MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum AS43.3 chromosome

Total Repeats: 84908

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
69001	NC_019842	TCA	2	6	3231049	3231054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429506650
69002	NC_019842	TTTG	2	8	3231055	3231062	0 %	75 %	25 %	0 %	429506650
69003	NC_019842	CCT	2	6	3231105	3231110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69004	NC_019842	GC	3	6	3231121	3231126	0 %	0 %	50 %	50 %	429506651
69005	NC_019842	TCTT	2	8	3231159	3231166	0 %	75 %	0 %	25 %	429506651
69006	NC_019842	GGC	2	6	3231209	3231214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429506651
69007	NC_019842	ATA	2	6	3231218	3231223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429506651
69008	NC_019842	CAGAA	2	10	3231224	3231233	60 %	0 %	20 %	20 %	429506651
69009	NC_019842	ATG	2	6	3231399	3231404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429506651
69010	NC_019842	C	6	6	3231419	3231424	0 %	0 %	0 %	100 %	429506651
69011	NC_019842	GCC	2	6	3231444	3231449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429506651
69012	NC_019842	TGA	2	6	3231487	3231492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429506651
69013	NC_019842	GCT	2	6	3231512	3231517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429506651
69014	NC_019842	ATG	2	6	3231627	3231632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429506651
69015	NC_019842	A	6	6	3231645	3231650	100 %	0 %	0 %	0 %	429506651
69016	NC_019842	AGC	2	6	3231714	3231719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429506651
69017	NC_019842	AT	3	6	3231754	3231759	50 %	50 %	0 %	0 %	429506651
69018	NC_019842	CT	3	6	3231845	3231850	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69019	NC_019842	AAT	2	6	3231875	3231880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429506652
69020	NC_019842	TCA	2	6	3231922	3231927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429506652
69021	NC_019842	TCA	2	6	3231955	3231960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429506652
69022	NC_019842	CCG	2	6	3232018	3232023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429506652
69023	NC_019842	T	6	6	3232028	3232033	0 %	100 %	0 %	0 %	429506652
69024	NC_019842	GTTTT	2	10	3232048	3232057	0 %	80 %	20 %	0 %	429506652
69025	NC_019842	TCG	2	6	3232085	3232090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429506652
69026	NC_019842	T	6	6	3232185	3232190	0 %	100 %	0 %	0 %	429506652
69027	NC_019842	GC	3	6	3232199	3232204	0 %	0 %	50 %	50 %	429506652
69028	NC_019842	CTTTC	2	10	3232233	3232242	0 %	60 %	0 %	40 %	429506652
69029	NC_019842	GTT	2	6	3232302	3232307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429506652
69030	NC_019842	TTGA	2	8	3232317	3232324	25 %	50 %	25 %	0 %	429506652
69031	NC_019842	T	6	6	3232332	3232337	0 %	100 %	0 %	0 %	429506652
69032	NC_019842	CGT	2	6	3232484	3232489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429506652
69033	NC_019842	ATC	2	6	3232509	3232514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429506652
69034	NC_019842	GTGCCG	2	12	3232540	3232551	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	429506652
69035	NC_019842	TTC	2	6	3232561	3232566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429506652
69036	NC_019842	GCC	2	6	3232588	3232593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429506652
69037	NC_019842	CGC	2	6	3232604	3232609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429506652
69038	NC_019842	CGC	2	6	3232620	3232625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429506652
69039	NC_019842	ATGAC	2	10	3232643	3232652	40 %	20 %	20 %	20 %	429506652
69040	NC_019842	ATT	2	6	3232695	3232700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429506653
69041	NC_019842	AAT	2	6	3232719	3232724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429506653
69042	NC_019842	CAG	2	6	3232852	3232857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429506653
69043	NC_019842	ACCG	2	8	3232864	3232871	25 %	0 %	25 %	50 %	429506653
69044	NC_019842	T	6	6	3232872	3232877	0 %	100 %	0 %	0 %	429506653
69045	NC_019842	TGC	2	6	3232974	3232979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429506653
69046	NC_019842	TGT	2	6	3233022	3233027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429506653
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69048	NC_019842	CGA	2	6	3233064	3233069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429506653
69049	NC_019842	GT	3	6	3233099	3233104	0 %	50 %	50 %	0 %	429506653
69050	NC_019842	AGT	2	6	3233145	3233150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429506653
69051	NC_019842	CGC	2	6	3233412	3233417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429506653
69052	NC_019842	AGC	2	6	3233465	3233470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429506653
69053	NC_019842	T	7	7	3233497	3233503	0 %	100 %	0 %	0 %	429506653
69054	NC_019842	TCA	2	6	3233570	3233575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429506654
69055	NC_019842	GC	3	6	3233661	3233666	0 %	0 %	50 %	50 %	429506654
69056	NC_019842	GCA	2	6	3233708	3233713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429506654
