MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella bronchiseptica 253

Total Repeats: 151443

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4003	NC_019382	TGG	4	12	155024	155035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337490
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4005	NC_019382	CGGC	2	8	155094	155101	0 %	0 %	50 %	50 %	412337490
4006	NC_019382	GGC	3	9	155099	155107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337490
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4013	NC_019382	GGCGG	2	10	155427	155436	0 %	0 %	80 %	20 %	412337490
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4124	NC_019382	TGG	2	6	159607	159612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337493
4125	NC_019382	GTT	2	6	159644	159649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	412337493
4126	NC_019382	GCG	2	6	159684	159689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337493
4127	NC_019382	CG	3	6	159829	159834	0 %	0 %	50 %	50 %	412337493
4128	NC_019382	GCGCC	2	10	159842	159851	0 %	0 %	40 %	60 %	412337493
4129	NC_019382	GGC	2	6	159903	159908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337493
4130	NC_019382	TTC	2	6	159921	159926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	412337493
4131	NC_019382	TACC	2	8	159962	159969	25 %	25 %	0 %	50 %	412337493
4132	NC_019382	GCG	2	6	160003	160008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337493
4133	NC_019382	CTGG	2	8	160133	160140	0 %	25 %	50 %	25 %	412337493
4134	NC_019382	GGC	2	6	160181	160186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337493
4135	NC_019382	ATGC	2	8	160220	160227	25 %	25 %	25 %	25 %	412337493
4136	NC_019382	GCG	2	6	160239	160244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337493
4137	NC_019382	GTC	2	6	160289	160294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337493
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4139	NC_019382	GCT	2	6	160365	160370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337494
4140	NC_019382	GCC	2	6	160381	160386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337494
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4143	NC_019382	GGC	2	6	160665	160670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337494
4144	NC_019382	GC	3	6	160688	160693	0 %	0 %	50 %	50 %	412337494
4145	NC_019382	CG	3	6	160781	160786	0 %	0 %	50 %	50 %	412337494
4146	NC_019382	CG	4	8	160836	160843	0 %	0 %	50 %	50 %	412337494
4147	NC_019382	AGA	2	6	161009	161014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	412337494
4148	NC_019382	TTG	2	6	161017	161022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	412337494
4149	NC_019382	CGG	2	6	161078	161083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337494
4150	NC_019382	GCGCC	2	10	161119	161128	0 %	0 %	40 %	60 %	412337494
4151	NC_019382	AGC	2	6	161135	161140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337494
4152	NC_019382	CG	3	6	161188	161193	0 %	0 %	50 %	50 %	412337494
4153	NC_019382	GGT	2	6	161198	161203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337494
4154	NC_019382	CGG	3	9	161288	161296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337494
4155	NC_019382	CGTG	2	8	161316	161323	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4156	NC_019382	G	6	6	161329	161334	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4157	NC_019382	CGG	2	6	161416	161421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337495
4158	NC_019382	CGGCG	2	10	161438	161447	0 %	0 %	60 %	40 %	412337495
4159	NC_019382	GAC	2	6	161485	161490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337495
4160	NC_019382	GCG	2	6	161580	161585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337495
4161	NC_019382	GAC	2	6	161600	161605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337495
4162	NC_019382	GCC	2	6	161668	161673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337495
4163	NC_019382	CGC	2	6	161681	161686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337495
4164	NC_019382	GC	4	8	161693	161700	0 %	0 %	50 %	50 %	412337495
4165	NC_019382	GGC	2	6	161759	161764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337495
4166	NC_019382	AGC	2	6	161769	161774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337495
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4169	NC_019382	TTC	2	6	161915	161920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	412337495
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4171	NC_019382	GTG	2	6	161966	161971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337495
4172	NC_019382	AGG	2	6	162000	162005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	412337495
4173	NC_019382	CAGC	2	8	162016	162023	25 %	0 %	25 %	50 %	412337495
4174	NC_019382	GA	3	6	162031	162036	50 %	0 %	50 %	0 %	412337495
4175	NC_019382	CGC	3	9	162100	162108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337495
4176	NC_019382	CTGGGC	2	12	162228	162239	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	412337496
4177	NC_019382	TCCA	2	8	162255	162262	25 %	25 %	0 %	50 %	412337496
4178	NC_019382	ATC	2	6	162325	162330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337496
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4180	NC_019382	GTAC	2	8	162430	162437	25 %	25 %	25 %	25 %	412337496
4181	NC_019382	TTC	2	6	162460	162465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	412337496
4182	NC_019382	TCC	2	6	162474	162479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	412337496
4183	NC_019382	TCA	2	6	162539	162544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337496
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4185	NC_019382	CG	3	6	162619	162624	0 %	0 %	50 %	50 %	412337496
4186	NC_019382	TCA	2	6	162668	162673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337496
4187	NC_019382	CGC	2	6	162744	162749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337496
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4189	NC_019382	TCG	2	6	162827	162832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337496
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4191	NC_019382	CAT	2	6	162937	162942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337497
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4193	NC_019382	GGA	2	6	163090	163095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	412337497
