MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella bronchiseptica 253

Total Repeats: 151443

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24003	NC_019382	CG	4	8	805676	805683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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24005	NC_019382	GC	3	6	805719	805724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24006	NC_019382	TCC	2	6	805753	805758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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24123	NC_019382	CTC	2	6	810710	810715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24124	NC_019382	TCG	2	6	810749	810754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24125	NC_019382	GCT	2	6	810759	810764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24126	NC_019382	TA	3	6	810850	810855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24127	NC_019382	TTA	2	6	810872	810877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24128	NC_019382	CGG	2	6	811014	811019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412338097
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24130	NC_019382	CGC	2	6	811048	811053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412338097
24131	NC_019382	GCCA	2	8	811061	811068	25 %	0 %	25 %	50 %	412338097
24132	NC_019382	GCC	2	6	811085	811090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412338097
24133	NC_019382	GCC	2	6	811130	811135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412338097
24134	NC_019382	AGC	2	6	811179	811184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412338097
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24136	NC_019382	TAC	2	6	811277	811282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412338097
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24138	NC_019382	CCGA	2	8	811308	811315	25 %	0 %	25 %	50 %	412338097
24139	NC_019382	GCC	2	6	811319	811324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412338097
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24143	NC_019382	GGCC	2	8	811462	811469	0 %	0 %	50 %	50 %	412338097
24144	NC_019382	GCCG	2	8	811471	811478	0 %	0 %	50 %	50 %	412338097
24145	NC_019382	GC	3	6	811498	811503	0 %	0 %	50 %	50 %	412338097
24146	NC_019382	GCCCG	2	10	811525	811534	0 %	0 %	40 %	60 %	412338097
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24151	NC_019382	GCT	2	6	811689	811694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412338098
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24154	NC_019382	GCC	2	6	811726	811731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412338098
24155	NC_019382	CGCCC	2	10	811734	811743	0 %	0 %	20 %	80 %	412338098
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24164	NC_019382	CTGG	2	8	812076	812083	0 %	25 %	50 %	25 %	412338098
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24179	NC_019382	A	7	7	812628	812634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24180	NC_019382	GGCC	2	8	812635	812642	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24181	NC_019382	GC	3	6	812650	812655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24182	NC_019382	TTC	2	6	812670	812675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24183	NC_019382	GTC	2	6	812734	812739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412338099
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24188	NC_019382	TCG	2	6	812870	812875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412338099
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24200	NC_019382	CTG	2	6	813151	813156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412338099
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24210	NC_019382	TACC	2	8	813582	813589	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24211	NC_019382	TTGC	2	8	813642	813649	0 %	50 %	25 %	25 %	412338101
24212	NC_019382	CCTC	2	8	813693	813700	0 %	25 %	0 %	75 %	412338101
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24222	NC_019382	GC	3	6	814125	814130	0 %	0 %	50 %	50 %	412338101
24223	NC_019382	GCC	2	6	814210	814215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412338101
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24227	NC_019382	GC	3	6	814406	814411	0 %	0 %	50 %	50 %	412338101
24228	NC_019382	AGA	2	6	814456	814461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	412338101
24229	NC_019382	AGA	2	6	814495	814500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	412338101
24230	NC_019382	CAC	2	6	814667	814672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412338101
24231	NC_019382	TGG	2	6	814675	814680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412338101
24232	NC_019382	AGTTCC	2	12	814702	814713	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	412338101
24233	NC_019382	CG	3	6	814717	814722	0 %	0 %	50 %	50 %	412338101
24234	NC_019382	CAC	2	6	814728	814733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412338101
24235	NC_019382	CACC	2	8	814808	814815	25 %	0 %	0 %	75 %	412338101
24236	NC_019382	GCT	2	6	814829	814834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412338101
24237	NC_019382	CG	3	6	814948	814953	0 %	0 %	50 %	50 %	412338101
24238	NC_019382	CCAT	2	8	814981	814988	25 %	25 %	0 %	50 %	412338101
24239	NC_019382	CGC	2	6	815012	815017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412338101
24240	NC_019382	CAG	2	6	815057	815062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412338101
24241	NC_019382	ATC	2	6	815079	815084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412338101
24242	NC_019382	GAG	2	6	815184	815189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	412338101
24243	NC_019382	GAT	2	6	815225	815230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412338101
24244	NC_019382	CGA	2	6	815258	815263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412338101
24245	NC_019382	GC	3	6	815283	815288	0 %	0 %	50 %	50 %	412338101
24246	NC_019382	CG	3	6	815305	815310	0 %	0 %	50 %	50 %	412338101
24247	NC_019382	GTG	2	6	815355	815360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412338101
24248	NC_019382	GCG	2	6	815363	815368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412338101
24249	NC_019382	CCA	2	6	815395	815400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412338101
24250	NC_019382	GCC	3	9	815403	815411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412338101
24251	NC_019382	GC	4	8	815430	815437	0 %	0 %	50 %	50 %	412338101
