MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum AS43.3 chromosome

Total Repeats: 84908

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23501	NC_019842	GA	3	6	1098609	1098614	50 %	0 %	50 %	0 %	429504588
23502	NC_019842	TGAA	2	8	1098615	1098622	50 %	25 %	25 %	0 %	429504588
23503	NC_019842	CAG	2	6	1098662	1098667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504588
23504	NC_019842	A	6	6	1098688	1098693	100 %	0 %	0 %	0 %	429504588
23505	NC_019842	CGAT	2	8	1098708	1098715	25 %	25 %	25 %	25 %	429504588
23506	NC_019842	TG	3	6	1098862	1098867	0 %	50 %	50 %	0 %	429504588
23507	NC_019842	GAA	2	6	1098868	1098873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504588
23508	NC_019842	ACGGTG	2	12	1098896	1098907	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	429504588
23509	NC_019842	TAAAA	2	10	1098969	1098978	80 %	20 %	0 %	0 %	429504588
23510	NC_019842	A	6	6	1098975	1098980	100 %	0 %	0 %	0 %	429504588
23511	NC_019842	GCG	2	6	1098981	1098986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23512	NC_019842	T	8	8	1099008	1099015	0 %	100 %	0 %	0 %	429504589
23513	NC_019842	GCT	2	6	1099052	1099057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504589
23514	NC_019842	CTG	2	6	1099167	1099172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504589
23515	NC_019842	TGC	2	6	1099244	1099249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504590
23516	NC_019842	CCTTG	2	10	1099315	1099324	0 %	40 %	20 %	40 %	429504590
23517	NC_019842	GTC	2	6	1099395	1099400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23518	NC_019842	TCCG	2	8	1099482	1099489	0 %	25 %	25 %	50 %	429504591
23519	NC_019842	CGG	2	6	1099514	1099519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504591
23520	NC_019842	CGC	2	6	1099556	1099561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429504591
23521	NC_019842	TCG	2	6	1099597	1099602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504591
23522	NC_019842	GAT	2	6	1099611	1099616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504591
23523	NC_019842	TC	3	6	1099621	1099626	0 %	50 %	0 %	50 %	429504591
23524	NC_019842	TTC	2	6	1099651	1099656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429504591
23525	NC_019842	GCC	2	6	1099711	1099716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429504591
23526	NC_019842	TCT	2	6	1099719	1099724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429504591
23527	NC_019842	GC	3	6	1099760	1099765	0 %	0 %	50 %	50 %	429504591
23528	NC_019842	TCC	2	6	1099816	1099821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429504591
23529	NC_019842	TCA	2	6	1099891	1099896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504591
23530	NC_019842	CAT	2	6	1099913	1099918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504591
23531	NC_019842	TGG	2	6	1100035	1100040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429504591
23532	NC_019842	ATA	2	6	1100091	1100096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429504591
23533	NC_019842	GGAAC	2	10	1100106	1100115	40 %	0 %	40 %	20 %	429504591
23534	NC_019842	ATG	2	6	1100139	1100144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504591
23535	NC_019842	CTT	2	6	1100150	1100155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429504591
23536	NC_019842	TAA	2	6	1100208	1100213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429504591
23537	NC_019842	TCCA	2	8	1100217	1100224	25 %	25 %	0 %	50 %	429504591
23538	NC_019842	ATAA	2	8	1100257	1100264	75 %	25 %	0 %	0 %	429504591
23539	NC_019842	AGG	2	6	1100365	1100370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23540	NC_019842	ATC	2	6	1100392	1100397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504592
23541	NC_019842	AGA	2	6	1100435	1100440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504592
23542	NC_019842	TGCT	2	8	1100524	1100531	0 %	50 %	25 %	25 %	429504592
23543	NC_019842	TGC	2	6	1100551	1100556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504592
23544	NC_019842	CAG	2	6	1100596	1100601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504592
23545	NC_019842	GAG	2	6	1100646	1100651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429504592
23546	NC_019842	GC	3	6	1100679	1100684	0 %	0 %	50 %	50 %	429504592
23547	NC_019842	T	6	6	1100817	1100822	0 %	100 %	0 %	0 %	429504592
