MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella bronchiseptica 253

Total Repeats: 151443

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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151005	NC_019382	GGCC	2	8	5244033	5244040	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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151125	NC_019382	TTG	2	6	5249104	5249109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151126	NC_019382	GCT	2	6	5249150	5249155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151127	NC_019382	GGCC	2	8	5249228	5249235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151128	NC_019382	GGC	2	6	5249246	5249251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
151129	NC_019382	AAC	2	6	5249362	5249367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151130	NC_019382	GGTC	2	8	5249405	5249412	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
151131	NC_019382	GCC	2	6	5249415	5249420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
151132	NC_019382	C	6	6	5249419	5249424	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
151133	NC_019382	CTG	2	6	5249549	5249554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151134	NC_019382	TAAG	2	8	5249559	5249566	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
151135	NC_019382	CGG	2	6	5249652	5249657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
151136	NC_019382	GC	3	6	5249677	5249682	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151137	NC_019382	GC	3	6	5249687	5249692	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151138	NC_019382	CCGCC	2	10	5249719	5249728	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
151139	NC_019382	TCG	2	6	5249770	5249775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151140	NC_019382	CGC	2	6	5249839	5249844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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151143	NC_019382	GC	3	6	5249952	5249957	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151144	NC_019382	TCG	2	6	5250027	5250032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151145	NC_019382	GC	3	6	5250122	5250127	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151146	NC_019382	CGC	2	6	5250139	5250144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
151147	NC_019382	CG	3	6	5250187	5250192	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151148	NC_019382	CAT	2	6	5250325	5250330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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151150	NC_019382	CAT	2	6	5250409	5250414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151151	NC_019382	CACTT	2	10	5250479	5250488	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
151152	NC_019382	AAC	2	6	5250521	5250526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151153	NC_019382	GCC	3	9	5250551	5250559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
151154	NC_019382	TCCT	2	8	5250614	5250621	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151155	NC_019382	TGA	2	6	5250623	5250628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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151162	NC_019382	GC	3	6	5250985	5250990	0 %	0 %	50 %	50 %	412342112
151163	NC_019382	CG	3	6	5251139	5251144	0 %	0 %	50 %	50 %	412342112
151164	NC_019382	TCCC	2	8	5251358	5251365	0 %	25 %	0 %	75 %	412342113
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151185	NC_019382	C	6	6	5252337	5252342	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
151186	NC_019382	GCAG	2	8	5252343	5252350	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
151187	NC_019382	CAG	2	6	5252359	5252364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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151193	NC_019382	AGCC	2	8	5252637	5252644	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
151194	NC_019382	AGT	2	6	5252684	5252689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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151220	NC_019382	CG	3	6	5253922	5253927	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151221	NC_019382	CAAG	2	8	5253942	5253949	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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151223	NC_019382	GCT	3	9	5254183	5254191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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151226	NC_019382	GC	3	6	5254267	5254272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151227	NC_019382	CCG	2	6	5254282	5254287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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151230	NC_019382	CAAC	2	8	5254416	5254423	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
151231	NC_019382	AGG	2	6	5254433	5254438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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151233	NC_019382	TTC	2	6	5254464	5254469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151234	NC_019382	ACA	2	6	5254474	5254479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151235	NC_019382	TGGAA	2	10	5254510	5254519	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
151236	NC_019382	AGC	2	6	5254609	5254614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151237	NC_019382	GCCGTC	2	12	5254631	5254642	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
151238	NC_019382	ACA	2	6	5254643	5254648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151239	NC_019382	GC	3	6	5254651	5254656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151240	NC_019382	CATG	2	8	5254701	5254708	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
151241	NC_019382	CCT	2	6	5254714	5254719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
151242	NC_019382	GCT	2	6	5254720	5254725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151243	NC_019382	CAGC	2	8	5254726	5254733	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
151244	NC_019382	GCC	2	6	5254734	5254739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
151245	NC_019382	GCC	2	6	5254747	5254752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
151246	NC_019382	CCCCTT	2	12	5254784	5254795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
151247	NC_019382	GAA	2	6	5254845	5254850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151248	NC_019382	TCA	2	6	5254897	5254902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151249	NC_019382	GC	3	6	5255026	5255031	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151250	NC_019382	GAC	2	6	5255070	5255075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151251	NC_019382	GC	3	6	5255111	5255116	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151252	NC_019382	CGA	2	6	5255189	5255194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151253	NC_019382	CGA	2	6	5255210	5255215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151254	NC_019382	CTT	2	6	5255217	5255222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151255	NC_019382	CAG	2	6	5255251	5255256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151256	NC_019382	CCAT	2	8	5255309	5255316	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
151257	NC_019382	CCT	2	6	5255326	5255331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
