MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum AS43.3 chromosome

Total Repeats: 84908

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_019842	AATCCC	2	12	610597	610608	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	429504115
13003	NC_019842	AATC	2	8	610620	610627	50 %	25 %	0 %	25 %	429504115
13004	NC_019842	GATTC	2	10	610644	610653	20 %	40 %	20 %	20 %	429504115
13005	NC_019842	TC	3	6	610668	610673	0 %	50 %	0 %	50 %	429504115
13006	NC_019842	ACA	2	6	610683	610688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429504115
13007	NC_019842	TAA	2	6	610703	610708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429504115
13008	NC_019842	TAG	2	6	610709	610714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504115
13009	NC_019842	T	6	6	610836	610841	0 %	100 %	0 %	0 %	429504115
13010	NC_019842	CGC	2	6	610842	610847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429504115
13011	NC_019842	GCG	2	6	610853	610858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504115
13012	NC_019842	CTT	2	6	610893	610898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429504115
13013	NC_019842	CGC	2	6	610926	610931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429504115
13014	NC_019842	AGA	2	6	610937	610942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504115
13015	NC_019842	TGC	2	6	610996	611001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504115
13016	NC_019842	T	6	6	611005	611010	0 %	100 %	0 %	0 %	429504115
13017	NC_019842	CAG	2	6	611029	611034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504115
13018	NC_019842	GTC	2	6	611068	611073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504115
13019	NC_019842	GC	3	6	611082	611087	0 %	0 %	50 %	50 %	429504115
13020	NC_019842	GT	3	6	611201	611206	0 %	50 %	50 %	0 %	429504115
13021	NC_019842	CGG	2	6	611229	611234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504115
13022	NC_019842	ATTCG	2	10	611247	611256	20 %	40 %	20 %	20 %	429504115
13023	NC_019842	GAT	2	6	611296	611301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504115
13024	NC_019842	TGT	2	6	611321	611326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429504115
13025	NC_019842	ATA	2	6	611467	611472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429504115
13026	NC_019842	CTT	2	6	611493	611498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429504115
13027	NC_019842	TAC	2	6	611571	611576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504115
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13029	NC_019842	T	6	6	611673	611678	0 %	100 %	0 %	0 %	429504115
13030	NC_019842	AAAGC	2	10	611698	611707	60 %	0 %	20 %	20 %	429504115
13031	NC_019842	GT	3	6	611724	611729	0 %	50 %	50 %	0 %	429504115
13032	NC_019842	AAT	2	6	611780	611785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429504115
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13034	NC_019842	CGG	2	6	611883	611888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504115
13035	NC_019842	ATTC	2	8	611901	611908	25 %	50 %	0 %	25 %	429504115
13036	NC_019842	GCT	2	6	611934	611939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504115
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13038	NC_019842	A	6	6	612001	612006	100 %	0 %	0 %	0 %	429504115
13039	NC_019842	GCC	2	6	612047	612052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429504115
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13042	NC_019842	GAC	2	6	612229	612234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504115
13043	NC_019842	TTGA	2	8	612248	612255	25 %	50 %	25 %	0 %	429504115
13044	NC_019842	A	6	6	612302	612307	100 %	0 %	0 %	0 %	429504115
13045	NC_019842	GAT	2	6	612346	612351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504115
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13047	NC_019842	GCT	2	6	612398	612403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504115
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13052	NC_019842	GTG	2	6	612731	612736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429504115
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13054	NC_019842	CGT	2	6	612816	612821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504115
13055	NC_019842	TA	3	6	612913	612918	50 %	50 %	0 %	0 %	429504115
13056	NC_019842	T	6	6	612930	612935	0 %	100 %	0 %	0 %	429504115
13057	NC_019842	GAT	2	6	612966	612971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504115
13058	NC_019842	CAG	2	6	612997	613002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504115
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13060	NC_019842	T	6	6	613080	613085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13061	NC_019842	A	6	6	613093	613098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13062	NC_019842	CAG	2	6	613129	613134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13064	NC_019842	GCG	2	6	613269	613274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504116
13065	NC_019842	GA	3	6	613289	613294	50 %	0 %	50 %	0 %	429504116
13066	NC_019842	ATCA	2	8	613326	613333	50 %	25 %	0 %	25 %	429504116
13067	NC_019842	TGA	2	6	613334	613339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504116
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13072	NC_019842	AT	3	6	613631	613636	50 %	50 %	0 %	0 %	429504116
13073	NC_019842	T	6	6	613657	613662	0 %	100 %	0 %	0 %	429504116
13074	NC_019842	TTGA	2	8	613698	613705	25 %	50 %	25 %	0 %	429504116
13075	NC_019842	GCG	3	9	613806	613814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504116
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13082	NC_019842	AT	3	6	614113	614118	50 %	50 %	0 %	0 %	429504116
13083	NC_019842	GAATT	2	10	614155	614164	40 %	40 %	20 %	0 %	429504116
