MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum AS43.3 chromosome

Total Repeats: 84908

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24501	NC_019842	AT	3	6	1142657	1142662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24502	NC_019842	CAGT	2	8	1142677	1142684	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24503	NC_019842	TGATA	2	10	1142745	1142754	40 %	40 %	20 %	0 %	429504635
24504	NC_019842	CAAA	2	8	1142773	1142780	75 %	0 %	0 %	25 %	429504635
24505	NC_019842	TTTG	2	8	1142790	1142797	0 %	75 %	25 %	0 %	429504635
24506	NC_019842	TGT	2	6	1142825	1142830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429504635
24507	NC_019842	A	8	8	1142883	1142890	100 %	0 %	0 %	0 %	429504635
24508	NC_019842	T	6	6	1142913	1142918	0 %	100 %	0 %	0 %	429504635
24509	NC_019842	TCC	2	6	1142939	1142944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429504636
24510	NC_019842	TGCTT	2	10	1142978	1142987	0 %	60 %	20 %	20 %	429504636
24511	NC_019842	T	6	6	1143019	1143024	0 %	100 %	0 %	0 %	429504636
24512	NC_019842	CTT	2	6	1143039	1143044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429504636
24513	NC_019842	TTTC	2	8	1143072	1143079	0 %	75 %	0 %	25 %	429504636
24514	NC_019842	GGC	2	6	1143119	1143124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504636
24515	NC_019842	TCA	3	9	1143215	1143223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504636
24516	NC_019842	CCG	2	6	1143273	1143278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429504636
24517	NC_019842	TTC	2	6	1143340	1143345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429504636
24518	NC_019842	AAAC	2	8	1143411	1143418	75 %	0 %	0 %	25 %	429504636
24519	NC_019842	TGC	2	6	1143432	1143437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504636
24520	NC_019842	TTC	2	6	1143459	1143464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429504636
24521	NC_019842	T	6	6	1143576	1143581	0 %	100 %	0 %	0 %	429504636
24522	NC_019842	AGG	2	6	1143596	1143601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429504636
24523	NC_019842	T	6	6	1143604	1143609	0 %	100 %	0 %	0 %	429504636
24524	NC_019842	A	7	7	1143664	1143670	100 %	0 %	0 %	0 %	429504636
24525	NC_019842	T	7	7	1143691	1143697	0 %	100 %	0 %	0 %	429504636
24526	NC_019842	T	7	7	1143763	1143769	0 %	100 %	0 %	0 %	429504636
24527	NC_019842	GATC	2	8	1143823	1143830	25 %	25 %	25 %	25 %	429504637
24528	NC_019842	AGG	2	6	1144032	1144037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429504637
24529	NC_019842	GAGAC	2	10	1144124	1144133	40 %	0 %	40 %	20 %	429504637
24530	NC_019842	CAA	2	6	1144151	1144156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429504637
24531	NC_019842	ACT	2	6	1144219	1144224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24532	NC_019842	ACAA	2	8	1144326	1144333	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24533	NC_019842	TCATA	2	10	1144361	1144370	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24534	NC_019842	TTCA	2	8	1144381	1144388	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24535	NC_019842	A	7	7	1144409	1144415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24536	NC_019842	GAAG	2	8	1144425	1144432	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24537	NC_019842	CT	3	6	1144434	1144439	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24538	NC_019842	CGG	2	6	1144497	1144502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504638
24539	NC_019842	GGC	2	6	1144545	1144550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504638
24540	NC_019842	CGT	2	6	1144571	1144576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504638
24541	NC_019842	GCC	2	6	1144608	1144613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429504638
24542	NC_019842	TAA	2	6	1144742	1144747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429504638
24543	NC_019842	CG	3	6	1144749	1144754	0 %	0 %	50 %	50 %	429504638
24544	NC_019842	AGC	2	6	1144881	1144886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504638
24545	NC_019842	GCT	2	6	1144967	1144972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504638
24546	NC_019842	GC	3	6	1145006	1145011	0 %	0 %	50 %	50 %	429504638
24547	NC_019842	GA	3	6	1145066	1145071	50 %	0 %	50 %	0 %	429504638
24548	NC_019842	ATTG	2	8	1145086	1145093	25 %	50 %	25 %	0 %	429504638
24549	NC_019842	GCC	2	6	1145107	1145112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429504638
24550	NC_019842	T	7	7	1145144	1145150	0 %	100 %	0 %	0 %	429504639
24551	NC_019842	ATTTT	2	10	1145174	1145183	20 %	80 %	0 %	0 %	429504639
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24553	NC_019842	TCT	2	6	1145279	1145284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429504639
24554	NC_019842	CG	3	6	1145341	1145346	0 %	0 %	50 %	50 %	429504639
24555	NC_019842	TGG	2	6	1145468	1145473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429504639