23548	NC_019842	CAG	3	9	1100823	1100831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504592
23549	NC_019842	GCC	2	6	1100947	1100952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429504592
23550	NC_019842	GCT	2	6	1100954	1100959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504592
23551	NC_019842	CAG	2	6	1101038	1101043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504592
23552	NC_019842	GAA	2	6	1101212	1101217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504593
23553	NC_019842	CAT	2	6	1101232	1101237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504593
23554	NC_019842	GTT	2	6	1101254	1101259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429504593
23555	NC_019842	ACG	2	6	1101303	1101308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504593
23556	NC_019842	GAC	2	6	1101320	1101325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504593
23557	NC_019842	CGCT	2	8	1101369	1101376	0 %	25 %	25 %	50 %	429504593
23558	NC_019842	ATC	2	6	1101380	1101385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504593
23559	NC_019842	CGA	2	6	1101388	1101393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504593
23560	NC_019842	A	6	6	1101398	1101403	100 %	0 %	0 %	0 %	429504593
23561	NC_019842	TAA	2	6	1101515	1101520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429504593
23562	NC_019842	CTTTT	2	10	1101566	1101575	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
23563	NC_019842	GTTT	2	8	1101600	1101607	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23564	NC_019842	CAAA	2	8	1101615	1101622	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23565	NC_019842	TA	3	6	1101627	1101632	50 %	50 %	0 %	0 %	429504594
23566	NC_019842	A	6	6	1101632	1101637	100 %	0 %	0 %	0 %	429504594
23567	NC_019842	T	6	6	1101656	1101661	0 %	100 %	0 %	0 %	429504594
23568	NC_019842	GTCT	2	8	1101673	1101680	0 %	50 %	25 %	25 %	429504594
23569	NC_019842	TG	3	6	1101692	1101697	0 %	50 %	50 %	0 %	429504594
23570	NC_019842	AAAT	2	8	1101729	1101736	75 %	25 %	0 %	0 %	429504594
23571	NC_019842	AT	3	6	1101775	1101780	50 %	50 %	0 %	0 %	429504594
23572	NC_019842	T	6	6	1101792	1101797	0 %	100 %	0 %	0 %	429504594
23573	NC_019842	ATG	2	6	1101803	1101808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504594
23574	NC_019842	ATTTC	2	10	1101867	1101876	20 %	60 %	0 %	20 %	429504594
23575	NC_019842	TAAGT	2	10	1101893	1101902	40 %	40 %	20 %	0 %	429504594
23576	NC_019842	A	6	6	1102015	1102020	100 %	0 %	0 %	0 %	429504594
23577	NC_019842	GAT	2	6	1102024	1102029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504594
23578	NC_019842	TGTT	2	8	1102069	1102076	0 %	75 %	25 %	0 %	429504594
23579	NC_019842	AT	4	8	1102106	1102113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23580	NC_019842	TA	3	6	1102118	1102123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23581	NC_019842	A	6	6	1102130	1102135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23582	NC_019842	TCTG	2	8	1102226	1102233	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23583	NC_019842	AAG	2	6	1102261	1102266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23584	NC_019842	A	7	7	1102278	1102284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23585	NC_019842	CCA	2	6	1102295	1102300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23586	NC_019842	T	6	6	1102308	1102313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23587	NC_019842	A	7	7	1102334	1102340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23588	NC_019842	ATA	2	6	1102358	1102363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23589	NC_019842	GAGG	2	8	1102378	1102385	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
23590	NC_019842	GAA	2	6	1102393	1102398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504595
23591	NC_019842	A	6	6	1102397	1102402	100 %	0 %	0 %	0 %	429504595
23592	NC_019842	GCA	2	6	1102477	1102482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504595
23593	NC_019842	AGAA	2	8	1102551	1102558	75 %	0 %	25 %	0 %	429504595
23594	NC_019842	GGC	2	6	1102634	1102639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504595
23595	NC_019842	TAT	2	6	1102646	1102651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429504595
23596	NC_019842	ACA	2	6	1102683	1102688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429504595
