MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bordetella bronchiseptica 253

Total Repeats: 151443

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
145001	NC_019382	CGA	2	6	5021999	5022004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412341927
145002	NC_019382	TGCCG	2	10	5022020	5022029	0 %	20 %	40 %	40 %	412341927
145003	NC_019382	GCC	2	6	5022117	5022122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412341927
145004	NC_019382	CGAT	2	8	5022176	5022183	25 %	25 %	25 %	25 %	412341927
145005	NC_019382	GGC	2	6	5022234	5022239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412341927
145006	NC_019382	CCA	2	6	5022251	5022256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412341927
145007	NC_019382	GC	3	6	5022265	5022270	0 %	0 %	50 %	50 %	412341927
145008	NC_019382	GCG	2	6	5022275	5022280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412341927
145009	NC_019382	GC	3	6	5022299	5022304	0 %	0 %	50 %	50 %	412341927
145010	NC_019382	GCA	2	6	5022362	5022367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412341927
145011	NC_019382	GC	3	6	5022373	5022378	0 %	0 %	50 %	50 %	412341927
145012	NC_019382	GCT	2	6	5022384	5022389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412341927
145013	NC_019382	GTCCAG	2	12	5022414	5022425	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	412341927
145014	NC_019382	GCCG	2	8	5022426	5022433	0 %	0 %	50 %	50 %	412341927
145015	NC_019382	CG	4	8	5022437	5022444	0 %	0 %	50 %	50 %	412341927
145016	NC_019382	GCAG	2	8	5022464	5022471	25 %	0 %	50 %	25 %	412341927
145017	NC_019382	CGGCG	2	10	5022477	5022486	0 %	0 %	60 %	40 %	412341927
145018	NC_019382	CAGGAA	2	12	5022514	5022525	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	412341928
145019	NC_019382	T	6	6	5022535	5022540	0 %	100 %	0 %	0 %	412341928
145020	NC_019382	GCT	2	6	5022558	5022563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412341928
145021	NC_019382	GTG	2	6	5022608	5022613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412341928
145022	NC_019382	GC	5	10	5022615	5022624	0 %	0 %	50 %	50 %	412341928
145023	NC_019382	GCC	2	6	5022653	5022658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412341928
145024	NC_019382	GGCG	2	8	5022723	5022730	0 %	0 %	75 %	25 %	412341928
145025	NC_019382	TGC	2	6	5022734	5022739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412341928
145026	NC_019382	GC	3	6	5022746	5022751	0 %	0 %	50 %	50 %	412341928
145027	NC_019382	GC	3	6	5022761	5022766	0 %	0 %	50 %	50 %	412341928
145028	NC_019382	CAG	2	6	5022838	5022843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412341928
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145030	NC_019382	GCC	3	9	5022893	5022901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412341928
145031	NC_019382	ACC	2	6	5022902	5022907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412341928
145032	NC_019382	CGG	2	6	5022927	5022932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412341928
145033	NC_019382	GCC	2	6	5022967	5022972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412341928
145034	NC_019382	GCG	2	6	5022978	5022983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412341928
145035	NC_019382	CAG	2	6	5023066	5023071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412341928
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145037	NC_019382	GC	4	8	5023134	5023141	0 %	0 %	50 %	50 %	412341928
145038	NC_019382	CGGC	2	8	5023146	5023153	0 %	0 %	50 %	50 %	412341928
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145048	NC_019382	GC	3	6	5023537	5023542	0 %	0 %	50 %	50 %	412341929
145049	NC_019382	CCG	2	6	5023549	5023554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412341929
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145054	NC_019382	CGG	2	6	5023721	5023726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412341929
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145057	NC_019382	GC	3	6	5023900	5023905	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145058	NC_019382	GACG	2	8	5023931	5023938	25 %	0 %	50 %	25 %	412341930
145059	NC_019382	CG	3	6	5023976	5023981	0 %	0 %	50 %	50 %	412341930
145060	NC_019382	AGC	2	6	5024050	5024055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412341930
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145077	NC_019382	GTC	2	6	5024999	5025004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412341932
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145081	NC_019382	CTG	2	6	5025269	5025274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412341932
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145097	NC_019382	GC	3	6	5025739	5025744	0 %	0 %	50 %	50 %	412341932
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145108	NC_019382	CGA	2	6	5026101	5026106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412341933
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145232	NC_019382	CGG	2	6	5030093	5030098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412341937
145233	NC_019382	CGA	2	6	5030108	5030113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412341937
145234	NC_019382	GCACG	2	10	5030132	5030141	20 %	0 %	40 %	40 %	412341937
145235	NC_019382	CGC	2	6	5030146	5030151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412341937
145236	NC_019382	TGG	2	6	5030212	5030217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412341937
145237	NC_019382	CTG	2	6	5030247	5030252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412341937
145238	NC_019382	CGC	2	6	5030311	5030316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412341937
145239	NC_019382	AGATCG	2	12	5030389	5030400	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	412341937
145240	NC_019382	TTCG	2	8	5030411	5030418	0 %	50 %	25 %	25 %	412341937
145241	NC_019382	CGG	2	6	5030423	5030428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412341937
145242	NC_019382	TCG	2	6	5030450	5030455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412341937
145243	NC_019382	CGG	2	6	5030475	5030480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412341938
145244	NC_019382	TGGC	2	8	5030548	5030555	0 %	25 %	50 %	25 %	412341938
145245	NC_019382	GGC	2	6	5030562	5030567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412341938
145246	NC_019382	GCG	4	12	5030578	5030589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412341938
145247	NC_019382	TGGC	2	8	5030605	5030612	0 %	25 %	50 %	25 %	412341938
145248	NC_019382	GCTG	2	8	5030631	5030638	0 %	25 %	50 %	25 %	412341938
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145251	NC_019382	CTG	2	6	5030662	5030667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412341938
145252	NC_019382	GCG	2	6	5030675	5030680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412341938
145253	NC_019382	CGG	2	6	5030685	5030690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412341938
145254	NC_019382	GCG	2	6	5030707	5030712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412341938