24556	NC_019842	CAG	2	6	1145479	1145484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504639
24557	NC_019842	ACCG	2	8	1145485	1145492	25 %	0 %	25 %	50 %	429504639
24558	NC_019842	GAAC	2	8	1145514	1145521	50 %	0 %	25 %	25 %	429504639
24559	NC_019842	T	8	8	1145554	1145561	0 %	100 %	0 %	0 %	429504639
24560	NC_019842	AAT	2	6	1145589	1145594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429504639
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24562	NC_019842	CAG	2	6	1145668	1145673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504639
24563	NC_019842	ATTTCT	2	12	1145687	1145698	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	429504639
24564	NC_019842	TGATA	2	10	1145784	1145793	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24565	NC_019842	AAAT	2	8	1145794	1145801	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24566	NC_019842	A	6	6	1145815	1145820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24573	NC_019842	CGG	2	6	1146076	1146081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504640
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24576	NC_019842	GAA	2	6	1146167	1146172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504640
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24578	NC_019842	ACAA	2	8	1146231	1146238	75 %	0 %	0 %	25 %	429504641
24579	NC_019842	GAA	2	6	1146275	1146280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504641
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24583	NC_019842	ACC	2	6	1146579	1146584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429504641
24584	NC_019842	ACAA	2	8	1146604	1146611	75 %	0 %	0 %	25 %	429504641
24585	NC_019842	GAA	2	6	1146776	1146781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504641
24586	NC_019842	GAAA	2	8	1146831	1146838	75 %	0 %	25 %	0 %	429504641
24587	NC_019842	A	6	6	1146836	1146841	100 %	0 %	0 %	0 %	429504641
24588	NC_019842	ACC	2	6	1146849	1146854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429504641
24589	NC_019842	AGG	2	6	1146863	1146868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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24591	NC_019842	CGG	2	6	1147002	1147007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504642
24592	NC_019842	CTT	2	6	1147018	1147023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429504642
24593	NC_019842	CTT	2	6	1147180	1147185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429504642
24594	NC_019842	ATG	2	6	1147205	1147210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504642
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24596	NC_019842	TCG	2	6	1147274	1147279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504642
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24598	NC_019842	TGTC	2	8	1147333	1147340	0 %	50 %	25 %	25 %	429504642
24599	NC_019842	TAA	2	6	1147365	1147370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429504642
24600	NC_019842	GGC	2	6	1147378	1147383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504642
24601	NC_019842	ATC	2	6	1147387	1147392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504642
24602	NC_019842	CATC	2	8	1147430	1147437	25 %	25 %	0 %	50 %	429504642
24603	NC_019842	AAC	2	6	1147438	1147443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429504642
24604	NC_019842	CGC	2	6	1147466	1147471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429504642
24605	NC_019842	ATC	2	6	1147484	1147489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504642
24606	NC_019842	TCA	2	6	1147499	1147504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504642
24607	NC_019842	ACG	2	6	1147514	1147519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504642
24608	NC_019842	TGC	2	6	1147553	1147558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504642
24609	NC_019842	T	6	6	1147701	1147706	0 %	100 %	0 %	0 %	429504643
24610	NC_019842	CGG	2	6	1147805	1147810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504643
24611	NC_019842	GCG	2	6	1148062	1148067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504643
24612	NC_019842	GCA	2	6	1148163	1148168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504643
24613	NC_019842	AGA	2	6	1148170	1148175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504643
24614	NC_019842	CAG	2	6	1148186	1148191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504643
24615	NC_019842	GAAG	2	8	1148228	1148235	50 %	0 %	50 %	0 %	429504643
24616	NC_019842	GAA	2	6	1148257	1148262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504643
24617	NC_019842	TAT	2	6	1148273	1148278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429504643
24618	NC_019842	CGG	2	6	1148447	1148452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504643
24619	NC_019842	A	6	6	1148453	1148458	100 %	0 %	0 %	0 %	429504643
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