4194	NC_019382	CGT	2	6	163102	163107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337497
4195	NC_019382	GC	3	6	163133	163138	0 %	0 %	50 %	50 %	412337497
4196	NC_019382	ATCGAG	2	12	163226	163237	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	412337497
4197	NC_019382	CGC	2	6	163249	163254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337497
4198	NC_019382	CAA	2	6	163282	163287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	412337497
4199	NC_019382	CAT	2	6	163291	163296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337497
4200	NC_019382	TGGGG	2	10	163335	163344	0 %	20 %	80 %	0 %	412337497
4201	NC_019382	GC	3	6	163385	163390	0 %	0 %	50 %	50 %	412337497
4202	NC_019382	GGCCG	2	10	163402	163411	0 %	0 %	60 %	40 %	412337497
4203	NC_019382	TGC	2	6	163504	163509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337497
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4207	NC_019382	GC	3	6	163830	163835	0 %	0 %	50 %	50 %	412337497
4208	NC_019382	CGGC	2	8	163896	163903	0 %	0 %	50 %	50 %	412337497
4209	NC_019382	GCG	2	6	163956	163961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337497
4210	NC_019382	CTG	2	6	164018	164023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337497
4211	NC_019382	GAC	2	6	164065	164070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337497
4212	NC_019382	TGGG	2	8	164097	164104	0 %	25 %	75 %	0 %	412337497
4213	NC_019382	GGA	2	6	164134	164139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	412337497
4214	NC_019382	CGC	2	6	164149	164154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337497
4215	NC_019382	ACG	2	6	164245	164250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4216	NC_019382	CAT	2	6	164486	164491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337498
4217	NC_019382	CGG	2	6	164518	164523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337498
4218	NC_019382	GGCGC	2	10	164581	164590	0 %	0 %	60 %	40 %	412337498
4219	NC_019382	CGA	2	6	164705	164710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337498
4220	NC_019382	GC	3	6	164723	164728	0 %	0 %	50 %	50 %	412337498
4221	NC_019382	CGGC	2	8	164734	164741	0 %	0 %	50 %	50 %	412337498
4222	NC_019382	GGTCC	2	10	164754	164763	0 %	20 %	40 %	40 %	412337498
4223	NC_019382	GGCC	2	8	164811	164818	0 %	0 %	50 %	50 %	412337498
4224	NC_019382	CGG	2	6	164822	164827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337498
4225	NC_019382	CCG	2	6	164828	164833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337498
4226	NC_019382	CGG	2	6	164930	164935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337498
4227	NC_019382	GGT	2	6	165024	165029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337498
4228	NC_019382	TGGCG	2	10	165062	165071	0 %	20 %	60 %	20 %	412337498
4229	NC_019382	CAG	3	9	165144	165152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337498
4230	NC_019382	GGT	3	9	165180	165188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337498
4231	NC_019382	GAC	2	6	165189	165194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337498
4232	NC_019382	CCA	2	6	165206	165211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412337498
4233	NC_019382	GTA	2	6	165267	165272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412337498
4234	NC_019382	GTGG	2	8	165276	165283	0 %	25 %	75 %	0 %	412337498
4235	NC_019382	GC	3	6	165286	165291	0 %	0 %	50 %	50 %	412337498
4236	NC_019382	CGG	2	6	165311	165316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337498
4237	NC_019382	CGA	2	6	165317	165322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337498
4238	NC_019382	GAT	2	6	165345	165350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412337498
4239	NC_019382	GC	3	6	165363	165368	0 %	0 %	50 %	50 %	412337498
4240	NC_019382	CGG	2	6	165392	165397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337498
4241	NC_019382	GTC	3	9	165399	165407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337498
4242	NC_019382	CGG	2	6	165443	165448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337498
4243	NC_019382	GC	3	6	165453	165458	0 %	0 %	50 %	50 %	412337498
4244	NC_019382	CCGGG	2	10	165515	165524	0 %	0 %	60 %	40 %	412337498
4245	NC_019382	GAC	2	6	165540	165545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337498
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4247	NC_019382	GGT	2	6	165594	165599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337498
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4369	NC_019382	TGT	2	6	170106	170111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4370	NC_019382	CGG	2	6	170119	170124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4371	NC_019382	GC	3	6	170158	170163	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4372	NC_019382	GC	3	6	170174	170179	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4373	NC_019382	GGA	2	6	170180	170185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4384	NC_019382	GTCG	2	8	170485	170492	0 %	25 %	50 %	25 %	412337502
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4433	NC_019382	GAC	2	6	172499	172504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337504
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4489	NC_019382	CAT	2	6	174299	174304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337505
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4491	NC_019382	GAT	2	6	174365	174370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412337505
4492	NC_019382	GC	3	6	174404	174409	0 %	0 %	50 %	50 %	412337505
4493	NC_019382	GGC	2	6	174440	174445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337505
4494	NC_019382	CCG	2	6	174454	174459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337505
4495	NC_019382	GGCC	2	8	174485	174492	0 %	0 %	50 %	50 %	412337505
4496	NC_019382	CCG	2	6	174535	174540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337505
4497	NC_019382	CAG	2	6	174594	174599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337505
4498	NC_019382	CCG	2	6	174654	174659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337505
4499	NC_019382	CAG	2	6	174669	174674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337505
4500	NC_019382	TCG	2	6	174676	174681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337505

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