151258	NC_019382	TGC	2	6	5255336	5255341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151259	NC_019382	GTCTT	2	10	5255384	5255393	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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151262	NC_019382	AG	3	6	5255546	5255551	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151263	NC_019382	GC	3	6	5255600	5255605	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151264	NC_019382	CG	3	6	5255610	5255615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151265	NC_019382	TGCAT	2	10	5255635	5255644	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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151271	NC_019382	CGG	2	6	5255978	5255983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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151275	NC_019382	TCA	2	6	5256214	5256219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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151279	NC_019382	TATT	2	8	5256420	5256427	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151280	NC_019382	GGC	2	6	5256487	5256492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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151282	NC_019382	GCTG	2	8	5256598	5256605	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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151338	NC_019382	CG	3	6	5259937	5259942	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151339	NC_019382	CG	3	6	5259952	5259957	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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151342	NC_019382	CG	3	6	5260057	5260062	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151343	NC_019382	CG	3	6	5260177	5260182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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151347	NC_019382	GC	4	8	5260449	5260456	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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151349	NC_019382	GGC	2	6	5260542	5260547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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151352	NC_019382	GCCG	2	8	5260662	5260669	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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151356	NC_019382	CGCT	2	8	5260857	5260864	0 %	25 %	25 %	50 %	412342114
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151363	NC_019382	GCT	2	6	5261049	5261054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412342114
151364	NC_019382	GC	3	6	5261075	5261080	0 %	0 %	50 %	50 %	412342114
151365	NC_019382	TGA	2	6	5261118	5261123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412342114
151366	NC_019382	GCA	2	6	5261380	5261385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412342114
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151370	NC_019382	CG	4	8	5261547	5261554	0 %	0 %	50 %	50 %	412342115
151371	NC_019382	CGA	2	6	5261573	5261578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412342115
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151373	NC_019382	TGG	2	6	5261745	5261750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412342116
151374	NC_019382	TGCG	2	8	5261759	5261766	0 %	25 %	50 %	25 %	412342116
151375	NC_019382	GCG	2	6	5261840	5261845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412342116
151376	NC_019382	GCT	2	6	5261851	5261856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412342116
151377	NC_019382	GC	3	6	5261870	5261875	0 %	0 %	50 %	50 %	412342116
151378	NC_019382	GTCG	2	8	5261890	5261897	0 %	25 %	50 %	25 %	412342116
151379	NC_019382	CTG	2	6	5261939	5261944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412342116
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151381	NC_019382	GC	3	6	5262027	5262032	0 %	0 %	50 %	50 %	412342117
151382	NC_019382	GACCTG	2	12	5262043	5262054	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	412342117
151383	NC_019382	CGC	2	6	5262063	5262068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412342117
151384	NC_019382	CGC	2	6	5262075	5262080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412342117
151385	NC_019382	CGC	2	6	5262168	5262173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412342117
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151387	NC_019382	TCA	2	6	5262203	5262208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412342118
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151389	NC_019382	TGC	2	6	5262302	5262307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412342118
151390	NC_019382	CG	3	6	5262431	5262436	0 %	0 %	50 %	50 %	412342118
151391	NC_019382	CCG	2	6	5262533	5262538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412342118
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151394	NC_019382	TGG	2	6	5262629	5262634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412342118
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151396	NC_019382	GTC	2	6	5262729	5262734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412342118
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151398	NC_019382	GC	3	6	5262783	5262788	0 %	0 %	50 %	50 %	412342118
151399	NC_019382	GAA	2	6	5262804	5262809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	412342118
151400	NC_019382	CCA	2	6	5262831	5262836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412342118
151401	NC_019382	CGG	2	6	5262849	5262854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412342118
151402	NC_019382	CCA	2	6	5262866	5262871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412342118
151403	NC_019382	GC	3	6	5262878	5262883	0 %	0 %	50 %	50 %	412342118
151404	NC_019382	CTG	2	6	5262898	5262903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412342118
151405	NC_019382	GCC	3	9	5262940	5262948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412342118
151406	NC_019382	GC	3	6	5262984	5262989	0 %	0 %	50 %	50 %	412342118
151407	NC_019382	GGC	2	6	5263032	5263037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412342118
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151411	NC_019382	GCC	2	6	5263110	5263115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412342118
151412	NC_019382	CGA	2	6	5263128	5263133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412342118
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151415	NC_019382	GGCT	2	8	5263212	5263219	0 %	25 %	50 %	25 %	412342119
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151417	NC_019382	CCG	2	6	5263255	5263260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412342119
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151422	NC_019382	CGGC	2	8	5263520	5263527	0 %	0 %	50 %	50 %	412342119
151423	NC_019382	GCG	2	6	5263528	5263533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412342119
151424	NC_019382	CAC	2	6	5263559	5263564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412342119
151425	NC_019382	CGA	2	6	5263778	5263783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412342119
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151427	NC_019382	GCG	2	6	5263827	5263832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
151428	NC_019382	CCA	2	6	5263836	5263841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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151431	NC_019382	CAC	2	6	5263885	5263890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
151432	NC_019382	CAAC	2	8	5263917	5263924	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
151433	NC_019382	AAGA	2	8	5263957	5263964	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
151434	NC_019382	CCG	2	6	5264055	5264060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
151435	NC_019382	GAC	2	6	5264110	5264115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151436	NC_019382	GTC	2	6	5264179	5264184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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151439	NC_019382	CCGAC	2	10	5264225	5264234	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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151441	NC_019382	GGT	3	9	5264289	5264297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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151443	NC_019382	TGG	2	6	5264369	5264374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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