MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella bronchiseptica 253

Total Repeats: 151443

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18003	NC_019382	TGC	2	6	614100	614105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337923
18004	NC_019382	CGG	2	6	614110	614115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337923
18005	NC_019382	CCAACC	2	12	614172	614183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412337923
18006	NC_019382	CTG	2	6	614195	614200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337923
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18008	NC_019382	GC	3	6	614244	614249	0 %	0 %	50 %	50 %	412337923
18009	NC_019382	TGC	2	6	614307	614312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337923
18010	NC_019382	GCG	2	6	614351	614356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337923
18011	NC_019382	TGG	2	6	614361	614366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337923
18012	NC_019382	GC	3	6	614391	614396	0 %	0 %	50 %	50 %	412337923
18013	NC_019382	TGGGCG	2	12	614397	614408	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	412337923
18014	NC_019382	GC	3	6	614409	614414	0 %	0 %	50 %	50 %	412337923
18015	NC_019382	TCGT	2	8	614417	614424	0 %	50 %	25 %	25 %	412337923
18016	NC_019382	CGCC	2	8	614457	614464	0 %	0 %	25 %	75 %	412337923
18017	NC_019382	TGG	2	6	614484	614489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337923
18018	NC_019382	CGCC	2	8	614530	614537	0 %	0 %	25 %	75 %	412337923
18019	NC_019382	GCGCT	2	10	614540	614549	0 %	20 %	40 %	40 %	412337923
18020	NC_019382	CGCGC	2	10	614550	614559	0 %	0 %	40 %	60 %	412337923
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18023	NC_019382	TCG	2	6	614634	614639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337923
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18026	NC_019382	CGGCC	2	10	614668	614677	0 %	0 %	40 %	60 %	412337923
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18029	NC_019382	CCG	2	6	614747	614752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337923
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18031	NC_019382	CG	3	6	614780	614785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18032	NC_019382	GGC	2	6	614786	614791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18033	NC_019382	TGC	3	9	614859	614867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337924
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18051	NC_019382	GCA	2	6	615448	615453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337924
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18053	NC_019382	GTG	2	6	615521	615526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337924
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18055	NC_019382	GC	3	6	615552	615557	0 %	0 %	50 %	50 %	412337924
18056	NC_019382	GC	3	6	615560	615565	0 %	0 %	50 %	50 %	412337924
18057	NC_019382	CCG	2	6	615587	615592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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18059	NC_019382	TGC	2	6	615650	615655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337925
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18104	NC_019382	CCGCG	2	10	617107	617116	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
18105	NC_019382	TGA	2	6	617144	617149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412337927
18106	NC_019382	CGGC	2	8	617179	617186	0 %	0 %	50 %	50 %	412337927
18107	NC_019382	CTTC	2	8	617195	617202	0 %	50 %	0 %	50 %	412337927
18108	NC_019382	AGC	2	6	617233	617238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337927
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18121	NC_019382	TTC	2	6	617596	617601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	412337927
18122	NC_019382	GGC	3	9	617714	617722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337927
18123	NC_019382	ATGTCG	2	12	617737	617748	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	412337927
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18129	NC_019382	CGT	2	6	617858	617863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337927
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18139	NC_019382	CAG	2	6	618209	618214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18234	NC_019382	CGGG	2	8	621695	621702	0 %	0 %	75 %	25 %	412337932
18235	NC_019382	GCCA	2	8	621704	621711	25 %	0 %	25 %	50 %	412337932
18236	NC_019382	GA	3	6	621713	621718	50 %	0 %	50 %	0 %	412337932
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18238	NC_019382	CAT	2	6	621740	621745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337932
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18240	NC_019382	CGG	2	6	621788	621793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337932
18241	NC_019382	TCG	2	6	621796	621801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337932
18242	NC_019382	GC	3	6	621944	621949	0 %	0 %	50 %	50 %	412337932
18243	NC_019382	CG	3	6	622054	622059	0 %	0 %	50 %	50 %	412337932
18244	NC_019382	TCG	2	6	622066	622071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337932
18245	NC_019382	GC	3	6	622104	622109	0 %	0 %	50 %	50 %	412337932
18246	NC_019382	CTCG	2	8	622124	622131	0 %	25 %	25 %	50 %	412337932
18247	NC_019382	GC	4	8	622184	622191	0 %	0 %	50 %	50 %	412337932
18248	NC_019382	GCC	2	6	622277	622282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337932
18249	NC_019382	GCC	2	6	622301	622306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337932
