MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum AS43.3 chromosome

Total Repeats: 84908

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_019842	TG	3	6	656019	656024	0 %	50 %	50 %	0 %	429504156
14003	NC_019842	ATG	2	6	656028	656033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504156
14004	NC_019842	GGAGC	2	10	656045	656054	20 %	0 %	60 %	20 %	429504156
14005	NC_019842	ATT	2	6	656070	656075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429504156
14006	NC_019842	CGGA	2	8	656130	656137	25 %	0 %	50 %	25 %	429504156
14007	NC_019842	CGG	2	6	656164	656169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504156
14008	NC_019842	CGG	2	6	656175	656180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504156
14009	NC_019842	TGA	2	6	656203	656208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504156
14010	NC_019842	ACTT	2	8	656299	656306	25 %	50 %	0 %	25 %	429504156
14011	NC_019842	CTT	2	6	656351	656356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429504156
14012	NC_019842	CGG	2	6	656362	656367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504156
14013	NC_019842	GAA	2	6	656414	656419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504156
14014	NC_019842	CGA	2	6	656430	656435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504156
14015	NC_019842	AT	3	6	656438	656443	50 %	50 %	0 %	0 %	429504156
14016	NC_019842	GGA	2	6	656507	656512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429504156
14017	NC_019842	TGC	2	6	656535	656540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504156
14018	NC_019842	CGGA	2	8	656541	656548	25 %	0 %	50 %	25 %	429504156
14019	NC_019842	CCG	2	6	656585	656590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429504156
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14022	NC_019842	TTTC	2	8	656772	656779	0 %	75 %	0 %	25 %	429504156
14023	NC_019842	GA	3	6	656862	656867	50 %	0 %	50 %	0 %	429504157
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14027	NC_019842	CGA	2	6	657216	657221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504157
14028	NC_019842	ATACA	2	10	657299	657308	60 %	20 %	0 %	20 %	429504157
14029	NC_019842	GCT	2	6	657348	657353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504157
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14032	NC_019842	GGAC	2	8	657560	657567	25 %	0 %	50 %	25 %	429504158
14033	NC_019842	CGG	2	6	657596	657601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504158
14034	NC_019842	GTC	2	6	657678	657683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504158
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14039	NC_019842	TCA	2	6	657811	657816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504158
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14043	NC_019842	CGG	2	6	658090	658095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504158
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14052	NC_019842	AG	3	6	658557	658562	50 %	0 %	50 %	0 %	429504158
14053	NC_019842	CGAG	2	8	658564	658571	25 %	0 %	50 %	25 %	429504158
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14056	NC_019842	GC	3	6	658741	658746	0 %	0 %	50 %	50 %	429504158
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14094	NC_019842	AAT	2	6	660643	660648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14102	NC_019842	AAAG	2	8	661096	661103	75 %	0 %	25 %	0 %	429504161
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14105	NC_019842	TGG	2	6	661151	661156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429504161
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14108	NC_019842	TGCA	2	8	661310	661317	25 %	25 %	25 %	25 %	429504161
14109	NC_019842	A	6	6	661371	661376	100 %	0 %	0 %	0 %	429504161
14110	NC_019842	GGC	2	6	661430	661435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504161
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14119	NC_019842	GAAT	2	8	661609	661616	50 %	25 %	25 %	0 %	429504161
14120	NC_019842	GGA	2	6	661633	661638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429504161
14121	NC_019842	TAT	2	6	661691	661696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429504161
14122	NC_019842	GAC	2	6	661703	661708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504161
14123	NC_019842	GGTC	2	8	661720	661727	0 %	25 %	50 %	25 %	429504161
14124	NC_019842	GCTT	2	8	661735	661742	0 %	50 %	25 %	25 %	429504161
14125	NC_019842	CTG	2	6	661805	661810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504161
14126	NC_019842	ATATG	2	10	661888	661897	40 %	40 %	20 %	0 %	429504161
14127	NC_019842	GATG	2	8	661900	661907	25 %	25 %	50 %	0 %	429504161
14128	NC_019842	CTTT	2	8	662000	662007	0 %	75 %	0 %	25 %	429504161
14129	NC_019842	ATG	2	6	662013	662018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504161
14130	NC_019842	TAT	2	6	662131	662136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429504161
14131	NC_019842	A	6	6	662146	662151	100 %	0 %	0 %	0 %	429504161
14132	NC_019842	AGA	2	6	662155	662160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504161
14133	NC_019842	GAAA	2	8	662185	662192	75 %	0 %	25 %	0 %	429504161
