MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella bronchiseptica 253

Total Repeats: 151443

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30118	NC_019382	ATCGCC	2	12	1018185	1018196	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	412338278
30119	NC_019382	TTC	2	6	1018203	1018208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	412338278
30120	NC_019382	CGG	2	6	1018334	1018339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412338278
30121	NC_019382	GC	3	6	1018348	1018353	0 %	0 %	50 %	50 %	412338278
30122	NC_019382	GTCG	2	8	1018388	1018395	0 %	25 %	50 %	25 %	412338278
30123	NC_019382	GC	3	6	1018417	1018422	0 %	0 %	50 %	50 %	412338278
30124	NC_019382	GCC	2	6	1018438	1018443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412338278
30125	NC_019382	CTA	2	6	1018463	1018468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412338278
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30127	NC_019382	GGGC	2	8	1018698	1018705	0 %	0 %	75 %	25 %	412338278
30128	NC_019382	GC	4	8	1018709	1018716	0 %	0 %	50 %	50 %	412338278
30129	NC_019382	CGC	2	6	1018733	1018738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412338278
30130	NC_019382	GGCG	2	8	1018760	1018767	0 %	0 %	75 %	25 %	412338278
30131	NC_019382	GTC	2	6	1018785	1018790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412338278
30132	NC_019382	GCT	2	6	1018820	1018825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412338278
30133	NC_019382	TCA	2	6	1018843	1018848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412338278
30134	NC_019382	TCGA	2	8	1018875	1018882	25 %	25 %	25 %	25 %	412338278
30135	NC_019382	GCG	2	6	1018906	1018911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412338278
30136	NC_019382	CTG	2	6	1018947	1018952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412338278
30137	NC_019382	ATG	2	6	1019016	1019021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412338278
30138	NC_019382	CAT	2	6	1019060	1019065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412338278
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30140	NC_019382	A	6	6	1019085	1019090	100 %	0 %	0 %	0 %	412338278
30141	NC_019382	CTG	2	6	1019096	1019101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412338279
30142	NC_019382	GGC	2	6	1019129	1019134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412338279
30143	NC_019382	GC	3	6	1019137	1019142	0 %	0 %	50 %	50 %	412338279
30144	NC_019382	ACG	2	6	1019148	1019153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412338279
30145	NC_019382	ACC	2	6	1019216	1019221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412338279
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30147	NC_019382	GCCG	2	8	1019258	1019265	0 %	0 %	50 %	50 %	412338279
30148	NC_019382	CGT	2	6	1019266	1019271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412338279
30149	NC_019382	CGA	2	6	1019281	1019286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412338279
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30151	NC_019382	GC	3	6	1019415	1019420	0 %	0 %	50 %	50 %	412338279
30152	NC_019382	GC	3	6	1019443	1019448	0 %	0 %	50 %	50 %	412338279
30153	NC_019382	GC	3	6	1019467	1019472	0 %	0 %	50 %	50 %	412338279
30154	NC_019382	GAA	2	6	1019474	1019479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	412338279
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30156	NC_019382	CG	3	6	1019516	1019521	0 %	0 %	50 %	50 %	412338279
30157	NC_019382	GCC	2	6	1019534	1019539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412338279
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30160	NC_019382	TGC	3	9	1019604	1019612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412338279
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30164	NC_019382	TCG	2	6	1019751	1019756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412338279
30165	NC_019382	CCG	2	6	1019789	1019794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412338279
30166	NC_019382	CGG	2	6	1019814	1019819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412338279
30167	NC_019382	CGC	2	6	1019824	1019829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412338279
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30182	NC_019382	CGGG	2	8	1020269	1020276	0 %	0 %	75 %	25 %	412338280
30183	NC_019382	CAG	3	9	1020277	1020285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412338280
30184	NC_019382	GC	4	8	1020298	1020305	0 %	0 %	50 %	50 %	412338280
30185	NC_019382	CCTG	2	8	1020323	1020330	0 %	25 %	25 %	50 %	412338280
30186	NC_019382	CTG	3	9	1020328	1020336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412338280
30187	NC_019382	ATC	2	6	1020364	1020369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412338280
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30189	NC_019382	TGC	2	6	1020422	1020427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412338280
30190	NC_019382	GC	3	6	1020449	1020454	0 %	0 %	50 %	50 %	412338280
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30194	NC_019382	GGC	2	6	1020737	1020742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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30196	NC_019382	ACG	2	6	1020764	1020769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30197	NC_019382	CAT	2	6	1020850	1020855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412338281
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30199	NC_019382	GGC	2	6	1020865	1020870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412338281
30200	NC_019382	GC	3	6	1020878	1020883	0 %	0 %	50 %	50 %	412338281
30201	NC_019382	CAC	2	6	1020994	1020999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412338281
30202	NC_019382	CTG	2	6	1021013	1021018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412338281
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30205	NC_019382	CG	3	6	1021110	1021115	0 %	0 %	50 %	50 %	412338281
30206	NC_019382	CGT	2	6	1021123	1021128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412338281
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30214	NC_019382	CTT	2	6	1021486	1021491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	412338282
30215	NC_019382	CGCC	2	8	1021504	1021511	0 %	0 %	25 %	75 %	412338282
30216	NC_019382	ACC	2	6	1021592	1021597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412338282
30217	NC_019382	CGT	2	6	1021599	1021604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412338282
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30219	NC_019382	ACGGG	2	10	1021662	1021671	20 %	0 %	60 %	20 %	412338282
30220	NC_019382	GCC	2	6	1021680	1021685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412338282
30221	NC_019382	TCG	2	6	1021700	1021705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412338282
30222	NC_019382	CGC	2	6	1021761	1021766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412338282
30223	NC_019382	CG	3	6	1021778	1021783	0 %	0 %	50 %	50 %	412338282
30224	NC_019382	CGC	2	6	1021792	1021797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412338282
30225	NC_019382	CGT	2	6	1021845	1021850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412338282
30226	NC_019382	GCC	2	6	1021865	1021870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412338282
