1332445	1332450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429504865
28483	NC_019842	GAT	2	6	1332473	1332478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504865
28484	NC_019842	A	6	6	1332645	1332650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28485	NC_019842	T	6	6	1332658	1332663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28486	NC_019842	CTA	2	6	1332692	1332697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28487	NC_019842	GCCG	2	8	1332714	1332721	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28488	NC_019842	A	6	6	1332748	1332753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28489	NC_019842	A	6	6	1332772	1332777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28490	NC_019842	AAAT	2	8	1332782	1332789	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28491	NC_019842	TCAT	2	8	1332813	1332820	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28492	NC_019842	TCA	2	6	1332985	1332990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504866
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