69057	NC_019842	TCC	2	6	3233719	3233724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429506654
69058	NC_019842	TGC	2	6	3233741	3233746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429506654
69059	NC_019842	TGCCC	2	10	3233750	3233759	0 %	20 %	20 %	60 %	429506654
69060	NC_019842	ACC	2	6	3233783	3233788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429506654
69061	NC_019842	CCGT	2	8	3233859	3233866	0 %	25 %	25 %	50 %	429506654
69062	NC_019842	ACG	2	6	3233878	3233883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429506654
69063	NC_019842	CAG	2	6	3233982	3233987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429506654
69064	NC_019842	AT	3	6	3234067	3234072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69065	NC_019842	ATTT	2	8	3234124	3234131	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69066	NC_019842	A	7	7	3234140	3234146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69067	NC_019842	AAAGG	2	10	3234149	3234158	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
69068	NC_019842	GCC	2	6	3234256	3234261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429506655
69069	NC_019842	ACT	2	6	3234272	3234277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429506655
69070	NC_019842	CGA	2	6	3234284	3234289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429506655
69071	NC_019842	GC	3	6	3234326	3234331	0 %	0 %	50 %	50 %	429506655
69072	NC_019842	GAAGCT	2	12	3234351	3234362	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	429506655
69073	NC_019842	GGGCG	2	10	3234368	3234377	0 %	0 %	80 %	20 %	429506655
69074	NC_019842	CGGGC	2	10	3234391	3234400	0 %	0 %	60 %	40 %	429506655
69075	NC_019842	GGCC	2	8	3234459	3234466	0 %	0 %	50 %	50 %	429506655
69076	NC_019842	GAT	2	6	3234571	3234576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429506655
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69078	NC_019842	GCG	2	6	3234629	3234634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429506655
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69081	NC_019842	CAGA	2	8	3234701	3234708	50 %	0 %	25 %	25 %	429506655
69082	NC_019842	GCC	2	6	3234718	3234723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429506655
69083	NC_019842	AAGC	2	8	3234725	3234732	50 %	0 %	25 %	25 %	429506655
69084	NC_019842	AATG	2	8	3234754	3234761	50 %	25 %	25 %	0 %	429506655
69085	NC_019842	CGCC	2	8	3234773	3234780	0 %	0 %	25 %	75 %	429506655
69086	NC_019842	CAG	2	6	3234858	3234863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429506655
69087	NC_019842	ACGGCG	2	12	3234913	3234924	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	429506655
69088	NC_019842	CCG	2	6	3234982	3234987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429506655
69089	NC_019842	AGA	2	6	3235011	3235016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429506655
69090	NC_019842	CAG	2	6	3235047	3235052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429506655
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69092	NC_019842	A	7	7	3235085	3235091	100 %	0 %	0 %	0 %	429506655
69093	NC_019842	TA	3	6	3235126	3235131	50 %	50 %	0 %	0 %	429506656
69094	NC_019842	GCC	2	6	3235146	3235151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429506656
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69099	NC_019842	GACAGC	2	12	3235426	3235437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429506656
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69101	NC_019842	CTTC	2	8	3235520	3235527	0 %	50 %	0 %	50 %	429506656
69102	NC_019842	ATC	2	6	3235534	3235539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429506656
69103	NC_019842	CGC	2	6	3235568	3235573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429506656
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69105	NC_019842	CTG	2	6	3235683	3235688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429506656
69106	NC_019842	CCG	2	6	3235709	3235714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429506656
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69108	NC_019842	TTC	2	6	3235794	3235799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429506656
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69111	NC_019842	TCT	2	6	3235945	3235950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69112	NC_019842	TA	3	6	3235951	3235956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69113	NC_019842	TAT	2	6	3235992	3235997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69114	NC_019842	CTT	2	6	3236099	3236104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429506657
69115	NC_019842	CAT	2	6	3236129	3236134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429506657
69116	NC_019842	TTC	2	6	3236173	3236178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429506657
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69118	NC_019842	T	8	8	3236353	3236360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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69236	NC_019842	TCCTC	2	10	3242370	3242379	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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