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30230	NC_019382	TCG	2	6	1021967	1021972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412338282
30231	NC_019382	CAC	2	6	1021984	1021989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412338282
30232	NC_019382	CG	3	6	1022086	1022091	0 %	0 %	50 %	50 %	412338282
30233	NC_019382	CCA	2	6	1022094	1022099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412338282
30234	NC_019382	GCG	2	6	1022123	1022128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412338282
30235	NC_019382	GCC	2	6	1022155	1022160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412338282
30236	NC_019382	C	6	6	1022159	1022164	0 %	0 %	0 %	100 %	412338282
30237	NC_019382	TGC	2	6	1022244	1022249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412338282
30238	NC_019382	CGC	2	6	1022260	1022265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412338282
30239	NC_019382	GCGCG	2	10	1022275	1022284	0 %	0 %	60 %	40 %	412338282
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30241	NC_019382	GCCG	2	8	1022322	1022329	0 %	0 %	50 %	50 %	412338282
30242	NC_019382	CGCAG	2	10	1022331	1022340	20 %	0 %	40 %	40 %	412338282
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30245	NC_019382	GGC	2	6	1022477	1022482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412338282
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30247	NC_019382	GC	3	6	1022496	1022501	0 %	0 %	50 %	50 %	412338282
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30249	NC_019382	CGC	2	6	1022563	1022568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412338282
30250	NC_019382	TAAT	3	12	1022625	1022636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30251	NC_019382	ATT	2	6	1022648	1022653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30252	NC_019382	CGCC	2	8	1022693	1022700	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
30253	NC_019382	CAT	2	6	1022852	1022857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412338283
30254	NC_019382	CGC	2	6	1022927	1022932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412338283
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30258	NC_019382	CG	4	8	1023017	1023024	0 %	0 %	50 %	50 %	412338283
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30263	NC_019382	ATC	2	6	1023093	1023098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412338283
30264	NC_019382	GATCGA	2	12	1023128	1023139	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	412338283
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30274	NC_019382	CCG	2	6	1023540	1023545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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30276	NC_019382	CCG	2	6	1023589	1023594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30277	NC_019382	GGC	2	6	1023601	1023606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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30280	NC_019382	CG	3	6	1023734	1023739	0 %	0 %	50 %	50 %	412338285
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30297	NC_019382	GGC	2	6	1024335	1024340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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30310	NC_019382	GCT	2	6	1025328	1025333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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30330	NC_019382	GC	3	6	1026389	1026394	0 %	0 %	50 %	50 %	412338288
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30334	NC_019382	TGCT	2	8	1026533	1026540	0 %	50 %	25 %	25 %	412338288
30335	NC_019382	TCG	2	6	1026545	1026550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412338288
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30339	NC_019382	TCG	2	6	1026632	1026637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412338288
30340	NC_019382	CGCCGG	2	12	1026645	1026656	0 %	0 %	50 %	50 %	412338288
30341	NC_019382	TCG	2	6	1026701	1026706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412338288
30342	NC_019382	CGCGCA	2	12	1026723	1026734	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	412338288
30343	NC_019382	TGG	3	9	1026759	1026767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412338288
30344	NC_019382	CGATTT	2	12	1026822	1026833	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	412338288
30345	NC_019382	CG	3	6	1026840	1026845	0 %	0 %	50 %	50 %	412338288
30346	NC_019382	CAG	2	6	1026847	1026852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412338288
30347	NC_019382	GGT	2	6	1026895	1026900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412338288
30348	NC_019382	GGT	2	6	1026922	1026927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412338288
30349	NC_019382	CGGCCT	2	12	1026933	1026944	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	412338288
30350	NC_019382	TCG	3	9	1026956	1026964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412338288
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30352	NC_019382	TGA	2	6	1027056	1027061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412338288
30353	NC_019382	GTC	2	6	1027090	1027095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412338288
30354	NC_019382	GCT	2	6	1027158	1027163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412338288
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30381	NC_019382	GCCCT	2	10	1027926	1027935	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
30382	NC_019382	GCT	2	6	1027938	1027943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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30468	NC_019382	TGA	2	6	1031129	1031134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412338291
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30470	NC_019382	GCT	2	6	1031184	1031189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412338291
30471	NC_019382	CGC	3	9	1031249	1031257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412338291
30472	NC_019382	GC	3	6	1031256	1031261	0 %	0 %	50 %	50 %	412338291
30473	NC_019382	GGT	2	6	1031330	1031335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412338291
30474	NC_019382	GCC	2	6	1031422	1031427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30475	NC_019382	CGG	2	6	1031442	1031447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30476	NC_019382	AAT	2	6	1031455	1031460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30479	NC_019382	GC	3	6	1031609	1031614	0 %	0 %	50 %	50 %	412338292
30480	NC_019382	CGCCTG	2	12	1031687	1031698	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	412338292
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30491	NC_019382	TGC	2	6	1032070	1032075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412338292
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30495	NC_019382	CTG	2	6	1032155	1032160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412338292
30496	NC_019382	TCG	2	6	1032318	1032323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412338292
30497	NC_019382	GCGCG	2	10	1032360	1032369	0 %	0 %	60 %	40 %	412338292
30498	NC_019382	GC	3	6	1032434	1032439	0 %	0 %	50 %	50 %	412338292
30499	NC_019382	CG	3	6	1032442	1032447	0 %	0 %	50 %	50 %	412338292
30500	NC_019382	GGCC	2	8	1032523	1032530	0 %	0 %	50 %	50 %	412338292

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