MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum AS43.3 chromosome

Total Repeats: 84908

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24003	NC_019842	TCG	2	6	1120353	1120358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504614
24004	NC_019842	ATG	2	6	1120470	1120475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504614
24005	NC_019842	CGG	2	6	1120525	1120530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504614
24006	NC_019842	CTA	2	6	1120541	1120546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504614
24007	NC_019842	AGC	2	6	1120555	1120560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504614
24008	NC_019842	A	6	6	1120576	1120581	100 %	0 %	0 %	0 %	429504614
24009	NC_019842	GA	3	6	1120607	1120612	50 %	0 %	50 %	0 %	429504614
24010	NC_019842	CAG	2	6	1120613	1120618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504614
24011	NC_019842	A	7	7	1120694	1120700	100 %	0 %	0 %	0 %	429504614
24012	NC_019842	A	6	6	1120717	1120722	100 %	0 %	0 %	0 %	429504614
24013	NC_019842	AAG	2	6	1120729	1120734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504614
24014	NC_019842	ATT	2	6	1120797	1120802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24015	NC_019842	A	6	6	1120824	1120829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24016	NC_019842	TAA	2	6	1120842	1120847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24017	NC_019842	TAA	2	6	1120853	1120858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24018	NC_019842	AAT	2	6	1120973	1120978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429504615
24019	NC_019842	T	6	6	1120990	1120995	0 %	100 %	0 %	0 %	429504615
24020	NC_019842	AGAA	2	8	1120997	1121004	75 %	0 %	25 %	0 %	429504615
24021	NC_019842	TAT	2	6	1121110	1121115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429504615
24022	NC_019842	CCT	2	6	1121184	1121189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429504615
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24024	NC_019842	A	6	6	1121342	1121347	100 %	0 %	0 %	0 %	429504615
24025	NC_019842	TCG	2	6	1121367	1121372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504615
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24032	NC_019842	CTG	2	6	1121579	1121584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504615
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24040	NC_019842	T	7	7	1122006	1122012	0 %	100 %	0 %	0 %	429504616
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24054	NC_019842	A	7	7	1122738	1122744	100 %	0 %	0 %	0 %	429504616
24055	NC_019842	ATC	2	6	1122766	1122771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504616
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24059	NC_019842	AT	4	8	1122976	1122983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24062	NC_019842	TGA	2	6	1123244	1123249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504617
24063	NC_019842	GCTG	2	8	1123271	1123278	0 %	25 %	50 %	25 %	429504617
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24072	NC_019842	AT	3	6	1123552	1123557	50 %	50 %	0 %	0 %	429504617
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24101	NC_019842	AGG	2	6	1124650	1124655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24102	NC_019842	TTCCT	2	10	1124656	1124665	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
24103	NC_019842	CT	3	6	1124664	1124669	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24104	NC_019842	AT	3	6	1124705	1124710	50 %	50 %	0 %	0 %	429504618
24105	NC_019842	CAT	2	6	1124771	1124776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504618
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24108	NC_019842	TGC	2	6	1124911	1124916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504618
24109	NC_019842	CTTAT	2	10	1124967	1124976	20 %	60 %	0 %	20 %	429504618
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24114	NC_019842	TA	3	6	1125339	1125344	50 %	50 %	0 %	0 %	429504618
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24117	NC_019842	TCA	2	6	1125421	1125426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504618
24118	NC_019842	TGA	2	6	1125439	1125444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504618
24119	NC_019842	TGG	2	6	1125586	1125591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429504618
24120	NC_019842	AG	3	6	1125651	1125656	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24121	NC_019842	C	6	6	1125693	1125698	0 %	0 %	0 %	100 %	429504619
24122	NC_019842	T	7	7	1125754	1125760	0 %	100 %	0 %	0 %	429504619
24123	NC_019842	CAT	3	9	1125812	1125820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504619
24124	NC_019842	GCC	2	6	1125893	1125898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429504619
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24126	NC_019842	CTTG	2	8	1125977	1125984	0 %	50 %	25 %	25 %	429504619
24127	NC_019842	TAT	2	6	1126096	1126101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429504619
24128	NC_019842	AT	3	6	1126111	1126116	50 %	50 %	0 %	0 %	429504619
24129	NC_019842	TTA	2	6	1126123	1126128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429504619
24130	NC_019842	TTAATT	2	12	1126164	1126175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429504619
24131	NC_019842	ACA	2	6	1126194	1126199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429504619
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24133	NC_019842	A	6	6	1126277	1126282	100 %	0 %	0 %	0 %	429504619
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24137	NC_019842	AT	3	6	1126303	1126308	50 %	50 %	0 %	0 %	429504619
24138	NC_019842	ATT	2	6	1126329	1126334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429504619
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24142	NC_019842	CTT	2	6	1126509	1126514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429504619
24143	NC_019842	CGGA	2	8	1126589	1126596	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24144	NC_019842	T	7	7	1126605	1126611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24145	NC_019842	AAT	2	6	1126668	1126673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24146	NC_019842	TATC	2	8	1126675	1126682	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24147	NC_019842	ACA	2	6	1126700	1126705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24148	NC_019842	ATG	2	6	1126744	1126749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504620