145255	NC_019382	GGC	2	6	5030722	5030727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412341938
145256	NC_019382	GGGC	2	8	5030739	5030746	0 %	0 %	75 %	25 %	412341938
145257	NC_019382	CTG	2	6	5030767	5030772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412341938
145258	NC_019382	GGC	2	6	5030870	5030875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412341938
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145260	NC_019382	GCC	2	6	5030900	5030905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412341938
145261	NC_019382	CTG	2	6	5030911	5030916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412341938
145262	NC_019382	GCG	2	6	5030923	5030928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412341938
145263	NC_019382	GGC	2	6	5030937	5030942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412341938
145264	NC_019382	G	6	6	5030951	5030956	0 %	0 %	100 %	0 %	412341938
145265	NC_019382	CG	4	8	5030993	5031000	0 %	0 %	50 %	50 %	412341939
145266	NC_019382	CTG	2	6	5031030	5031035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412341939
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145268	NC_019382	CTG	2	6	5031066	5031071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412341939
145269	NC_019382	GC	3	6	5031072	5031077	0 %	0 %	50 %	50 %	412341939
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145272	NC_019382	GC	3	6	5031244	5031249	0 %	0 %	50 %	50 %	412341939
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145278	NC_019382	GAG	2	6	5031615	5031620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	412341940
145279	NC_019382	TGGA	2	8	5031633	5031640	25 %	25 %	50 %	0 %	412341940
145280	NC_019382	ATC	2	6	5031709	5031714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412341940
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145282	NC_019382	CG	3	6	5031786	5031791	0 %	0 %	50 %	50 %	412341940
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145286	NC_019382	CGG	2	6	5031967	5031972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412341940
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145290	NC_019382	CGG	2	6	5032212	5032217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412341941
145291	NC_019382	TGC	2	6	5032236	5032241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412341941
145292	NC_019382	CAG	2	6	5032253	5032258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412341941
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145294	NC_019382	GT	3	6	5032284	5032289	0 %	50 %	50 %	0 %	412341941
145295	NC_019382	CAG	2	6	5032298	5032303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412341941
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145303	NC_019382	CTG	3	9	5032646	5032654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412341941
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145314	NC_019382	CGGCG	2	10	5032991	5033000	0 %	0 %	60 %	40 %	412341941
145315	NC_019382	CGGC	2	8	5033061	5033068	0 %	0 %	50 %	50 %	412341941
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145319	NC_019382	CT	3	6	5033163	5033168	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145320	NC_019382	T	7	7	5033194	5033200	0 %	100 %	0 %	0 %	412341942
145321	NC_019382	CCG	2	6	5033245	5033250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412341942
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145323	NC_019382	TCG	2	6	5033320	5033325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412341942
145324	NC_019382	CGT	2	6	5033342	5033347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412341942
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145327	NC_019382	GCG	2	6	5033392	5033397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412341942
145328	NC_019382	TTC	2	6	5033427	5033432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	412341942
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145330	NC_019382	CGC	2	6	5033472	5033477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412341942
145331	NC_019382	AGC	2	6	5033479	5033484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412341942
145332	NC_019382	GAA	2	6	5033499	5033504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	412341942
145333	NC_019382	CG	3	6	5033515	5033520	0 %	0 %	50 %	50 %	412341942
145334	NC_019382	CTT	2	6	5033534	5033539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	412341942
145335	NC_019382	CAA	2	6	5033567	5033572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	412341942
145336	NC_019382	GACG	2	8	5033616	5033623	25 %	0 %	50 %	25 %	412341942
145337	NC_019382	CGC	2	6	5033701	5033706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412341942
145338	NC_019382	GAA	2	6	5033732	5033737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	412341942
145339	NC_019382	CGGG	2	8	5033878	5033885	0 %	0 %	75 %	25 %	412341942
145340	NC_019382	GCT	2	6	5033888	5033893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412341942
145341	NC_019382	GCG	2	6	5033944	5033949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412341942
145342	NC_019382	CGA	2	6	5033981	5033986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412341942
145343	NC_019382	CG	3	6	5034031	5034036	0 %	0 %	50 %	50 %	412341942
145344	NC_019382	CG	3	6	5034097	5034102	0 %	0 %	50 %	50 %	412341942
145345	NC_019382	GC	3	6	5034109	5034114	0 %	0 %	50 %	50 %	412341942
145346	NC_019382	CAG	2	6	5034119	5034124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412341942
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145348	NC_019382	CCG	2	6	5034343	5034348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412341942
145349	NC_019382	GCCGA	2	10	5034363	5034372	20 %	0 %	40 %	40 %	412341942
145350	NC_019382	ACC	2	6	5034382	5034387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412341942
145351	NC_019382	CGT	2	6	5034398	5034403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412341942
145352	NC_019382	GGGCG	2	10	5034443	5034452	0 %	0 %	80 %	20 %	412341942
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145354	NC_019382	CAA	2	6	5034554	5034559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	412341942
145355	NC_019382	GCC	2	6	5034588	5034593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412341942
145356	NC_019382	CTG	2	6	5034597	5034602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412341942
145357	NC_019382	GCG	2	6	5034605	5034610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412341942
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145359	NC_019382	CCGA	2	8	5034746	5034753	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
145360	NC_019382	TAAT	2	8	5034775	5034782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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145364	NC_019382	TGG	2	6	5035085	5035090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412341943
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145457	NC_019382	CGA	2	6	5038745	5038750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412341946
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