MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella bronchiseptica 253

Total Repeats: 151443

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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150116	NC_019382	GCG	2	6	5201617	5201622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412342088
150117	NC_019382	GCG	2	6	5201693	5201698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412342088
150118	NC_019382	GCG	2	6	5201719	5201724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412342088
150119	NC_019382	CAC	2	6	5201885	5201890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412342088
150120	NC_019382	AGC	3	9	5201925	5201933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412342088
150121	NC_019382	GCC	2	6	5202024	5202029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412342088
150122	NC_019382	ATG	2	6	5202042	5202047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412342088
150123	NC_019382	GTG	2	6	5202063	5202068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412342088
150124	NC_019382	TCG	2	6	5202126	5202131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412342088
150125	NC_019382	CGG	2	6	5202186	5202191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412342088
150126	NC_019382	CGC	2	6	5202222	5202227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412342088
150127	NC_019382	CCG	2	6	5202250	5202255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412342088
150128	NC_019382	GTA	2	6	5202314	5202319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412342088
150129	NC_019382	CAG	2	6	5202323	5202328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412342088
150130	NC_019382	ATC	2	6	5202462	5202467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412342088
150131	NC_019382	GCG	2	6	5202488	5202493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412342088
150132	NC_019382	CGGCG	2	10	5202565	5202574	0 %	0 %	60 %	40 %	412342088
150133	NC_019382	GTC	2	6	5202591	5202596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412342088
150134	NC_019382	TTCGGC	2	12	5202617	5202628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412342088
150135	NC_019382	GGCC	2	8	5202635	5202642	0 %	0 %	50 %	50 %	412342088
150136	NC_019382	TGC	2	6	5202650	5202655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412342088
150137	NC_019382	GCC	2	6	5202680	5202685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412342089
150138	NC_019382	GCA	2	6	5202702	5202707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412342089
150139	NC_019382	CGGC	2	8	5202729	5202736	0 %	0 %	50 %	50 %	412342089
150140	NC_019382	ACC	2	6	5202902	5202907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412342089
150141	NC_019382	GAT	2	6	5202955	5202960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412342089
150142	NC_019382	TGA	2	6	5203101	5203106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412342089
150143	NC_019382	GCCG	2	8	5203120	5203127	0 %	0 %	50 %	50 %	412342089
150144	NC_019382	GC	3	6	5203161	5203166	0 %	0 %	50 %	50 %	412342089
150145	NC_019382	GCC	2	6	5203189	5203194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412342089
150146	NC_019382	CCA	2	6	5203212	5203217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412342089
150147	NC_019382	GC	3	6	5203239	5203244	0 %	0 %	50 %	50 %	412342089
150148	NC_019382	CGC	2	6	5203252	5203257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412342089
150149	NC_019382	CTGC	2	8	5203320	5203327	0 %	25 %	25 %	50 %	412342089
150150	NC_019382	GGGC	2	8	5203354	5203361	0 %	0 %	75 %	25 %	412342089
150151	NC_019382	CGG	2	6	5203386	5203391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412342089
150152	NC_019382	GGC	2	6	5203402	5203407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412342089
150153	NC_019382	CTG	2	6	5203468	5203473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412342089
150154	NC_019382	ACG	2	6	5203502	5203507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412342089
150155	NC_019382	CCGG	2	8	5203520	5203527	0 %	0 %	50 %	50 %	412342089
150156	NC_019382	ATC	2	6	5203538	5203543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412342089
150157	NC_019382	GCC	2	6	5203568	5203573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412342089
150158	NC_019382	GCG	2	6	5203577	5203582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412342089
150159	NC_019382	GCA	2	6	5203699	5203704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412342090
150160	NC_019382	TGC	2	6	5203713	5203718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412342090
150161	NC_019382	CGA	2	6	5203777	5203782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412342090
150162	NC_019382	ACG	2	6	5203827	5203832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412342090
150163	NC_019382	GCTGAA	2	12	5203856	5203867	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	412342090
150164	NC_019382	CG	3	6	5203931	5203936	0 %	0 %	50 %	50 %	412342090
150165	NC_019382	CAG	2	6	5203979	5203984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412342090
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150167	NC_019382	TCC	2	6	5204091	5204096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	412342091
150168	NC_019382	GGT	2	6	5204111	5204116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412342091
150169	NC_019382	CCG	2	6	5204142	5204147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412342091
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150173	NC_019382	GCC	2	6	5204243	5204248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412342091
150174	NC_019382	GTT	2	6	5204264	5204269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	412342091
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150176	NC_019382	ATG	2	6	5204388	5204393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412342091