14134	NC_019842	CGG	3	9	662194	662202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504161
14135	NC_019842	TTC	2	6	662229	662234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429504161
14136	NC_019842	GAA	2	6	662282	662287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504161
14137	NC_019842	GGA	2	6	662323	662328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429504161
14138	NC_019842	CGATC	2	10	662347	662356	20 %	20 %	20 %	40 %	429504161
14139	NC_019842	GCT	2	6	662362	662367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504161
14140	NC_019842	CA	3	6	662380	662385	50 %	0 %	0 %	50 %	429504161
14141	NC_019842	TGA	2	6	662427	662432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504161
14142	NC_019842	A	7	7	662432	662438	100 %	0 %	0 %	0 %	429504161
14143	NC_019842	TGC	2	6	662535	662540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504162
14144	NC_019842	GCC	2	6	662543	662548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429504162
14145	NC_019842	AAT	2	6	662558	662563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429504162
14146	NC_019842	AAG	2	6	662583	662588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504162
14147	NC_019842	ATC	2	6	662664	662669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504162
14148	NC_019842	TGT	2	6	662707	662712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429504162
14149	NC_019842	CAG	2	6	662824	662829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504162
14150	NC_019842	CAT	2	6	662852	662857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504162
14151	NC_019842	A	6	6	662875	662880	100 %	0 %	0 %	0 %	429504162
14152	NC_019842	TA	3	6	662906	662911	50 %	50 %	0 %	0 %	429504162
14153	NC_019842	GCC	2	6	662962	662967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429504162
14154	NC_019842	CGT	2	6	662982	662987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504162
14155	NC_019842	GGC	2	6	663004	663009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504162
14156	NC_019842	A	6	6	663155	663160	100 %	0 %	0 %	0 %	429504162
14157	NC_019842	AAG	2	6	663175	663180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504162
14158	NC_019842	TTG	2	6	663246	663251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429504162
14159	NC_019842	GACA	2	8	663268	663275	50 %	0 %	25 %	25 %	429504162
14160	NC_019842	TCAG	2	8	663301	663308	25 %	25 %	25 %	25 %	429504162
14161	NC_019842	G	6	6	663308	663313	0 %	0 %	100 %	0 %	429504162
14162	NC_019842	CCT	2	6	663319	663324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429504162
14163	NC_019842	TTC	2	6	663402	663407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429504162
14164	NC_019842	GGA	2	6	663561	663566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429504163
14165	NC_019842	CGA	2	6	663701	663706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504163
14166	NC_019842	GCT	2	6	663722	663727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504163
14167	NC_019842	ACG	2	6	663740	663745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504163
14168	NC_019842	TCC	2	6	663784	663789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429504163
14169	NC_019842	A	6	6	663800	663805	100 %	0 %	0 %	0 %	429504163
14170	NC_019842	T	8	8	663831	663838	0 %	100 %	0 %	0 %	429504164
14171	NC_019842	TCC	2	6	663886	663891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429504164
14172	NC_019842	CGC	3	9	663939	663947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429504164
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14175	NC_019842	CAA	2	6	664247	664252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429504164
14176	NC_019842	AAG	2	6	664304	664309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504164
14177	NC_019842	TAA	2	6	664340	664345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429504164
14178	NC_019842	TGA	2	6	664362	664367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504164
14179	NC_019842	GGC	2	6	664548	664553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504164
14180	NC_019842	TTC	2	6	664557	664562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429504164
14181	NC_019842	GGC	2	6	664646	664651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504164
14182	NC_019842	T	7	7	664652	664658	0 %	100 %	0 %	0 %	429504164
14183	NC_019842	TTC	2	6	664665	664670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429504164
14184	NC_019842	ATA	2	6	664729	664734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429504164
14185	NC_019842	CGC	2	6	664739	664744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429504164
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14187	NC_019842	GCC	2	6	664794	664799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429504164
14188	NC_019842	CTT	2	6	664899	664904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429504164
14189	NC_019842	TAA	2	6	664948	664953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429504164
14190	NC_019842	CAG	2	6	664992	664997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504164
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14192	NC_019842	CTC	2	6	665058	665063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429504164