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24150	NC_019842	GGAA	2	8	1126813	1126820	50 %	0 %	50 %	0 %	429504620
24151	NC_019842	CGC	2	6	1126846	1126851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429504620
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24153	NC_019842	CCA	2	6	1126931	1126936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429504620
24154	NC_019842	A	6	6	1126952	1126957	100 %	0 %	0 %	0 %	429504620
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24164	NC_019842	GC	4	8	1127586	1127593	0 %	0 %	50 %	50 %	429504621
24165	NC_019842	TCG	2	6	1127601	1127606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504621
24166	NC_019842	TCG	2	6	1127622	1127627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504621
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24179	NC_019842	T	6	6	1128014	1128019	0 %	100 %	0 %	0 %	429504621
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24193	NC_019842	TTC	2	6	1128550	1128555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24194	NC_019842	A	6	6	1128562	1128567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24195	NC_019842	GTG	2	6	1128582	1128587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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24199	NC_019842	GCT	2	6	1128673	1128678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24200	NC_019842	CT	3	6	1128726	1128731	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24201	NC_019842	TAC	2	6	1128751	1128756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24202	NC_019842	TCA	2	6	1128760	1128765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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24205	NC_019842	TAT	2	6	1128797	1128802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24207	NC_019842	A	7	7	1128970	1128976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24208	NC_019842	TTAG	2	8	1128978	1128985	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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24224	NC_019842	ATG	2	6	1129906	1129911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504622
24225	NC_019842	GAA	2	6	1129983	1129988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504622
24226	NC_019842	TGA	2	6	1130000	1130005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504622
24227	NC_019842	TAACAA	2	12	1130007	1130018	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	429504622
24228	NC_019842	A	6	6	1130029	1130034	100 %	0 %	0 %	0 %	429504622
24229	NC_019842	A	6	6	1130107	1130112	100 %	0 %	0 %	0 %	429504622
24230	NC_019842	AGA	2	6	1130169	1130174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504622
24231	NC_019842	GCC	2	6	1130286	1130291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429504622
24232	NC_019842	TAAA	2	8	1130366	1130373	75 %	25 %	0 %	0 %	429504622
24233	NC_019842	GAATG	2	10	1130524	1130533	40 %	20 %	40 %	0 %	429504622
24234	NC_019842	GGCT	2	8	1130581	1130588	0 %	25 %	50 %	25 %	429504622
24235	NC_019842	CGATC	2	10	1130601	1130610	20 %	20 %	20 %	40 %	429504622
24236	NC_019842	AAG	2	6	1130636	1130641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504622
24237	NC_019842	GCT	2	6	1130685	1130690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504622
24238	NC_019842	A	6	6	1130740	1130745	100 %	0 %	0 %	0 %	429504622
24239	NC_019842	CTT	2	6	1130873	1130878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429504622
24240	NC_019842	GGA	2	6	1130924	1130929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24241	NC_019842	A	6	6	1130971	1130976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24242	NC_019842	AT	3	6	1131001	1131006	50 %	50 %	0 %	0 %	429504623
24243	NC_019842	ATC	2	6	1131029	1131034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504623
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24250	NC_019842	TGCT	2	8	1131342	1131349	0 %	50 %	25 %	25 %	429504623
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24353	NC_019842	ATGA	2	8	1136256	1136263	50 %	25 %	25 %	0 %	429504628
24354	NC_019842	GAA	2	6	1136299	1136304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504628
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24359	NC_019842	AGA	3	9	1136682	1136690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504628
24360	NC_019842	A	6	6	1136768	1136773	100 %	0 %	0 %	0 %	429504628
24361	NC_019842	TGA	2	6	1136796	1136801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504628
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24363	NC_019842	A	6	6	1136811	1136816	100 %	0 %	0 %	0 %	429504628
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24368	NC_019842	T	6	6	1136949	1136954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24384	NC_019842	A	6	6	1137918	1137923	100 %	0 %	0 %	0 %	429504630
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24477	NC_019842	GCT	2	6	1141888	1141893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504633
24478	NC_019842	AT	3	6	1141900	1141905	50 %	50 %	0 %	0 %	429504633
24479	NC_019842	CAGA	2	8	1141984	1141991	50 %	0 %	25 %	25 %	429504633
24480	NC_019842	CTG	2	6	1142060	1142065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504633
24481	NC_019842	TAT	2	6	1142075	1142080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429504633
24482	NC_019842	ACA	2	6	1142106	1142111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429504633
24483	NC_019842	TGAT	2	8	1142115	1142122	25 %	50 %	25 %	0 %	429504633
24484	NC_019842	ATT	2	6	1142169	1142174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429504633
24485	NC_019842	AGC	2	6	1142219	1142224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504633
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24490	NC_019842	A	6	6	1142429	1142434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24491	NC_019842	T	8	8	1142458	1142465	0 %	100 %	0 %	0 %	429504634
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24500	NC_019842	CCT	2	6	1142639	1142644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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