18250	NC_019382	GC	3	6	622320	622325	0 %	0 %	50 %	50 %	412337932
18251	NC_019382	GC	4	8	622332	622339	0 %	0 %	50 %	50 %	412337932
18252	NC_019382	CGCC	2	8	622370	622377	0 %	0 %	25 %	75 %	412337933
18253	NC_019382	CTG	2	6	622378	622383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337933
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18256	NC_019382	GCC	2	6	622415	622420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337933
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18259	NC_019382	CTG	2	6	622516	622521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337933
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18263	NC_019382	CG	3	6	622682	622687	0 %	0 %	50 %	50 %	412337933
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18266	NC_019382	CG	3	6	622752	622757	0 %	0 %	50 %	50 %	412337933
18267	NC_019382	CAGGGC	2	12	622765	622776	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	412337933
18268	NC_019382	GCTGGC	2	12	622782	622793	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	412337933
18269	NC_019382	GC	3	6	622792	622797	0 %	0 %	50 %	50 %	412337933
18270	NC_019382	GCT	2	6	622824	622829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337933
18271	NC_019382	CGA	2	6	622830	622835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337933
18272	NC_019382	CGC	2	6	622854	622859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337933
18273	NC_019382	CGG	3	9	622902	622910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337933
18274	NC_019382	CGG	3	9	622935	622943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337933
18275	NC_019382	CTGGC	2	10	623033	623042	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18276	NC_019382	GGCC	2	8	623046	623053	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18277	NC_019382	GTG	2	6	623081	623086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337934
18278	NC_019382	GCT	2	6	623128	623133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337934
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18280	NC_019382	CTG	2	6	623171	623176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337934
18281	NC_019382	GCA	2	6	623194	623199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337934
18282	NC_019382	GCG	2	6	623223	623228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337934
18283	NC_019382	GGC	2	6	623287	623292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337934
18284	NC_019382	CTGG	2	8	623296	623303	0 %	25 %	50 %	25 %	412337934
18285	NC_019382	GCT	3	9	623392	623400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337934
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18300	NC_019382	CGCC	2	8	623737	623744	0 %	0 %	25 %	75 %	412337935
18301	NC_019382	TCT	2	6	623746	623751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	412337935
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18317	NC_019382	GGC	2	6	624180	624185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337935
18318	NC_019382	CTG	3	9	624192	624200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337935
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18322	NC_019382	GC	3	6	624300	624305	0 %	0 %	50 %	50 %	412337935
18323	NC_019382	TGG	2	6	624310	624315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337935
18324	NC_019382	TGG	2	6	624331	624336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337935
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18332	NC_019382	GGC	2	6	624506	624511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337936
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18334	NC_019382	CG	3	6	624556	624561	0 %	0 %	50 %	50 %	412337936
18335	NC_019382	CGA	2	6	624580	624585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337936
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18341	NC_019382	CGG	2	6	624752	624757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337937
18342	NC_019382	GC	3	6	624764	624769	0 %	0 %	50 %	50 %	412337937
18343	NC_019382	CGC	2	6	624785	624790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337937
18344	NC_019382	TCG	2	6	624811	624816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337937
18345	NC_019382	GCT	2	6	624857	624862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337937
18346	NC_019382	GTG	3	9	624891	624899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337937
18347	NC_019382	ACG	2	6	624955	624960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337937
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18350	NC_019382	CAGG	2	8	624995	625002	25 %	0 %	50 %	25 %	412337937
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18352	NC_019382	TGC	2	6	625107	625112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337938
18353	NC_019382	TGG	2	6	625116	625121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337938
18354	NC_019382	GGCC	2	8	625141	625148	0 %	0 %	50 %	50 %	412337938
18355	NC_019382	CGGC	2	8	625160	625167	0 %	0 %	50 %	50 %	412337938
18356	NC_019382	CGC	2	6	625282	625287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337938
18357	NC_019382	GGC	2	6	625310	625315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337938
18358	NC_019382	GCT	3	9	625327	625335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337938
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18500	NC_019382	CGC	2	6	629220	629225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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