14193	NC_019842	ATA	2	6	665094	665099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429504164
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14195	NC_019842	TC	3	6	665182	665187	0 %	50 %	0 %	50 %	429504164
14196	NC_019842	TTC	2	6	665202	665207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429504164
14197	NC_019842	AATA	2	8	665221	665228	75 %	25 %	0 %	0 %	429504164
14198	NC_019842	T	6	6	665249	665254	0 %	100 %	0 %	0 %	429504164
14199	NC_019842	AT	3	6	665258	665263	50 %	50 %	0 %	0 %	429504164
14200	NC_019842	GCA	2	6	665294	665299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504164
14201	NC_019842	TTC	2	6	665307	665312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429504164
14202	NC_019842	GCG	2	6	665350	665355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504164
14203	NC_019842	ATA	2	6	665365	665370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429504164
14204	NC_019842	T	6	6	665431	665436	0 %	100 %	0 %	0 %	429504165
14205	NC_019842	CGG	2	6	665488	665493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504165
14206	NC_019842	T	7	7	665503	665509	0 %	100 %	0 %	0 %	429504165
14207	NC_019842	GGA	2	6	665591	665596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14208	NC_019842	AAC	2	6	665671	665676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429504166
14209	NC_019842	GGA	2	6	665718	665723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429504166
14210	NC_019842	GCG	2	6	665771	665776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504166
14211	NC_019842	CGA	2	6	665806	665811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504166
14212	NC_019842	GCAT	2	8	665890	665897	25 %	25 %	25 %	25 %	429504166
14213	NC_019842	GGA	2	6	665936	665941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429504166
14214	NC_019842	GGC	2	6	665984	665989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504166
14215	NC_019842	AGA	2	6	666023	666028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504166
14216	NC_019842	T	6	6	666076	666081	0 %	100 %	0 %	0 %	429504166
14217	NC_019842	GTCC	2	8	666149	666156	0 %	25 %	25 %	50 %	429504166
14218	NC_019842	GGC	2	6	666168	666173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504166
14219	NC_019842	CGG	2	6	666190	666195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504166
14220	NC_019842	GGC	2	6	666275	666280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504166
14221	NC_019842	CAAT	2	8	666368	666375	50 %	25 %	0 %	25 %	429504167
14222	NC_019842	CAG	2	6	666399	666404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504167
14223	NC_019842	GAC	2	6	666416	666421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504167
14224	NC_019842	GCT	2	6	666431	666436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504167
14225	NC_019842	GGCG	2	8	666443	666450	0 %	0 %	75 %	25 %	429504167
14226	NC_019842	AGC	2	6	666554	666559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504167
14227	NC_019842	TGCG	2	8	666639	666646	0 %	25 %	50 %	25 %	429504167
14228	NC_019842	TTA	2	6	666724	666729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429504167
14229	NC_019842	CAG	2	6	666797	666802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504167
14230	NC_019842	A	6	6	666806	666811	100 %	0 %	0 %	0 %	429504167
14231	NC_019842	CGGC	2	8	666844	666851	0 %	0 %	50 %	50 %	429504167
14232	NC_019842	CTA	2	6	666854	666859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504167
14233	NC_019842	A	6	6	666897	666902	100 %	0 %	0 %	0 %	429504167
14234	NC_019842	CTG	2	6	666903	666908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504167
14235	NC_019842	TGA	2	6	666929	666934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504167
14236	NC_019842	GAC	2	6	666944	666949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504167
14237	NC_019842	AGC	2	6	667063	667068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504167
14238	NC_019842	CGT	2	6	667094	667099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504167
14239	NC_019842	TCCTT	2	10	667153	667162	0 %	60 %	0 %	40 %	429504167
14240	NC_019842	CAA	2	6	667216	667221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429504167
14241	NC_019842	GGC	2	6	667235	667240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504167
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14484	NC_019842	GGC	2	6	678766	678771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504175
14485	NC_019842	A	6	6	678779	678784	100 %	0 %	0 %	0 %	429504175
14486	NC_019842	CG	3	6	678901	678906	0 %	0 %	50 %	50 %	429504175
14487	NC_019842	CCG	2	6	678958	678963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429504175
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14490	NC_019842	A	6	6	678994	678999	100 %	0 %	0 %	0 %	429504175
14491	NC_019842	A	9	9	679004	679012	100 %	0 %	0 %	0 %	429504175
14492	NC_019842	GCC	2	6	679016	679021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14493	NC_019842	GCT	2	6	679031	679036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14495	NC_019842	CTGC	2	8	679129	679136	0 %	25 %	25 %	50 %	429504176
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