MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum AS43.3 chromosome

Total Repeats: 84908

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
26001	NC_019842	ATTA	2	8	1215119	1215126	50 %	50 %	0 %	0 %	429504737
26002	NC_019842	TCT	2	6	1215128	1215133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26003	NC_019842	TC	3	6	1215167	1215172	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26004	NC_019842	ATA	2	6	1215188	1215193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26005	NC_019842	GTT	2	6	1215224	1215229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26006	NC_019842	CTTT	2	8	1215252	1215259	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26007	NC_019842	TAA	2	6	1215318	1215323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26008	NC_019842	TAAG	2	8	1215356	1215363	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26009	NC_019842	CAT	2	6	1215386	1215391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26010	NC_019842	CAT	2	6	1215395	1215400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26011	NC_019842	TA	4	8	1215495	1215502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26012	NC_019842	AGA	2	6	1215530	1215535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26013	NC_019842	TAC	2	6	1215571	1215576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26014	NC_019842	AAT	2	6	1215613	1215618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26015	NC_019842	A	7	7	1215633	1215639	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26016	NC_019842	T	6	6	1215686	1215691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26017	NC_019842	T	6	6	1215696	1215701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26018	NC_019842	A	6	6	1215773	1215778	100 %	0 %	0 %	0 %	429504738
26019	NC_019842	ATG	2	6	1215783	1215788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504738
26020	NC_019842	TCA	2	6	1215825	1215830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504738
26021	NC_019842	AAT	2	6	1215928	1215933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429504738
26022	NC_019842	GAT	2	6	1215984	1215989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26023	NC_019842	AT	3	6	1215988	1215993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26024	NC_019842	AGA	2	6	1216078	1216083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26025	NC_019842	AGA	2	6	1216154	1216159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26026	NC_019842	T	6	6	1216253	1216258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26027	NC_019842	GGGC	2	8	1216463	1216470	0 %	0 %	75 %	25 %	429504739
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26030	NC_019842	GAA	2	6	1216649	1216654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504739
26031	NC_019842	T	9	9	1216689	1216697	0 %	100 %	0 %	0 %	429504739
26032	NC_019842	GTCTA	2	10	1216745	1216754	20 %	40 %	20 %	20 %	429504739
26033	NC_019842	TGG	2	6	1216770	1216775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26034	NC_019842	TTG	2	6	1216832	1216837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26035	NC_019842	AGT	2	6	1216863	1216868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26036	NC_019842	GTT	2	6	1216994	1216999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429504740
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26038	NC_019842	TCT	2	6	1217086	1217091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429504740
26039	NC_019842	TTAG	2	8	1217092	1217099	25 %	50 %	25 %	0 %	429504740
26040	NC_019842	CTT	2	6	1217147	1217152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429504740
26041	NC_019842	TGA	2	6	1217206	1217211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504740
26042	NC_019842	A	6	6	1217224	1217229	100 %	0 %	0 %	0 %	429504740
26043	NC_019842	CT	3	6	1217276	1217281	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26044	NC_019842	TTGG	2	8	1217288	1217295	0 %	50 %	50 %	0 %	429504741
26045	NC_019842	TTA	2	6	1217321	1217326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429504741
26046	NC_019842	T	6	6	1217329	1217334	0 %	100 %	0 %	0 %	429504741
26047	NC_019842	CTA	2	6	1217364	1217369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504741
26048	NC_019842	ATT	2	6	1217399	1217404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429504741
26049	NC_019842	T	6	6	1217440	1217445	0 %	100 %	0 %	0 %	429504741
26050	NC_019842	ATC	2	6	1217449	1217454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504741
26051	NC_019842	T	6	6	1217480	1217485	0 %	100 %	0 %	0 %	429504741
26052	NC_019842	CTG	2	6	1217681	1217686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504741
26053	NC_019842	TATG	2	8	1217703	1217710	25 %	50 %	25 %	0 %	429504741
26054	NC_019842	CT	3	6	1217747	1217752	0 %	50 %	0 %	50 %	429504741
26055	NC_019842	AAT	2	6	1217764	1217769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429504741
26056	NC_019842	CAA	2	6	1217776	1217781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429504741
26057	NC_019842	TTC	2	6	1217789	1217794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429504741
26058	NC_019842	GGC	2	6	1217953	1217958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504741
26059	NC_019842	GCTT	2	8	1217973	1217980	0 %	50 %	25 %	25 %	429504741
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26062	NC_019842	CAT	2	6	1218246	1218251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504741
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26064	NC_019842	TCT	2	6	1218375	1218380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429504741
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26070	NC_019842	GTTC	2	8	1218630	1218637	0 %	50 %	25 %	25 %	429504741
26071	NC_019842	TCGTT	2	10	1218696	1218705	0 %	60 %	20 %	20 %	429504741
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26073	NC_019842	AG	3	6	1218724	1218729	50 %	0 %	50 %	0 %	429504741
26074	NC_019842	GAT	2	6	1218769	1218774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504741
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26081	NC_019842	CG	3	6	1219117	1219122	0 %	0 %	50 %	50 %	429504741
26082	NC_019842	GGC	3	9	1219129	1219137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504741