13084	NC_019842	AATG	2	8	614262	614269	50 %	25 %	25 %	0 %	429504116
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13089	NC_019842	TTA	2	6	614500	614505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429504117
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13093	NC_019842	GGA	2	6	614829	614834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429504117
13094	NC_019842	ACGG	2	8	614835	614842	25 %	0 %	50 %	25 %	429504117
13095	NC_019842	GAC	3	9	614847	614855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504117
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13101	NC_019842	A	7	7	615045	615051	100 %	0 %	0 %	0 %	429504117
13102	NC_019842	GTT	2	6	615219	615224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429504117
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13109	NC_019842	GCTT	2	8	615420	615427	0 %	50 %	25 %	25 %	429504117
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13113	NC_019842	TAT	2	6	615666	615671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429504117
13114	NC_019842	A	8	8	615698	615705	100 %	0 %	0 %	0 %	429504117
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13117	NC_019842	TAA	2	6	615832	615837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13118	NC_019842	CGG	2	6	615956	615961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504118
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13120	NC_019842	GTTT	2	8	616130	616137	0 %	75 %	25 %	0 %	429504118
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13122	NC_019842	GAT	2	6	616203	616208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504118
13123	NC_019842	GGAAG	2	10	616369	616378	40 %	0 %	60 %	0 %	429504118
13124	NC_019842	A	7	7	616403	616409	100 %	0 %	0 %	0 %	429504118
13125	NC_019842	ATC	2	6	616458	616463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504118
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13133	NC_019842	GAT	2	6	616692	616697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504118
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13136	NC_019842	TTTA	2	8	616865	616872	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13137	NC_019842	TACA	2	8	616941	616948	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13138	NC_019842	CTG	3	9	616985	616993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13154	NC_019842	GGAAA	2	10	617753	617762	60 %	0 %	40 %	0 %	429504120
13155	NC_019842	GACT	2	8	617779	617786	25 %	25 %	25 %	25 %	429504120
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13161	NC_019842	GA	3	6	618206	618211	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13162	NC_019842	GCG	2	6	618246	618251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504121
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13227	NC_019842	TGC	2	6	621169	621174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504124
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13230	NC_019842	GAT	2	6	621366	621371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504124
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13232	NC_019842	GAGG	2	8	621467	621474	25 %	0 %	75 %	0 %	429504124
13233	NC_019842	TGTT	2	8	621546	621553	0 %	75 %	25 %	0 %	429504124
13234	NC_019842	T	6	6	621566	621571	0 %	100 %	0 %	0 %	429504124
13235	NC_019842	ATTTG	2	10	621609	621618	20 %	60 %	20 %	0 %	429504124
13236	NC_019842	TTCT	2	8	621627	621634	0 %	75 %	0 %	25 %	429504124
13237	NC_019842	T	6	6	621659	621664	0 %	100 %	0 %	0 %	429504124
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13240	NC_019842	TCT	2	6	621691	621696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429504124
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13243	NC_019842	T	8	8	621783	621790	0 %	100 %	0 %	0 %	429504124
13244	NC_019842	GCC	2	6	621810	621815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429504124
13245	NC_019842	GGC	2	6	621831	621836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504124
13246	NC_019842	CTG	2	6	621859	621864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504124
13247	NC_019842	TTCCA	2	10	621880	621889	20 %	40 %	0 %	40 %	429504124
13248	NC_019842	GCG	2	6	621909	621914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504124
13249	NC_019842	GCT	2	6	622146	622151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504124
13250	NC_019842	GCC	2	6	622206	622211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429504124
13251	NC_019842	AGC	3	9	622255	622263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504124
13252	NC_019842	AGC	2	6	622272	622277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504124
13253	NC_019842	TGC	2	6	622307	622312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504124
13254	NC_019842	CTAAAG	2	12	622352	622363	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	429504124
13255	NC_019842	TAA	2	6	622405	622410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429504124
13256	NC_019842	CCG	2	6	622426	622431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429504124
13257	NC_019842	CAT	2	6	622440	622445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504124
13258	NC_019842	AGC	2	6	622531	622536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504124
13259	NC_019842	TTC	2	6	622563	622568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429504124
13260	NC_019842	T	6	6	622588	622593	0 %	100 %	0 %	0 %	429504124
13261	NC_019842	TGA	2	6	622633	622638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504124
13262	NC_019842	ACC	2	6	622646	622651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429504124
13263	NC_019842	A	6	6	622664	622669	100 %	0 %	0 %	0 %	429504124
13264	NC_019842	GAG	2	6	622672	622677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429504124