150177	NC_019382	ATG	2	6	5204397	5204402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412342091
150178	NC_019382	CCG	2	6	5204437	5204442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412342091
150179	NC_019382	CGC	2	6	5204465	5204470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412342091
150180	NC_019382	GCGG	2	8	5204480	5204487	0 %	0 %	75 %	25 %	412342091
150181	NC_019382	CAG	2	6	5204498	5204503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412342091
150182	NC_019382	TGG	2	6	5204511	5204516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412342091
150183	NC_019382	CCG	2	6	5204517	5204522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412342091
150184	NC_019382	TTG	2	6	5204523	5204528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	412342091
150185	NC_019382	CAC	2	6	5204552	5204557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412342091
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150187	NC_019382	GCC	3	9	5204615	5204623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412342091
150188	NC_019382	TGA	2	6	5204629	5204634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412342091
150189	NC_019382	GCA	2	6	5204636	5204641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412342091
150190	NC_019382	CCA	2	6	5204665	5204670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412342091
150191	NC_019382	CGT	2	6	5204686	5204691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412342091
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150194	NC_019382	ATG	2	6	5204738	5204743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412342091
150195	NC_019382	GGC	2	6	5204747	5204752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412342091
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150198	NC_019382	TGGCC	2	10	5204908	5204917	0 %	20 %	40 %	40 %	412342091
150199	NC_019382	GCG	2	6	5204970	5204975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412342091
150200	NC_019382	GCG	2	6	5204985	5204990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412342091
150201	NC_019382	GCC	2	6	5205014	5205019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412342091
150202	NC_019382	TCAGGT	2	12	5205052	5205063	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	412342091
150203	NC_019382	CCA	2	6	5205067	5205072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412342091
150204	NC_019382	CGT	2	6	5205142	5205147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412342091
150205	NC_019382	GC	3	6	5205151	5205156	0 %	0 %	50 %	50 %	412342091
150206	NC_019382	CG	4	8	5205157	5205164	0 %	0 %	50 %	50 %	412342091
150207	NC_019382	TGTC	2	8	5205259	5205266	0 %	50 %	25 %	25 %	412342091
150208	NC_019382	TCC	2	6	5205271	5205276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
150209	NC_019382	CGCGC	2	10	5205287	5205296	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
150210	NC_019382	GCT	2	6	5205334	5205339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412342092
150211	NC_019382	GTAGGC	2	12	5205380	5205391	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	412342092
150212	NC_019382	TG	3	6	5205464	5205469	0 %	50 %	50 %	0 %	412342092
150213	NC_019382	GGCC	2	8	5205523	5205530	0 %	0 %	50 %	50 %	412342092
150214	NC_019382	TCGG	2	8	5205645	5205652	0 %	25 %	50 %	25 %	412342092
150215	NC_019382	ACC	2	6	5205663	5205668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412342092
150216	NC_019382	TGT	2	6	5205700	5205705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150217	NC_019382	CGC	2	6	5205715	5205720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412342093
150218	NC_019382	CAC	2	6	5205744	5205749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412342093
150219	NC_019382	CGG	2	6	5205760	5205765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412342093
150220	NC_019382	TCG	2	6	5205803	5205808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412342093
150221	NC_019382	GAGG	2	8	5205861	5205868	25 %	0 %	75 %	0 %	412342093
150222	NC_019382	GCG	2	6	5205877	5205882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412342093
150223	NC_019382	CCG	2	6	5205902	5205907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412342093
150224	NC_019382	CCG	2	6	5205914	5205919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412342093
150225	NC_019382	GC	4	8	5206025	5206032	0 %	0 %	50 %	50 %	412342093
150226	NC_019382	TGT	2	6	5206070	5206075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	412342093
150227	NC_019382	GCCC	2	8	5206094	5206101	0 %	0 %	25 %	75 %	412342093
150228	NC_019382	AAC	2	6	5206114	5206119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	412342093
150229	NC_019382	TGC	2	6	5206120	5206125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412342093
150230	NC_019382	CGGC	2	8	5206246	5206253	0 %	0 %	50 %	50 %	412342093
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150335	NC_019382	GCC	2	6	5210674	5210679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
150336	NC_019382	CGG	2	6	5210708	5210713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
150337	NC_019382	GCA	2	6	5210725	5210730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150338	NC_019382	TGC	3	9	5210768	5210776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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150340	NC_019382	TCG	2	6	5210848	5210853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150341	NC_019382	GC	3	6	5211001	5211006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150342	NC_019382	CGG	2	6	5211014	5211019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
150343	NC_019382	GTA	2	6	5211027	5211032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150344	NC_019382	TGGT	2	8	5211037	5211044	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