23597	NC_019842	GAAA	2	8	1102707	1102714	75 %	0 %	25 %	0 %	429504595
23598	NC_019842	A	7	7	1102712	1102718	100 %	0 %	0 %	0 %	429504595
23599	NC_019842	TCA	2	6	1102719	1102724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504595
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23601	NC_019842	TGAT	2	8	1102875	1102882	25 %	50 %	25 %	0 %	429504595
23602	NC_019842	TCA	2	6	1102923	1102928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504595
23603	NC_019842	CGG	2	6	1102966	1102971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504595
23604	NC_019842	GAT	2	6	1103018	1103023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504595
23605	NC_019842	ATGAA	2	10	1103031	1103040	60 %	20 %	20 %	0 %	429504595
23606	NC_019842	ATAC	2	8	1103061	1103068	50 %	25 %	0 %	25 %	429504595
23607	NC_019842	GCA	2	6	1103083	1103088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504595
23608	NC_019842	CCG	2	6	1103103	1103108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429504595
23609	NC_019842	GCAT	2	8	1103112	1103119	25 %	25 %	25 %	25 %	429504595
23610	NC_019842	CG	3	6	1103122	1103127	0 %	0 %	50 %	50 %	429504595
23611	NC_019842	ATGT	2	8	1103162	1103169	25 %	50 %	25 %	0 %	429504595
23612	NC_019842	AC	3	6	1103178	1103183	50 %	0 %	0 %	50 %	429504595
23613	NC_019842	AGAA	2	8	1103196	1103203	75 %	0 %	25 %	0 %	429504595
23614	NC_019842	AGA	2	6	1103227	1103232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504595
23615	NC_019842	CCG	2	6	1103272	1103277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429504595
23616	NC_019842	CAG	2	6	1103312	1103317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504595
23617	NC_019842	ACA	2	6	1103406	1103411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429504595
23618	NC_019842	TGC	2	6	1103418	1103423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504595
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23739	NC_019842	CGC	2	6	1108665	1108670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429504600
23740	NC_019842	AGA	2	6	1108684	1108689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504600
23741	NC_019842	AGC	2	6	1108717	1108722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504600
23742	NC_019842	T	8	8	1108754	1108761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23743	NC_019842	TAAT	2	8	1108791	1108798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23744	NC_019842	TCA	2	6	1108802	1108807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23745	NC_019842	CAT	2	6	1108854	1108859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504601
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23747	NC_019842	T	7	7	1108905	1108911	0 %	100 %	0 %	0 %	429504601
23748	NC_019842	TCG	2	6	1108968	1108973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504601
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23752	NC_019842	TAAA	2	8	1109118	1109125	75 %	25 %	0 %	0 %	429504601
23753	NC_019842	AC	3	6	1109154	1109159	50 %	0 %	0 %	50 %	429504601
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23825	NC_019842	GATC	2	8	1112141	1112148	25 %	25 %	25 %	25 %	429504602
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23837	NC_019842	A	6	6	1112664	1112669	100 %	0 %	0 %	0 %	429504602
23838	NC_019842	GCA	2	6	1112671	1112676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504602
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23842	NC_019842	CA	3	6	1112960	1112965	50 %	0 %	0 %	50 %	429504602
23843	NC_019842	AC	3	6	1112977	1112982	50 %	0 %	0 %	50 %	429504603
23844	NC_019842	TTTC	2	8	1113008	1113015	0 %	75 %	0 %	25 %	429504603
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23847	NC_019842	GAT	2	6	1113118	1113123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504603
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23849	NC_019842	TTTC	2	8	1113197	1113204	0 %	75 %	0 %	25 %	429504603
23850	NC_019842	AGC	2	6	1113206	1113211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504603
23851	NC_019842	G	6	6	1113228	1113233	0 %	0 %	100 %	0 %	429504603
23852	NC_019842	GACC	2	8	1113358	1113365	25 %	0 %	25 %	50 %	429504603
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23977	NC_019842	CAAA	2	8	1119284	1119291	75 %	0 %	0 %	25 %	429504613
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