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26087	NC_019842	GAA	2	6	1219221	1219226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26088	NC_019842	GTT	2	6	1219333	1219338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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26091	NC_019842	GAAT	2	8	1219404	1219411	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26092	NC_019842	ACG	2	6	1219418	1219423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26093	NC_019842	AACC	2	8	1219446	1219453	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26094	NC_019842	CTG	2	6	1219639	1219644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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26096	NC_019842	GAG	2	6	1219674	1219679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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26101	NC_019842	GACA	2	8	1219978	1219985	50 %	0 %	25 %	25 %	429504742
26102	NC_019842	A	6	6	1220030	1220035	100 %	0 %	0 %	0 %	429504742
26103	NC_019842	A	6	6	1220056	1220061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26104	NC_019842	TTAC	2	8	1220090	1220097	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26105	NC_019842	GCG	2	6	1220102	1220107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26106	NC_019842	GTGAA	2	10	1220154	1220163	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
26107	NC_019842	A	7	7	1220251	1220257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26108	NC_019842	AATG	2	8	1220305	1220312	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26109	NC_019842	AGG	2	6	1220327	1220332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26110	NC_019842	TGC	2	6	1220348	1220353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504743
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26116	NC_019842	T	6	6	1220728	1220733	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26117	NC_019842	ACTT	2	8	1220765	1220772	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26118	NC_019842	GAT	2	6	1220902	1220907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26119	NC_019842	GCG	2	6	1220948	1220953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26120	NC_019842	TAA	2	6	1220958	1220963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26121	NC_019842	ATC	2	6	1220987	1220992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26122	NC_019842	AT	3	6	1221002	1221007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26123	NC_019842	AGA	2	6	1221037	1221042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26124	NC_019842	ATT	2	6	1221053	1221058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26125	NC_019842	ATA	2	6	1221059	1221064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26126	NC_019842	AGG	2	6	1221065	1221070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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26244	NC_019842	CCT	2	6	1226672	1226677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429504749
26245	NC_019842	TGA	2	6	1226868	1226873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504749
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26342	NC_019842	T	6	6	1231303	1231308	0 %	100 %	0 %	0 %	429504752
26343	NC_019842	A	6	6	1231310	1231315	100 %	0 %	0 %	0 %	429504752
26344	NC_019842	TGA	2	6	1231339	1231344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504752
26345	NC_019842	CGG	2	6	1231370	1231375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504753
26346	NC_019842	TCA	2	6	1231428	1231433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504753
26347	NC_019842	CTT	2	6	1231488	1231493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429504753
26348	NC_019842	TGC	2	6	1231555	1231560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504753
26349	NC_019842	CTT	2	6	1231590	1231595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429504753
26350	NC_019842	CGA	2	6	1231638	1231643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504753
26351	NC_019842	TTC	2	6	1231666	1231671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429504753
26352	NC_019842	A	7	7	1231682	1231688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26353	NC_019842	CCT	2	6	1231689	1231694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26354	NC_019842	CA	3	6	1231703	1231708	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26355	NC_019842	TGA	2	6	1231709	1231714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26356	NC_019842	TTGTTT	2	12	1231752	1231763	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	429504754
26357	NC_019842	A	6	6	1231830	1231835	100 %	0 %	0 %	0 %	429504754
26358	NC_019842	TGT	2	6	1231848	1231853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429504754
26359	NC_019842	AAAT	2	8	1231870	1231877	75 %	25 %	0 %	0 %	429504754
26360	NC_019842	AAG	2	6	1231892	1231897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504754
26361	NC_019842	ATG	2	6	1231985	1231990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504754
26362	NC_019842	CTT	2	6	1232136	1232141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429504754
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26390	NC_019842	TG	3	6	1233368	1233373	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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26482	NC_019842	TGAAT	2	10	1236693	1236702	40 %	40 %	20 %	0 %	429504760
26483	NC_019842	TGAAG	2	10	1236714	1236723	40 %	20 %	40 %	0 %	429504760
26484	NC_019842	GCG	2	6	1236751	1236756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504760
26485	NC_019842	CCT	2	6	1236824	1236829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26486	NC_019842	ATA	2	6	1236915	1236920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26487	NC_019842	GGC	2	6	1236922	1236927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26488	NC_019842	ATA	2	6	1236957	1236962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26489	NC_019842	GGC	2	6	1236964	1236969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26490	NC_019842	CCT	2	6	1237046	1237051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26491	NC_019842	GTAC	2	8	1237100	1237107	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26492	NC_019842	A	10	10	1237115	1237124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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26494	NC_019842	T	7	7	1237148	1237154	0 %	100 %	0 %	0 %	429504761
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