24252	NC_019382	TGC	2	6	815490	815495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412338101
24253	NC_019382	CAT	2	6	815516	815521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412338101
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24255	NC_019382	CG	5	10	815589	815598	0 %	0 %	50 %	50 %	412338101
24256	NC_019382	GCG	2	6	815686	815691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412338101
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24262	NC_019382	CGC	2	6	815892	815897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24263	NC_019382	TGC	2	6	815908	815913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412338102
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24265	NC_019382	CGGC	2	8	815957	815964	0 %	0 %	50 %	50 %	412338102
24266	NC_019382	CGT	2	6	815969	815974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412338102
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24280	NC_019382	CTG	2	6	816366	816371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412338102
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24288	NC_019382	CCTGGC	2	12	816748	816759	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	412338103
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24322	NC_019382	ATC	2	6	818205	818210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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24325	NC_019382	GGCC	2	8	818332	818339	0 %	0 %	50 %	50 %	412338105
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24330	NC_019382	AGCC	2	8	818455	818462	25 %	0 %	25 %	50 %	412338105
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24333	NC_019382	CTG	2	6	818558	818563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412338105
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24351	NC_019382	ACC	2	6	819015	819020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412338105
24352	NC_019382	TCG	2	6	819065	819070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412338105
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24355	NC_019382	GC	4	8	819129	819136	0 %	0 %	50 %	50 %	412338105
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24357	NC_019382	GCT	2	6	819148	819153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412338105
24358	NC_019382	CTGCG	2	10	819179	819188	0 %	20 %	40 %	40 %	412338105
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24360	NC_019382	GGCCG	2	10	819339	819348	0 %	0 %	60 %	40 %	412338106
24361	NC_019382	CCT	2	6	819352	819357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	412338106
24362	NC_019382	CCG	2	6	819358	819363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412338106
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24364	NC_019382	CGG	2	6	819389	819394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412338106
24365	NC_019382	GC	3	6	819442	819447	0 %	0 %	50 %	50 %	412338106
24366	NC_019382	CGC	2	6	819479	819484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412338106
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24392	NC_019382	CG	3	6	820400	820405	0 %	0 %	50 %	50 %	412338106
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24438	NC_019382	GCCG	2	8	821994	822001	0 %	0 %	50 %	50 %	412338106
24439	NC_019382	TCA	2	6	822017	822022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412338106
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24465	NC_019382	CGGC	2	8	822779	822786	0 %	0 %	50 %	50 %	412338106
24466	NC_019382	CAG	2	6	822810	822815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412338106
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24469	NC_019382	CGCCC	2	10	823000	823009	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
24470	NC_019382	GGCG	2	8	823010	823017	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24471	NC_019382	CG	3	6	823016	823021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24472	NC_019382	ATG	2	6	823029	823034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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24474	NC_019382	CG	3	6	823057	823062	0 %	0 %	50 %	50 %	412338107
24475	NC_019382	AGCG	2	8	823084	823091	25 %	0 %	50 %	25 %	412338107
24476	NC_019382	CCG	2	6	823126	823131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412338107
24477	NC_019382	TGA	2	6	823190	823195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412338107
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24479	NC_019382	CGC	2	6	823247	823252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412338107
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24482	NC_019382	GGT	2	6	823358	823363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412338107
24483	NC_019382	GTG	2	6	823368	823373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412338107
24484	NC_019382	CGT	2	6	823385	823390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412338107
24485	NC_019382	GGCC	2	8	823409	823416	0 %	0 %	50 %	50 %	412338107
24486	NC_019382	GCC	3	9	823414	823422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412338107
24487	NC_019382	TGGC	2	8	823453	823460	0 %	25 %	50 %	25 %	412338107
24488	NC_019382	ATC	2	6	823462	823467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412338107
24489	NC_019382	GC	3	6	823496	823501	0 %	0 %	50 %	50 %	412338107
24490	NC_019382	GAA	2	6	823522	823527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	412338107
24491	NC_019382	TGC	2	6	823541	823546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412338107
24492	NC_019382	TAA	2	6	823585	823590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24493	NC_019382	TCA	2	6	823603	823608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24494	NC_019382	A	6	6	823611	823616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24495	NC_019382	CA	3	6	823617	823622	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24496	NC_019382	CGGC	2	8	823631	823638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24497	NC_019382	GCC	2	6	823665	823670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24498	NC_019382	GCC	2	6	823751	823756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412338108
24499	NC_019382	GCC	2	6	823781	823786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412338108
24500	NC_019382	CTG	2	6	823829	823834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412338108

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