13265	NC_019842	CGT	2	6	622737	622742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504124
13266	NC_019842	GCC	2	6	622759	622764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429504124
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13268	NC_019842	ATA	2	6	622840	622845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429504124
13269	NC_019842	A	6	6	622872	622877	100 %	0 %	0 %	0 %	429504124
13270	NC_019842	CCG	2	6	622897	622902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429504124
13271	NC_019842	GAT	2	6	622922	622927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504124
13272	NC_019842	TCCA	2	8	622962	622969	25 %	25 %	0 %	50 %	429504124
13273	NC_019842	TGTC	2	8	623000	623007	0 %	50 %	25 %	25 %	429504124
13274	NC_019842	TCC	2	6	623015	623020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13275	NC_019842	AAT	2	6	623021	623026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13276	NC_019842	A	6	6	623132	623137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13277	NC_019842	TGAA	2	8	623138	623145	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13278	NC_019842	GAAA	2	8	623233	623240	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13279	NC_019842	A	6	6	623238	623243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13280	NC_019842	T	8	8	623268	623275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13281	NC_019842	CTTT	2	8	623276	623283	0 %	75 %	0 %	25 %	429504125
13282	NC_019842	AGC	2	6	623307	623312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504125
13283	NC_019842	AT	3	6	623355	623360	50 %	50 %	0 %	0 %	429504125
13284	NC_019842	ATC	3	9	623462	623470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504125
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13287	NC_019842	TGA	2	6	623539	623544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504125
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13300	NC_019842	TCC	2	6	624152	624157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429504126
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13306	NC_019842	GCT	2	6	624679	624684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13309	NC_019842	A	7	7	624772	624778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13310	NC_019842	CTT	2	6	624887	624892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429504127
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13313	NC_019842	CTG	2	6	624935	624940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504127
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13332	NC_019842	GTA	2	6	626072	626077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13333	NC_019842	TA	3	6	626094	626099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13334	NC_019842	CGT	2	6	626116	626121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13335	NC_019842	TCA	2	6	626134	626139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13336	NC_019842	TCT	2	6	626181	626186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13337	NC_019842	AGG	2	6	626218	626223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13341	NC_019842	A	6	6	626373	626378	100 %	0 %	0 %	0 %	429504128
13342	NC_019842	ATG	2	6	626491	626496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504128
13343	NC_019842	GA	3	6	626654	626659	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13344	NC_019842	GAA	3	9	626668	626676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504129
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13352	NC_019842	AGA	2	6	626985	626990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504129
13353	NC_019842	ATTT	2	8	627053	627060	25 %	75 %	0 %	0 %	429504129
13354	NC_019842	TTTGA	2	10	627104	627113	20 %	60 %	20 %	0 %	429504129
13355	NC_019842	AAACG	2	10	627114	627123	60 %	0 %	20 %	20 %	429504129
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13359	NC_019842	ATT	2	6	627216	627221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429504129
13360	NC_019842	A	6	6	627240	627245	100 %	0 %	0 %	0 %	429504129
13361	NC_019842	CGA	2	6	627282	627287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504129
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13365	NC_019842	A	6	6	627458	627463	100 %	0 %	0 %	0 %	429504129
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13367	NC_019842	GCA	2	6	627537	627542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504129
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13462	NC_019842	TAT	2	6	631492	631497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13482	NC_019842	ATC	2	6	632401	632406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504135
13483	NC_019842	CTGA	2	8	632449	632456	25 %	25 %	25 %	25 %	429504135
13484	NC_019842	GTC	2	6	632572	632577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504135
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13486	NC_019842	T	7	7	632767	632773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13487	NC_019842	GA	3	6	632822	632827	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13488	NC_019842	AGG	2	6	632833	632838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13489	NC_019842	AGA	2	6	632839	632844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13490	NC_019842	AGA	2	6	632856	632861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504136
13491	NC_019842	GCT	2	6	632871	632876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504136
13492	NC_019842	CAT	3	9	632904	632912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504136
13493	NC_019842	GCC	2	6	632944	632949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429504136
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13500	NC_019842	CA	3	6	633288	633293	50 %	0 %	0 %	50 %	429504136

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