150345	NC_019382	CGG	2	6	5211081	5211086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
150346	NC_019382	GC	3	6	5211112	5211117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150347	NC_019382	CAG	3	9	5211126	5211134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150348	NC_019382	AGCC	2	8	5211138	5211145	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
150349	NC_019382	GC	4	8	5211157	5211164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150350	NC_019382	GTTG	2	8	5211195	5211202	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
150351	NC_019382	GCC	2	6	5211223	5211228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
150352	NC_019382	GGC	2	6	5211231	5211236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
150353	NC_019382	GTT	2	6	5211237	5211242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150354	NC_019382	GGT	2	6	5211246	5211251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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150356	NC_019382	ATG	2	6	5211444	5211449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150357	NC_019382	TGC	2	6	5211502	5211507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150358	NC_019382	CGT	2	6	5211577	5211582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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150361	NC_019382	CG	4	8	5211783	5211790	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150362	NC_019382	CTG	2	6	5211858	5211863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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150367	NC_019382	CAT	2	6	5212095	5212100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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150377	NC_019382	GTGG	2	8	5212589	5212596	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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150379	NC_019382	CCG	2	6	5212762	5212767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
150380	NC_019382	CG	3	6	5212778	5212783	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150381	NC_019382	CGG	2	6	5212861	5212866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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150391	NC_019382	GC	3	6	5213286	5213291	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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150463	NC_019382	GC	3	6	5216142	5216147	0 %	0 %	50 %	50 %	412342102
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150467	NC_019382	CG	3	6	5216298	5216303	0 %	0 %	50 %	50 %	412342103
150468	NC_019382	CAG	2	6	5216317	5216322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412342103
150469	NC_019382	CGC	2	6	5216329	5216334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412342103
150470	NC_019382	CCA	2	6	5216424	5216429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412342103
150471	NC_019382	CGC	2	6	5216459	5216464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412342103
150472	NC_019382	GTC	2	6	5216595	5216600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412342104
150473	NC_019382	GC	5	10	5216619	5216628	0 %	0 %	50 %	50 %	412342104
150474	NC_019382	GCT	2	6	5216663	5216668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412342104
150475	NC_019382	GAAC	2	8	5216673	5216680	50 %	0 %	25 %	25 %	412342104
150476	NC_019382	CTG	2	6	5216788	5216793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150477	NC_019382	GC	3	6	5217118	5217123	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150478	NC_019382	AGCA	2	8	5217140	5217147	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
150479	NC_019382	GAT	2	6	5217187	5217192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150480	NC_019382	TCG	2	6	5217255	5217260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150481	NC_019382	CG	3	6	5217331	5217336	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150482	NC_019382	CG	3	6	5217346	5217351	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150483	NC_019382	CG	3	6	5217391	5217396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150484	NC_019382	CG	3	6	5217481	5217486	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150485	NC_019382	CG	3	6	5217586	5217591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150486	NC_019382	CG	3	6	5217601	5217606	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150487	NC_019382	CG	3	6	5217646	5217651	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150488	NC_019382	CG	3	6	5217691	5217696	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150489	NC_019382	CG	3	6	5217706	5217711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150490	NC_019382	CG	3	6	5217826	5217831	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150491	NC_019382	CG	3	6	5217931	5217936	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150492	NC_019382	CG	3	6	5217946	5217951	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150493	NC_019382	CG	3	6	5217991	5217996	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150494	NC_019382	GC	4	8	5218096	5218103	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150495	NC_019382	CG	3	6	5218104	5218109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150496	NC_019382	GGC	2	6	5218189	5218194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
150497	NC_019382	GCTG	2	8	5218240	5218247	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
150498	NC_019382	GGCG	2	8	5218260	5218267	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
150499	NC_019382	GCCG	2	8	5218309	5218316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150500	NC_019382	GAT	2	6	5218317	5218322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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